Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v2249040.2
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v2249040.2 Non Chatacterized Hit- tr|J3KUY8|J3KUY8_ORYBR
Uncharacterized protein OS=Oryza brachyantha
GN=OB0093,65.62,5e-16,Nucleotidyltransferase,NULL;
HD-domain/PDEase-like,NULL; EF-hand,NULL; no description,EF-hand-like
d,CUFF.50553.2
(1722 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC61124 similar to UniRef100_A7NVZ3 Cluster: Chromosome... 1580 0.0
gnl|LJGI|FS362756 similar to UniRef100_A7NVZ3 Cluster: Chromosom... 1364 0.0
>gnl|LJGI|TC61124 similar to UniRef100_A7NVZ3 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_2,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr5 scaffold_2, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (39%)
Length = 858
Score = 1580 bits (797), Expect = 0.0
Identities = 835/851 (98%), Gaps = 15/851 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 29 ctcacgatttccccaccacacactattctctccccaaaacccccaccacttctccattca 88
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5 ctcacgatttccccaccacacactattctctccccaaaacccccaccacttctccattca 64
Query: 89 ttctcataccactcttcatcctccgtcaccaccgccgccgccgcacgcgtctccgatggt 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 65 ttctcataccactcttcatcctccgtcaccaccgccgccgccgcacgcgtctccgatggt 124
Query: 149 cagctccgagggcgtgcgcggcggcggaggtcaccggcggagggaagatggtgatggagt 208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 125 cagctccgagggcgtgcgcggcggcggaggtcaccggcggagggaagatggtgatggagt 184
Query: 209 tggtcggagccttcaacgaactcaccgagaggatgaaggtgctgtcgacgagctcctccg 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 tggtcggagccttcaacgaactcaccgagaggatgaaggtgctgtcgacgagctcctccg 244
Query: 269 gccttctcttcaagtccctcaagctctccatccctgttcttcaaacctcccctgtctccg 328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 245 gccttctcttcaagtccctcaagctctccatccctgttcttcaaacctcccctgtctccg 304
Query: 329 ccgatggccgctctcccctttccaaagcactgtccctcgccatgatcctcgctgatctcc 388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 305 ccgatggccgctctcccctttccaaagcactgtccctcgccatgatcctcgctgatctcc 364
Query: 389 ag---------------atggatgctgaagttatatcggctggaatattgagagaggtgt 433
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 agtaagtatgattgcagatggatgctgaagttatatcggctggaatattgagagaggtgt 424
Query: 434 tggaggtaggtgcattgagtatcaatgaaattcagagcgagataggtgctgccactgctc 493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 425 tggaggtaggtgcattgagtatcaatgaaattcagagcgagataggtgctgccactgctc 484
Query: 494 atttggtgtacgagagtttgcgtgtgaagaacatcccgtccaggattgatgttctggatg 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 485 atttggtgtacgagagtttgcgtgtgaagaacatcccgtccaggattgatgttctggatg 544
Query: 554 atgacaatgctgctgcgctgaggaagttctgcctcacttattatgacatcagggctttga 613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 545 atgacaatgctgctgcgctgaggaagttctgcctcacttattatgacatcagggctttga 604
Query: 614 tcttggacctggccttgaagcttgacatgatgagacatattgcttatctccctaggtacc 673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 605 tcttggacctggccttgaagcttgacatgatgagacatattgcttatctccctaggtacc 664
Query: 674 agcagcagatccgttccctacaagtgatgaaaattcatgccccccttgctcatgctctgg 733
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 665 agcagcagatcctttccctacaagtgatgaaaattcatgccccccttgctcatgctctgg 724
Query: 734 ggactacctacttgtcactggagttggaagatctgtcctttcagtatttgtttccttact 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 725 ggactacctacttgtcactggagttggaagatctgtcctttcagtatttgtttccttact 784
Query: 794 catacctttatgttgatacgtggttgacgagtcatgagactggggataaacctcttattg 853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 785 catacctttatgttgatacgtggttgacgagtcatgagactggggataaacctcttattg 844
Query: 854 atgtgtacaag 864
|||||||||||
Sbjct: 845 atgtgtacaag 855
>gnl|LJGI|FS362756 similar to UniRef100_A7NVZ3 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_2,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr5 scaffold_2, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (38%)
Length = 806
Score = 1364 bits (688), Expect = 0.0
Identities = 703/708 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1015 gggctgcgagtcgtgttgaatcctaaacctggtgatggtgcattggaagctggagagaga 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 806 gggctgcgagtcgtgttgaatcctaaacctggtgatggtgcattggaagctggagagaga 747
Query: 1075 gcttgctatagggctcatgagatcattcagtccatgtggaaagaaatcccttacaggaca 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 746 gcttgctatagggctcatgagatcattcagtccatgtggaaagaaatcccttacaggaca 687
Query: 1135 aaagattatattgccaggccaaaagcaaatgggtatagaagtttgcatatggcagtggat 1194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 686 aaagattatattgccaggccaaaagcaaatgggtatagaagtttgcatatggcagtggat 627
Query: 1195 gtgagtgacaattgtaggacaagaccattgatggaaatacagataagaacaacagaaatg 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 626 gtgagtgacaattgtaggacaagaccattgatggaaatacagataagaacaacagaaatg 567
Query: 1255 gacaggttagctgttggtggaacagattcacactcattatataaggctgggcttactgat 1314
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 566 gacaggttagctgttggtggaacagcttcacactcattatataaggctggtcttactgat 507
Query: 1315 ccacaagaggctaagcgtctgaagacaatcatgctggctgcagctgagcttgctgctctg 1374
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 506 ccacaagaggcaaagcgtctgaagacaatcatgctggctgcagctgagcttgctgctttg 447
Query: 1375 cgccttagagatcttccaggcgcaattcataaagggatcgagattgaccagagggataga 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 446 cgccttagagatcttccaggcgcaattcataaagggatcgagattgaccagagggataga 387
Query: 1435 gtgtttcgccttcttgacaagaatggagatggtaaaattagcattgaggaacttgcagag 1494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 386 gtgtttcgccttcttgacaagaatggagatggtaaaattagcattgaggaacttgcagag 327
Query: 1495 gtgatggaggagcttggtgcaccaggagaagatgccaaagacatgatgcagctccttgac 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 326 gtgatggaggagcttggtgcaccaggagaagatgccaaagacatgatgcagctccttgac 267
Query: 1555 tcgaatagtgatggctctctgagttctgatgaatttcatatgttccaaaaccagattgag 1614
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 266 tcgaatagtgatggctctctgagttttgatgaatttcatatgttccaaaaccagattgag 207
Query: 1615 ttggtgcacaatttagaggaccgagatgatcagtacaagaaaatgttggatgagaagctt 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 206 ttggtgcacaatttagaggaccgagatgatcagtacaagaaaatgttggatgagaagctt 147
Query: 1675 catatggcagatgacagtggattaattcaggtatataataaggagttc 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 146 catatggcagatgacagtggattaattcaggtatataataaggagttc 99