Miyakogusa Predicted Gene

Lj4g3v2172780.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj4g3v2172780.1 Non Chatacterized Hit- tr|E9IDD9|E9IDD9_SOLIN
Putative uncharacterized protein (Fragment) OS=Solenop,21.51,2e-18,WD
REPEAT PROTEIN,NULL; WD40 REPEAT PROTEIN,NULL; WD40,WD40 repeat; WD40
repeat-like,WD40-repeat-con,CUFF.50393.1
         (1113 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC64192 similar to UniRef100_A7PE48 Cluster: Chromosome...  2206   0.0  
gnl|LJGI|GO015456 similar to UniRef100_A7PE48 Cluster: Chromosom...   841   0.0  

>gnl|LJGI|TC64192 similar to UniRef100_A7PE48 Cluster: Chromosome chr11 scaffold_13,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr11 scaffold_13, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (85%)
          Length = 1634

 Score = 2206 bits (1113), Expect = 0.0
 Identities = 1113/1113 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgtgcggtgacgccaccaactgggacgaagatgcgtacagagaaagcatcctgaaggag 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 146  atgtgcggtgacgccaccaactgggacgaagatgcgtacagagaaagcatcctgaaggag 205

                                                                        
Query: 61   cgtgagattcaaacgcaaaccgttttccgaaccgcctgggctcctccgcaaacccctaac 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 206  cgtgagattcaaacgcaaaccgttttccgaaccgcctgggctcctccgcaaacccctaac 265

                                                                        
Query: 121  ctccactctctcatcgccgcatccagcgacggttccatcgccgcatactccatctccgcc 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 266  ctccactctctcatcgccgcatccagcgacggttccatcgccgcatactccatctccgcc 325

                                                                        
Query: 181  tataacctcaacaatccgattggttctgtcaaaagtgatacagatgagttatttgctgaa 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 326  tataacctcaacaatccgattggttctgtcaaaagtgatacagatgagttatttgctgaa 385

                                                                        
Query: 241  ccggattgtatctttaaagcgcatgatggaccggcgtatgatgtcaaattctatggtgat 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 386  ccggattgtatctttaaagcgcatgatggaccggcgtatgatgtcaaattctatggtgat 445

                                                                        
Query: 301  ggtgaagatgctctgttgctgagttgtggtgatgatggtcgggttcgaggatggagatgg 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 446  ggtgaagatgctctgttgctgagttgtggtgatgatggtcgggttcgaggatggagatgg 505

                                                                        
Query: 361  aatggccttacaagctcaaattgttctggttcttcgctaggaaatgatatcaagcctgta 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 506  aatggccttacaagctcaaattgttctggttcttcgctaggaaatgatatcaagcctgta 565

                                                                        
Query: 421  cttgatgtggtaaatcctcagcagaaaggtccttggggtgcactttcacctatccctgag 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 566  cttgatgtggtaaatcctcagcagaaaggtccttggggtgcactttcacctatccctgag 625

                                                                        
Query: 481  aataatgctattgctgttaatactcaggggggatctatttttgctgcttctggtgattcc 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 626  aataatgctattgctgttaatactcaggggggatctatttttgctgcttctggtgattcc 685

                                                                        
Query: 541  tgtgcatattgttgggatgtggaaactggtaaattaaaaatggtattcaaggggcactca 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 686  tgtgcatattgttgggatgtggaaactggtaaattaaaaatggtattcaaggggcactca 745

                                                                        
Query: 601  gactacttgcattgtatagttgctcgcaacacttataatcagattataacagggtcagag 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 746  gactacttgcattgtatagttgctcgcaacacttataatcagattataacagggtcagag 805

                                                                        
Query: 661  gatgggaccgcacgaatttgggattgcaaaagtgggaagtgtatccaactgattaatcca 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 806  gatgggaccgcacgaatttgggattgcaaaagtgggaagtgtatccaactgattaatcca 865

                                                                        
Query: 721  gcaaaacatttgaagttaaaaggatctgtttcatgcattggctgtattgctttggatgca 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 866  gcaaaacatttgaagttaaaaggatctgtttcatgcattggctgtattgctttggatgca 925

                                                                        
Query: 781  agtgagagctggttggcttgcagtagtggacggaatatatcactttggaatcttcctgca 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 926  agtgagagctggttggcttgcagtagtggacggaatatatcactttggaatcttcctgca 985

                                                                        
Query: 841  tcagagtgtgtatcaaagatttcaactcgtgcttctgtacaggacatgttatttgacaat 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 986  tcagagtgtgtatcaaagatttcaactcgtgcttctgtacaggacatgttatttgacaat 1045

                                                                        
Query: 901  aatcaaattttgacagttggtgccgatcctcttctcaatcgctttgacatgaatggtgcg 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1046 aatcaaattttgacagttggtgccgatcctcttctcaatcgctttgacatgaatggtgcg 1105

                                                                        
Query: 961  atcctttcacaaatacagtgtgctccaccatcagctttttctatctccttaaacccagct 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1106 atcctttcacaaatacagtgtgctccaccatcagctttttctatctccttaaacccagct 1165

                                                                        
Query: 1021 ggggttatggcagttggaggttatggatgtcttgtggatgtaatctcacaatttggcagc 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1166 ggggttatggcagttggaggttatggatgtcttgtggatgtaatctcacaatttggcagc 1225

                                             
Query: 1081 cacatgtgcacatttcattgtcgatgtatttag 1113
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1226 cacatgtgcacatttcattgtcgatgtatttag 1258


>gnl|LJGI|GO015456 similar to UniRef100_A7PE48 Cluster: Chromosome chr11 scaffold_13,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr11 scaffold_13, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (50%)
          Length = 831

 Score =  841 bits (424), Expect = 0.0
 Identities = 430/432 (99%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                        
Query: 682  gattgcaaaagtgggaagtgtatccaactgattaatccagcaaaacatttgaagttaaaa 741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 624  gattgcaaaagtgggaagtgtatccaactgattaatccagcaaaacatttgaagttaaaa 565

                                                                        
Query: 742  ggatctgtttcatgcattggctgtattgctttggatgcaagtgagagctggttggcttgc 801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 564  ggatctgtttcatgcattggctgtattgctttggatgcaagtgagagctggttggcttgc 505

                                                                        
Query: 802  agtagtggacggaatatatcactttggaatcttcctgcatcagagtgtgtatcaaagatt 861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 504  agtagtggacggaatatatcactttggaatcttcctgcatcagagtgtgtatcaaagatt 445

                                                                        
Query: 862  tcaactcgtgcttctgtacaggacatgttatttgacaataatcaaattttgacagttggt 921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 444  tcaactcgtgcttctgtacaggacatgttatttgacaataatcaaattttgacagttggt 385

                                                                        
Query: 922  gccgatcctcttctcaatcgctttgacatgaatggtgcgatcctttcacaaatacagtgt 981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 384  gccgatcctcttctcaatcgctttgacatgaatggtgcgatcctttcacgaatacagtgt 325

                                                                        
Query: 982  gctccaccatcagctttttctatctccttaaacccagctggggttatggcagttggaggt 1041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 324  gctccaccatcagctttttctatctccttaaacccagctggggttatggtagttggaggt 265

                                                                        
Query: 1042 tatggatgtcttgtggatgtaatctcacaatttggcagccacatgtgcacatttcattgt 1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264  tatggatgtcttgtggatgtaatctcacaatttggcagccacatgtgcacatttcattgt 205

                        
Query: 1102 cgatgtatttag 1113
            ||||||||||||
Sbjct: 204  cgatgtatttag 193



 Score =  418 bits (211), Expect = e-116
 Identities = 211/211 (100%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 435 tcctcagcagaaaggtccttggggtgcactttcacctatccctgagaataatgctattgc 494
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 831 tcctcagcagaaaggtccttggggtgcactttcacctatccctgagaataatgctattgc 772

                                                                       
Query: 495 tgttaatactcaggggggatctatttttgctgcttctggtgattcctgtgcatattgttg 554
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 771 tgttaatactcaggggggatctatttttgctgcttctggtgattcctgtgcatattgttg 712

                                                                       
Query: 555 ggatgtggaaactggtaaattaaaaatggtattcaaggggcactcagactacttgcattg 614
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 711 ggatgtggaaactggtaaattaaaaatggtattcaaggggcactcagactacttgcattg 652

                                          
Query: 615 tatagttgctcgcaacacttataatcagatt 645
           |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 651 tatagttgctcgcaacacttataatcagatt 621