Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v2120600.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v2120600.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1LEV4|I1LEV4_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.49399
PE,91.69,0,tRNA-synt_1c,Glutamyl/glutaminyl-tRNA synthetase, class Ib,
catalytic domain; tRNA_synt_1c_R1,Glutam,CUFF.50289.1
(2349 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC71669 homologue to UniRef100_P52780 Cluster: Glutamin... 1398 0.0
gnl|LJGI|TC62586 similar to UniRef100_P52780 Cluster: Glutaminyl... 1287 0.0
gnl|LJGI|FS359327 similar to UniRef100_P52780 Cluster: Glutaminy... 1176 0.0
gnl|LJGI|TC71076 similar to UniRef100_P52780 Cluster: Glutaminyl... 959 0.0
>gnl|LJGI|TC71669 homologue to UniRef100_P52780 Cluster: Glutaminyl-tRNA synthetase;
n=1; Lupinus luteus|Rep: Glutaminyl-tRNA synthetase -
Lupinus luteus (European yellow lupin), partial (33%)
Length = 777
Score = 1398 bits (705), Expect = 0.0
Identities = 715/717 (99%), Gaps = 1/717 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1011 taagattacttatacaagtgattatttccaagaattgtatgagttagcagtggagctcat 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 taagattacttatacaagtgattatttccaagaattgtatgagttagcagtggagctcat 120
Query: 1071 aagaaagggccatgcttatgttgatcatcagactccggatgagataaaggagtacagaga 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aagaaagggccatgcttatgttgatcatcagactccggatgagataaaggagtacagaga 180
Query: 1131 gaagaaattgaacagtccttggagagacagaccaatatcagaatctctgaaactctttga 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gaagaaattgaacagtccttggagagacagaccaatatcagaatctctgaaactctttga 240
Query: 1191 ggatatgaggcgcggtcttatagacgaaggaaaagccacacttagaatgaagcaagacat 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ggatatgaggcgcggtcttatagacgaaggaaaagccacacttagaatgaagcaagacat 300
Query: 1251 gcagagcgataattacaatatgtatgaccttattgcataccgaattaagtttacaccaca 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gcagagcgataattacaatatgtatgaccttattgcataccgaattaagtttacaccaca 360
Query: 1311 ccctcatgctggagacaaatggtgtatctatccaagttatgattatgctcactgcattgt 1370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 361 ccctcatgctggagacaaatggtgtatctatccaagttatgattatgctcactgcattat 420
Query: 1371 ggattccctagagaatatcacacattcactgtgtacactggaatttgagacacgtcgtgc 1430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggattccctagagaatatcacacattcactgtgtacactggaatttgagacacgtcgtgc 480
Query: 1431 gtcatactattggttgttgcatgcattagacatttaccaaccttatgtatgggaatattc 1490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gtcatactattggttgttgcatgcattagacatttaccaaccttatgtatgggaatattc 540
Query: 1491 aaggttgaatgtctctaacacagttatgtcgaagcgtaagctaaaccgtctagttacaga 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aaggttgaatgtctctaacacagttatgtcgaagcgtaagctaaaccgtctagttacaga 600
Query: 1551 gaagtgggttgatgggtgggatgatcctcggctgatgacactagctgggttgc-ggcgta 1609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 601 gaagtgggttgatgggtgggatgatcctcggctgatgacactagctgggttgcgggcgta 660
Query: 1610 gaggtttcacttcaacagcgatcaactcttttgtccgaggaattggaatcactagaagtg 1669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gaggtttcacttcaacagcgatcaactcttttgtccgaggaattggaatcactagaagtg 720
Query: 1670 atggcactttgatatctgtggaacgccttgaatatcatgttagggaagaattgaaca 1726
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 atggcactttgatatctgtggaacgccttgaatatcatgttagggaagaattgaaca 777
Score = 123 bits (62), Expect = 5e-27
Identities = 65/66 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 692 ctaatccggaggaaaatttaaaggtgcatactgaagtaccttttagtgatggtagtattc 751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ctaatccggaggaaaatttaaaggtgcatactgaagtaccttttagtgatggtagtattc 60
Query: 752 tgagat 757
| ||||
Sbjct: 61 taagat 66
>gnl|LJGI|TC62586 similar to UniRef100_P52780 Cluster: Glutaminyl-tRNA synthetase;
n=1; Lupinus luteus|Rep: Glutaminyl-tRNA synthetase -
Lupinus luteus (European yellow lupin), partial (26%)
Length = 765
Score = 1287 bits (649), Expect = 0.0
Identities = 649/649 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgccgaccaaggaagataacgccgagaaggagaagtgcttcgagctctttctcaagatc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 117 atgccgaccaaggaagataacgccgagaaggagaagtgcttcgagctctttctcaagatc 176
Query: 61 ggcttggacgaacgcaccgcccgtaacaccgtcgccaacaacaaagtcaccaccaatctc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 177 ggcttggacgaacgcaccgcccgtaacaccgtcgccaacaacaaagtcaccaccaatctc 236
Query: 121 acctccgtcatcaccgaggctggtgttgccgatgggtgtagcagaacggttggaaatctg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 237 acctccgtcatcaccgaggctggtgttgccgatgggtgtagcagaacggttggaaatctg 296
Query: 181 ctttacacggctgcgacgaagtaccctggaaatgcgttgcctcatcgcccgacgctgctt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 297 ctttacacggctgcgacgaagtaccctggaaatgcgttgcctcatcgcccgacgctgctt 356
Query: 241 cagtacgttgtttcgtcgaaggtgaaaacaactgcgcagttagatgcagcattatctttt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 357 cagtacgttgtttcgtcgaaggtgaaaacaactgcgcagttagatgcagcattatctttt 416
Query: 301 cttgctgccacgggttcggagagtcttgatttgaataagtttgaagaagcttgtggtgtt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 417 cttgctgccacgggttcggagagtcttgatttgaataagtttgaagaagcttgtggtgtt 476
Query: 361 ggtgttgaggtttccacagatgatatcaagcatgctgttaatgaagttgttgaggagaac 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 477 ggtgttgaggtttccacagatgatatcaagcatgctgttaatgaagttgttgaggagaac 536
Query: 421 aaggctacaattttggagctgcgttatcgaacaaatgttggtgagttacttgggcatgtg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 537 aaggctacaattttggagctgcgttatcgaacaaatgttggtgagttacttgggcatgtg 596
Query: 481 cggaagaggctcccatggggtgatgcaaaagttgcaaagcaactttttgatgcaaaacta 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 597 cggaagaggctcccatggggtgatgcaaaagttgcaaagcaactttttgatgcaaaacta 656
Query: 541 tatgagcttcttggtgataggacagcagcagatgatgaaaagccttcaaaaaagaagaag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 657 tatgagcttcttggtgataggacagcagcagatgatgaaaagccttcaaaaaagaagaag 716
Query: 601 gagaaacctgctaaagtggaggataaggcagcacctgttgtgactgctg 649
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 717 gagaaacctgctaaagtggaggataaggcagcacctgttgtgactgctg 765
>gnl|LJGI|FS359327 similar to UniRef100_P52780 Cluster: Glutaminyl-tRNA synthetase; n=1;
Lupinus luteus|Rep: Glutaminyl-tRNA synthetase - Lupinus
luteus (European yellow lupin), partial (26%)
Length = 731
Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0
Identities = 593/593 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1757 atccactcaaggttgttattactaaccttgaagccaactcagcaattgaggttgatgcca 1816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 731 atccactcaaggttgttattactaaccttgaagccaactcagcaattgaggttgatgcca 672
Query: 1817 agaaatggcctgatgctcaagctgatgatccatctgctttctacaagattccattttcga 1876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 671 agaaatggcctgatgctcaagctgatgatccatctgctttctacaagattccattttcga 612
Query: 1877 atgttgtatatattgaacgctcggattttcggatgcaagattcaaaagattattatggcc 1936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 611 atgttgtatatattgaacgctcggattttcggatgcaagattcaaaagattattatggcc 552
Query: 1937 ttgctcccggtaaatctgtgatcctcagatatgcatttcctataaagtgcactgaagtta 1996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 551 ttgctcccggtaaatctgtgatcctcagatatgcatttcctataaagtgcactgaagtta 492
Query: 1997 ttctagctgaagataatgagactattgtagaaattcgggctgagtatgatccttcaaaga 2056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 491 ttctagctgaagataatgagactattgtagaaattcgggctgagtatgatccttcaaaga 432
Query: 2057 agacaaagcctaagggtgttctccattgggttgctcaaccttcttccggagttgagccgt 2116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 431 agacaaagcctaagggtgttctccattgggttgctcaaccttcttccggagttgagccgt 372
Query: 2117 taaaggtggaagtcaggctgtttgagaggcttttcctatcagagaatcccgctgaacttg 2176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 371 taaaggtggaagtcaggctgtttgagaggcttttcctatcagagaatcccgctgaacttg 312
Query: 2177 aaaactggctcggcgacctaaaccctcattccaaagtcgtaattccaaatgcatatggtg 2236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 311 aaaactggctcggcgacctaaaccctcattccaaagtcgtaattccaaatgcatatggtg 252
Query: 2237 ggtcttcactccagggttccaaagttggggacagtttccaatttgaaagattaggctatt 2296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 251 ggtcttcactccagggttccaaagttggggacagtttccaatttgaaagattaggctatt 192
Query: 2297 tcgtggtcgacaaggactctagttcagagaagcttgtttttaataggacggtc 2349
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 tcgtggtcgacaaggactctagttcagagaagcttgtttttaataggacggtc 139
>gnl|LJGI|TC71076 similar to UniRef100_P52780 Cluster: Glutaminyl-tRNA synthetase; n=1;
Lupinus luteus|Rep: Glutaminyl-tRNA synthetase - Lupinus
luteus (European yellow lupin), partial (22%)
Length = 819
Score = 959 bits (484), Expect = 0.0
Identities = 487/488 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1862 agattccattttcgaatgttgtatatattgaacgctcggattttcggatgcaagattcaa 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 37 agattccattttcgaatgttgtatatattgaacgctcggattttcggatgcaagattcaa 96
Query: 1922 aagattattatggccttgctcccggtaaatctgtgatcctcagatatgcatttcctataa 1981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 97 aagattattatggccttgctcccggtaaatctgtgatcctcagatatgcatttcctataa 156
Query: 1982 agtgcactgaagttattctagctgaagataatgagactattgtagaaattcgggctgagt 2041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 157 agtgcactgaagttattctagctgaagataatgagactattgtagaaattcgggctgagt 216
Query: 2042 atgatccttcaaagaagacaaagcctaagggtgttctccattgggttgctcaaccttctt 2101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 217 atgatccttcaaagaagacaaagcctaagggtgttctccattgggttgctcaaccttctt 276
Query: 2102 ccggagttgagccgttaaaggtggaagtcaggctgtttgagaggcttttcctatcagaga 2161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 277 ccggagttgagccgttaaaggtggaagtcaggctgtttgagaggcttttcctatcagaga 336
Query: 2162 atcccgctgaacttgaaaactggctcggcgacctaaaccctcattccaaagtcgtaattc 2221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 337 atcccgctgaacttgaaaactggctcggcgacctaaaccctcattccaaagtcgtaattc 396
Query: 2222 caaatgcatatggtgggtcttcactccagggttccaaagttggggacagtttccaatttg 2281
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 397 caaatgcatatggtgggtcttcactccagggttccaaagttggggacagtttcccatttg 456
Query: 2282 aaagattaggctatttcgtggtcgacaaggactctagttcagagaagcttgtttttaata 2341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 457 aaagattaggctatttcgtggtcgacaaggactctagttcagagaagcttgtttttaata 516
Query: 2342 ggacggtc 2349
||||||||
Sbjct: 517 ggacggtc 524