Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v2093720.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v2093720.1 gi|36957232|gb|AY316741.1|.path1.1
(837 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC79954 UniRef100_Q6W2J1 Cluster: VDAC3.1; n=1; Lotus j... 1659 0.0
gnl|LJGI|TC72526 UniRef100_Q6W2J1 Cluster: VDAC3.1; n=1; Lotus j... 1203 0.0
gnl|LJGI|TC68473 UniRef100_Q6W2J1 Cluster: VDAC3.1; n=1; Lotus j... 948 0.0
>gnl|LJGI|TC79954 UniRef100_Q6W2J1 Cluster: VDAC3.1; n=1; Lotus japonicus|Rep: VDAC3.1
- Lotus japonicus, complete
Length = 1403
Score = 1659 bits (837), Expect = 0.0
Identities = 837/837 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctaatggtccagcgctgtatcctgagattggcaaaagggcaagagacctcttgtac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 332 atggctaatggtccagcgctgtatcctgagattggcaaaagggcaagagacctcttgtac 391
Query: 61 aaggattataactttgatcaaaagtttaacctgtcaattccaagctccactggattgggc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 392 aaggattataactttgatcaaaagtttaacctgtcaattccaagctccactggattgggc 451
Query: 121 cttatagctacagggttgaagaaggatcaaattttcattggtgacataaatacgctttac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 452 cttatagctacagggttgaagaaggatcaaattttcattggtgacataaatacgctttac 511
Query: 181 aagagtgggaatcttactgtggatgtgaaagttgatacatactctaatgtatcgacaaaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 512 aagagtgggaatcttactgtggatgtgaaagttgatacatactctaatgtatcgacaaaa 571
Query: 241 gtgactttgaatgatatcttccgttgtaaaaaagtagctttgagcttcaatatacctgat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 572 gtgactttgaatgatatcttccgttgtaaaaaagtagctttgagcttcaatatacctgat 631
Query: 301 cacaagtcaggaaagctggatgtgcagtatcttcatcctcatgcagccattgattcgagt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 632 cacaagtcaggaaagctggatgtgcagtatcttcatcctcatgcagccattgattcgagt 691
Query: 361 attggcttgaatccatcccctcaattggagctttcaactgcaattggcagcaaagatctt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 692 attggcttgaatccatcccctcaattggagctttcaactgcaattggcagcaaagatctt 751
Query: 421 tgtatgggtgctgaagttggattcaatacaacttctgcttcgttcacaaaatataatgct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 752 tgtatgggtgctgaagttggattcaatacaacttctgcttcgttcacaaaatataatgct 811
Query: 481 ggaattaccttcaatagaccagatttctctgcagcgctcatgctggttgataaaggaaag 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 812 ggaattaccttcaatagaccagatttctctgcagcgctcatgctggttgataaaggaaag 871
Query: 541 tccctgaaagcatcttacattcatcatgtggatcgccctgatggatttacagttgctgct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 872 tccctgaaagcatcttacattcatcatgtggatcgccctgatggatttacagttgctgct 931
Query: 601 gaaatcaatcacaggttttcctcctttgagaacagatttacaattgggagctcacagtta 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 932 gaaatcaatcacaggttttcctcctttgagaacagatttacaattgggagctcacagtta 991
Query: 661 atagatccaaacacagttctcaagactcgattcagcgatgatggcaaagccgccttccta 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 992 atagatccaaacacagttctcaagactcgattcagcgatgatggcaaagccgccttccta 1051
Query: 721 tgccaacgagcatggaggccgaaatcacttataaccctctctgctgaatatgactccacc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1052 tgccaacgagcatggaggccgaaatcacttataaccctctctgctgaatatgactccacc 1111
Query: 781 aagatctttggttcatccaccaagctcggtcttgccctcgctctccagccttaacct 837
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1112 aagatctttggttcatccaccaagctcggtcttgccctcgctctccagccttaacct 1168
>gnl|LJGI|TC72526 UniRef100_Q6W2J1 Cluster: VDAC3.1; n=1; Lotus japonicus|Rep:
VDAC3.1 - Lotus japonicus, partial (75%)
Length = 798
Score = 1203 bits (607), Expect = 0.0
Identities = 623/627 (99%), Gaps = 1/627 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctaatggtccagcgctgtatcctgagattggcaaaagggcaagagacctcttgtac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 172 atggctaatggtccagcgctgtatcctgagattggcaaaagggcaagagacctcttgtac 231
Query: 61 aaggattataactttgatcaaaagtttaacctgtcaattccaagctccactggattgggc 120
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 232 aaggattataacttcgatcaaaagtttaacctgtcaattccaagctccactggattgggc 291
Query: 121 cttatagctacagggttgaagaaggatcaaattttcattggtgacataaatacgctttac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292 cttatagctacagggttgaagaaggatcaaattttcattggtgacataaatacgctttac 351
Query: 181 aagagtgggaatcttactgtggatgtgaaagttgatacatactctaatgtatcgacaaaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 352 aagagtgggaatcttactgtggatgtgaaagttgatacatactctaatgtatccacaaaa 411
Query: 241 gtgactttgaatgatatcttccgttgtaaaa-aagtagctttgagcttcaatatacctga 299
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 412 gtgactttgaatgatatcttccgttgtaaaaaaagtagctttgagcttcaatatacctga 471
Query: 300 tcacaagtcaggaaagctggatgtgcagtatcttcatcctcatgcagccattgattcgag 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 472 tcacaagtcaggaaagctggatgtgcagtatcttcatcctcatgcagccattgattcgag 531
Query: 360 tattggcttgaatccatcccctcaattggagctttcaactgcaattggcagcaaagatct 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 tattggcttgaatccatcccctcaattggagctttcaactgcaattggcagcaaagatct 591
Query: 420 ttgtatgggtgctgaagttggattcaatacaacttctgcttcgttcacaaaatataatgc 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 592 ttgtatgggtgctgaagttggattcaatacaacttctgcttcgttcacaaaatataatgc 651
Query: 480 tggaattaccttcaatagaccagatttctctgcagcgctcatgctggttgataaaggaaa 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 652 tggaattaccttcaatagaccagatttctctgcagcgctcatgctggttgataaaggaaa 711
Query: 540 gtccctgaaagcatcttacattcatcatgtggatcgccctgatggatttacagttgctgc 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 712 gtccctgaaagcatcttacattcatcatgtggatcgccctgatggatttacagttgctgc 771
Query: 600 tgaaatcaatcacaggttttcctcctt 626
|||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 772 tgaaatcaatcacaggctttcctcctt 798
>gnl|LJGI|TC68473 UniRef100_Q6W2J1 Cluster: VDAC3.1; n=1; Lotus japonicus|Rep:
VDAC3.1 - Lotus japonicus, partial (96%)
Length = 1132
Score = 948 bits (478), Expect = 0.0
Identities = 481/482 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctaatggtccagcgctgtatcctgagattggcaaaagggcaagagacctcttgtac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 163 atggctaatggtccagcgctgtatcctgagattggcaaaagggcaagagacctcttgtac 222
Query: 61 aaggattataactttgatcaaaagtttaacctgtcaattccaagctccactggattgggc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 223 aaggattataactttgatcaaaagtttaacctgtcaattccaagctccactggattgggc 282
Query: 121 cttatagctacagggttgaagaaggatcaaattttcattggtgacataaatacgctttac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 283 cttatagctacagggttgaagaaggatcaaattttcattggtgacataaatacgctttac 342
Query: 181 aagagtgggaatcttactgtggatgtgaaagttgatacatactctaatgtatcgacaaaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 343 aagagtgggaatcttactgtggatgtgaaagttgatacatactctaatgtatccacaaaa 402
Query: 241 gtgactttgaatgatatcttccgttgtaaaaaagtagctttgagcttcaatatacctgat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 403 gtgactttgaatgatatcttccgttgtaaaaaagtagctttgagcttcaatatacctgat 462
Query: 301 cacaagtcaggaaagctggatgtgcagtatcttcatcctcatgcagccattgattcgagt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 463 cacaagtcaggaaagctggatgtgcagtatcttcatcctcatgcagccattgattcgagt 522
Query: 361 attggcttgaatccatcccctcaattggagctttcaactgcaattggcagcaaagatctt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 523 attggcttgaatccatcccctcaattggagctttcaactgcaattggcagcaaagatctt 582
Query: 421 tgtatgggtgctgaagttggattcaatacaacttctgcttcgttcacaaaatataatgct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 583 tgtatgggtgctgaagttggattcaatacaacttctgcttcgttcacaaaatataatgct 642
Query: 481 gg 482
||
Sbjct: 643 gg 644
Score = 630 bits (318), Expect = e-180
Identities = 318/318 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 520 atgctggttgataaaggaaagtccctgaaagcatcttacattcatcatgtggatcgccct 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 638 atgctggttgataaaggaaagtccctgaaagcatcttacattcatcatgtggatcgccct 697
Query: 580 gatggatttacagttgctgctgaaatcaatcacaggttttcctcctttgagaacagattt 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 698 gatggatttacagttgctgctgaaatcaatcacaggttttcctcctttgagaacagattt 757
Query: 640 acaattgggagctcacagttaatagatccaaacacagttctcaagactcgattcagcgat 699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 758 acaattgggagctcacagttaatagatccaaacacagttctcaagactcgattcagcgat 817
Query: 700 gatggcaaagccgccttcctatgccaacgagcatggaggccgaaatcacttataaccctc 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 818 gatggcaaagccgccttcctatgccaacgagcatggaggccgaaatcacttataaccctc 877
Query: 760 tctgctgaatatgactccaccaagatctttggttcatccaccaagctcggtcttgccctc 819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 878 tctgctgaatatgactccaccaagatctttggttcatccaccaagctcggtcttgccctc 937
Query: 820 gctctccagccttaacct 837
||||||||||||||||||
Sbjct: 938 gctctccagccttaacct 955