Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v1947710.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v1947710.1 CUFF.50048.1
(1191 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC58674 similar to UniRef100_A7QTL1 Cluster: Chromosome... 1968 0.0
gnl|LJGI|FS321232 homologue to UniRef100_A7QTL1 Cluster: Chromos... 1134 0.0
>gnl|LJGI|TC58674 similar to UniRef100_A7QTL1 Cluster: Chromosome chr11 scaffold_170,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr11 scaffold_170, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (74%)
Length = 1162
Score = 1968 bits (993), Expect = 0.0
Identities = 1007/1014 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtcatccgagatcgaggtcgtcgacgacgacgaggtgcaccagtcccgcggcaacgac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 149 atgtcatccgagatcgaggtcgtcgacgacgacgaggtgcaccagtcccgcggcaacgac 208
Query: 61 gatcaccagcaaccgtcatcatcgtcctcccccgccgaggagacactccgcaatgacgtc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 209 gatcaccagcaaccgtcatcatcgtcctcccccgccgaggagacactccgcaatgacgtc 268
Query: 121 tacaccgccgcggcttatggcgatttggagaagctacagagattggtcgagcatgatggt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 269 tacaccgccgcggcttatggcgatttggagaagctacagagattggtcgagcatgatggt 328
Query: 181 tgccctgtctccgagcctgatggcttgggttactacgcgcttcagtgggctgctctcaat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 329 tgccctgtctccgagcctgatggcttgggttactacgcgcttcagtgggctgctctcaat 388
Query: 241 aaccgcgctgccgctgctcagtacatcattgagcatgggggagatgtaaatgccacagat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 389 aaccgcgctgccgctgctcagtacatcattgagcatgggggagatgtaaatgccacagat 448
Query: 301 catactggccagacagctctacattggagtgcggttcggggtgctatccaggtagcggag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 449 catactggccagacagctctacattggagtgcggttcggggtgctatccaggtagcggag 508
Query: 361 cttttactccaagagggtgctcgagtgaatgctgccgacatgaatgggtatcagacaaca 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 509 cttttactccaagagggtgctcgagtgaatgctgccgacatgaatgggtatcagacaaca 568
Query: 421 catgttgctgctcaatatggtcagacagcttacctttaccatgttgtttccaaatggaat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 569 catgttgctgctcaatatggtcagacagcttacctttaccatgttgtttccaaatggaat 628
Query: 481 gctgatcctgatgttcctgataatgatgggagaagccccttgcactgggctgcttacaaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 629 gctgatcctgatgttcctgataatgatgggagaagccccttgcactgggctgcttacaaa 688
Query: 541 ggttttgccgatagtatacgccttctcttatttcttgatgcacataggggacgccaggat 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 689 ggttttgccgatagtatacgccttctcttatttcttgatgcacataggggacgccaggat 748
Query: 601 aaagagggttgtactcctcttcattgggctgctattaggggtaacttagaggcctgtact 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 749 aaagagggttgtactcctcttcattgggctgctattaggggtaacttagaggcctgtact 808
Query: 661 gtgttagtacaggctggcaaaaaggaagacttgatggtgactgataatactggccttaca 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 809 gtgttagtacaggctggcaaaaaggaagacttgatggtgactgataatactggccttaca 868
Query: 721 ccagcccagcttgcttctgataagaatcacagacaagttgcatttttccttggaaatgcc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 869 ccagcccagcttgcttctgataagaatcacagacaagttgcatttttccttggaaatgcc 928
Query: 781 cgaaggctgctcgacaaacgttgtgatgggaacacccgccttgggaagatagctaaatta 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 929 cgaaggctgctcgacaaacgttgtgatgggaacacccgccttgggaagatagctaaatta 988
Query: 841 ggacttgctcctgtactttggttcataannnnnnngctcttggtcacctatattaattca 900
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 989 ggacttgctcctgtactttggttcataatttttttgctcttggtcacctatattaattca 1048
Query: 901 gtcatcttggcatcaaatatgccaaagctgacagctgcagctggccttcttgcatggttt 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1049 gtcatcttggcatcaaatatgccaaagctgacagctgcagctggccttcttgcatggttt 1108
Query: 961 ggagtgttacttgcaactgctggattggtgatgttttacaagtgtagcagcaag 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1109 ggagtgttacttgcaactgctggattggtgatgttttacaagtgtagcagcaag 1162
>gnl|LJGI|FS321232 homologue to UniRef100_A7QTL1 Cluster: Chromosome chr11
scaffold_170, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome chr11 scaffold_170, whole
genome shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape),
partial (42%)
Length = 760
Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0
Identities = 604/617 (97%), Gaps = 12/617 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtcatccgagatcgaggtcgtcgacgacgacgaggtgcaccagtcccgcggcaacgac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 144 atgtcatccgagatcgaggtcgtcgacgacgacgaggtgcaccagtcccgcggcaacgac 203
Query: 61 gatcaccagcaaccgtcatcatcgtcctcccccgccgaggagacactccgcaatgacgtc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 204 gatcaccagcaaccgtcatcatcgtcctcccccgccgaggagacactccgcaatgacgtc 263
Query: 121 tacaccgccgcggcttatggcgatttggagaagctacagagattggtcgagcatgatggt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264 tacaccgccgcggcttatggcgatttggagaagctacagagattggtcgagcatgatggt 323
Query: 181 tgccctgtctccgagcctgatggcttgggttactacgcgcttcagtgggctgctctcaat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 324 tgccctgtctccgagcctgatggcttgggttactacgcgcttcagtgggctgctctcaat 383
Query: 241 aaccgcgctgccgctgctcagtacatcattgag------------catgggggagatgta 288
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 384 aaccgcgctgccgctgctcagtacatcattgaggttctttgatcgcatgggggagatgta 443
Query: 289 aatgccacagatcatactggccagacagctctacattggagtgcggttcggggtgctatc 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 444 aatgccacagatcatactggccagacagctctacattggagtgcggttcggggtgctatc 503
Query: 349 caggtagcggagcttttactccaagagggtgctcgagtgaatgctgccgacatgaatggg 408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 504 caggtagcggagcttttactccaagagggtgctcgagtgaatgctgccgacatgaatggg 563
Query: 409 tatcagacaacacatgttgctgctcaatatggtcagacagcttacctttaccatgttgtt 468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 564 tatcagacaacacatgttgctgctcaatatggtcagacagcttacctttaccatgttgtt 623
Query: 469 tccaaatggaatgctgatcctgatgttcctgataatgatgggagaagccccttgcactgg 528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 624 tccaaatggaatgctgatcctgatgttcctgataatgatgggagaagccccttgcactgg 683
Query: 529 gctgcttacaaaggttttgccgatagtatacgccttctcttatttcttgatgcacatagg 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 684 gctgcttacaaaggttttgccgatagtatacgccttctcttatttcttgatacacatagg 743
Query: 589 ggacgccaggataaaga 605
|||||||||||||||||
Sbjct: 744 ggacgccaggataaaga 760