Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v1687570.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v1687570.1 tr|Q39889|Q39889_SOYBN Heat shock protein
OS=Glycine max GN=SB100 PE=2 SV=1,92.67,0,P-loop containing nucleoside
triphosphate hydrolases,NULL; Double Clp-N motif,NULL;
CLPPROTEASEA,Cha,CUFF.49608.1
(2733 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC71141 homologue to UniRef100_Q39889 Cluster: Heat sho... 2694 0.0
gnl|LJGI|TC65961 homologue to UniRef100_Q39889 Cluster: Heat sho... 1540 0.0
gnl|LJGI|BP067290 homologue to UniRef100_Q39889 Cluster: Heat sh... 315 8e-85
>gnl|LJGI|TC71141 homologue to UniRef100_Q39889 Cluster: Heat shock protein; n=1;
Glycine max|Rep: Heat shock protein - Glycine max
(Soybean), partial (50%)
Length = 1718
Score = 2694 bits (1359), Expect = 0.0
Identities = 1362/1363 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1371 acctctgatgatgaagtatagaaaagagaaggagagggttgatgagattcgaaggctcaa 1430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 9 acctctgatgatgaagtatagaaaagagaaggagagggttgatgagattcgaaggctcaa 68
Query: 1431 gcagaaaagagaagagcttctctttgctgcacaagaggctgaaagacgatacgatctagc 1490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69 gcagaaaagagaagagcttctctttgctgcacaagaggctgaaagacgatacgatctagc 128
Query: 1491 cagagctgctgacctgcgatatggtgcaattcaagaggtggaatctgcaattcagcagct 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129 cagagctgctgacctgcgatatggtgcaattcaagaggtggaatctgcaattcagcagct 188
Query: 1551 cgaagggagcactgatcaggagaacttaatgttgacagaaactgttggtccagatcaaat 1610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189 cgaagggagcactgatcaggagaacttaatgttgacagaaactgttggtccagatcaaat 248
Query: 1611 atctgaggttgtgagccgctggaccggtattccagtgacaaggcttggccaaaatgagaa 1670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 atctgaggttgtgagccgctggaccggtattccagtgacaaggcttggccaaaatgagaa 308
Query: 1671 agaaaggttgattggacttggtgatagactgcacaacagagttgtagggcaagaccaggc 1730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309 agaaaggttgattggacttggtgatagactgcacaacagagttgtagggcaagaccaggc 368
Query: 1731 tgttaatgctgttgctgaggctgtattgagatcaagagctggactcgggagacctcaaca 1790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 369 tgttaatgctgttgctgaggctgtattgagatcaagagctggactcgggagacctcaaca 428
Query: 1791 accaactggttcattcctgtttttgggtccaactggtgttggcaaaactgaacttgcaaa 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429 accaactggttcattcctgtttttgggtccaactggtgttggcaaaactgaacttgcaaa 488
Query: 1851 ggctcttgctgagcaactgtttgatgatgaaaaccagttggtgaggattgacatgtctga 1910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 ggctcttgctgagcaactgtttgatgatgaaaaccagttggtgaggattgacatgtctga 548
Query: 1911 atacatggaacagcattctgtctcaagactgattggtgcaccaccagggtatgttggaca 1970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549 atacatggaacagcattctgtctcaagactgattggtgcaccaccagggtatgttggaca 608
Query: 1971 tgaggaaggtggtcagttaactgaagcagtgaggcgtaggccttacagtgtggtactttt 2030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609 tgaggaaggtggtcagttaactgaagcagtgaggcgtaggccttacagtgtggtactttt 668
Query: 2031 tgatgaagtggaaaaggcacacacatctgttttcaatacacttcttcaagttttggatga 2090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669 tgatgaagtggaaaaggcacacacatctgttttcaatacacttcttcaagttttggatga 728
Query: 2091 tggaagattaactgatgggcaaggccgtactgtggacttcagaaacactgtcgttatcat 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729 tggaagattaactgatgggcaaggccgtactgtggacttcagaaacactgtcgttatcat 788
Query: 2151 gacctcaaaccttggagcagagcacctcctaagtggactttcaggaaaatgttccatgca 2210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789 gacctcaaaccttggagcagagcacctcctaagtggactttcaggaaaatgttccatgca 848
Query: 2211 agttgctcgtgataaagtaatgcaggaggtgagaaagcattttaggccagaattgttgaa 2270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849 agttgctcgtgataaagtaatgcaggaggtgagaaagcattttaggccagaattgttgaa 908
Query: 2271 tcggcttgatgagattgtagtgtttgatcctctttcacatgagcaattgaggaaggttgc 2330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909 tcggcttgatgagattgtagtgtttgatcctctttcacatgagcaattgaggaaggttgc 968
Query: 2331 aaggttacaaatgaaggaggttgctagtagacttgctgagagaggaatagccatggcagt 2390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969 aaggttacaaatgaaggaggttgctagtagacttgctgagagaggaatagccatggcagt 1028
Query: 2391 aacagatgcagcattagattatatacttgctgagagctatgatcctgtttatggtgctag 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 aacagatgcagcattagattatatacttgctgagagctatgatcctgtttatggtgctag 1088
Query: 2451 accaattaggaggtggcttgagaggaaagtggtgacagagctttccagaatgcttataag 2510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 accaattaggaggtggcttgagaggaaagtggtgacagagctttccagaatgcttataag 1148
Query: 2511 ggatgaaattgatgagaactcaacagtgtacatcgatgctggcaccaagggtagtgagtt 2570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 ggatgaaattgatgagaactcaacagtgtacatcgatgctggcaccaagggtagtgagtt 1208
Query: 2571 ggtctaccgtgtagagaagaatggtgggctggttaatgctgcaactggtcagaagtctga 2630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1209 ggtctaccgtgtagagaagaatggtgggctggttaatgctgcaactggtcagaagtctga 1268
Query: 2631 tatcttgattcagatacctaatggaccaaaaagtgatgctgctcaagctgtgaagaagat 2690
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1269 tatcttgattcagatacctaatggacccaaaagtgatgctgctcaagctgtgaagaagat 1328
Query: 2691 gaggattgaggaaattgatgatggtgagatggaagagtgaatt 2733
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1329 gaggattgaggaaattgatgatggtgagatggaagagtgaatt 1371
>gnl|LJGI|TC65961 homologue to UniRef100_Q39889 Cluster: Heat shock protein; n=1;
Glycine max|Rep: Heat shock protein - Glycine max
(Soybean), partial (28%)
Length = 1036
Score = 1540 bits (777), Expect = 0.0
Identities = 799/804 (99%), Gaps = 3/804 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgaatcctgacaaattcacccacaagacaaatgaagctcttgctggggctcatgaactg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 236 atgaatcctgacaaattcacccacaagacaaatgaagctcttgctggggctcatgaactg 295
Query: 61 gcaatgagttctggacatgctcagatgactcctctgcacctagcaagcaccttgatttct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 296 gcaatgagttctggacatgctcagatgactcctctgcacctagcaagcaccttgatttct 355
Query: 121 gaccctaatggcattttcttccaagcaatttccaattccagtggagaagaatctgcacgt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 356 gaccctaatggcattttcttccaagcaatttccaattccagtggagaagaatctgcacgt 415
Query: 181 gctgtggagagggttttgaaccaggctttgaagaagttaccttctcagtcccctcctcct 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 416 gctgtggagagggttttgaaccaggctttgaagaagttaccttctcagtcccctcctcct 475
Query: 241 gatgagattccggcgagcacgacgcttattaaggccattcggagagcacaggcggcgcag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 476 gatgagattccggcgagcacgacgcttattaaggccattcggagagcacaggcggcgcag 535
Query: 301 aagtccaggggtgatacacatttagcagtggatcagttgattttgggcattcttgaggat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 536 aagtccaggggtgatacacatttagcagtggatcagttgattttgggcattcttgaggat 595
Query: 361 tctcaaattggtgacttgttgaaggaagctggtgtggctgctgctaaggttaaatcagag 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 596 tctcaaattggtgacttgttgaaggaagctggtgtggctgctgctaaggttaaatcagag 655
Query: 421 cttgacaagcttcgtgggaaggtagggaagaaggttgagagtgcatctggtgatactact 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 656 cttgacaagcttcgtgggaaggtagggaagaaggttgagagtgcatctggtgatactact 715
Query: 481 tttcaggctttgaagacttatgggagagaccttgtggagcaagcagggaagcttgatcca 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 716 tttcaggctttgaagacttatgggagagaccttgtggagcaagcagggaagcttgatcca 775
Query: 541 gtaattgggcgtgatgaggagataagaagggttgtgaggattttgtcaaggaggactaag 600
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 776 gttattgggcgtgatgaggagataagaagggttgtgaggattttgtcaaggaggactaag 835
Query: 601 aataacccggttctgattggagagcctggtgttggtaaaactgctgtggtggaaggcttg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 836 aataacccggttctgattggagagcctggtgttggtaaaactgctgtggtggaaggcttg 895
Query: 661 gcacagaggattgttagaggggatgttcccagcaatctttctgatgttaggcttattgca 720
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 896 gcacagaggattgttagaggggatgttcccagc-atctttctgatgttaggcttattgca 954
Query: 721 ttggacatgggtgctttggttgctggtgctaagtataggggagaatttgaggagaggttg 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 955 ttggacatgggtgctttggttgctggtgctaagtataggggagaatttgaggagaggt-- 1012
Query: 781 aaggcagttttgaaagaagtggag 804
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1013 gaggcagttttgaaagaagtggag 1036
>gnl|LJGI|BP067290 homologue to UniRef100_Q39889 Cluster: Heat shock protein; n=1;
Glycine max|Rep: Heat shock protein - Glycine max
(Soybean), partial (5%)
Length = 521
Score = 315 bits (159), Expect = 8e-85
Identities = 190/195 (97%), Gaps = 4/195 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2403 attagattatatacttgctgagagctatgatcctgtttatggtgctagaccaattaggag 2462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 521 attagattatatacttgctgagagctatgatcctgtttatggtgctagaccaattaggag 462
Query: 2463 gtggcttgagaggaaagtggtgacagagctttccagaatgcttataagggatgaaattga 2522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 461 gtggcttgagaggaaagtggtgacagagctttccagaatgcttataagggatgaaattga 402
Query: 2523 tgagaactcaacagtgtacatcgatgctggcacca-agggtagtg-agttggtcta-ccg 2579
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||
Sbjct: 401 tgagaactcaacagtgtacatcgatgctggcaccacagggtagtgtagttggtttatccg 342
Query: 2580 tgta-gagaagaatg 2593
|||| ||||||||||
Sbjct: 341 tgtatgagaagaatg 327