Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v1427520.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v1427520.1 Non Chatacterized Hit- tr|K3Y5Y0|K3Y5Y0_SETIT
Uncharacterized protein OS=Setaria italica
GN=Si009349,31.1,3e-18,OVARIAN CARCINOMA ANTIGEN CA125-RELATED,NULL;
UBA,Ubiquitin-associated/translation elongation factor,CUFF.49280.1
(2730 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC68529 similar to UniRef100_Q8H2A7 Cluster: PFE18 prot... 3227 0.0
gnl|LJGI|TC58112 similar to UniRef100_Q0ZII2 Cluster: Joka2; n=1... 1336 0.0
gnl|LJGI|BW598756 similar to UniRef100_A4IWG0 Cluster: Glycosyl ... 644 0.0
gnl|LJGI|BP054472 weakly similar to UniRef100_A7PCR7 Cluster: Ch... 178 1e-43
>gnl|LJGI|TC68529 similar to UniRef100_Q8H2A7 Cluster: PFE18 protein; n=1; Ananas
comosus|Rep: PFE18 protein - Ananas comosus (Pineapple),
partial (33%)
Length = 1914
Score = 3227 bits (1628), Expect = 0.0
Identities = 1644/1652 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1079 gtagcctacctagacatgtagcggttgtccctggccctgcccctgcccctgttgatctca 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gtagcctacctagacatgtagcggttgtccctggccctgcccctgcccctgttgatctca 61
Query: 1139 atacccacccatgttttccttcttcatctcattcaaccaatgtaaatagtgcaccacttt 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 atacccacccatgttttccttcttcatctcattcaaccaatgtaaatagtgcaccacttt 121
Query: 1199 cgccagctggctgtggatgtaaaatgtgtactgatgatagttttgctggtaaaggtgaat 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 cgccagctggctgtggatgtaaaatgtgtactgatgatagttttgctggtaaaggtgaat 181
Query: 1259 gttgtgggacatccacaagttctggagctcctagaaacagctcaacccagactactgcga 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 gttgtgggacatccacaagttctggagctcctagaaacagctcaacccagactactgcga 241
Query: 1319 attggtttggtcctcccatccaatttccattttctgggacaaatacttttcattcagggg 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 attggtttggtcctcccatccaatttccattttctgggacaaatacttttcattcagggg 301
Query: 1379 catctcctataggaaactgtccagtttcttcccttccttcctttaaaaggagccatagtc 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 catctcctataggaaactgtccagtttcttcccttccttcctttaaaaggagccatagtc 361
Query: 1439 acaatcaggctatgaggggtatgttccacaagggagtccgctgtgatggctgtggagtct 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 acaatcaggctatgaggggtatgttccacaagggagtccgctgtgatggctgtggagtct 421
Query: 1499 atccaataactgggtctcgtttcaaatccaaagtgaaagaaaattatgacctctgcatca 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 atccaataactgggtctcgtttcaaatccaaagtgaaagaaaattatgacctctgcatca 481
Query: 1559 tttgcttcaacgaaatgggtaataaggctgattatatcagaatggaccgtcctgaatctg 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 tttgcttcaacgaaatgggtaataaggctgattatatcagaatggaccgtcctgaatctg 541
Query: 1619 ctttggctggcccacgacgcacaaatgaacatacnnnnnnnnttcaaactattccaccat 1678
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 542 ctttggctggcccacgacgcacaaatgaacatacaaaaaaaattcaaactattccaccat 601
Query: 1679 gtcttaatagacgtgcacggccaaagctagacagtcggttcattttggatgttaatatca 1738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 gtcttaatagacgtgcacggccaaagctagacagtcggttcattttggatgttaatatca 661
Query: 1739 tagatggtacaatgatggctccatctactgcatttacaaagatctggcgtatgcgaaaca 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 tagatggtacaatgatggctccatctactgcatttacaaagatctggcgtatgcgaaaca 721
Query: 1799 atggcacttcagtgtggcccaagggaactgaacttgtttggattggaggagatgagtttt 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 atggcacttcagtgtggcccaagggaactgaacttgtttggattggaggagatgagtttt 781
Query: 1859 gtgattctactgcagttaaattagaggctcctgaggatggcgtacctgtggggaatgaga 1918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 gtgattctactgcagttaaattagaggctcctgaggatggcgtacctgtggggaatgaga 841
Query: 1919 ttgatattgcagttgattttagagcacctcagttacctggtcgatatatatcacactgga 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 ttgatattgcagttgattttagagcacctcagttacctggtcgatatatatcacactgga 901
Query: 1979 ggatggcatccccctccggccatgaatttggccagtgtgtttgggtccttatacaggttg 2038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 ggatggcatccccctccggccatgaatttggccagtgtgtttgggtccttatacaggttg 961
Query: 2039 atgcttctgtcatggacacaacttctgatagctctcaaaacctgaacttgaatattcctc 2098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 atgcttctgtcatggacacaacttctgatagctctcaaaacctgaacttgaatattcctc 1021
Query: 2099 ttgatgtcagcagctccaaagggcctcagagtatagatatcaatgctcaacctattgaag 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 ttgatgtcagcagctccaaagggcctcagagtatagatatcaatgctcaacctattgaag 1081
Query: 2159 atgatgcttcttttcaacaatacaatcctagtgctcccactgaacctgctgaacctgtga 2218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 atgatgcttcttttcaacaatacaatcctagtgctcccactgaacctgctgaacctgtga 1141
Query: 2219 atcaaatggctgatgtgaatcaaatggttgatgaggaaccaaggcaggagaagtcagtag 2278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 atcaaatggctgatgtgaatcaaatggttgatgaggaaccaaggcaggagaagtcagtag 1201
Query: 2279 acgaattcgctgaaaatgtagacgcatttgttgaccctgctgcctcacctcctgcaactt 2338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1202 acgaattcgctgaaaatgtagacgcatttgttgaccctgctgcctcacctcctgcaactt 1261
Query: 2339 ctgcagtaccttcatatcttccctatccgaatgttgatattgacatggctgaaacagtgt 2398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1262 ctgcagtaccttcatatcttccctatccgaatgttgatattgacatggctgaaacagtgt 1321
Query: 2399 ccctgcctggtcctattcagcaaacctcagccgcggatgccccgtcttcatctattggga 2458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1322 ccctgcctggtcctattcagcaaacctcagccgcggatgccccgtcttcatctattggga 1381
Query: 2459 ttggtggaaataatcctgtggaagaggctcttctcaaagagctagatgaaatggggttta 2518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1382 ttggtggaaataatcctgtggaagaggctcttctcaaagagctagatgaaatggggttta 1441
Query: 2519 agcaggttgatttgaacaaagagattttaaggaacaatggctacaatctggagcaggcaa 2578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1442 agcaggttgatttgaacaaagagattttaaggaacaatggctacaatctggagcaggcaa 1501
Query: 2579 tagttgatctctgcgatgaatctggatgggatcctatccttgaagagttaaaggagatgg 2638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1502 tagttgatctctgcgatgaatctggatgggatcctatccttgaagagttaaaggagatgg 1561
Query: 2639 gtttcggagatgatgacaaaaataagaagctgctgatgaaaaacaatggaagcatcatgg 2698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1562 gtttcggagatgatgacaaaaataagaagctgctgatgaaaaacaatggaagcatcatgg 1621
Query: 2699 gtgttgttatggatttaataagcaaggagtag 2730
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1622 gtgttgttatggatttaataagcaaggagtag 1653
>gnl|LJGI|TC58112 similar to UniRef100_Q0ZII2 Cluster: Joka2; n=1; Nicotiana
plumbaginifolia|Rep: Joka2 - Nicotiana plumbaginifolia
(Leadwort-leaved tobacco), partial (20%)
Length = 816
Score = 1336 bits (674), Expect = 0.0
Identities = 674/674 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggagtcttcactcgtgattaaggtgaaatatggtgatacacttcggcggtttaatgcg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 143 atggagtcttcactcgtgattaaggtgaaatatggtgatacacttcggcggtttaatgcg 202
Query: 61 cctgtggctgagaataataggttggatcttaacatggctgggctgagggccaagatatgt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 203 cctgtggctgagaataataggttggatcttaacatggctgggctgagggccaagatatgt 262
Query: 121 tctattttcgatttcgctgctgatgcgaagctgattttgacatacgttgatgaagatggt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 263 tctattttcgatttcgctgctgatgcgaagctgattttgacatacgttgatgaagatggt 322
Query: 181 gactcggtgactcttgtggatgatgaggacttgcttgatgtgatgaggcagaaattgaaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323 gactcggtgactcttgtggatgatgaggacttgcttgatgtgatgaggcagaaattgaaa 382
Query: 241 ttcttgaaaattgatgtgaaaatggttaatgacaatgttggtaattcaaattttgggtct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 383 ttcttgaaaattgatgtgaaaatggttaatgacaatgttggtaattcaaattttgggtct 442
Query: 301 agtggaagttccacccctttaagatctcctcctgtctcaaacccatttgctggtggagat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 443 agtggaagttccacccctttaagatctcctcctgtctcaaacccatttgctggtggagat 502
Query: 361 tttggtaaagctgatgtttttgatgctttgccagagccattacgtgaggctctttgctca 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 503 tttggtaaagctgatgtttttgatgctttgccagagccattacgtgaggctctttgctca 562
Query: 421 tcactttcaaaagctgcctcttcaagtccagtgctggctactcttgctgattcaattacc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 563 tcactttcaaaagctgcctcttcaagtccagtgctggctactcttgctgattcaattacc 622
Query: 481 aaaattggacagtctattctaaattcgcatccccagcctcatgttgcaactggtacaggc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 623 aaaattggacagtctattctaaattcgcatccccagcctcatgttgcaactggtacaggc 682
Query: 541 tcagcaaatagtgttcctgaagcctctgccacttctgaaaaaactcctcagcctccacat 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 683 tcagcaaatagtgttcctgaagcctctgccacttctgaaaaaactcctcagcctccacat 742
Query: 601 gtggcctccgcttccaatgcaagtgtccatgctagttcaagtggaagtgccactccgtta 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 743 gtggcctccgcttccaatgcaagtgtccatgctagttcaagtggaagtgccactccgtta 802
Query: 661 agctctcctgtccc 674
||||||||||||||
Sbjct: 803 agctctcctgtccc 816
>gnl|LJGI|BW598756 similar to UniRef100_A4IWG0 Cluster: Glycosyl hydrolase, family 18
protein; n=1; Francisella tularensis subsp. tularensis
WY96-3418|Rep: Glycosyl hydrolase, family 18 protein -
Francisella tularensis subsp. tularensis (strain
WY96-3418), partial (3%)
Length = 499
Score = 644 bits (325), Expect = 0.0
Identities = 325/325 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2061 ttctgatagctctcaaaacctgaacttgaatattcctcttgatgtcagcagctccaaagg 2120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 175 ttctgatagctctcaaaacctgaacttgaatattcctcttgatgtcagcagctccaaagg 234
Query: 2121 gcctcagagtatagatatcaatgctcaacctattgaagatgatgcttcttttcaacaata 2180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 235 gcctcagagtatagatatcaatgctcaacctattgaagatgatgcttcttttcaacaata 294
Query: 2181 caatcctagtgctcccactgaacctgctgaacctgtgaatcaaatggctgatgtgaatca 2240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295 caatcctagtgctcccactgaacctgctgaacctgtgaatcaaatggctgatgtgaatca 354
Query: 2241 aatggttgatgaggaaccaaggcaggagaagtcagtagacgaattcgctgaaaatgtaga 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 aatggttgatgaggaaccaaggcaggagaagtcagtagacgaattcgctgaaaatgtaga 414
Query: 2301 cgcatttgttgaccctgctgcctcacctcctgcaacttctgcagtaccttcatatcttcc 2360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 cgcatttgttgaccctgctgcctcacctcctgcaacttctgcagtaccttcatatcttcc 474
Query: 2361 ctatccgaatgttgatattgacatg 2385
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 ctatccgaatgttgatattgacatg 499
>gnl|LJGI|BP054472 weakly similar to UniRef100_A7PCR7 Cluster: Chromosome chr17
scaffold_12, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome chr17 scaffold_12, whole genome
shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (29%)
Length = 355
Score = 178 bits (90), Expect = 1e-43
Identities = 93/94 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2637 gggtttcggagatgatgacaaaaataagaagctgctgatgaaaaacaatggaagcatcat 2696
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 252 gggtttcggagatgatgacaaaaataagaagctgctgatgaaaaaccatggaagcatcat 193
Query: 2697 gggtgttgttatggatttaataagcaaggagtag 2730
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 192 gggtgttgttatggatttaataagcaaggagtag 159