Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v1389290.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v1389290.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1K072|I1K072_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.5287
PE=,90.74,0,MI,Initiation factor eIF-4 gamma, MA3; Domain in DAP-5,
eIF4G, MA-3 and other prote,Initiation facto,CUFF.49310.1
(2112 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC79150 similar to UniRef100_A7PCL2 Cluster: Chromosome... 3126 0.0
gnl|LJGI|TC67759 similar to UniRef100_A7PCL2 Cluster: Chromosome... 874 0.0
>gnl|LJGI|TC79150 similar to UniRef100_A7PCL2 Cluster: Chromosome chr17 scaffold_12,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr17 scaffold_12, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (73%)
Length = 1904
Score = 3126 bits (1577), Expect = 0.0
Identities = 1580/1581 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 532 gcttccgttctgctttcagcattgtatgctgatgtcattagccctgcacagattagggat 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 gcttccgttctgctttcagcattgtatgctgatgtcattagccctgcacagattagggat 62
Query: 592 gggttttttatgctgattgaatctgctgatgatcttgcagtagatatcctggatgcagtt 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 gggttttttatgctgattgaatctgctgatgatcttgcagtagatatcctggatgcagtt 122
Query: 652 gacatccttgctttattccttgcacgtgctgttgttgatgacattcttcctccggccttt 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 gacatccttgctttattccttgcacgtgctgttgttgatgacattcttcctccggccttt 182
Query: 712 cttgccagggcaaggaaggctcttccagaatcttccaagggagctcaggtaattcaaact 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 cttgccagggcaaggaaggctcttccagaatcttccaagggagctcaggtaattcaaact 242
Query: 772 gctgagaagagttatctctcagctccacaccatgcagaacttgtggaaaggcgatggggt 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 gctgagaagagttatctctcagctccacaccatgcagaacttgtggaaaggcgatggggt 302
Query: 832 ggtaccactcacatcactgttgaagaagtgaagaagaagattgctgatttacttagagaa 891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 ggtaccactcacatcactgttgaagaagtgaagaagaagattgctgatttacttagagaa 362
Query: 892 tatgtggatagtggtgacacacttgaagcctgcaggtgtattcgtgaattgggggtttca 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 tatgtggatagtggtgacacacttgaagcctgcaggtgtattcgtgaattgggggtttca 422
Query: 952 ttcttccaccatgaggttgtgaagagggctttggtacttgccatggaaaatcgttcagcg 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 ttcttccaccatgaggttgtgaagagggctttggtacttgccatggaaaatcgttcagcg 482
Query: 1012 gaacctctattgttgaagctattaaaagaagcggctgaagaaggacttattagttccagc 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 483 gaacctctattgttgaagctattaaaagaagcggctgaagaaggacttattagttccagc 542
Query: 1072 caaatggtgaaagggttttctcgtttggaagaaggcctggatgatcttgctcttgatatc 1131
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 543 caaatggtgaaagggctttctcgtttggaagaaggcctggatgatcttgctcttgatatc 602
Query: 1132 ccatccgccaaagccttgtttcagtcacttgtccccaaggcaatatctgaagggtggctt 1191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 603 ccatccgccaaagccttgtttcagtcacttgtccccaaggcaatatctgaagggtggctt 662
Query: 1192 gatgcttcatttaccgattctgctggtgaagatggggacatccaagttgaagatgagaag 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 663 gatgcttcatttaccgattctgctggtgaagatggggacatccaagttgaagatgagaag 722
Query: 1252 ttgaggaagtacaaagaggaaattgtatctataattcatgagtattttctctctgatgac 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 723 ttgaggaagtacaaagaggaaattgtatctataattcatgagtattttctctctgatgac 782
Query: 1312 attcctgaactcattagaagtctagaagatcttggagcacctgagtataacccaatattt 1371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 783 attcctgaactcattagaagtctagaagatcttggagcacctgagtataacccaatattt 842
Query: 1372 ttgaagaagcttataactcttgctatggatcgaaagaacagagaaaaggaaatggcatct 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 843 ttgaagaagcttataactcttgctatggatcgaaagaacagagaaaaggaaatggcatct 902
Query: 1432 gtcctgttatctgctcttcatatagagatattctcaacagaggatatagtcaatggtttt 1491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 903 gtcctgttatctgctcttcatatagagatattctcaacagaggatatagtcaatggtttt 962
Query: 1492 gtcatgcttctggaaagtgcagaagacacagcactggatattttggatgcttcaaatgag 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 963 gtcatgcttctggaaagtgcagaagacacagcactggatattttggatgcttcaaatgag 1022
Query: 1552 cttgctctttttctagctcgggctgtgattgatgatgttcttgccccattgaatttggaa 1611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1023 cttgctctttttctagctcgggctgtgattgatgatgttcttgccccattgaatttggaa 1082
Query: 1612 gaaattggcagcaggttaaccccaaaatgcagtggaagtgaaactgtgcgcatggctcgg 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1083 gaaattggcagcaggttaaccccaaaatgcagtggaagtgaaactgtgcgcatggctcgg 1142
Query: 1672 actctggtttctgctcgccatgctggtgaaaggcttttgaggtgctggggtgggggaact 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1143 actctggtttctgctcgccatgctggtgaaaggcttttgaggtgctggggtgggggaact 1202
Query: 1732 ggatgggccgtggaggatgctaaggacaagatcatgaagctcctggaggagtatgaaagc 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1203 ggatgggccgtggaggatgctaaggacaagatcatgaagctcctggaggagtatgaaagc 1262
Query: 1792 agtggggtcgtgagcgaagcatgccagtgtattcgtgacctgggaatgtctttcttcaac 1851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1263 agtggggtcgtgagcgaagcatgccagtgtattcgtgacctgggaatgtctttcttcaac 1322
Query: 1852 catgaggtagtgaagaaagctttggttatggccatggagaagcagaatgacaggatgcta 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1323 catgaggtagtgaagaaagctttggttatggccatggagaagcagaatgacaggatgcta 1382
Query: 1912 gatctgctgcaggagtgcttcagtgaaggactgatcaccatcaaccagatgaccaaaggg 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1383 gatctgctgcaggagtgcttcagtgaaggactgatcaccatcaaccagatgaccaaaggg 1442
Query: 1972 ttcacccgtgttaaggatagtcttgatgatctggctctggacattccaaatgcaaaggaa 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1443 ttcacccgtgttaaggatagtcttgatgatctggctctggacattccaaatgcaaaggaa 1502
Query: 2032 aaatttggcttctatgtggagcaggctcaagcaaagggctggcttctaccatcatttgat 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1503 aaatttggcttctatgtggagcaggctcaagcaaagggctggcttctaccatcatttgat 1562
Query: 2092 tcgtctaccacagatgtctaa 2112
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 1563 tcgtctaccacagatgtctaa 1583
>gnl|LJGI|TC67759 similar to UniRef100_A7PCL2 Cluster: Chromosome chr17 scaffold_12,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr17 scaffold_12, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (20%)
Length = 738
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 441/441 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgtcgggcgaggggtttctgactgatgggcagagggaaatactcaagattgctact 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 298 atggcgtcgggcgaggggtttctgactgatgggcagagggaaatactcaagattgctact 357
Query: 61 caaaatgctgacaatttgtcttcgtcgccgaaatccccatcgtcgttgctttcggaacat 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 358 caaaatgctgacaatttgtcttcgtcgccgaaatccccatcgtcgttgctttcggaacat 417
Query: 121 cacataaaggcccctgctgctggtggtaaggcgcaaacagctgggatagccgtgaggcat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 418 cacataaaggcccctgctgctggtggtaaggcgcaaacagctgggatagccgtgaggcat 477
Query: 181 gtgcgccggactcactccggaaagcttgtgcgggtgaagaaagatggtgctggtggcaag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 478 gtgcgccggactcactccggaaagcttgtgcgggtgaagaaagatggtgctggtggcaag 537
Query: 241 ggtacttggggaaaattgattgacacggatgttgaatctcacttagatcggaatgatcca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 538 ggtacttggggaaaattgattgacacggatgttgaatctcacttagatcggaatgatcca 597
Query: 301 aattatgacagtggcgaggaaccctatcagcttgttggatctactattactgaccccttg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 598 aattatgacagtggcgaggaaccctatcagcttgttggatctactattactgaccccttg 657
Query: 361 gatgaattcaagaaagcagtggtatccatcatagaggaatacttcagtaatggagatgtt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 658 gatgaattcaagaaagcagtggtatccatcatagaggaatacttcagtaatggagatgtt 717
Query: 421 gacttagcagcatctgacctc 441
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 718 gacttagcagcatctgacctc 738