Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v1037670.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v1037670.1 Non Chatacterized Hit- tr|B8BJ41|B8BJ41_ORYSI
Putative uncharacterized protein OS=Oryza sativa
subsp,47.13,0.0000000000001,Med4,Mediator complex, subunit Med4;
seg,NULL,CUFF.48379.1
(1207 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC76779 1727 0.0
gnl|LJGI|TC64385 710 0.0
gnl|LJGI|TC69600 575 e-163
gnl|LJGI|FS353730 weakly similar to UniRef100_A9RYJ6 Cluster: Pr... 523 e-148
>gnl|LJGI|TC76779
Length = 1332
Score = 1727 bits (871), Expect = 0.0
Identities = 892/899 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcttcaacaccaaattgtacaatcccctgcgaggctaggccttacgaatcctaactca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 434 atgcttcaacaccaaattgtacaatcccctgcgaggctaggccttacgaatcctaactca 493
Query: 61 ccatcgattccaaaccctaccccttcgaagccccctcctacacaaacgcataacaaccaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 494 ccatcgattccaaaccctaccccttcgaagccccctcctacacaaacgcataacaaccaa 553
Query: 121 gaccgccattcggcaaccccttctgctgctctactctctcttctcccacccctccccaga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 554 gaccgccattcggcaaccccttctgctgctctactctctcttctcccacccctccccaga 613
Query: 181 gcacaagcaattcttgttcaaatggcttccttgacatctaagctttttgaagtatcatcc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 614 gcacaagcaattcttgttcaaatggcttccttgacatctaagctttttgaagtatcatcc 673
Query: 241 aacagatctgtttgggtcactgcattccgcggatcaatcccaaccttcctttcttcccag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 674 aacagatctgtttgggtcactgcattccgcggatcaatcccaaccttcctttcttcccag 733
Query: 301 gcccaagcacattcgtctaccccattggagtcttctccttcctccaccaaagaaatcatt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 734 gcccaagcacattcgtctaccccattggagtcttctccttcctccaccaaagaaatcatt 793
Query: 361 tcacttttctctacccttcaaacccaaattgttgaagctataactgaactccaagaaatt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 794 tcacttttctctacccttcaaacccaaattgttgaagctataactgaactccaagaaatt 853
Query: 421 cttgatctacaggatgctaagcagaagattgaccgggaaatttgctcaaaggatatggca 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 854 cttgatctacaggatgctaagcagaagattgaccgggaaattcgctcaaaggatatggca 913
Query: 481 cttcttggattggctaacaaactcaaagattctgagcgcggacttgacattcttgttgat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 914 cttcttggattggctaacaaactcaaagattctgagcgcggacttgacattcttgttgat 973
Query: 541 tattactctgattatcgtcgcagcaagagaacgaaattaggagatggtagtgaagatgat 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 974 gattactctgattatcgtcgcagcaagagaacgaaattaggagatggtagtgaagatgat 1033
Query: 601 tctttgacttcctcgactgtatcatcccagctgaagctgtcagatatattgtcatatgcc 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1034 tctttgacttcctcgactgtatcatcccagctgaagctatcagatatattgtcatatgcc 1093
Query: 661 catcgtataagttataccacctttgctccaccagaatttggagctgggcaggctcctctc 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1094 catcgtataagttataccacctttgctccaccagaatttggagctgggcaggctcctctc 1153
Query: 721 cgtggtgcaatgccacccgcaccacaagatgaacaaatgagagcttcacagttatataat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1154 cgtggtgcaatgccacccgcaccacaagatgaacaaatgagagcttcacagttatataat 1213
Query: 781 tttgcagaccttgatattggattgcctaaagcagttgaaacgaaggagaaaacaattgag 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1214 tttgcagaccttgatattggattgcctaaagcagttgaaacgaaggagaaaacaattgag 1273
Query: 841 gctattgtggaacctccacctcaacaatctgtggatacaaatccacttgcaaatttgtc 899
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1274 gctattgtggaacctccgccctcacaatctgtggatacaaatccacttgcaaatttgtc 1332
>gnl|LJGI|TC64385
Length = 862
Score = 710 bits (358), Expect = 0.0
Identities = 370/374 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 834 aattgaggctattgtggaacctccacctcaacaatctgtggatacaaatccacttgcaaa 893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 6 aattgaggctattgtggaacctccacctcaacaatctgtggatacaaatccacttgcaaa 65
Query: 894 tttgtctgcaattcaagggttgcttcctccaaattttgctgtgccacctggttggaagcc 953
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 66 tttttctgcaattcaagggttgcttcctccaaattttgctgtgccgcctggttggaagcc 125
Query: 954 tggaatgcctgtacaattgcctatggatataccaattaagcctccacctgggtggaaacc 1013
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 126 cggaatgcctgtacaattgcctatggatataccaattaagcctccacctgggtggaaacc 185
Query: 1014 aggggatcctgtgccattgcctcccatggactcacttccagtaccaagatttgaggaaca 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 186 aggggatcctgtgccattgcctcccatggactcacttccagtaccgagatttgaggaaca 245
Query: 1074 acagttacacccccacattcctcagcccaagcagccagaagttattcaagtgcagcatgt 1133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 246 acagttacacccccacattcctcagcccaagcagccagaagttattcaagtgcagcatgt 305
Query: 1134 taatctggatcttggaggaagtgacagtagtgattatagtagtgatgaagccagctctga 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 306 taatctggatcttggaggaagtgacagtagtgattatagtagtgatgaagccagctctga 365
Query: 1194 tgatgaagattgag 1207
||||||||||||||
Sbjct: 366 tgatgaagattgag 379
>gnl|LJGI|TC69600
Length = 885
Score = 575 bits (290), Expect = e-163
Identities = 293/294 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcttcaacaccaaattgtacaatcccctgcgaggctaggccttacgaatcctaactca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 592 atgcttcaacaccaaattgtacaatcccctgcgaggctaggccttacgaatcctaactca 651
Query: 61 ccatcgattccaaaccctaccccttcgaagccccctcctacacaaacgcataacaaccaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 652 ccatcgattccaaaccctaccccttcgaagccccctcctacacaaacccataacaaccaa 711
Query: 121 gaccgccattcggcaaccccttctgctgctctactctctcttctcccacccctccccaga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 712 gaccgccattcggcaaccccttctgctgctctactctctcttctcccacccctccccaga 771
Query: 181 gcacaagcaattcttgttcaaatggcttccttgacatctaagctttttgaagtatcatcc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 772 gcacaagcaattcttgttcaaatggcttccttgacatctaagctttttgaagtatcatcc 831
Query: 241 aacagatctgtttgggtcactgcattccgcggatcaatcccaaccttcctttct 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 832 aacagatctgtttgggtcactgcattccgcggatcaatcccaaccttcctttct 885
>gnl|LJGI|FS353730 weakly similar to UniRef100_A9RYJ6 Cluster: Predicted protein; n=1;
Physcomitrella patens subsp. patens|Rep: Predicted
protein - Physcomitrella patens subsp. patens, partial
(8%)
Length = 644
Score = 523 bits (264), Expect = e-148
Identities = 267/268 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 940 cctggttggaagcctggaatgcctgtacaattgcctatggatataccaattaagcctcca 999
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 640 cctggttggaagcccggaatgcctgtacaattgcctatggatataccaattaagcctcca 581
Query: 1000 cctgggtggaaaccaggggatcctgtgccattgcctcccatggactcacttccagtacca 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 580 cctgggtggaaaccaggggatcctgtgccattgcctcccatggactcacttccagtacca 521
Query: 1060 agatttgaggaacaacagttacacccccacattcctcagcccaagcagccagaagttatt 1119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 520 agatttgaggaacaacagttacacccccacattcctcagcccaagcagccagaagttatt 461
Query: 1120 caagtgcagcatgttaatctggatcttggaggaagtgacagtagtgattatagtagtgat 1179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 460 caagtgcagcatgttaatctggatcttggaggaagtgacagtagtgattatagtagtgat 401
Query: 1180 gaagccagctctgatgatgaagattgag 1207
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 400 gaagccagctctgatgatgaagattgag 373