Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v0620110.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v0620110.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1KM15|I1KM15_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.30356
PE,73.82,0,zf-RING_2,Zinc finger, RING-type; ZINC FINGER (C3HC4-TYPE
RING FINGER) FAMILY PROTEIN,NULL; RING FIN,CUFF.47662.1
(2091 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC61339 similar to UniRef100_A7P9L8 Cluster: Chromosome... 4137 0.0
gnl|LJGI|FS336148 1098 0.0
gnl|LJGI|GO011795 similar to UniRef100_Q00M69 Cluster: Zinc fing... 86 1e-15
gnl|LJGI|TC69484 similar to UniRef100_Q00M69 Cluster: Zinc finge... 86 1e-15
>gnl|LJGI|TC61339 similar to UniRef100_A7P9L8 Cluster: Chromosome chr3 scaffold_8,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr3 scaffold_8, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (37%)
Length = 2557
Score = 4137 bits (2087), Expect = 0.0
Identities = 2090/2091 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcaaggtcaaaggaggactgctgggtccttcccagcaattgttagcatgatgcaaggg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 atgcaaggtcaaaggaggactgctgggtccttcccagcaattgttagcatgatgcaaggg 181
Query: 61 cctggttctagtggcactgatatgaataaccagtcttccttgaatcatgtgcaaaatgca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 cctggttctagtggcactgatatgaataaccagtcttccttgaatcatgtgcaaaatgca 241
Query: 121 gtagatttccggttgtcaaattatagggggtctactggtgagactgcacatttacgtggg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 gtagatttccggttgtcaaattatagggggtctactggtgagactgcacatttacgtggg 301
Query: 181 actggtcctaatgtcagcttcagtggctggaataatggagaatctagttctggactgaat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 actggtcctaatgtcagcttcagtggctggaataatggagaatctagttctggactgaat 361
Query: 241 cttatcaaccaagtcaatgatgaaggtctaaaatcagaacatgggatgtcttctttatgt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 cttatcaaccaagtcaatgatgaaggtctaaaatcagaacatgggatgtcttctttatgt 421
Query: 301 ggtacaactgctgataatggtctcagacctgaggaaaggcaattgcatgtgaatcaatct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 ggtacaactgctgataatggtctcagacctgaggaaaggcaattgcatgtgaatcaatct 481
Query: 361 agaattcaccattcctttttgcagggttccagctctaatcatatatcccagaatattagt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 agaattcaccattcctttttgcagggttccagctctaatcatatatcccagaatattagt 541
Query: 421 ctcgatatggggcacattcctaacactgctgatcgtgggaagggcatagaaacttctagt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 ctcgatatggggcacattcctaacactgctgatcgtgggaagggcatagaaacttctagt 601
Query: 481 gctgctcatgactgcaatccttgtgaattaggtagagagaaggcaccatttggcattgct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 gctgctcatgactgcaatccttgtgaattaggtagagagaaggcaccatttggcattgct 661
Query: 541 tcatacaatcatataggagcttcatctgaaagtcctggatacatggcttggggagatagt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 tcatacaatcatataggagcttcatctgaaagtcctggatacatggcttggggagatagt 721
Query: 601 gccagttcatggggtccttcctgcaagagaaaggccctcgaaggtagttctgggcatctg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 gccagttcatggggtccttcctgcaagagaaaggccctcgaaggtagttctgggcatctg 781
Query: 661 tgtactgaaggaagctcaagctctcttgtgcaaacggaaaatggttattggcctactgat 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 tgtactgaaggaagctcaagctctcttgtgcaaacggaaaatggttattggcctactgat 841
Query: 721 cctgttgatcttaatgcttcctgtagcttaagtgattctacacctttagaggatttttct 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 cctgttgatcttaatgcttcctgtagcttaagtgattctacacctttagaggatttttct 901
Query: 781 gttattagccctccattacaacagaacacacgaaatgggatgaggcaagaagcttccaat 840
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 gttattagccctccattacaacagaacacacgacatgggatgaggcaagaagcttccaat 961
Query: 841 gcatttccttccatgataagtgttgcggaaaatgtggaaaggcctctaagaaactttgat 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 gcatttccttccatgataagtgttgcggaaaatgtggaaaggcctctaagaaactttgat 1021
Query: 901 aggagaataacccgactacagcatcaggaatctggacctctcaatttaacatcaactggg 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 aggagaataacccgactacagcatcaggaatctggacctctcaatttaacatcaactggg 1081
Query: 961 agtggtatacttcataatcattcttctgcacatcaaatacctggctctctcttatttaat 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 agtggtatacttcataatcattcttctgcacatcaaatacctggctctctcttatttaat 1141
Query: 1021 gattccttggaattgaggttaacagctggagcaactgctgctaattctggtgctgttcag 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 gattccttggaattgaggttaacagctggagcaactgctgctaattctggtgctgttcag 1201
Query: 1081 aaccagacacctgccctgcacatgcatcctactccttggaatagagctgctaatcctaga 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1202 aaccagacacctgccctgcacatgcatcctactccttggaatagagctgctaatcctaga 1261
Query: 1141 gcttccagagcttcaagttcttatagctctggagaaagagcagtacgggaagatcttaat 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1262 gcttccagagcttcaagttcttatagctctggagaaagagcagtacgggaagatcttaat 1321
Query: 1201 ttaagaatctttccaagagattctactgaccacttcatgaatgtgcctgcatcttcagga 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1322 ttaagaatctttccaagagattctactgaccacttcatgaatgtgcctgcatcttcagga 1381
Query: 1261 cttgaacctatgggttggcatgcatcttctagtaatgtgaacaatgctggaggtatccct 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1382 cttgaacctatgggttggcatgcatcttctagtaatgtgaacaatgctggaggtatccct 1441
Query: 1321 cctacatcctggactggatctagtttaaatgtccattcattacctaatcccaactggaca 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1442 cctacatcctggactggatctagtttaaatgtccattcattacctaatcccaactggaca 1501
Query: 1381 tttaaccatgatgtcccggcggaaaatctgcagagagtgtcagagttgagtccttggtcc 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1502 tttaaccatgatgtcccggcggaaaatctgcagagagtgtcagagttgagtccttggtcc 1561
Query: 1441 ctttttccatcaattagctctgcacctggtactcatcacagccattctatttctaccccc 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1562 ctttttccatcaattagctctgcacctggtactcatcacagccattctatttctaccccc 1621
Query: 1501 tctacttctggtcctccttcatcttctcagggttctagcaacaatcaaccatatcgaaga 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1622 tctacttctggtcctccttcatcttctcagggttctagcaacaatcaaccatatcgaaga 1681
Query: 1561 acagcattttcaatggaaagaaggggtggtgatgttctctctggtcctcattcactgcga 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1682 acagcattttcaatggaaagaaggggtggtgatgttctctctggtcctcattcactgcga 1741
Query: 1621 gcattagcctttgatagtgaggggagacgtcgactaatatctgagattcgccaagtcttg 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1742 gcattagcctttgatagtgaggggagacgtcgactaatatctgagattcgccaagtcttg 1801
Query: 1681 actgcaatgcggaggggtgagaacttacgagctgaggattatatggtctttgaccctttc 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1802 actgcaatgcggaggggtgagaacttacgagctgaggattatatggtctttgaccctttc 1861
Query: 1741 ctatatcatggcttagctgaaatgcatgaccggcacagagaaatgcgccttgatgttgat 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1862 ctatatcatggcttagctgaaatgcatgaccggcacagagaaatgcgccttgatgttgat 1921
Query: 1801 aacatgtcttatgaggaactattggcattggaagagcaaataggagatgtgagcactgga 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1922 aacatgtcttatgaggaactattggcattggaagagcaaataggagatgtgagcactgga 1981
Query: 1861 ttgagtgaggataacattcataagttaatgaaacagcggctttacatttctttcatggct 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1982 ttgagtgaggataacattcataagttaatgaaacagcggctttacatttctttcatggct 2041
Query: 1921 gaatcatcatctgatcctgaaccttgctgtatctgtcaggagcaatatgctaatggagag 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2042 gaatcatcatctgatcctgaaccttgctgtatctgtcaggagcaatatgctaatggagag 2101
Query: 1981 attattggttcactagattgtgggcatgagttccacactaagtgcatcaagcaatggctt 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2102 attattggttcactagattgtgggcatgagttccacactaagtgcatcaagcaatggctt 2161
Query: 2041 gttcagaagaatctgtgccccatttgcaaaacaacagccttagctacatga 2091
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2162 gttcagaagaatctgtgccccatttgcaaaacaacagccttagctacatga 2212
>gnl|LJGI|FS336148
Length = 732
Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0
Identities = 554/554 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcaaggtcaaaggaggactgctgggtccttcccagcaattgttagcatgatgcaaggg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 179 atgcaaggtcaaaggaggactgctgggtccttcccagcaattgttagcatgatgcaaggg 238
Query: 61 cctggttctagtggcactgatatgaataaccagtcttccttgaatcatgtgcaaaatgca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 239 cctggttctagtggcactgatatgaataaccagtcttccttgaatcatgtgcaaaatgca 298
Query: 121 gtagatttccggttgtcaaattatagggggtctactggtgagactgcacatttacgtggg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 gtagatttccggttgtcaaattatagggggtctactggtgagactgcacatttacgtggg 358
Query: 181 actggtcctaatgtcagcttcagtggctggaataatggagaatctagttctggactgaat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359 actggtcctaatgtcagcttcagtggctggaataatggagaatctagttctggactgaat 418
Query: 241 cttatcaaccaagtcaatgatgaaggtctaaaatcagaacatgggatgtcttctttatgt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 419 cttatcaaccaagtcaatgatgaaggtctaaaatcagaacatgggatgtcttctttatgt 478
Query: 301 ggtacaactgctgataatggtctcagacctgaggaaaggcaattgcatgtgaatcaatct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 479 ggtacaactgctgataatggtctcagacctgaggaaaggcaattgcatgtgaatcaatct 538
Query: 361 agaattcaccattcctttttgcagggttccagctctaatcatatatcccagaatattagt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 539 agaattcaccattcctttttgcagggttccagctctaatcatatatcccagaatattagt 598
Query: 421 ctcgatatggggcacattcctaacactgctgatcgtgggaagggcatagaaacttctagt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599 ctcgatatggggcacattcctaacactgctgatcgtgggaagggcatagaaacttctagt 658
Query: 481 gctgctcatgactgcaatccttgtgaattaggtagagagaaggcaccatttggcattgct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659 gctgctcatgactgcaatccttgtgaattaggtagagagaaggcaccatttggcattgct 718
Query: 541 tcatacaatcatat 554
||||||||||||||
Sbjct: 719 tcatacaatcatat 732
>gnl|LJGI|GO011795 similar to UniRef100_Q00M69 Cluster: Zinc finger protein; n=1;
Glycine max|Rep: Zinc finger protein - Glycine max
(Soybean), partial (17%)
Length = 600
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-15
Identities = 91/107 (85%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1765 catgaccggcacagagaaatgcgccttgatgttgataacatgtcttatgaggaactattg 1824
|||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 269 catgaccgacacagggatatgcgacttgatgtcgataacatgtcttatgaggaattattg 328
Query: 1825 gcattggaagagcaaataggagatgtgagcactggattgagtgagga 1871
|| ||||||| | || ||| |||||| |||||||||| ||||||
Sbjct: 329 gctctggaagaacgcattggaaatgtgaatactggattgactgagga 375
>gnl|LJGI|TC69484 similar to UniRef100_Q00M69 Cluster: Zinc finger protein; n=1;
Glycine max|Rep: Zinc finger protein - Glycine max
(Soybean), partial (22%)
Length = 802
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-15
Identities = 91/107 (85%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1765 catgaccggcacagagaaatgcgccttgatgttgataacatgtcttatgaggaactattg 1824
|||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 246 catgaccgacacagggatatgcgacttgatgtcgataacatgtcttatgaggaattattg 305
Query: 1825 gcattggaagagcaaataggagatgtgagcactggattgagtgagga 1871
|| ||||||| | || ||| |||||| |||||||||| ||||||
Sbjct: 306 gctctggaagaacgcattggaaatgtgaatactggattgactgagga 352