Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v0619950.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v0619950.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1KM07|I1KM07_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=4
SV=1,89.61,0,Carboxyl_trans,Carboxyl transferase; seg,NULL;
ClpP/crotonase,NULL; ACETYL-COA CARBOXYLASE CARBOXYLT,CUFF.47647.1
(1674 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC78527 similar to UniRef100_A7P9K7 Cluster: Chromosome... 2359 0.0
gnl|LJGI|TC81412 similar to UniRef100_A7P9K7 Cluster: Chromosome... 1298 0.0
gnl|LJGI|TC66919 similar to UniRef100_A7P9K7 Cluster: Chromosome... 1156 0.0
gnl|LJGI|TC65808 similar to UniRef100_Q92E97 Cluster: Lin0563 pr... 54 3e-06
>gnl|LJGI|TC78527 similar to UniRef100_A7P9K7 Cluster: Chromosome chr3 scaffold_8,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr3 scaffold_8, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (64%)
Length = 1333
Score = 2359 bits (1190), Expect = 0.0
Identities = 1204/1211 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgatcgggttaatcggaagaaaagcaagctgggcatcctccaatttggtaggaagaaga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 atgatcgggttaatcggaagaaaagcaagctgggcatcctccaatttggtaggaagaaga 182
Query: 61 ggcttttgcttgggaatccttcctcatagcaatggtggtgccactgccatggaagatttg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 ggcttttgcttgggaatccttcctcatagcaatggtggtgccactgccatggaagatttg 242
Query: 121 ctttcccagctccaatctcacgtccataaagctcttgctggtggaggagctgaagcagtg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 ctttcccagctccaatctcacgtccataaagctcttgctggtggaggagctgaagcagtg 302
Query: 181 aagaggaacacaagtaggaataaacttctaccgagagaaagaatcgatcgccttcttgat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 aagaggaacacaagtaggaataaacttctaccgagagaaagaatcgatcgccttcttgat 362
Query: 241 cctggttcttccttcctcgagctttcacagcttgcaggacatgagttgtatgaagaaccc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 cctggttcttccttcctcgagctttcacagcttgcaggacatgagttgtatgaagaaccc 422
Query: 301 ttgccttctggtggagttgtcactgggataggtcctgtgcatgggcgactttgtatgttt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 ttgccttctggtggagttgtcactgggataggtcctgtgcatgggcgactttgtatgttt 482
Query: 361 gtggccaatgatcccactgttaagggagggacctattatcctattactgttaagaagcat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 483 gtggccaatgatcccactgttaagggagggacctattatcctattactgttaagaagcat 542
Query: 421 ctcagagcacaggagattgcttctcagtgcaaattgccctgcgtgtatcttgttgacagt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 543 ctcagagcacaggagattgcttctcagtgcaaattgccctgcgtgtatcttgttgacagt 602
Query: 481 ggaggtgctttccttcccaagcaggctgatgtctttccagacagggagaacttcggtaga 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 603 ggaggtgctttccttcccaagcaggctgatgtctttccagacagggagaacttcggtaga 662
Query: 541 atattctataatcaagctctaatgtctgctgaagggattccgcagattgcgttggtttta 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 663 atattctataatcaagctctaatgtctgctgaagggattccgcagattgcgttggtttta 722
Query: 601 ggttcttgcacggctgggggtgcatacatacctgctatggctgatgaaagtgtgatggtc 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 723 ggttcttgcacggctgggggtgcatacatacctgctatggctgatgaaagtgtgatggtc 782
Query: 661 aagggaaatggcaccannnnnnnagcaggacctcctcttgttaaggctgctactggagaa 720
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 783 aagggaaatggcaccatttttttagcaggacctcctcttgttaaggctgctactggagaa 842
Query: 721 gaagtctctgcagaggatttgggaggtgctactgtgcactgcaagacatcaggtgtttca 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 843 gaagtctctgcagaggatttgggaggtgctactgtgcactgcaagacatcaggtgtttca 902
Query: 781 gactattttgctcaagatgaatttcatgcacttgcacttgggaggaacatcattaagaat 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 903 gactattttgctcaagatgaatttcatgcacttgcacttgggaggaacatcattaagaat 962
Query: 841 ttgcacatggctgggaaagatgtcttggcaaatggattgcaaaatttaagctatgaatat 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 963 ttgcacatggctgggaaagatgtcttggcaaatggattgcaaaatttaagctatgaatat 1022
Query: 901 aaagagcctctatatgatgtcaacgaacttcgttctatagcccccactgatcttaagaag 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1023 aaagagcctctatatgatgtcaacgaacttcgttctatagcccccactgatcttaagaag 1082
Query: 961 cagtttgatgtccgatcagttattgctcgtattgtggatggaagtgaatttgatgaattc 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1083 cagtttgatgtccgatcagttattgctcgtattgtggatggaagtgaatttgatgaattc 1142
Query: 1021 aagaaattgtatggcactactctcgtaacaggttttgctagaatttatggacagcctgta 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1143 aagaaattgtatggcactactctcgtaacaggttttgctagaatttatggacagcctgta 1202
Query: 1081 ggaattattggaaacaatgggattttattcaacgaatctgctctgaaaggggcccatttc 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1203 ggaattattggaaacaatgggattttattcaacgaatctgctctgaaaggggcccatttc 1262
Query: 1141 attgaaatatgtactcaacgtaacattcccttggtcttccttcagaacatcactggattc 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1263 attgaaatatgtactcaacgtaacattcccttggtcttccttcagaacatcactggattc 1322
Query: 1201 atggtgggctc 1211
|||||||||||
Sbjct: 1323 atggtgggctc 1333
>gnl|LJGI|TC81412 similar to UniRef100_A7P9K7 Cluster: Chromosome chr3 scaffold_8,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr3 scaffold_8, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (35%)
Length = 826
Score = 1298 bits (655), Expect = 0.0
Identities = 691/706 (97%), Gaps = 7/706 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgatcgggttaatcggaagaaaagcaagctgggcatcctccaatttggtaggaagaaga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 35 atgatcgggttaatcggaagaaaagcaagctgggcatcctccaatttggtaggaagaaga 94
Query: 61 ggcttttgcttgggaatccttcctcatagcaatggtggtgccactgccatggaagatttg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 95 ggcttttgcttgggaatccttcctcatagcaatggtggtgccactgccatggaagatttg 154
Query: 121 ctttcccagctccaatctcacgtccataaagctcttgctggtggaggagctgaagcagtg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 155 ctttcccagctccaatctcacgtccataaagctcttgctggtggaggagctgaagcagtg 214
Query: 181 aagaggaacacaagtaggaataaacttctaccgagagaaagaatcgatcgccttcttgat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 215 aagaggaacacaagtaggaataaacttctaccgagagaaagaatcgatcgccttcttgat 274
Query: 241 cctggttcttccttcctcgagctttcacagcttgcaggacatgagttgtatgaagaaccc 300
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 275 cctggttcttccttcctcgagctttcacag-------gacatgagttgtatgaagaaccc 327
Query: 301 ttgccttctggtggagttgtcactgggataggtcctgtgcatgggcgactttgtatgttt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 328 ttgccttctggtggagttgtcactgggataggtcctgtgcatgggcgactttgtatgttt 387
Query: 361 gtggccaatgatcccactgttaagggagggacctattatcctattactgttaagaagcat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 388 gtggccaatgatcccactgttaagggagggacctattatcctattactgttaagaagcat 447
Query: 421 ctcagagcacaggagattgcttctcagtgcaaattgccctgcgtgtatcttgttgacagt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 448 ctcagagcacaggagattgcttctcagtgcaaattgccctgcgtgtatcttgttgacagt 507
Query: 481 ggaggtgctttccttcccaagcaggctgatgtctttccagacagggagaacttcggtaga 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 508 ggaggtgctttccttcccaagcaggctgatgtctttccagacagggagaacttcggtaga 567
Query: 541 atattctataatcaagctctaatgtctgctgaagggattccgcagattgcgttggtttta 600
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 568 atattctataatcaagctctaatgtctgctgaaaggattccgcagattgcgttggtttta 627
Query: 601 ggttcttgcacggctgggggtgcatacatacctgctatggctgatgaaagtgtgatggtc 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 628 ggttcttgcacggctgggggtgcatacatacctgctatggctgatgaaagtgtgatggtc 687
Query: 661 aagggaaatggcaccannnnnnnagcaggacctcctcttgttaagg 706
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 688 aagggaaatggcaccatttttttagcaggacctcctcttgttaagg 733
>gnl|LJGI|TC66919 similar to UniRef100_A7P9K7 Cluster: Chromosome chr3 scaffold_8,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr3 scaffold_8, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (46%)
Length = 1077
Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0
Identities = 608/618 (98%), Gaps = 10/618 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 825 gaacatcattaagaatttgcacatggctgggaaagatgtcttggcaaatggattgcaaaa 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gaacatcattaagaatttgcacatggctgggaaagatgtcttggcaaatggattgcaaaa 60
Query: 885 tttaagctatgaatataaagagcctctatatgatgtcaacgaacttcgttctatagcccc 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tttaagctatgaatataaagagcctctatatgatgtcaacgaacttcgttctatagcccc 120
Query: 945 cactgatcttaagaagcagtttgatgtccgatcagttattgctcgtattgtggatggaag 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cactgatcttaagaagcagtttgatgtccgatcagttattgctcgtattgtggatggaag 180
Query: 1005 tgaatttgatgaattcaagaaattgtatggcactactctcgtaacaggttttgctagaat 1064
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tgaatttgatgaattcaagaaatt----------actctcgtaacaggttttgctagaat 230
Query: 1065 ttatggacagcctgtaggaattattggaaacaatgggattttattcaacgaatctgctct 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 231 ttatggacagcctgtaggaattattggaaacaatgggattttattcaacgaatctgctct 290
Query: 1125 gaaaggggcccatttcattgaaatatgtactcaacgtaacattcccttggtcttccttca 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 291 gaaaggggcccatttcattgaaatatgtactcaacgtaacattcccttggtcttccttca 350
Query: 1185 gaacatcactggattcatggtgggctcaagatctgaggcaaatggcatagcaaaatctgg 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 351 gaacatcactggattcatggtgggctcaagatctgaggcaaatggcatagcaaaatctgg 410
Query: 1245 tgcgaaaatggtgatggcagtttcttgcgcaaaggtacctaaaatcaccataattgtcgg 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 411 tgcgaaaatggtgatggcagtttcttgcgcaaaggtacctaaaatcaccataattgtcgg 470
Query: 1305 cggaagcttcggtgcaggaaactatgcaatgtgtggccgtgcctacagtcccaatttcat 1364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 471 cggaagcttcggtgcaggaaactatgcaatgtgtggccgtgcctacagtcccaatttcat 530
Query: 1365 gttcctttggcctaatgccagaatatctgtgatgggtggtgctcaggctgctggggtact 1424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 531 gttcctttggcctaatgccagaatatctgtgatgggtggtgctcaggctgctggggtact 590
Query: 1425 gtctcaaatagagaaaac 1442
||||||||||||||||||
Sbjct: 591 gtctcaaatagagaaaac 608
Score = 337 bits (170), Expect = 1e-91
Identities = 170/170 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1505 tagtggaggcttatgaggtagaaggaagtccttattactcaacagcgaggctttgggatg 1564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 671 tagtggaggcttatgaggtagaaggaagtccttattactcaacagcgaggctttgggatg 730
Query: 1565 atggaatcatagatccagcggatacaagaaaagtgattggtctgagcatatctgcttcct 1624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 731 atggaatcatagatccagcggatacaagaaaagtgattggtctgagcatatctgcttcct 790
Query: 1625 tgaaccgcgccatagaagataccaaatttggtgtgtttagaatgtgattg 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 791 tgaaccgcgccatagaagataccaaatttggtgtgtttagaatgtgattg 840
>gnl|LJGI|TC65808 similar to UniRef100_Q92E97 Cluster: Lin0563 protein; n=1; Listeria
innocua|Rep: Lin0563 protein - Listeria innocua, partial
(5%)
Length = 655
Score = 54.0 bits (27), Expect = 3e-06
Identities = 36/39 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 174 agcagtgaagaggaacacaagtaggaataaacttctacc 212
||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 507 agcagtgaagaggaaaagaagtaggaacaaacttctacc 545