Miyakogusa Predicted Gene

Lj4g3v0486310.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj4g3v0486310.1 tr|F2DXM3|F2DXM3_HORVD Predicted protein
OS=Hordeum vulgare var. distichum PE=2
SV=1,51.72,3e-18,seg,NULL,CUFF.47480.1
         (1431 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC76139 similar to UniRef100_A7QPQ0 Cluster: Chromosome...  2837   0.0  

>gnl|LJGI|TC76139 similar to UniRef100_A7QPQ0 Cluster: Chromosome chr10 scaffold_138,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr10 scaffold_138, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (77%)
          Length = 2024

 Score = 2837 bits (1431), Expect = 0.0
 Identities = 1431/1431 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgaagaaggtttccaagacaagctgcaagtctgcatcacacaagctctttaaggacaag 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 140  atgaagaaggtttccaagacaagctgcaagtctgcatcacacaagctctttaaggacaag 199

                                                                        
Query: 61   gcgaagaatcgtgttgatgacctgcagctggtgtttcttgatctgcagtttgctaggaag 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 200  gcgaagaatcgtgttgatgacctgcagctggtgtttcttgatctgcagtttgctaggaag 259

                                                                        
Query: 121  gagagccgtacggttgatgctgcagttcttgaggaacaagtccatcagatgcttcgtgag 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260  gagagccgtacggttgatgctgcagttcttgaggaacaagtccatcagatgcttcgtgag 319

                                                                        
Query: 181  tggaagaatgagctcaatgagccttcgcctgcttcttctttgcagcaagatggcagtctt 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 320  tggaagaatgagctcaatgagccttcgcctgcttcttctttgcagcaagatggcagtctt 379

                                                                        
Query: 241  gggtcattctccaccgatatctgtcggcttttgcagctctgtgaggaggaagatgatgcc 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380  gggtcattctccaccgatatctgtcggcttttgcagctctgtgaggaggaagatgatgcc 439

                                                                        
Query: 301  tctagtccattagctgcacctaagcctgagcctgttgatcagactcttccagctgggagc 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 440  tctagtccattagctgcacctaagcctgagcctgttgatcagactcttccagctgggagc 499

                                                                        
Query: 361  aaggtcatattccaagggggccaacagcaacatgattttccattggttaatgaatgcaag 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500  aaggtcatattccaagggggccaacagcaacatgattttccattggttaatgaatgcaag 559

                                                                        
Query: 421  cactcaacctcaagagctcaaaatatggcagctaacaagccagatggacctgctttagaa 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 560  cactcaacctcaagagctcaaaatatggcagctaacaagccagatggacctgctttagaa 619

                                                                        
Query: 481  tatcatcagtttgatttgcatcaggactttgatcacagcttttatactggatttaatggc 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 620  tatcatcagtttgatttgcatcaggactttgatcacagcttttatactggatttaatggc 679

                                                                        
Query: 541  tcaggttattgtgaggaggatgctattcctcatatatctagctatctacccagtatctgc 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 680  tcaggttattgtgaggaggatgctattcctcatatatctagctatctacccagtatctgc 739

                                                                        
Query: 601  cctccaccttctgctttcttaggcccaaaatgtgcactttgggactgtccaagacctgca 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 740  cctccaccttctgctttcttaggcccaaaatgtgcactttgggactgtccaagacctgca 799

                                                                        
Query: 661  caagggttggactggtgtcaagattattgcagtagctatcatgctgctctagctttgaat 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 800  caagggttggactggtgtcaagattattgcagtagctatcatgctgctctagctttgaat 859

                                                                        
Query: 721  gaaggtccaccaggtatggccccagttctacgacctgggggcattggtttgaaggataat 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 860  gaaggtccaccaggtatggccccagttctacgacctgggggcattggtttgaaggataat 919

                                                                        
Query: 781  ctacttttttctgctcttagtgcaaaggcacaaggaaaagatgtcggcatcccagaatgt 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 920  ctacttttttctgctcttagtgcaaaggcacaaggaaaagatgtcggcatcccagaatgt 979

                                                                        
Query: 841  gagggagcagcaactgcaaagtctccatggaatgcccctgaactctttgatctttctgtt 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 980  gagggagcagcaactgcaaagtctccatggaatgcccctgaactctttgatctttctgtt 1039

                                                                        
Query: 901  cttgagggtgagactatcagggagtggctcttcttcgataagcctcggcgagcatttgag 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1040 cttgagggtgagactatcagggagtggctcttcttcgataagcctcggcgagcatttgag 1099

                                                                        
Query: 961  agtggaaacagaaagcagaggtcattgccagattacagtggacgcggttggcatgaatct 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1100 agtggaaacagaaagcagaggtcattgccagattacagtggacgcggttggcatgaatct 1159

                                                                        
Query: 1021 agaaagcaagtgatcaatgaatttggagggctgaagagatcctactatatggatccacaa 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1160 agaaagcaagtgatcaatgaatttggagggctgaagagatcctactatatggatccacaa 1219

                                                                        
Query: 1081 ccactgaaccatttcgagtggcacctttatgaatatgagattagcaagtgtgatttatgt 1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1220 ccactgaaccatttcgagtggcacctttatgaatatgagattagcaagtgtgatttatgt 1279

                                                                        
Query: 1141 gccttgtaccgattggaactgaagctcgttgagggaaagaagaactccaaggcaaaatta 1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1280 gccttgtaccgattggaactgaagctcgttgagggaaagaagaactccaaggcaaaatta 1339

                                                                        
Query: 1201 acaaacgattcagttgctgatctgcagaagcagatgggaaagctctccgccgagtttccg 1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1340 acaaacgattcagttgctgatctgcagaagcagatgggaaagctctccgccgagtttccg 1399

                                                                        
Query: 1261 ccagataacaaaaggcctgctaaaggcagagccaaaatcaatgccagagttgccatgggt 1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1400 ccagataacaaaaggcctgctaaaggcagagccaaaatcaatgccagagttgccatgggt 1459

                                                                        
Query: 1321 ggtgtctattcacacagagtgactccactgaacggaacatatgagtatgggttagcttcc 1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1460 ggtgtctattcacacagagtgactccactgaacggaacatatgagtatgggttagcttcc 1519

                                                               
Query: 1381 ccatatgactaccttgttgacaacttgggtgactactatgggacatgatct 1431
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1520 ccatatgactaccttgttgacaacttgggtgactactatgggacatgatct 1570