Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v0279770.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v0279770.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3S3W7|I3S3W7_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2
SV=1,99.28,0,DUF561,Uncharacterised protein family Ycf23; seg,NULL; no
description,Aldolase-type TIM barrel; Aldo,CUFF.46789.1
(837 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC57256 similar to UniRef100_A9SGF1 Cluster: Predicted ... 1659 0.0
gnl|LJGI|TC63391 similar to UniRef100_A9SGF1 Cluster: Predicted ... 1279 0.0
gnl|LJGI|TC78714 similar to UniRef100_A9SGF1 Cluster: Predicted ... 676 0.0
>gnl|LJGI|TC57256 similar to UniRef100_A9SGF1 Cluster: Predicted protein; n=1;
Physcomitrella patens subsp. patens|Rep: Predicted
protein - Physcomitrella patens subsp. patens, partial
(71%)
Length = 1215
Score = 1659 bits (837), Expect = 0.0
Identities = 837/837 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcattccttaacatgcaccccagtttcatctccttctcacacccttctaaagccaaac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 71 atgcattccttaacatgcaccccagtttcatctccttctcacacccttctaaagccaaac 130
Query: 61 aacaacaaccctttattgggttcaacttggaggccttgtccacctttgaaaagaagagcc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 131 aacaacaaccctttattgggttcaacttggaggccttgtccacctttgaaaagaagagcc 190
Query: 121 tgcttcactaccagagctctattgtcatccaccaaagaaactgttttgaaggatttccag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 tgcttcactaccagagctctattgtcatccaccaaagaaactgttttgaaggatttccag 250
Query: 181 gaacgaagagctctcaagattatctcaggcttgcataattttgataaagacaatgttgcc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 251 gaacgaagagctctcaagattatctcaggcttgcataattttgataaagacaatgttgcc 310
Query: 241 tctgttgtcactgctgcagacaaggggggagcgactcacgtggatatagcatgtgacccg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 311 tctgttgtcactgctgcagacaaggggggagcgactcacgtggatatagcatgtgacccg 370
Query: 301 gagttggtcaagctagctatcagtttaacttcttgtccggtttgtgtttcttctgtagat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 371 gagttggtcaagctagctatcagtttaacttcttgtccggtttgtgtttcttctgtagat 430
Query: 361 cctgcaacattcccagctgcagttgaagcaggagcactaatggttgagattggaaactac 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 431 cctgcaacattcccagctgcagttgaagcaggagcactaatggttgagattggaaactac 490
Query: 421 gattcattctatgagaagggagtagtttttactccagagcagattctaatactaacaaag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 491 gattcattctatgagaagggagtagtttttactccagagcagattctaatactaacaaag 550
Query: 481 gaaacaaggaggctacttccttctatcgccttgtctgttacagttcctcacacactaagc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 551 gaaacaaggaggctacttccttctatcgccttgtctgttacagttcctcacacactaagc 610
Query: 541 ctccctgatcaggtcaagctcgcagagttactggaacaagaaggcgtggatattattcaa 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 611 ctccctgatcaggtcaagctcgcagagttactggaacaagaaggcgtggatattattcaa 670
Query: 601 accgagggaggaaaatgttccaatcctacaaagtctggtatactgggtttgattgagaag 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 671 accgagggaggaaaatgttccaatcctacaaagtctggtatactgggtttgattgagaag 730
Query: 661 gcaacaccaactttagcagcagcatattctatatcgcgagctgttaagatacctgtcatg 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 731 gcaacaccaactttagcagcagcatattctatatcgcgagctgttaagatacctgtcatg 790
Query: 721 tgctcatctgggctaagtgctgtcacagcacctatggctatcactgctggagctgctgga 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 791 tgctcatctgggctaagtgctgtcacagcacctatggctatcactgctggagctgctgga 850
Query: 781 gtgggtgtgggctctgctgttaatagactaaatgatgtggttgccatgattgctgag 837
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 851 gtgggtgtgggctctgctgttaatagactaaatgatgtggttgccatgattgctgag 907
>gnl|LJGI|TC63391 similar to UniRef100_A9SGF1 Cluster: Predicted protein; n=1;
Physcomitrella patens subsp. patens|Rep: Predicted
protein - Physcomitrella patens subsp. patens, partial
(48%)
Length = 782
Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0
Identities = 652/653 (99%), Gaps = 1/653 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcattccttaacatgcaccccagtttcatctccttctcacacccttctaaagccaaac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 131 atgcattccttaacatgcaccccagtttcatctccttctcacacccttctaaagccaaac 190
Query: 61 aacaacaaccctttattgggttcaacttggaggccttgtccacctttgaaaagaagagcc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 aacaacaaccctttattgggttcaacttggaggccttgtccacctttgaaaagaagagcc 250
Query: 121 tgcttcactaccagagctctattgtcatccaccaaagaaactgttttgaaggatttccag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 251 tgcttcactaccagagctctattgtcatccaccaaagaaactgttttgaaggatttccag 310
Query: 181 gaacgaagagctctcaagattatctcaggcttgcataattttgataaagacaatgttgcc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 311 gaacgaagagctctcaagattatctcaggcttgcataattttgataaagacaatgttgcc 370
Query: 241 tctgttgtcactgctgcagacaaggggggagcgactcacgtggatatagcatgtgacccg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 371 tctgttgtcactgctgcagacaaggggggagcgactcacgtggatatagcatgtgacccg 430
Query: 301 gagttggtcaagctagctatcagtttaacttcttgtccggtttgtgtttcttctgtagat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 431 gagttggtcaagctagctatcagtttaacttcttgtccggtttgtgtttcttctgtagat 490
Query: 361 cctgcaacattcccagctgcagttgaagcaggagcactaatggttgagattggaaactac 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 491 cctgcaacattcccagctgcagttgaagcaggagcactaatggttgagattggaaactac 550
Query: 421 gattcattctatgagaagggagtagtttttactccagagcagattctaatactaacaaag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 551 gattcattctatgagaagggagtagtttttactccagagcagattctaatactaacaaag 610
Query: 481 gaaacaaggaggctacttccttctatcgccttgtctgttacagttcctcacacactaagc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 611 gaaacaaggaggctacttccttctatcgccttgtctgttacagttcctcacacactaagc 670
Query: 541 ctccctgatcaggtcaagctcgcagagttactggaacaagaaggcgtggatattattcaa 600
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 671 ctccctgatca-gtcaagctcgcagagttactggaacaagaaggcgtggatattattcaa 729
Query: 601 accgagggaggaaaatgttccaatcctacaaagtctggtatactgggtttgat 653
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 730 accgagggaggaaaatgttccaatcctacaaagtctggtatactgggtttgat 782
>gnl|LJGI|TC78714 similar to UniRef100_A9SGF1 Cluster: Predicted protein; n=1;
Physcomitrella patens subsp. patens|Rep: Predicted
protein - Physcomitrella patens subsp. patens, partial
(17%)
Length = 418
Score = 676 bits (341), Expect = 0.0
Identities = 364/373 (97%), Gaps = 9/373 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcattccttaacatgcaccccagtttcatctccttctcacacccttctaaagccaaac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 46 atgcattccttaacatgcaccccagtttcatctccttctcacacccttctaaagccaaac 105
Query: 61 aacaacaaccctttattgggttcaacttggaggccttgtccacctttgaaaagaagagcc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 106 aacaacaaccctttattgggttcaacttggaggccttgtccacctttgaaaagaagagcc 165
Query: 121 tgcttcactaccagagctctattgtcatccaccaaagaaactgttttgaaggatttccag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 166 tgcttcactaccagagctctattgtcatccaccaaagaaactgttttgaaggatttccag 225
Query: 181 gaacgaagagctctcaagattatctcaggcttgcataattttgataaagacaatgttgcc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 226 gaacgaagagctctcaagattatctcaggcttgcataattttgataaagacaatgttgcc 285
Query: 241 tctgttgtcactgctgcagacaaggggggagcgactcacgtggatatagcatgtgacccg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 286 tctgttgtcactgctgcagacaaggggggagcgactcacgtggatatagcatgtgacccg 345
Query: 301 gagttggtcaagctagctatcagtttaacttcttgtcc---------ggtttgtgtttct 351
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 346 gagttggtcaagctagctatcagtttaacttcttgtccgttcttgcaggtttgtgtttct 405
Query: 352 tctgtagatcctg 364
|||||||||||||
Sbjct: 406 tctgtagatcctg 418