Miyakogusa Predicted Gene

Lj4g3v0200060.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj4g3v0200060.1 Non Chatacterized Hit- tr|I0YI33|I0YI33_9CHLO
Uncharacterized protein OS=Coccomyxa subellipsoidea
C-,28.37,1e-18,Nucleotid_trans,Nucleotide-diphospho-sugar transferase;
seg,NULL; UNCHARACTERIZED,NULL; RETICULON,Re,CUFF.46638.1
         (1065 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC57415 similar to UniRef100_A7PI01 Cluster: Chromosome...  2111   0.0  

>gnl|LJGI|TC57415 similar to UniRef100_A7PI01 Cluster: Chromosome chr13 scaffold_17,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr13 scaffold_17, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (89%)
          Length = 1725

 Score = 2111 bits (1065), Expect = 0.0
 Identities = 1065/1065 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgtcatcgtttctccaccaacgaagcctcaccaacccgctttcgaatccatttccagtt 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 158  atgtcatcgtttctccaccaacgaagcctcaccaacccgctttcgaatccatttccagtt 217

                                                                        
Query: 61   tcatctccttcaaccaattcgaagaaacccatttcgattctgggtccaaccaccctcctt 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 218  tcatctccttcaaccaattcgaagaaacccatttcgattctgggtccaaccaccctcctt 277

                                                                        
Query: 121  gccctcttggctctcatggtggtgctcggtgtgttgtgtccatgggtgggtatgccctat 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 278  gccctcttggctctcatggtggtgctcggtgtgttgtgtccatgggtgggtatgccctat 337

                                                                        
Query: 181  ggtctctcctttacctcaaaacctgcagtttccaaatggggtcactatacattggaacaa 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 338  ggtctctcctttacctcaaaacctgcagtttccaaatggggtcactatacattggaacaa 397

                                                                        
Query: 241  gcactgtcgtttgtggcaagaaatgggactgtgattgtttgtattgtgagtcagccttac 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 398  gcactgtcgtttgtggcaagaaatgggactgtgattgtttgtattgtgagtcagccttac 457

                                                                        
Query: 301  ttgccttttctcaacaactggttgataagtatcagtatgcagaagcggcaggacatggtt 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 458  ttgccttttctcaacaactggttgataagtatcagtatgcagaagcggcaggacatggtt 517

                                                                        
Query: 361  cttgtcattgctgaggactactattcactctataaggtgaatgagctttggcctggtcat 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 518  cttgtcattgctgaggactactattcactctataaggtgaatgagctttggcctggtcat 577

                                                                        
Query: 421  gctgtgcttattcctcctgtgcttgaggctgaggatgcccataagtttggttccaagggt 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 578  gctgtgcttattcctcctgtgcttgaggctgaggatgcccataagtttggttccaagggt 637

                                                                        
Query: 481  ttcttcaactttacagccaggaggccaagccatctgctgaagattttggagcatggatat 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 638  ttcttcaactttacagccaggaggccaagccatctgctgaagattttggagcatggatat 697

                                                                        
Query: 541  agtgtaatgtacaatgatgttgatatggtttggttagctgatccatttccctatctggta 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 698  agtgtaatgtacaatgatgttgatatggtttggttagctgatccatttccctatctggta 757

                                                                        
Query: 601  gggaaccatgatgtgtactttacagatgatatgactgaaattaaaccattgaaccactct 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 758  gggaaccatgatgtgtactttacagatgatatgactgaaattaaaccattgaaccactct 817

                                                                        
Query: 661  catgatttacccccaccaggaaaaaagggccgcccgtacatatgtagttgcatgattttc 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 818  catgatttacccccaccaggaaaaaagggccgcccgtacatatgtagttgcatgattttc 877

                                                                        
Query: 721  cttcaccccactgatggatcaaagctaattttgaagaagtggattgaggagcttgagctt 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 878  cttcaccccactgatggatcaaagctaattttgaagaagtggattgaggagcttgagctt 937

                                                                        
Query: 781  cagccgtggtctagaactaagaaatctaatgatcagcctgcttttaactgggctttaatg 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 938  cagccgtggtctagaactaagaaatctaatgatcagcctgcttttaactgggctttaatg 997

                                                                        
Query: 841  aagaatgctaaagaggttgatttgtacctgcttccacagccagcattccctacgggtgga 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 998  aagaatgctaaagaggttgatttgtacctgcttccacagccagcattccctacgggtgga 1057

                                                                        
Query: 901  ttatatttcaagaacaagacatgggttaaggaaactaaagggaagcatgttataattcat 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1058 ttatatttcaagaacaagacatgggttaaggaaactaaagggaagcatgttataattcat 1117

                                                                        
Query: 961  aacaactacattgttggttttgagaagaagataaagcggtttcgtgattatggcctctgg 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1118 aacaactacattgttggttttgagaagaagataaagcggtttcgtgattatggcctctgg 1177

                                                         
Query: 1021 ctggtggatgatcatgcaaaagagtcccctctaggtacattatga 1065
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1178 ctggtggatgatcatgcaaaagagtcccctctaggtacattatga 1222