Miyakogusa Predicted Gene

Lj4g3v0189930.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj4g3v0189930.1 tr|Q84UE8|Q84UE8_LOTJA Proliferating floral
organs protein OS=Lotus japonicus GN=Pfo PE=2 SV=1,100,0,A Receptor
for Ubiquitination Targets,F-box domain, cyclin-like; FBOX,F-box
domain, cyclin-like; no ,CUFF.46628.1
         (1351 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC57155 UniRef100_Q84UE8 Cluster: Proliferating floral ...  1897   0.0  

>gnl|LJGI|TC57155 UniRef100_Q84UE8 Cluster: Proliferating floral organs protein; n=1;
            Lotus japonicus|Rep: Proliferating floral organs protein
            - Lotus japonicus, complete
          Length = 2288

 Score = 1897 bits (957), Expect = 0.0
 Identities = 957/957 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 395  ttattaccggttctgctggcactgcctcctgtgaaggatacctgtttgaccccgctgaga 454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1031 ttattaccggttctgctggcactgcctcctgtgaaggatacctgtttgaccccgctgaga 1090

                                                                        
Query: 455  tggcgtggtaccgcatctcctttgctatgatcccaccaggattctctccagcctcatcct 514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1091 tggcgtggtaccgcatctcctttgctatgatcccaccaggattctctccagcctcatcct 1150

                                                                        
Query: 515  ctgcaggccttctctgttgggcctcagatgaggctggcccaaaaaccatgcttctctcca 574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1151 ctgcaggccttctctgttgggcctcagatgaggctggcccaaaaaccatgcttctctcca 1210

                                                                        
Query: 575  accctatcctgggctccttaacccagctccctccaactctaaggccaaggctcttccctt 634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1211 accctatcctgggctccttaacccagctccctccaactctaaggccaaggctcttccctt 1270

                                                                        
Query: 635  ccattggcctaaccatcaccccaacctgcatagacgtgactgtagcaggtgatgacatga 694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1271 ccattggcctaaccatcaccccaacctgcatagacgtgactgtagcaggtgatgacatga 1330

                                                                        
Query: 695  tatccccttatgccgtcaagaacctcacatcggaaagcttccacatcgacggtggaggct 754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1331 tatccccttatgccgtcaagaacctcacatcggaaagcttccacatcgacggtggaggct 1390

                                                                        
Query: 755  tttactcgatgtggggcacgacctccccgcttccaaggctctgcagccttgaaagcggta 814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1391 tttactcgatgtggggcacgacctccccgcttccaaggctctgcagccttgaaagcggta 1450

                                                                        
Query: 815  ggatggtgtgtgctgaggggaaattctactgcatgaactgcagcccttttagtgttttag 874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1451 ggatggtgtgtgctgaggggaaattctactgcatgaactgcagcccttttagtgttttag 1510

                                                                        
Query: 875  cctatgacattgcatccaccacttggttcaagattcaagctcctatgaggaggtttttaa 934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1511 cctatgacattgcatccaccacttggttcaagattcaagctcctatgaggaggtttttaa 1570

                                                                        
Query: 935  ggtctcctaacctggttgagtgtagggagaagctgatgctggttgcggcggttgagaaga 994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1571 ggtctcctaacctggttgagtgtagggagaagctgatgctggttgcggcggttgagaaga 1630

                                                                        
Query: 995  gcaagctgaatgttccaaggagtttgagggtgtggacgttgcaggcttgtgggaccatgt 1054
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1631 gcaagctgaatgttccaaggagtttgagggtgtggacgttgcaggcttgtgggaccatgt 1690

                                                                        
Query: 1055 gggtggaatctgagaggatgccgcagcagctttacattcagtttgctgagattgaaggtg 1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1691 gggtggaatctgagaggatgccgcagcagctttacattcagtttgctgagattgaaggtg 1750

                                                                        
Query: 1115 gaaatgggtttgaatgtgtagggcatggtgagtttgtggtgatcatgatcaaagggacag 1174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1751 gaaatgggtttgaatgtgtagggcatggtgagtttgtggtgatcatgatcaaagggacag 1810

                                                                        
Query: 1175 ataaggcgttgctgtatgatttggtgaggaagaggtggcagtggattccgccgtgtcctt 1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1811 ataaggcgttgctgtatgatttggtgaggaagaggtggcagtggattccgccgtgtcctt 1870

                                                                        
Query: 1235 atgctggttatgatgggtttgagttgcatggttttgcttatgagcctagattggctactc 1294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1871 atgctggttatgatgggtttgagttgcatggttttgcttatgagcctagattggctactc 1930

                                                                     
Query: 1295 ctgttactgcacttcttgatcagttggcacttccttttcagagttacaatgcttagg 1351
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1931 ctgttactgcacttcttgatcagttggcacttccttttcagagttacaatgcttagg 1987



 Score =  692 bits (349), Expect = 0.0
 Identities = 349/349 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   atggaaggttttcacccatctatgactatggcctctccttttccttacacattccccatc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 637 atggaaggttttcacccatctatgactatggcctctccttttccttacacattccccatc 696

                                                                       
Query: 61  agtgctggtggtattggtgttggtgttgttggtgttggtagtagcaatctaaccaccccc 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 697 agtgctggtggtattggtgttggtgttgttggtgttggtagtagcaatctaaccaccccc 756

                                                                       
Query: 121 acccccactgccactggaacttacaacaacactccatggatgaacagcaggatatggagc 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 757 acccccactgccactggaacttacaacaacactccatggatgaacagcaggatatggagc 816

                                                                       
Query: 181 aagctccctcagaagcttctggaccgagtcattgccttcctccctacaccggctttcttc 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 817 aagctccctcagaagcttctggaccgagtcattgccttcctccctacaccggctttcttc 876

                                                                       
Query: 241 cgagcacgctccgtctgcaagagatggtactctcttctcttctctaacaccttccttgaa 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 877 cgagcacgctccgtctgcaagagatggtactctcttctcttctctaacaccttccttgaa 936

                                                            
Query: 301 ttgtacctccacctctcccctcgccgccactggttcatcttcttcaagc 349
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 937 ttgtacctccacctctcccctcgccgccactggttcatcttcttcaagc 985