Miyakogusa Predicted Gene
- Lj4g3v0153950.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj4g3v0153950.1 tr|G7JI15|G7JI15_MEDTR Calcium-independent
phospholipase A2-gamma OS=Medicago truncatula
GN=MTR_4g13,84.76,0,FAMILY NOT NAMED,NULL;
Patatin,Patatin/Phospholipase A2-related; LRR_8,NULL; Arm,Armadillo;
no descr,CUFF.46588.1
(3978 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC71204 similar to UniRef100_A7QUL2 Cluster: Chromosome... 1923 0.0
gnl|LJGI|AV767691 similar to UniRef100_A7QUL2 Cluster: Chromosom... 1223 0.0
gnl|LJGI|TC82624 similar to UniRef100_A7QUL2 Cluster: Chromosome... 1183 0.0
>gnl|LJGI|TC71204 similar to UniRef100_A7QUL2 Cluster: Chromosome chr10 scaffold_179,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr10 scaffold_179, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (24%)
Length = 1121
Score = 1923 bits (970), Expect = 0.0
Identities = 1000/1008 (99%), Gaps = 4/1008 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2975 caggaagcttcccttcaagtccacttgtgtatagccctgatataggtcagaggattggac 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 caggaagcttcccttcaagtccacttgtgtatagccctgatataggtcagaggattggac 61
Query: 3035 gaattgatctggtaccacctttaagtttagatggtcagttgggaaaatcagctgcatcgc 3094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 gaattgatctggtaccacctttaagtttagatggtcagttgggaaaatcagctgcatcgc 121
Query: 3095 ctccagtatctcctcgaggacttaggcagctctctgtgcctgtcaaagcattgcatgaga 3154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 122 ctccagtatctcctcgaggacttaggcagctctctgtgcctgtcaaagcattgcacgaga 181
Query: 3155 aattgcagaattcaccacaagtgggtgttatacatttgtctcttcaaaatgactcagatg 3214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 aattgcagaattcaccacaagtgggtgttatacatttgtctcttcaaaatgactcagatg 241
Query: 3215 gcttaattgttagttggcacaatgatgtgtttgtggtggctgaacctggagagcttgctg 3274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 gcttaattgttagttggcacaatgatgtgtttgtggtggctgaacctggagagcttgctg 301
Query: 3275 ataaatttctacaaagtgttaaattcagtttgttgtcaacaatgaggagacatcgcagga 3334
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ataaatttctacaaagtgttaaattcagtttgctgtcaacaatgaggagacatcgcagga 361
Query: 3335 agggcgcatctctcttggcaaatatttctaccatttctgatttagttgcctttaaacctt 3394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 agggcgcatctctcttggcaaatatttctaccatttctgatttagttgcctttaaacctt 421
Query: 3395 atttccaaattggaggcattgttcaccgttatctaggacgtcaaaccctagttatggaag 3454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 atttccaaattggaggcattgttcaccgttatctaggacgtcaaaccctagttatggaag 481
Query: 3455 atgatcatgaaatttgttcatacatgttccgtaggactgttccctctatgcatttatcac 3514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 atgatcatgaaatttgttcatacatgttccgtaggactgttccctctatgcatttatcac 541
Query: 3515 atgatgatgtaagatggatggttggagcttggagagacaggatcataatatgcaca-ggg 3573
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 542 atgatgatgtaagatggatggttggagcttggagagacaggatcataatatgcacagggg 601
Query: 3574 acatatggacctactccttctcttattaaggccttgctggattcaggtgccaaagctgtc 3633
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 acatatggacctactccttctcttattaaggcctcgctggattcaggtgccaaagctgtc 661
Query: 3634 gtatgttcttcaaatgaaccaccagaatctcagtt---gacgtccttcgatggttccaga 3690
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 gtatgttcttcaaatgaaccaccagaatctcagttgacgacgtccttcgatggttccaga 721
Query: 3691 gagatgaatgcgatggaaaatgggaagtttgaaatcggagaggacgatgcagacgatgag 3750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 gagatgaatgcgatggaaaatgggaagtttgaaatcggagaggacgatgcagacgatgag 781
Query: 3751 aacgtacctgccagtccagttagtgactgggaagatagtgacggtgagaaaattttggac 3810
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 aacgtacctgccagtccagttagtgactgggaagacagtgacggtgagaaaattttggac 841
Query: 3811 cgcagtttttctttttgggacgatgatgaagaggaactgtcacaatttgtttgtcagata 3870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 cgcagtttttctttttgggacgatgatgaagaggaactgtcacaatttgtttgtcagata 901
Query: 3871 tacgaatcattattcagggagggtgctggtatcaatgttgccttgcaacatgcccttgcc 3930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 tacgaatcattattcagggagggtgctggtatcaatgttgccttgcaacatgcccttgcc 961
Query: 3931 tcatatcgaaaaatggggtatgtgtgccatctccctggcgtacaataa 3978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 tcatatcgaaaaatggggtatgtgtgccatctccctggcgtacaataa 1009
>gnl|LJGI|AV767691 similar to UniRef100_A7QUL2 Cluster: Chromosome chr10 scaffold_179,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr10 scaffold_179, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (14%)
Length = 617
Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0
Identities = 617/617 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2489 ctgttgatcgcgtggaggaagctttaagtacattgttacctatgcttcctgaaatacaat 2548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 617 ctgttgatcgcgtggaggaagctttaagtacattgttacctatgcttcctgaaatacaat 558
Query: 2549 attttcgtttcaatccagttgatgaacgttgtgatatggaacttgatgagacagatccaa 2608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 557 attttcgtttcaatccagttgatgaacgttgtgatatggaacttgatgagacagatccaa 498
Query: 2609 caaactggctaaagttggaatctgcaattgaagaatatatgcaacagaatcatcatgcat 2668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 caaactggctaaagttggaatctgcaattgaagaatatatgcaacagaatcatcatgcat 438
Query: 2669 ttgaaaatgcgtgtgagagattgcttcttcctttccagcatgacgagaacctgagatcta 2728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ttgaaaatgcgtgtgagagattgcttcttcctttccagcatgacgagaacctgagatcta 378
Query: 2729 aattacccaagacaaaggagtcaaacgagggtgcaaatggccctactttagggtggaggc 2788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 aattacccaagacaaaggagtcaaacgagggtgcaaatggccctactttagggtggaggc 318
Query: 2789 gcaatgtcctacttgttgaagcttcacatgatccagattctggaaggatgatccatcatg 2848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 gcaatgtcctacttgttgaagcttcacatgatccagattctggaaggatgatccatcatg 258
Query: 2849 ccagggcgctcgagtcattctgtgctcgtaatagcatacggttatccctcatgcaaggct 2908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 ccagggcgctcgagtcattctgtgctcgtaatagcatacggttatccctcatgcaaggct 198
Query: 2909 tgtcggggatagtcaagacagtgccatcaacaacattcgcgactccatttgcgtcacctt 2968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgtcggggatagtcaagacagtgccatcaacaacattcgcgactccatttgcgtcacctt 138
Query: 2969 tgttcacaggaagcttcccttcaagtccacttgtgtatagccctgatataggtcagagga 3028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 tgttcacaggaagcttcccttcaagtccacttgtgtatagccctgatataggtcagagga 78
Query: 3029 ttggacgaattgatctggtaccacctttaagtttagatggtcagttgggaaaatcagctg 3088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 ttggacgaattgatctggtaccacctttaagtttagatggtcagttgggaaaatcagctg 18
Query: 3089 catcgcctccagtatct 3105
|||||||||||||||||
Sbjct: 17 catcgcctccagtatct 1
>gnl|LJGI|TC82624 similar to UniRef100_A7QUL2 Cluster: Chromosome chr10 scaffold_179,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr10 scaffold_179, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (15%)
Length = 599
Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0
Identities = 597/597 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1741 ggcggaatgctagctgttgcccttgggattaagttaatgacattggaagaatgtgaagat 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 ggcggaatgctagctgttgcccttgggattaagttaatgacattggaagaatgtgaagat 62
Query: 1801 atatacaaaaatcttggtaagcttgttttcgctgatcctgttcccaaggacaatgaagct 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 atatacaaaaatcttggtaagcttgttttcgctgatcctgttcccaaggacaatgaagct 122
Query: 1861 gcatcatggagagaaaagttagatcaactttataagagttcatcacagagctttagagtt 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 gcatcatggagagaaaagttagatcaactttataagagttcatcacagagctttagagtt 182
Query: 1921 gttgttcatggatcaaaacacagtgcagatcagttcgagaggctattaaaggaaatgtgt 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 gttgttcatggatcaaaacacagtgcagatcagttcgagaggctattaaaggaaatgtgt 242
Query: 1981 agtgatgaagatggggatctaatgatagactctgctgtgaaaaatgtgcccaaagttttt 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 agtgatgaagatggggatctaatgatagactctgctgtgaaaaatgtgcccaaagttttt 302
Query: 2041 gttgtatcaaccttagtgagcatgatgccagcacagccgttcatatttcgtaattatcag 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 gttgtatcaaccttagtgagcatgatgccagcacagccgttcatatttcgtaattatcag 362
Query: 2101 tatcctgctggaacaccagaggtggctcttacaacatcagatagttctgggatcactgta 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 tatcctgctggaacaccagaggtggctcttacaacatcagatagttctgggatcactgta 422
Query: 2161 ttagcatcgcctattggtggacaagctggctataaacgcagtgcattcattggaagttgt 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 ttagcatcgcctattggtggacaagctggctataaacgcagtgcattcattggaagttgt 482
Query: 2221 aagcatcaagtgtggcaggctatcagagcgtcatctgctgctccttattatcttgatgat 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 483 aagcatcaagtgtggcaggctatcagagcgtcatctgctgctccttattatcttgatgat 542
Query: 2281 ttctcagttgatgtcaaccgctggcaagatggtgcgatagtggcaaacaatcctaca 2337
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 543 ttctcagttgatgtcaaccgctggcaagatggtgcgatagtggcaaacaatcctaca 599