Miyakogusa Predicted Gene
- Lj3g3v3755420.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj3g3v3755420.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1LNN6|I1LNN6_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.43804
PE,84.85,0,Elongator protein 3, MiaB family, Radical SA,Elongator
protein 3/MiaB/NifB; TRAM,TRAM domain; MTTASE,CUFF.46340.1
(1806 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC58540 similar to UniRef100_A7Q7H0 Cluster: Chromosome... 2589 0.0
gnl|LJGI|TC60849 similar to UniRef100_A7Q7H0 Cluster: Chromosome... 2226 0.0
>gnl|LJGI|TC58540 similar to UniRef100_A7Q7H0 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_59,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_59, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (68%)
Length = 2641
Score = 2589 bits (1306), Expect = 0.0
Identities = 1312/1314 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaggacattgaggatatgctgatcggaaccacaactggtcacccggcaggctttcgt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 atggaggacattgaggatatgctgatcggaaccacaactggtcacccggcaggctttcgt 134
Query: 61 ttgccagtagcggcagttggtgttggcgttggaacgaagaggaatcagcgttgttcacct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 ttgccagtagcggcagttggtgttggcgttggaacgaagaggaatcagcgttgttcacct 194
Query: 121 tgttcttctgcaatccctggcactcagactatctacatgaagaccttcggctgctctcat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 tgttcttctgcaatccctggcactcagactatctacatgaagaccttcggctgctctcat 254
Query: 181 aaccagagtgacagtgaatatatggctggtcagctttcggctttcggctattcattgagt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 aaccagagtgacagtgaatatatggctggtcagctttcggctttcggctattcattgagt 314
Query: 241 gataaccccgacgaagccgatctatggctcatcaacacttgcacagtcaaatccccaagt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 gataaccccgacgaagccgatctatggctcatcaacacttgcacagtcaaatccccaagt 374
Query: 301 caatctgccatggacaccatcatagcaaaaggtaaatcttcaaataaaccactagttgtt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375 caatctgccatggacaccatcatagcaaaaggtaaatcttcaaataaaccactagttgtt 434
Query: 361 tctggctgtgtacctcaaggaagtcgagatttgaaagagctcgacgggatcagcatagtt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 tctggctgtgtacctcaaggaagtcgagatttgaaagagctcgacgggatcagcatagtt 494
Query: 421 ggagtccagcaaattcatcgtgttgttgaagttgtagaggagactttaaaaggtcatgaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 495 ggagtccagcaaattcatcgtgttgttgaagttgtagaggagactttaaaaggtcatgaa 554
Query: 481 gtgcgtcttttgacccgtaagacattgccagcacttgaccttccaaaggtgagaaagaac 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 555 gtgcgtcttttgacccgtaagacattgccagcacttgaccttccaaaggtgagaaagaac 614
Query: 541 aagtttgttgagattcttccaattaatgttggttgtttaggtgcgtgcacttattgcaag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 615 aagtttgttgagattcttccaattaatgttggttgtttaggtgcgtgcacttattgcaag 674
Query: 601 acaaagcatgctcggggtcacctagggagttacactatagatagccttgttgggcgtgta 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 675 acaaagcatgctcggggtcacctagggagttacactatagatagccttgttgggcgtgca 734
Query: 661 aaatctgtcatatctgatggagttaaagagatttggctaagcagtgaagacactggagct 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 735 aaatctgtcatatctgatggagttaaagagatttggctaagcagtgaagacactggagct 794
Query: 721 tatggtcgtgacattggtgccaatcttccaaatttattgaatgcattagtagcagaacta 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 795 tatggtcgtgacattggtgccaatcttccaaatttattgaatgcattagtagcagaacta 854
Query: 781 ccacctaatgcgagcactatgcttcgtatcggaatgaccaatcctccttttatccttgag 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 855 ccacctaatgcgagcactatgcttcgtatcggaatgaccaatcctccttttacccttgag 914
Query: 841 cacttgaaagagatagcagagattttgcggcatccatgtgtgtattcttttttgcatgta 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 915 cacttgaaagagatagcagagattttgcggcatccatgtgtgtattcttttttgcatgta 974
Query: 901 ccagttcagtctggaagtgatactattttgagtgcaatgaatcgggaatatactgtgagt 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 975 ccagttcagtctggaagtgatactattttgagtgcaatgaatcgggaatatactgtgagt 1034
Query: 961 gagttcaggactgttgtagataccttaactgagcttgtgccagggatgcagattgccacc 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1035 gagttcaggactgttgtagataccttaactgagcttgtgccagggatgcagattgccacc 1094
Query: 1021 gatataatatgtggatttcctggtgaaactgatgaggatttttcacaaactgtcaacctc 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1095 gatataatatgtggatttcctggtgaaactgatgaggatttttcacaaactgtcaacctc 1154
Query: 1081 atcaaagagtacaagttctctcaagttcatatttcacaattttatcctcgaccagggaca 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1155 atcaaagagtacaagttctctcaagttcatatttcacaattttatcctcgaccagggaca 1214
Query: 1141 cctgctgcaaggatgaaaaaggttccaagtaatgtggtgaagagaagaagccgtgaactg 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1215 cctgctgcaaggatgaaaaaggttccaagtaatgtggtgaagagaagaagccgtgaactg 1274
Query: 1201 accaatgtttttgaagccttcacaccatactctgggatggaaggcaaagtggaaagaatc 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1275 accaatgtttttgaagccttcacaccatactctgggatggaaggcaaagtggaaagaatc 1334
Query: 1261 tggattactgatgttgcatctgatggagttcacttggttggtcatacgaaggga 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1335 tggattactgatgttgcatctgatggagttcacttggttggtcatacgaaggga 1388
>gnl|LJGI|TC60849 similar to UniRef100_A7Q7H0 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_59,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_59, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (47%)
Length = 1401
Score = 2226 bits (1123), Expect = 0.0
Identities = 1129/1131 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 676 gatggagttaaagagatttggctaagcagtgaagacactggagcttatggtcgtgacatt 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gatggagttaaagagatttggctaagcagtgaagacactggagcttatggtcgtgacatt 60
Query: 736 ggtgccaatcttccaaatttattgaatgcattagtagcagaactaccacctaatgcgagc 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ggtgccaatcttccaaatttattgaatgcattagtagcagaactaccacctaatgcgagc 120
Query: 796 actatgcttcgtatcggaatgaccaatcctccttttatccttgagcacttgaaagagata 855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 actatgcttcgtatcggaatgaccaatcctccttttatccttgagcacttgaaagagata 180
Query: 856 gcagagattttgcggcatccatgtgtgtattcttttttgcatgtaccagttcagtctgga 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gcagagattttgcggcatccatgtgtgtattcttttttgcatgtaccagttcagtctgga 240
Query: 916 agtgatactattttgagtgcaatgaatcgggaatatactgtgagtgagttcaggactgtt 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 agtgatactattttgagtgcaatgaatcgggaatatactgtgagtgagttcaggactgtt 300
Query: 976 gtagataccttaactgagcttgtgccagggatgcagattgccaccgatataatatgtgga 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagataccttaactgagcttgtgccagggatgcagattgccaccgatataatatgtgga 360
Query: 1036 tttcctggtgaaactgatgaggatttttcacaaactgtcaacctcatcaaagagtacaag 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tttcctggtgaaactgatgaggatttttcacaaactgtcaacctcatcaaagagtacaag 420
Query: 1096 ttctctcaagttcatatttcacaattttatcctcgaccagggacacctgctgcaaggatg 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttctctcaagttcatatttcacaattttatcctcgaccagggacacctgctgcaaggatg 480
Query: 1156 aaaaaggttccaagtaatgtggtgaagagaagaagccgtgaactgaccaatgtttttgaa 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aaaaaggttccaagtaatgtggtgaagagaagaagccgtgaactgaccaatgtttttgaa 540
Query: 1216 gccttcacaccatactctgggatggaaggcaaagtggaaagaatctggattactgatgtt 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gccttcacaccatactctgggatggaaggcaaagtggaaagaatctggattactgatgtt 600
Query: 1276 gcatctgatggagttcacttggttggtcatacgaagggatatatacaagttcttgtaatt 1335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gcatctgatggagttcacttggttggtcatacgaagggatatatacaagttcttgtaatt 660
Query: 1336 gctccagactatatgctgggaacttcagctatggttaaaataacatctgttggaaggtgg 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gctccagactatatgctgggaacttcagctatggttaaaataacatctgttggaaggtgg 720
Query: 1396 tcagtttttggggaagtaattgagatggtcaaccatgtaagtgatgataaagtcgtaaac 1455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 tcagtttttggggaagtaattgagatggtcaaccatgtaagtgatgataaagtcgtaaac 780
Query: 1456 aagcaggatcccaatcaggacatgcaagagccagaatcttgtgcttgtggaaatgatatt 1515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 aagcaggatcccaatcaggacatgcaagagccagaatcttgtgcttgtggaaatgatatt 840
Query: 1516 gacagctgctgtggtcagagtaatctcgataagaatgatcagtcaagaggccctgcagag 1575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 gacagctgctgtggtcagagtaatctcgataagaatgatcagtcaagaggccctgcagag 900
Query: 1576 ccacagagtcaaaacagtagaaatttcatcggatggatactgaggaagcggaagcatctg 1635
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 ccacagagtccaaacagtagaaatttcatcggatggatactgaggaagcggaagcatctg 960
Query: 1636 cacaaaggggtagagagtgaacttgcgtccggatctgttcaaaatcaagaagggagcatg 1695
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 caccaaggggtagagagtgaacttgcgtccggatctgttcaaaatcaagaagggagcatg 1020
Query: 1696 aaaaagttggactttgttgacaaggctcttttgagcggaatatctatcagcatctttatg 1755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 aaaaagttggactttgttgacaaggctcttttgagcggaatatctatcagcatctttatg 1080
Query: 1756 attattgctatagtagctgctcttacgtttagggttatttggtcccagtaa 1806
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 attattgctatagtagctgctcttacgtttagggttatttggtcccagtaa 1131