Miyakogusa Predicted Gene

Lj3g3v3189730.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj3g3v3189730.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1LK32|I1LK32_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=4 SV=1,83.41,0,seg,NULL;
ARM_REPEAT,Armadillo; coiled-coil,NULL; Modified RING finger domain,U
box domain; Armadill,CUFF.45422.1
         (1962 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC63883 similar to UniRef100_A7NZ27 Cluster: Chromosome...  3889   0.0  

>gnl|LJGI|TC63883 similar to UniRef100_A7NZ27 Cluster: Chromosome chr6 scaffold_3,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr6 scaffold_3, whole genome shotgun sequence
            - Vitis vinifera (Grape), partial (88%)
          Length = 2549

 Score = 3889 bits (1962), Expect = 0.0
 Identities = 1962/1962 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atggaggttgttgttgaggttgagatagctggctcggtgattgagctggtgaatgagata 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 206  atggaggttgttgttgaggttgagatagctggctcggtgattgagctggtgaatgagata 265

                                                                        
Query: 61   gctagcatctctgacttcagacctatggtgaagaagcagtactgcaacttggcacgcagg 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 266  gctagcatctctgacttcagacctatggtgaagaagcagtactgcaacttggcacgcagg 325

                                                                        
Query: 121  ttgaagcttctcgtgcctttgttcgaggaaattagggacatgaaagatcccatcactgac 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 326  ttgaagcttctcgtgcctttgttcgaggaaattagggacatgaaagatcccatcactgac 385

                                                                        
Query: 181  gaaacttcgaaatccatgcttgcttttaaggaagctcttgaatctgcaaaggagcttctc 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 386  gaaacttcgaaatccatgcttgcttttaaggaagctcttgaatctgcaaaggagcttctc 445

                                                                        
Query: 241  aaattcggatgtgaaggcagcaagatttacatggttcttgagagggaccaaatcatgaac 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 446  aaattcggatgtgaaggcagcaagatttacatggttcttgagagggaccaaatcatgaac 505

                                                                        
Query: 301  aaattctatgaggtgacagctcggctggaacaatcattgaatggaatttcctatgataaa 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 506  aaattctatgaggtgacagctcggctggaacaatcattgaatggaatttcctatgataaa 565

                                                                        
Query: 361  cttgacatttctgatgaagttaaggagcaggttgaattggttcttgcccagtttagaaga 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 566  cttgacatttctgatgaagttaaggagcaggttgaattggttcttgcccagtttagaaga 625

                                                                        
Query: 421  gccaaaggaagggttgatgaacctgatgtcaagttgtatgaggatatattgtccctttac 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 626  gccaaaggaagggttgatgaacctgatgtcaagttgtatgaggatatattgtccctttac 685

                                                                        
Query: 481  aatgatagtagtgatgcagctacagatccagctgttcttagccgattagctgaaaaattg 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 686  aatgatagtagtgatgcagctacagatccagctgttcttagccgattagctgaaaaattg 745

                                                                        
Query: 541  caattgatggggatagccgattttattcatgaatctctcacattacatgacatggtggga 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 746  caattgatggggatagccgattttattcatgaatctctcacattacatgacatggtggga 805

                                                                        
Query: 601  gcgagtggtggggatccaggggcacgcatcgagaagatgtcaatgttattgaagaagata 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 806  gcgagtggtggggatccaggggcacgcatcgagaagatgtcaatgttattgaagaagata 865

                                                                        
Query: 661  aaggattatgtgcaaactgaaaacctagtcaaggatgataatgttggagcaaaaggcctt 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 866  aaggattatgtgcaaactgaaaacctagtcaaggatgataatgttggagcaaaaggcctt 925

                                                                        
Query: 721  ccttcaagcgttagcagattagggtcaatcgaaaagaatcatccggcccttgttatccct 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 926  ccttcaagcgttagcagattagggtcaatcgaaaagaatcatccggcccttgttatccct 985

                                                                        
Query: 781  actgattttaaatgtccgatttccttggaattgatgcaggatcctgtcattgtttcaaca 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 986  actgattttaaatgtccgatttccttggaattgatgcaggatcctgtcattgtttcaaca 1045

                                                                        
Query: 841  ggacagacttatgagcgttcttgtattgagaagtggttgcaagctgggcatgggacatgc 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1046 ggacagacttatgagcgttcttgtattgagaagtggttgcaagctgggcatgggacatgc 1105

                                                                        
Query: 901  ccaaaaacacaacagagtctcactagtactgttctcacacccaactacgtgttacggagc 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1106 ccaaaaacacaacagagtctcactagtactgttctcacacccaactacgtgttacggagc 1165

                                                                        
Query: 961  ctcatagaacaatggtgtgaagccaatggcatagagccaccaaaacgacccagcacctct 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1166 ctcatagaacaatggtgtgaagccaatggcatagagccaccaaaacgacccagcacctct 1225

                                                                        
Query: 1021 caacctagcaaatcagcatcagcctgcaccccagctgagcgaagtaagattgaaaatctt 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1226 caacctagcaaatcagcatcagcctgcaccccagctgagcgaagtaagattgaaaatctt 1285

                                                                        
Query: 1081 ctccaaaagctctcatctggtaatcctgaagaccagagattagctgctggtgagatccgc 1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1286 ctccaaaagctctcatctggtaatcctgaagaccagagattagctgctggtgagatccgc 1345

                                                                        
Query: 1141 cttcttgcaaagcgcaatgcagataatcgggtcgcaattgctgaagctggagcaatacct 1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1346 cttcttgcaaagcgcaatgcagataatcgggtcgcaattgctgaagctggagcaatacct 1405

                                                                        
Query: 1201 ctccttgttggtctcttgtccgtgcccgactctcgcactcaagagcatgctgtgacagcg 1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1406 ctccttgttggtctcttgtccgtgcccgactctcgcactcaagagcatgctgtgacagcg 1465

                                                                        
Query: 1261 cttttgaatctttccatatatgagaataacaaagggtgcattgtgtcttctggagcagtc 1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1466 cttttgaatctttccatatatgagaataacaaagggtgcattgtgtcttctggagcagtc 1525

                                                                        
Query: 1321 ccaggtatagttcatgtgctgaggaaaggaagcatggaagcccgtgaaaatgcagcagca 1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1526 ccaggtatagttcatgtgctgaggaaaggaagcatggaagcccgtgaaaatgcagcagca 1585

                                                                        
Query: 1381 acacttttcagcctttcggttgtggacgaaaacaaggttacaattggttcttcaggagcc 1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1586 acacttttcagcctttcggttgtggacgaaaacaaggttacaattggttcttcaggagcc 1645

                                                                        
Query: 1441 ataccgccgctagtgacgctgctgagtgaaggtacccaaaggggtaagaaagacgctgca 1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1646 ataccgccgctagtgacgctgctgagtgaaggtacccaaaggggtaagaaagacgctgca 1705

                                                                        
Query: 1501 acagcactcttcaatttgtgcatttaccagggtaacaaaggaaaggcggtgagggcgggt 1560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1706 acagcactcttcaatttgtgcatttaccagggtaacaaaggaaaggcggtgagggcgggt 1765

                                                                        
Query: 1561 gttattcccacactgatgaaactgctgacagaaccaagtggaggaatggtggacgaagca 1620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1766 gttattcccacactgatgaaactgctgacagaaccaagtggaggaatggtggacgaagca 1825

                                                                        
Query: 1621 ttggccattttggcaatcttgtctagtcatcctgatgggaaggctgcgattggtgctgca 1680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1826 ttggccattttggcaatcttgtctagtcatcctgatgggaaggctgcgattggtgctgca 1885

                                                                        
Query: 1681 gatgcggttccaattttggtagagtttattgggaatggatcgccgaggaacaaagagaac 1740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1886 gatgcggttccaattttggtagagtttattgggaatggatcgccgaggaacaaagagaac 1945

                                                                        
Query: 1741 tcagctgctgttttagtgcacctttcttctggtgatcaacaatatctagcacaagcacac 1800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1946 tcagctgctgttttagtgcacctttcttctggtgatcaacaatatctagcacaagcacac 2005

                                                                        
Query: 1801 aaactagggttgatgactcctttgttggaactggctcaacatggtacagatagaggcaaa 1860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2006 aaactagggttgatgactcctttgttggaactggctcaacatggtacagatagaggcaaa 2065

                                                                        
Query: 1861 agaaaggcggcacaattgatagatcgcatgagcaggtttcttgagcagcagaggcagcag 1920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2066 agaaaggcggcacaattgatagatcgcatgagcaggtttcttgagcagcagaggcagcag 2125

                                                      
Query: 1921 caggagcaggtggaggaagttcaaacacaaactgaacctcaa 1962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2126 caggagcaggtggaggaagttcaaacacaaactgaacctcaa 2167