Miyakogusa Predicted Gene

Lj3g3v3069050.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj3g3v3069050.1 gi|13539544|emb|AJ292342.1|.path1.1
         (1593 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC73201 UniRef100_Q9ARC5 Cluster: Membrane transporter;...  2952   0.0  
gnl|LJGI|TC77301 homologue to UniRef100_Q9ARC5 Cluster: Membrane...   805   0.0  

>gnl|LJGI|TC73201 UniRef100_Q9ARC5 Cluster: Membrane transporter; n=1; Lotus
            japonicus|Rep: Membrane transporter - Lotus japonicus,
            complete
          Length = 1950

 Score = 2952 bits (1489), Expect = 0.0
 Identities = 1567/1593 (98%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atggttgaaattgaaggatctccaggaacctccatgcatggagtaacagggagggaacaa 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72   atggttgaaattgaaggatctccaggaacctccatgcatggagtaacagggagggaacaa 131

                                                                        
Query: 61   accttcatatcctcagtttcttccccaatggtcccaacagacaccacagccaaattcgat 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 132  accttcatatcctcagtttcttccccaatggtcccaacagacaccacagccaaattcgat 191

                                                                        
Query: 121  ttaccagttgattcacagcacaaagccaaagttttcaaactgttctcattagctaatcct 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 192  ttaccagttgattcacagcacaaagccaaagttttcaaactgttctcattagctaatcct 251

                                                                        
Query: 181  cacatgacaaccttccacttatcatggatttccttcttcacctgctttgtctctaccttt 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 252  cacatgacaaccttccacttatcatggatttccttcttcacctgctttgtctctaccttt 311

                                                                        
Query: 241  gcagcagctcctcttgtccccatcatccgagacaacctcaatctcaccaaaagcgacatt 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 312  gcagcagctcctcttgtccccatcatccgagacaacctcaatctcaccaaaagcgacatt 371

                                                                        
Query: 301  ggcaacgccggtgtcgcgtctgtctccggcagcattttctccaggctcaccatgggtgta 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 372  ggcaacgccggtgtcgcgtctgtctccggcagcattttctccaggctcaccatgggtgta 431

                                                                        
Query: 361  atttgtgacctcttaggcccacgttacgggtgtgccttcctgatcatgctgtctgcacca 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 432  atttgtgacctcttaggcccacgttacgggtgtgccttcctgatcatgctgtctgcacca 491

                                                                        
Query: 421  actgtgttctgcatgtcgtttgtgaatgatgctgcaggctacattgtggttcggttcatg 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 492  actgtgttctgcatgtcgtttgtgaatgatgctgcaggctacattgtggttcggttcatg 551

                                                                        
Query: 481  atcgggttctcattggccacgtttgtttcgtgccagtactggatgagtaccatgtttaac 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 552  atcgggttctcattggccacgtttgtttcgtgccagtactggatgagtaccatgtttaac 611

                                                                        
Query: 541  agtaagattattgggcttgttaatggaactgcagctggttggggtaacatgggtggtgga 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 612  agtaagattattgggcttgttaatggaactgcagctggttggggtaacatgggtggtgga 671

                                                                        
Query: 601  gccactcagctcatcatgcctattgtctatgaattgatcaggagagcggggtccactggg 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 672  gccactcagctcatcatgcctattgtctatgaattgatcaggagagcggggtccactggg 731

                                                                        
Query: 661  ttcactgcttggaggattgccttcttcatccctggtttcatgcatgttttcatggggatc 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 732  ttcactgcttggaggattgccttcttcatccctggtttcatgcatgttttcatggggatc 791

                                                                        
Query: 721  cttgtcttaacccttggccaagacttgcctgatggcaacctcagtgccctccagaagaag 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 792  cttgtcttaacccttggccaagacttgcctgatggcaacctcagtgccctccagaagaag 851

                                                                        
Query: 781  ggtgatgttgctaaagacaaattctccaaggtgttatggtatgccataacaaattacagg 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 852  ggtgatgttgctaaagacaaattctccaaggtgttatggtatgccataacaaattacagg 911

                                                                        
Query: 841  acatggatctttgcacttctctatggatactctatgggagtcgaattaaccactgacaat 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 912  acatggatctttgcacttctctatggatactctatgggagtcgaattaaccactgacaat 971

                                                                        
Query: 901  gtcattgctgagtatttttatgacagatttaatctgaagttgcacacagttggaatcatt 960
            ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| 
Sbjct: 972  gtcattgctgagtatttctatgacaggtttaatctgaagctgcacacagctggaatcata 1031

                                                                        
Query: 961  gctgcttcttttggaatggcaaatcttgttgctcgcccctttggcggatatgtatctgat 1020
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1032 gctgcttcatttggaatggcaaatcttgttgctcgcccctttggcggatatgtatctgat 1091

                                                                        
Query: 1021 gttgcagcccggttgtttggtatgagaggaagactgtggactctgtggatcctccaaaca 1080
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1092 gttgcagcgcggttgtttggtatgagaggaagactgtggaccctgtggatcctccaaaca 1151

                                                                        
Query: 1081 cttggaggagtgttctgtatatggcttgggcgtgcgaattcacttccaattgcggtgttg 1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct: 1152 cttggaggagtgttctgtatatggcttgggcgtgcgaattcgcttccaattgctgtgttg 1211

                                                                        
Query: 1141 gcgatgatccttttctcagttggagctcaagctgcttgtggtgcaacatttggaatcatt 1200
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1212 gccatgatccttttctcagttggagctcaagctgcttgtggtgcaacatttggaatcatt 1271

                                                                        
Query: 1201 cctttcatctcaaaaaggtctttggggatcatttcaggtctaactggtgcaggtggcaac 1260
            ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct: 1272 cctttcatctcaagaaggtctttggggatcatttcaggtctaaccggtgcaggtggaaac 1331

                                                                        
Query: 1261 tttggttctggattgacacagttggtattcttttctacttcaagattctccacaggtgca 1320
            || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 1332 ttcggttctggtttgacacaattggtattcttttcaacttcaagattctccacagctgca 1391

                                                                        
Query: 1321 ggattgtcatggatgggtgtgatgattgttggttgcactcttccggtgactcttgttcac 1380
            ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||
Sbjct: 1392 ggattgtcatggatgggtgtgatgattgtgggatgcactctccccgtgacacttgttcac 1451

                                                                        
Query: 1381 ttcccacagtggggtagcatgttccttcctccttcaaaagacatcaacaagtccagtgag 1440
            |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1452 ttcccacagtggggaagcatgttcctccctccttcaaaagacatcaacaagtccagtgag 1511

                                                                        
Query: 1441 gaacactattacactgctgaatgggatgaggaagagaggaagaaggggttgcactctcaa 1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1512 gaacactattacactgctgaatgggatgaggaagagaggaagaaggggttgcactctcaa 1571

                                                                        
Query: 1501 agtcttaagtttgcagagaatagtcgctctgagagaggaaaacgtgtttcctctgctcca 1560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1572 agtcttaagtttgcagagaatagtcgctctgagagaggaaaacgtgtttcctctgctcca 1631

                                             
Query: 1561 actcctccaaacacaacccctacccatgtctaa 1593
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1632 actcctccaaacacaacccctacccatgtctaa 1664


>gnl|LJGI|TC77301 homologue to UniRef100_Q9ARC5 Cluster: Membrane transporter; n=1;
            Lotus japonicus|Rep: Membrane transporter - Lotus
            japonicus, partial (33%)
          Length = 901

 Score =  805 bits (406), Expect = 0.0
 Identities = 496/526 (94%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1067 ggatcctccaaacacttggaggagtgttctgtatatggcttgggcgtgcgaattcacttc 1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 2    ggatcctccaaacacttggaggagtgttctgtatatggcttgggcgtgcgaattcgcttc 61

                                                                        
Query: 1127 caattgcggtgttggcgatgatccttttctcagttggagctcaagctgcttgtggtgcaa 1186
            ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62   caattgctgtgttggccatgatccttttctcagttggagctcaagctgcttgtggtgcaa 121

                                                                        
Query: 1187 catttggaatcattcctttcatctcaaaaaggtctttggggatcatttcaggtctaactg 1246
            ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 122  catttggaatcattcctttcatctcaagaaggtctttggggatcatttcaggtctaaccg 181

                                                                        
Query: 1247 gtgcaggtggcaactttggttctggattgacacagttggtattcttttctacttcaagat 1306
            |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 182  gtgcaggtggaaacttcggttctggtttgacacaattggtattcttttcaacttcaagat 241

                                                                        
Query: 1307 tctccacaggtgcaggattgtcatggatgggtgtgatgattgttggttgcactcttccgg 1366
            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |
Sbjct: 242  tctccacagttgcaggattgtcatggatgggtgtgatgattgtgggatgcactctccccg 301

                                                                        
Query: 1367 tgactcttgttcacttcccacagtggggtagcatgttccttcctccttcaaaagacatca 1426
            |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| 
Sbjct: 302  tgacacttgttcacttcccacagtggggaagcatgttcctccctccttcaaaagacatcc 361

                                                                        
Query: 1427 acaagtccagtgaggaacactattacactgctgaatgggatgaggaagagaggaagaagg 1486
            ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 362  acaagtccagtgaagaacactattacactgctgaatgggacgaggaagagaggaagaagg 421

                                                                        
Query: 1487 ggttgcactctcaaagtcttaagtttgcagagaatagtcgctctgagagaggaaaacgtg 1546
            |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| 
Sbjct: 422  ggttacactcacaaagtctcaagtttgcagagaatagtcgctctgagagaggcaagcgta 481

                                                          
Query: 1547 tttcctctgctccaactcctccaaacacaacccctacccatgtcta 1592
            |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 482  tttcctctgcaccaacacctccaaacacaacccctacgcatgtcta 527