Miyakogusa Predicted Gene
- Lj3g3v3069030.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj3g3v3069030.1 tr|Q9ARC5|Q9ARC5_LOTJA Membrane transporter
OS=Lotus japonicus GN=nrt2 PE=2 SV=1,97.36,0,MFS general substrate
transporter,Major facilitator superfamily domain, general substrate
transporte,CUFF.49605.1
(1596 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC73201 UniRef100_Q9ARC5 Cluster: Membrane transporter;... 2775 0.0
gnl|LJGI|TC77301 homologue to UniRef100_Q9ARC5 Cluster: Membrane... 1043 0.0
gnl|LJGI|TC63411 similar to UniRef100_A7QP22 Cluster: Chromosome... 82 1e-14
>gnl|LJGI|TC73201 UniRef100_Q9ARC5 Cluster: Membrane transporter; n=1; Lotus
japonicus|Rep: Membrane transporter - Lotus japonicus,
complete
Length = 1950
Score = 2775 bits (1400), Expect = 0.0
Identities = 1544/1592 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggttgagattgagggatctccaggaagctccatgcatggagtaacaggaagggagcaa 60
|||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 72 atggttgaaattgaaggatctccaggaacctccatgcatggagtaacagggagggaacaa 131
Query: 61 accttcatagccacagttaattccccatctgtcccaacagacaccacagccaaattcgat 120
||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 132 accttcatatcctcagtttcttccccaatggtcccaacagacaccacagccaaattcgat 191
Query: 121 ttacctgttgattcagaacacaaagccaaagttttcaaactgttctcattagccaatcct 180
||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 192 ttaccagttgattcacagcacaaagccaaagttttcaaactgttctcattagctaatcct 251
Query: 181 cacatgagaaccttccacttatcatggatttccttcttcacctgttttgtctctaccttt 240
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 252 cacatgacaaccttccacttatcatggatttccttcttcacctgctttgtctctaccttt 311
Query: 241 gcagcagcccctcttgtccccatcatccgagacaacctcaatctcaccaaaagcgacatc 300
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 312 gcagcagctcctcttgtccccatcatccgagacaacctcaatctcaccaaaagcgacatt 371
Query: 301 ggcaacgccggtgtcgcttctgtctccggcagcattttctccaggctcactatgggtgta 360
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 372 ggcaacgccggtgtcgcgtctgtctccggcagcattttctccaggctcaccatgggtgta 431
Query: 361 atttgtgacctcttaggcccgcgttacggctgcgccttcttgatcatgctgtctgcacca 420
|||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 432 atttgtgacctcttaggcccacgttacgggtgtgccttcctgatcatgctgtctgcacca 491
Query: 421 actgtgttctgcatgtcatttgtgaatgatgctgcaggctacattgtggttcggttcatg 480
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 492 actgtgttctgcatgtcgtttgtgaatgatgctgcaggctacattgtggttcggttcatg 551
Query: 481 atcgggttctcattggccacgtttgtttcgtgccagtactggatgagcaccatgtttaac 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 552 atcgggttctcattggccacgtttgtttcgtgccagtactggatgagtaccatgtttaac 611
Query: 541 actaagattattgggcttgttaatggaactgcagctgggtggggtaatatgggtggtggg 600
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct: 612 agtaagattattgggcttgttaatggaactgcagctggttggggtaacatgggtggtgga 671
Query: 601 gccactcagctcatcatgcctattgtctatgaattgatcaggagagcggggtccactccc 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 672 gccactcagctcatcatgcctattgtctatgaattgatcaggagagcggggtccactggg 731
Query: 661 ttcactgcttggaggattgccttcttcatccctggtttcatgcatgttttcatggggatc 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 732 ttcactgcttggaggattgccttcttcatccctggtttcatgcatgttttcatggggatc 791
Query: 721 cttgtcttaacccttggccaagacttgcctgatggcaacctcagtgccctccagaagaag 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 792 cttgtcttaacccttggccaagacttgcctgatggcaacctcagtgccctccagaagaag 851
Query: 781 ggtgatgttgctaaagacaaattctccaaggtgttatggtatgccataacaaattacagg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 852 ggtgatgttgctaaagacaaattctccaaggtgttatggtatgccataacaaattacagg 911
Query: 841 acatggatctttgcacttctctatggatactctatgggagttgaattaaccactgacaat 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 912 acatggatctttgcacttctctatggatactctatgggagtcgaattaaccactgacaat 971
Query: 901 gtcattgctgagtatttctatgacaggtttaatctgaagctgcacacagctggaatcata 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 972 gtcattgctgagtatttctatgacaggtttaatctgaagctgcacacagctggaatcata 1031
Query: 961 gctgcttcatttggaatggcaaatcttgttgctcgcccctttggcggatatgtatctgat 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1032 gctgcttcatttggaatggcaaatcttgttgctcgcccctttggcggatatgtatctgat 1091
Query: 1021 gttgcagcgcggttgtttggtatgagaggaagactgtggaccctgtggatcctccaaaca 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1092 gttgcagcgcggttgtttggtatgagaggaagactgtggaccctgtggatcctccaaaca 1151
Query: 1081 cttggaggagtgttctgtatatggcttgggcgtgcgaattcgcttccaattgctgtgttg 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1152 cttggaggagtgttctgtatatggcttgggcgtgcgaattcgcttccaattgctgtgttg 1211
Query: 1141 gccatgatccttttctcagttggagctcaagctgcttgtggtgcaacatttggaatcatt 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1212 gccatgatccttttctcagttggagctcaagctgcttgtggtgcaacatttggaatcatt 1271
Query: 1201 cctttcatctcaagaaggtctttggggatcatttcaggtctaaccggtgcaggtggaaac 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1272 cctttcatctcaagaaggtctttggggatcatttcaggtctaaccggtgcaggtggaaac 1331
Query: 1261 ttcggttctggtttgacacaattggtattcttttcaacttcaagattctccacagctgca 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1332 ttcggttctggtttgacacaattggtattcttttcaacttcaagattctccacagctgca 1391
Query: 1321 ggattgtcatggatgggtgtgatgattgtgggatgcactctccccgtgacacttgttcac 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1392 ggattgtcatggatgggtgtgatgattgtgggatgcactctccccgtgacacttgttcac 1451
Query: 1381 ttcccacagtggggaagcatgttcctccctccttcaaaagacatccacaagtccagtgaa 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 1452 ttcccacagtggggaagcatgttcctccctccttcaaaagacatcaacaagtccagtgag 1511
Query: 1441 gaacactattacactgctgaatgggacgaggaagagaggaagaaggggttacactcacaa 1500
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 1512 gaacactattacactgctgaatgggatgaggaagagaggaagaaggggttgcactctcaa 1571
Query: 1501 agtctcaagtttgcagagaatagtcgctctgagagaggcaagcgtatttcctctgcacca 1560
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||
Sbjct: 1572 agtcttaagtttgcagagaatagtcgctctgagagaggaaaacgtgtttcctctgctcca 1631
Query: 1561 acacctccaaacacaacccctacgcatgtcta 1592
|| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1632 actcctccaaacacaacccctacccatgtcta 1663
>gnl|LJGI|TC77301 homologue to UniRef100_Q9ARC5 Cluster: Membrane transporter; n=1;
Lotus japonicus|Rep: Membrane transporter - Lotus
japonicus, partial (33%)
Length = 901
Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0
Identities = 529/530 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1067 ggatcctccaaacacttggaggagtgttctgtatatggcttgggcgtgcgaattcgcttc 1126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 ggatcctccaaacacttggaggagtgttctgtatatggcttgggcgtgcgaattcgcttc 61
Query: 1127 caattgctgtgttggccatgatccttttctcagttggagctcaagctgcttgtggtgcaa 1186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 caattgctgtgttggccatgatccttttctcagttggagctcaagctgcttgtggtgcaa 121
Query: 1187 catttggaatcattcctttcatctcaagaaggtctttggggatcatttcaggtctaaccg 1246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 catttggaatcattcctttcatctcaagaaggtctttggggatcatttcaggtctaaccg 181
Query: 1247 gtgcaggtggaaacttcggttctggtttgacacaattggtattcttttcaacttcaagat 1306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 gtgcaggtggaaacttcggttctggtttgacacaattggtattcttttcaacttcaagat 241
Query: 1307 tctccacagctgcaggattgtcatggatgggtgtgatgattgtgggatgcactctccccg 1366
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 tctccacagttgcaggattgtcatggatgggtgtgatgattgtgggatgcactctccccg 301
Query: 1367 tgacacttgttcacttcccacagtggggaagcatgttcctccctccttcaaaagacatcc 1426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tgacacttgttcacttcccacagtggggaagcatgttcctccctccttcaaaagacatcc 361
Query: 1427 acaagtccagtgaagaacactattacactgctgaatgggacgaggaagagaggaagaagg 1486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 acaagtccagtgaagaacactattacactgctgaatgggacgaggaagagaggaagaagg 421
Query: 1487 ggttacactcacaaagtctcaagtttgcagagaatagtcgctctgagagaggcaagcgta 1546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 ggttacactcacaaagtctcaagtttgcagagaatagtcgctctgagagaggcaagcgta 481
Query: 1547 tttcctctgcaccaacacctccaaacacaacccctacgcatgtctagttt 1596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 tttcctctgcaccaacacctccaaacacaacccctacgcatgtctagttt 531
>gnl|LJGI|TC63411 similar to UniRef100_A7QP22 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_135,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr1 scaffold_135, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (95%)
Length = 1881
Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-14
Identities = 68/77 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 889 accactgacaatgtcattgctgagtatttctatgacaggtttaatctgaagctgcacaca 948
|||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct: 935 accattgacaacatcattgctgagtacttctatgacaggtttaatctgaaacttcacact 994
Query: 949 gctggaatcatagctgc 965
|| |||||||| |||||
Sbjct: 995 gccggaatcatcgctgc 1011