Miyakogusa Predicted Gene

Lj3g3v3069020.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj3g3v3069020.1 tr|Q9ARC5|Q9ARC5_LOTJA Membrane transporter
OS=Lotus japonicus GN=nrt2 PE=2 SV=1,99.02,0,seg,NULL; no
description,NULL; MFS general substrate transporter,Major facilitator
superfamily domai,CUFF.49570.1
         (936 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC73201 UniRef100_Q9ARC5 Cluster: Membrane transporter;...  1842   0.0  

>gnl|LJGI|TC73201 UniRef100_Q9ARC5 Cluster: Membrane transporter; n=1; Lotus
            japonicus|Rep: Membrane transporter - Lotus japonicus,
            complete
          Length = 1950

 Score = 1842 bits (929), Expect = 0.0
 Identities = 936/937 (99%), Gaps = 1/937 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atggttgaaattgaaggatctccaggaacctccatgcatggagtaacagggagggaacaa 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72   atggttgaaattgaaggatctccaggaacctccatgcatggagtaacagggagggaacaa 131

                                                                        
Query: 61   accttcatatcctcagtttcttccccaatggtcccaacagacaccacagccaaattcgat 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 132  accttcatatcctcagtttcttccccaatggtcccaacagacaccacagccaaattcgat 191

                                                                        
Query: 121  ttaccagttgattcacagcacaaagccaaagttttcaaactgttctcattagctaatcct 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 192  ttaccagttgattcacagcacaaagccaaagttttcaaactgttctcattagctaatcct 251

                                                                        
Query: 181  cacatgacaaccttccacttatcatggatttccttcttcacctgctttgtctctaccttt 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 252  cacatgacaaccttccacttatcatggatttccttcttcacctgctttgtctctaccttt 311

                                                                        
Query: 241  gcagcagctcctcttgtccccatcatccgagacaacctcaatctcaccaaaagcgacatt 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 312  gcagcagctcctcttgtccccatcatccgagacaacctcaatctcaccaaaagcgacatt 371

                                                                        
Query: 301  ggcaacgccggtgtcgcgtctgtctccggcagcattttctccaggctcaccatgggtgta 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 372  ggcaacgccggtgtcgcgtctgtctccggcagcattttctccaggctcaccatgggtgta 431

                                                                        
Query: 361  atttgtgacctcttaggcccacgttacgggtgtgccttcctgatcatgctgtctgcacca 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 432  atttgtgacctcttaggcccacgttacgggtgtgccttcctgatcatgctgtctgcacca 491

                                                                        
Query: 421  actgtgttctgcatgtcgtttgtgaatgatgctgcaggctacattgtggttcggttcatg 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 492  actgtgttctgcatgtcgtttgtgaatgatgctgcaggctacattgtggttcggttcatg 551

                                                                        
Query: 481  atcgggttctcattggccacgtttgtttcgtgccagtactggatgagtaccatgtttaac 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 552  atcgggttctcattggccacgtttgtttcgtgccagtactggatgagtaccatgtttaac 611

                                                                        
Query: 541  agtaagattattgggcttgttaatggaactgcagctggttggggtaacatgggtggtgga 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 612  agtaagattattgggcttgttaatggaactgcagctggttggggtaacatgggtggtgga 671

                                                                        
Query: 601  gccactcagctcatcatgcctattgtctatgaattgatcaggagagcggggtccactggg 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 672  gccactcagctcatcatgcctattgtctatgaattgatcaggagagcggggtccactggg 731

                                                                        
Query: 661  ttcactgcttggaggattgccttcttcatccctggtttcatgcatgttttcatggggatc 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 732  ttcactgcttggaggattgccttcttcatccctggtttcatgcatgttttcatggggatc 791

                                                                        
Query: 721  cttgtcttaacccttggccaagacttgcctgatggcaacctcagtgccctccagaagaag 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 792  cttgtcttaacccttggccaagacttgcctgatggcaacctcagtgccctccagaagaag 851

                                                                        
Query: 781  ggtgatgttgctaaagacaaattctccaaggtgttatggtatgccataacaaattacagg 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 852  ggtgatgttgctaaagacaaattctccaaggtgttatggtatgccataacaaattacagg 911

                                                                        
Query: 841  acatggatctttgcacttctctatggatactctatgggagtcgaattaaccactgacaat 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 912  acatggatctttgcacttctctatggatactctatgggagtcgaattaaccactgacaat 971

                                                 
Query: 901  gtcattgctgagtattt-tatgacaggtttaatctga 936
            ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 972  gtcattgctgagtatttctatgacaggtttaatctga 1008