Miyakogusa Predicted Gene
- Lj3g3v2996020.2
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj3g3v2996020.2 Non Chatacterized Hit- tr|I3SM43|I3SM43_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2 SV=1,99.32,0,miaA:
tRNA dimethylallyltransferase,tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate
transferase; no descripti,CUFF.45132.2
(1320 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC60878 UniRef100_A8W7I2 Cluster: tRNA isopentenyltrans... 2579 0.0
gnl|LJGI|BP082405 UniRef100_A8W7I2 Cluster: tRNA isopentenyltran... 353 2e-96
>gnl|LJGI|TC60878 UniRef100_A8W7I2 Cluster: tRNA isopentenyltransferase; n=1; Lotus
japonicus|Rep: tRNA isopentenyltransferase - Lotus
japonicus, complete
Length = 1969
Score = 2579 bits (1301), Expect = 0.0
Identities = 1319/1325 (99%), Gaps = 5/1325 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgacggaggacactgtatcatcaaaccctaaccatggagaaaaacgaccaaaagtg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 80 atggcgacggaggacactgtatcatcaaaccctaaccatggagaaaaacgaccaaaagtg 139
Query: 61 gtggttataacaggccccaccggttccgggaagtcgaggctcgccgtcgatttagcctcc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 140 gtggttataacaggccccaccggttccgggaagtcgaggctcgccgtcgatttagcctcc 199
Query: 121 cacttccccgtcgaagtcatcaacgccgattccatgcaggtctacagtggtctcgatgtt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 200 cacttccccgtcgaagtcatcaacgccgattccatgcaggtctacagtggtctcgatgtt 259
Query: 181 ctcaccaacaaaatccccatatccgagcaaaacggagtgccgcaccatctcctcggaacc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 ctcaccaacaaaatccccatatccgagcaaaacggagtgccgcaccatctcctcggaacc 319
Query: 241 gtatccccaaccgtcgaattcaccgccaaaacctttcgcgattctgctattcctatcatt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 320 gtatccccaaccgtcgaattcaccgccaaaacctttcgcgattctgctattcctatcatt 379
Query: 301 gatgctatattggctcgcaaccacttaccagttatagttgggggcaccaattactatatc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 gatgctatattggctcgcaaccacttaccagttatagttgggggcaccaattactatatc 439
Query: 361 caggctcttgtgagtcagtttctcttagatgaatcgatggatgatatgaatgatagctgt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 440 caggctcttgtgagtcagtttctcttagatgaatcgatggatgatatgaatgatagctgt 499
Query: 421 tgtttgggtgatctacctggtgtcatgtggtctgataacagcttcattgcggaaagtgac 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 tgtttgggtgatctacctggtgtcatgtggtctgataacagcttcattgcggaaagtgac 559
Query: 481 agttcaaacgattttaattatgatctacttaaagatattgatccaattgcagcaaataga 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 560 agttcaaacgattttaattatgatctacttaaagatattgatccaattgcagcaaataga 619
Query: 541 atccatccaaataatcatagaaagataaatcaatatattagtttgtacgctcgcactggt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 620 atccatccaaataatcatagaaagataaatcaatatattagtttgtacgctcgcactggt 679
Query: 601 gttcttccgagcaaagtttttcaaggagaggcggcagag-----aagtggggtcaagttg 655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 680 gttcttccgagcaaagtttttcaaggagaggcggcagagggcagaagtggggtcaagttg 739
Query: 656 ataacttaagatatgattgctgttttatatgcgtggacgcatctctccctgtattggaca 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 740 ataacttaagatatgattgctgttttatatgcgtggacgcatctctccctgtattggaca 799
Query: 716 gatatgtagagcagagagtagattgcatgatggatgctggattactcaatgaagtctatg 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 800 gatatgtagagcagagagtagattgcatgatggatgctggattactcaatgaagtctatg 859
Query: 776 acatttacaatttgaatgcagattatagcagaggtttgcggcaggccattggtgtccgtg 835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 860 acatttacaatttgaatgcagattatagcagaggtttgcggcaggccattggtgtccgtg 919
Query: 836 aatttgagcctcttcttagaacttttgttctcaaggacatctatgaaagagagaaggagt 895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 920 aatttgagcctcttcttagaacttttgttctcaaggacatctatgaaagagagaaggagt 979
Query: 896 tgaccggaggatccaccatagagaagcgtgagacattgtctaatggtaatctgatggagt 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 980 tgaccggaggatccaccatagagaagcgtgagacattgtctaatggtaatctgatggagt 1039
Query: 956 ggttaagatcttactctgatgctaaatccatgattcttatggaagaagcaattgaaaaag 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1040 ggttaagatcttactctgatgctaaatccatgattcttatggaagaagcaattgaaaaag 1099
Query: 1016 tgaaggttaatacccggagacttgttcgccgtcagaagaggatgctcaatcgactgcaaa 1075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1100 tgaaggttaatacccggagacttgttcgccgtcagaagaggatgctcaatcgactgcaaa 1159
Query: 1076 tgctgtttggttggaacatacactctgttgattccacagaatcaatatcaagtaaatcag 1135
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1160 cgctgtttggttggaacatacactctgttgattccacagaatcaatatcaagtaaatcag 1219
Query: 1136 atgatgtttggaaaggtcaagtggttgaatctagcatgaagatagttaactcattcctga 1195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1220 atgatgtttggaaaggtcaagtggttgaatctagcatgaagatagttaactcattcctga 1279
Query: 1196 gtgagaatggaagcatgtcatccacctgtagcatgtcaaatgacactgggatgaaaatag 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1280 gtgagaatggaagcatgtcatccacctgtagcatgtcaaatgacactgggatgaaaatag 1339
Query: 1256 tccaaagggacctctggactcaatacacatgcaaggcctgtggtgatcgggtgcttagag 1315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1340 tccaaagggacctctggactcaatacacatgcaaggcctgtggtgatcgggtgcttagag 1399
Query: 1316 gatta 1320
|||||
Sbjct: 1400 gatta 1404
>gnl|LJGI|BP082405 UniRef100_A8W7I2 Cluster: tRNA isopentenyltransferase; n=1; Lotus
japonicus|Rep: tRNA isopentenyltransferase - Lotus
japonicus, partial (12%)
Length = 402
Score = 353 bits (178), Expect = 2e-96
Identities = 178/178 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgacggaggacactgtatcatcaaaccctaaccatggagaaaaacgaccaaaagtg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 225 atggcgacggaggacactgtatcatcaaaccctaaccatggagaaaaacgaccaaaagtg 284
Query: 61 gtggttataacaggccccaccggttccgggaagtcgaggctcgccgtcgatttagcctcc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 285 gtggttataacaggccccaccggttccgggaagtcgaggctcgccgtcgatttagcctcc 344
Query: 121 cacttccccgtcgaagtcatcaacgccgattccatgcaggtctacagtggtctcgatg 178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345 cacttccccgtcgaagtcatcaacgccgattccatgcaggtctacagtggtctcgatg 402