Miyakogusa Predicted Gene
- Lj3g3v2888320.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj3g3v2888320.1 tr|I1LRU3|I1LRU3_SOYBN Beta-amylase OS=Glycine
max PE=3 SV=1,87.1,0,no description,Glycoside hydrolase, catalytic
domain; BETAAMYLASE,Glycoside hydrolase, family 14; GL,CUFF.44883.1
(1494 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC64025 similar to UniRef100_O22585 Cluster: Beta-amyla... 2908 0.0
gnl|LJGI|AV779855 similar to UniRef100_O22585 Cluster: Beta-amyl... 299 3e-80
>gnl|LJGI|TC64025 similar to UniRef100_O22585 Cluster: Beta-amylase; n=1; Medicago
sativa|Rep: Beta-amylase - Medicago sativa (Alfalfa),
complete
Length = 1822
Score = 2908 bits (1467), Expect = 0.0
Identities = 1489/1495 (99%), Gaps = 1/1495 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggccacttcagagagaaacatgctgctgaattatgtcccagtttttgtcatgctccca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 131 atggccacttcagagagaaacatgctgctgaattatgtcccagtttttgtcatgctccca 190
Query: 61 cttggagttgtaagtgttagcaatgtctttgaagacccagctggcctcaaagaacagctc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 cttggagttgtaagtgttagcaatgtctttgaagacccagctggcctcaaagaacagctc 250
Query: 121 ctgcagctgcgagcagcaggagttgatggggttatggttgatgtctggtgggggatcaca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 251 ctgcagctgcgagcagcaggagttgatggggttatggttgatgtctggtgggggatcaca 310
Query: 181 gaacagaaggggcctaagcagtatgattggggtgcctacaggagcttgtttcagctgatt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 311 gaacagaaggggcctaagcagtatgattggggtgcctacaggagcttgtttcagctgatt 370
Query: 241 caggaatgtggcttgaaactgcaggcgatcatgtcattccaccaatgtggggggaatgta 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 371 caggaatgtggcttgaaactgcaggcgatcatgtcattccaccaatgtggggggaatgta 430
Query: 301 ggggatgctgttaacattcccattccccaatgggtacttgacattggagaatcaaatcct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 431 ggggatgctgttaacattcccattccccaatgggtacttgacattggagaatcaaatcct 490
Query: 361 gatatcttctacactgacatctcaggtaccaggaacaaggaatatctaactgttggtgta 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 491 gatatcttctacactgacatctcaggtaccaggaacaaggaatatctaactgttggtgta 550
Query: 421 gacaacgagcgtatcttccatggaagaacagccattgagctatacagtgactacatgaag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 551 gacaacgagcgtatcttccatggaagaacagccattgagctatacagtgactacatgaag 610
Query: 481 agtttcagagaaaacatgtcagatttcttaaaatctgaacttattatagacattgaagtt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 611 agtttcagagaaaacatgtcagatttcttaaaatctgaacttattatagacattgaagtt 670
Query: 541 gggcttggtccagcaggagagctcagatatccctcttatccacaaagtcaagggtgggaa 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 671 gggcttggtccagcaggagagctcagatatccctcttatccacaaagtcaagggtgggaa 730
Query: 601 tatcctggtattggagaatttcagtgctatgacaactatttgaaggcagatttcaaagcg 660
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 731 tatcctggtattggagaatgtcagtgctatgacaactatgtgaaggcagatttcaaagcg 790
Query: 661 gcagcaa-caagggctggccatcctgaatgggaactaccagatgatgcaggcaagtacaa 719
||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 791 gcagcgagcaggggctggccatcctgaatgggaactaccagatgatgcaggcaagtacaa 850
Query: 720 tgatgtaccacaatctactgagttctttagatcaaatggcacatacctcactgagaaagg 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 851 tgatgtaccacaatctactgagttctttagatcaaatggcacataccccactgagaaagg 910
Query: 780 gaagttcttcttgacttggtactctaacaaactgctgaaccatggtgatcaaatcctaga 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 911 gaagttcttcttgacttggtactctaacaaactgctgaaccatggtgatcaaatcctaga 970
Query: 840 tgaagccaacaaagctttcctgggctgtaaagtcaaattagcactcaaagtctctggaat 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 971 tgaagccaacaaagctttcctgggctgtaaagtcaaattagcactcaaagtctctggaat 1030
Query: 900 ccactggtggtacaaatccgaaagtcatgctgctgagcttactgctggatattacaacct 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1031 ccactggtggtacaaatccgaaagtcatgctgctgagcttactgctggatattacaacct 1090
Query: 960 tggtaatagagatggataccgtccaattgcaagaatgctgtcccgtcatcatgccatttt 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1091 tggtaatagagatggataccgtccaattgcaagaatgctgtcccgtcatcatgccatttt 1150
Query: 1020 gaactttacatgtcttgagatgagggattcagaacaaagatctgatgtcgatagtggacc 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1151 gaactttacatgtcttgagatgagggattcagaacaaagatctgatgtcgatagtggacc 1210
Query: 1080 agaggaacttgttcagcaggtattgagtggaggttggagagaacacatcgaagttgctgg 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1211 agaggaacttgttcagcaggtattgagtggaggttggagagaacacatcgaagttgctgg 1270
Query: 1140 agaaaatgcactttcaaggtatgatgccacagcttataaccaaatcatattgaatgcaag 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1271 agaaaatgcactttcaaggtatgatgccacagcttataaccaaatcatattgaatgcaag 1330
Query: 1200 accacaaggtgtcaacaaagatggccctccaaagtttcggatgtatggagtaacatacct 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1331 accacaaggtgtcaacaaagatggccctccaaagtttcggatgtatggagtaacatacct 1390
Query: 1260 tcgtctatcggatgatctactgcaacaatcaaattttgacatattcagaaagtttgtgca 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1391 tcgtctatcggatgatctactgcaacaatcaaattttgacatattcagaaagtttgtgca 1450
Query: 1320 aaagatgcatgcagatcaggattactgtgcagaccctggaaagtacggtcatatcatacc 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1451 aaagatgcatgcagatcaggattactgtgcagaccctggaaagtacggtcatatcatacc 1510
Query: 1380 accattgaagcgatcagggccaaagatacccgatgatgttcttctcaaagcaactgaacc 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1511 accattgaagcgatcagggccaaagatacccgatgatgttcttctcaaagcaactgaacc 1570
Query: 1440 tatgccgccgttcccttgggattcagagacagacatggaagttgatggttgactt 1494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1571 tatgccgccgttcccttgggattcagagacagacatggaagttgatggttgactt 1625
>gnl|LJGI|AV779855 similar to UniRef100_O22585 Cluster: Beta-amylase; n=1; Medicago
sativa|Rep: Beta-amylase - Medicago sativa (Alfalfa),
partial (15%)
Length = 505
Score = 299 bits (151), Expect = 3e-80
Identities = 157/159 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1336 caggattactgtgcagaccctggaaagtacggtcatatcataccaccattgaagcgatca 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 330 caggattactgtgcagaccctggaaagtacggtcatatcataccaccattgaagcgatca 271
Query: 1396 gggccaaagatacccgatgatgttcttctcaaagcaactgaacctatgccgccgttccct 1455
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 270 gggcccaagatacccgatgatgttcttctctaagcaactgaacctatgccgccgttccct 211
Query: 1456 tgggattcagagacagacatggaagttgatggttgactt 1494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 210 tgggattcagagacagacatggaagttgatggttgactt 172
Score = 135 bits (68), Expect = 9e-31
Identities = 77/80 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1260 tcgtctatcggatgatctactgcaacaatcaaattttgacatattcagaaagtttgtgca 1319
||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 505 tcgtctatcggatgatctactgccacgatcacattttgacatattcagaaagtttgtgca 446
Query: 1320 aaagatgcatgcagatcagg 1339
||||||||||||||||||||
Sbjct: 445 aaagatgcatgcagatcagg 426