Miyakogusa Predicted Gene
- Lj3g3v2532340.2
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj3g3v2532340.2 CUFF.44199.2
(1281 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC60911 homologue to UniRef100_Q41365 Cluster: 26S prot... 2498 0.0
gnl|LJGI|AW719510 homologue to UniRef100_A7P698 Cluster: Chromos... 426 e-118
>gnl|LJGI|TC60911 homologue to UniRef100_Q41365 Cluster: 26S protease regulatory
subunit 7; n=4; Magnoliophyta|Rep: 26S protease
regulatory subunit 7 - Spinacia oleracea (Spinach),
complete
Length = 1654
Score = 2498 bits (1260), Expect = 0.0
Identities = 1274/1281 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgacaattgatcacgaagatgaactcaaggacgagaagaatccccgacccctcgacgag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 90 atgacaattgatcacgaagatgaactcaaggacgagaagaatccccgacccctcgacgag 149
Query: 61 gatgacatcgctctcctcaaaacctacggtttggggccttattccacaagcatnnnnnnn 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 150 gatgacatcgctctcctcaaaacctacggtttggggccttattccacaagcataaaaaaa 209
Query: 121 gcggagaaggaaatcaaagatatggcgaagaaagtaaatgacttatgtggtatcaaggag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 210 gcggagaaggaaatcaaagatatggcgaagaaagtaaatgacttatgtggtatcaaggag 269
Query: 181 tctgatactggattagctgcaccaagccaatgggatcttgtttctgataagcaaatgatg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 270 tctgatactggattagctgcaccaagccaatgggatcttgtttctgataagcaaatgatg 329
Query: 241 caggaggagcagcctcttcaggtggcaagatgcactaagatcatcaatccaaactctgaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 330 caggaggagcagcctcttcaggtggcaagatgcactaagatcatcaatccaaactctgaa 389
Query: 301 gatgcgaaatatgttatcaatgtgaagcagattgcaaagtttgttgttgggctaggagac 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 390 gatgcgaaatatgttatcaatgtgaagcagattgcaaagtttgttgttgggctaggagac 449
Query: 361 aaagtctcccccactgacatcgaggaaggaatgcgtgttggggttgatagaaacaaatat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 450 aaagtctcccccactgacatcgaggaaggaatgcgtgttggggttgatagaaacaaatat 509
Query: 421 cagattcagattccgttgcctccaaaaattgatcctagtgttaccatgatgacagttgaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 510 cagattcagattccgttgcctccaaaaattgatcctagtgttaccatgatgacagttgaa 569
Query: 481 gagaagccagatgtgacatataatgatgttggtggttgcaaggagcaaattgagaagatg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 570 gagaagccagatgtgacatataatgatgttggtggttgcaaggagcaaattgagaagatg 629
Query: 541 cgtgaagttgttgaactgccaatgcttcatccagagaaattcgtcaagcttggaattgat 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 630 cgtgaagttgttgaactgccaatgcttcatccagagaaattcgtcaagcttggaattgat 689
Query: 601 cctccaaagggtgttctctgttatggtccaccaggaactggcaaaacacttctggctagg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 690 cctccaaagggtgttctctgttatggtccaccaggaactggcaaaacacttctggctagg 749
Query: 661 gctgtggctaataggaccgatgcttgttttataagggttattggaagtgagctggttcag 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 750 gctgtggctaataggaccgatgcttgttttataagggttattggaagtgagctggttcag 809
Query: 721 aaatatgttggtgagggagctcggatggttcgtgagctgttccagatggctcgttcaaag 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 810 aaatatgttggtgagggagctcggatggttcgtgagctgttccagatggctcgttcaaag 869
Query: 781 aaggcctgcattgtattttttgatgaagtagatgcaattggaggggctcgatttgatgat 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 870 aaggcctgcattgtattttttgatgaagtagatgcaattggaggggctcgatttgatgat 929
Query: 841 ggtgttggtggtgacaatgaggttcagcgcacaatgcttgagattgtgaatcaactcgat 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 930 ggtgttggtggtgacaatgaggttcagcgcacaatgcttgagattgtgaatcaactcgat 989
Query: 901 gggtttgatgctcgaggaaacatcaaagttttgatggcaactaacaggcctgacactcta 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 990 gggtttgatgctcgaggaaacatcaaagttttgatggcaactaacaggcctgacactcta 1049
Query: 961 gatccagctctacttcggcctgggcgattggatcggaaagttgaatttggccttcctgat 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1050 gatccagctctacttcggcctgggcgattggatcggaaagttgaatttggccttcctgat 1109
Query: 1021 ttagagagtaggacgcagatattcaagatacacacaagaacaatgaactgtgaaagggat 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1110 ttagagagtaggacgcagatattcaagatacacacaagaacaatgaactgtgaaagggat 1169
Query: 1081 atccgttttgaacttctgtctcgcctttgcccaaattccactggagctgatatcaggagt 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1170 atccgttttgaacttctgtctcgcctttgcccaaattccactggagctgatatcaggagt 1229
Query: 1141 gtatgcactgaagctggtatgtatgctatccgtgcccgaaggaagactgtgacagagaaa 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1230 gtatgcactgaagctggtatgtatgctatccgtgcccgaaggaagactgtgacagagaaa 1289
Query: 1201 gacttccttgatgcagtgaataaagtcatcaaaggataccagaagttcagtgctactccc 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1290 gacttccttgatgcagtgaataaagtcatcaaaggataccagaagttcagtgctactccc 1349
Query: 1261 aagtatatggtctacaactga 1281
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 1350 aagtatatggtctacaactga 1370
>gnl|LJGI|AW719510 homologue to UniRef100_A7P698 Cluster: Chromosome chr9 scaffold_7,
whole genome shotgun sequence; n=2; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr9 scaffold_7, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (17%)
Length = 358
Score = 426 bits (215), Expect = e-118
Identities = 215/215 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 912 tcgaggaaacatcaaagttttgatggcaactaacaggcctgacactctagatccagctct 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 358 tcgaggaaacatcaaagttttgatggcaactaacaggcctgacactctagatccagctct 299
Query: 972 acttcggcctgggcgattggatcggaaagttgaatttggccttcctgatttagagagtag 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 298 acttcggcctgggcgattggatcggaaagttgaatttggccttcctgatttagagagtag 239
Query: 1032 gacgcagatattcaagatacacacaagaacaatgaactgtgaaagggatatccgttttga 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 238 gacgcagatattcaagatacacacaagaacaatgaactgtgaaagggatatccgttttga 179
Query: 1092 acttctgtctcgcctttgcccaaattccactggag 1126
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 178 acttctgtctcgcctttgcccaaattccactggag 144
Score = 287 bits (145), Expect = 8e-77
Identities = 145/145 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1129 gatatcaggagtgtatgcactgaagctggtatgtatgctatccgtgcccgaaggaagact 1188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gatatcaggagtgtatgcactgaagctggtatgtatgctatccgtgcccgaaggaagact 60
Query: 1189 gtgacagagaaagacttccttgatgcagtgaataaagtcatcaaaggataccagaagttc 1248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gtgacagagaaagacttccttgatgcagtgaataaagtcatcaaaggataccagaagttc 120
Query: 1249 agtgctactcccaagtatatggtct 1273
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agtgctactcccaagtatatggtct 145