Miyakogusa Predicted Gene

Lj3g3v2330790.2
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj3g3v2330790.2 tr|D7UPI5|D7UPI5_LOTJA BHLH transcription factor
LjTAN1 OS=Lotus japonicus GN=LjTAN1 PE=2 SV=1,96.81,0,SUBFAMILY NOT
NAMED,NULL; MYC,NULL; seg,NULL,CUFF.43918.2
         (1227 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC75505 homologue to UniRef100_A2ICR1 Cluster: TAN1; n=...  1897   0.0  

>gnl|LJGI|TC75505 homologue to UniRef100_A2ICR1 Cluster: TAN1; n=1; Lotus
            angustissimus|Rep: TAN1 - Lotus angustissimus, partial
            (86%)
          Length = 1723

 Score = 1897 bits (957), Expect = 0.0
 Identities = 963/965 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atggagaactcatgttcctttgcagaagaactcaaatttgatgaatatcctggcagggag 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 758  atggagaactcatgttcctttgcagaagaactcaaatttgatgaatatcctggcagggag 817

                                                                        
Query: 61   ttacaagatgatgataacaatgaagattgtgacatggatggattctctgatggtggttgt 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 818  ttacaagatgatgataacaatgaagattgtgacatggatggattctctgatggtggttgt 877

                                                                        
Query: 121  gatcattatgaatccatgatagagggcatcaacgagggtggttcttctcaagttcatttt 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 878  gatcattatgaatccatgatagagggcatcaacgagggtggttcttctcaagttcatttt 937

                                                                        
Query: 181  gtgaatgaaggtggtgacatcaatggtgccccagattcctctagttcttgtgattgtagg 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 938  gtgaatgaaggtggtgacatcaatggtgccccagattcctctagttcttgtgattgtagg 997

                                                                        
Query: 241  tctgaggcttctgagaaccatggtaagaaggattctaaaaatgtaatccaaattcaacaa 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 998  tctgaggcttctgagaaccatggtaagaaggattctaaaaatgtaatccaaattcaacaa 1057

                                                                        
Query: 301  aaggagcttcaagactgtgatgataactcaaaaagtagctctttggatattggagctgat 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1058 aaggagcttcaagactgtgatgataactcaaaaagtagctctttggatattggagctgat 1117

                                                                        
Query: 361  gaagttttgtactacacaagaactctctgtgctgttctgggaaattcatcaagttttgca 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1118 gaagttttgtactacacaagaactctctgtgctgttctgggaaattcatcaagttttgca 1177

                                                                        
Query: 421  caaaatctatgtgcaagtaaatctagttttgtgaaatggaataaaggaggagtttctgaa 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1178 caaaatctatgtgcaagtaaatctagttttgtgaaatggaataaaggaggagtttctgaa 1237

                                                                        
Query: 481  aggaagtggccgcggttgcaacaaatgatgttaaagaagactttgtttgatgtccctttt 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1238 aggaagtggccgcggttgcaacaaatgatgttaaagaagactttgtttgatgtccctttt 1297

                                                                        
Query: 541  atgcacctaagttgctcctctctcaaattacaaaaagaaaatggaagaaaagaatggact 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1298 atgcacctaagttgctcctctctcaaattacaaaaagaaaatggaagaaaagaatggact 1357

                                                                        
Query: 601  tctaaattggaaaatgctgataatttcatggggaatgtcttctctgataagaaaagagaa 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1358 tctaaattggaaaatgctgataatttcatggggaatgtcttctctgataagaaaagagaa 1417

                                                                        
Query: 661  tctagaaacattcaggtactcaaatctgtggctccttctgcatgtgaggtggagaagatt 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1418 tctagaaacattcaggtactcaaatctgtggctccttctgcatgtgaggtggagaagatt 1477

                                                                        
Query: 721  tcagttcttggtgacacaattcaatacttgaaaaagcttgaggcaagagtggaagaacta 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1478 tcagttcttggtgacacaattcaatacttgaaaaagcttgaggcaagagtggaagaacta 1537

                                                                        
Query: 781  gaatcttacatggacactacagctactggagcaagaaccagaagaaaatgcccagatgtg 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1538 gaatcttacatggacactacagctactggagcaagaaccagaagaaaatgcccagatgtg 1597

                                                                        
Query: 841  caagagcagatatcagatagctatggccccagtaatatttacatgggaatgaaaaaatct 900
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1598 caagagcagatatcagataactatggccccagtaatatttacatgggaatgaaaaaatct 1657

                                                                        
Query: 901  aggataaacaagaggaaggcttgtgatattgatgacatagacacagggctagacatgatt 960
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1658 aggataaacaagaggaaggcttgtgatattgatgacatagacacagggctagacataatt 1717

                 
Query: 961  gtttc 965
            |||||
Sbjct: 1718 gtttc 1722