Miyakogusa Predicted Gene

Lj3g3v2317860.1

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj3g3v2317860.1 tr|D4P3K4|D4P3K4_SOYBN Glycine and proline rich
protein 4 OS=Glycine max GN=GPRP4 PE=2
SV=1,41.81,0.00003,seg,NULL,CUFF.43904.1
         (510 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC63444 weakly similar to UniRef100_Q5ZF72 Cluster: Gly...  1011   0.0  
gnl|LJGI|FS356868                                                     668   0.0  

>gnl|LJGI|TC63444 weakly similar to UniRef100_Q5ZF72 Cluster: Glycine/proline-rich
           protein; n=1; Plantago major|Rep: Glycine/proline-rich
           protein - Plantago major (Common plantain), partial
           (44%)
          Length = 814

 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0
 Identities = 510/510 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   atgagctatgatcatgagtctagtgagagatgtctgtattcacaagcagcaacaggctat 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 96  atgagctatgatcatgagtctagtgagagatgtctgtattcacaagcagcaacaggctat 155

                                                                       
Query: 61  catcatgcagcaccctcctattcctgtcctccgcctggatcctaccctccaactgcatat 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 156 catcatgcagcaccctcctattcctgtcctccgcctggatcctaccctccaactgcatat 215

                                                                       
Query: 121 ggcggtggctatccccaaacagcctacccaccaactgcatatccaccttctggaggctat 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 216 ggcggtggctatccccaaacagcctacccaccaactgcatatccaccttctggaggctat 275

                                                                       
Query: 181 ccacctgctggaggctatccacctgctggttatcctcattcaggatataattcctcagct 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276 ccacctgctggaggctatccacctgctggttatcctcattcaggatataattcctcagct 335

                                                                       
Query: 241 tatcctgccccacatggctatccaactcactattctggagggcgagggtctggtatagga 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 336 tatcctgccccacatggctatccaactcactattctggagggcgagggtctggtatagga 395

                                                                       
Query: 301 ggattgtttgcagggggtgttgctgctgcagctgcatatggggctcataaatatggacat 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 396 ggattgtttgcagggggtgttgctgctgcagctgcatatggggctcataaatatggacat 455

                                                                       
Query: 361 ggatctcatcaatatggacatggatctcatcattatggacatggggcttcctatggtcat 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 456 ggatctcatcaatatggacatggatctcatcattatggacatggggcttcctatggtcat 515

                                                                       
Query: 421 ggaaagtataagcatgggaaatatggcaagcatgggggatatggatatggcaagtataag 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 516 ggaaagtataagcatgggaaatatggcaagcatgggggatatggatatggcaagtataag 575

                                         
Query: 481 cgtgggaaatttggtaagtgttggaagtga 510
           ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 576 cgtgggaaatttggtaagtgttggaagtga 605


>gnl|LJGI|FS356868 
          Length = 604

 Score =  668 bits (337), Expect = 0.0
 Identities = 337/337 (100%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 174 aggctatccacctgctggaggctatccacctgctggttatcctcattcaggatataattc 233
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 604 aggctatccacctgctggaggctatccacctgctggttatcctcattcaggatataattc 545

                                                                       
Query: 234 ctcagcttatcctgccccacatggctatccaactcactattctggagggcgagggtctgg 293
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 544 ctcagcttatcctgccccacatggctatccaactcactattctggagggcgagggtctgg 485

                                                                       
Query: 294 tataggaggattgtttgcagggggtgttgctgctgcagctgcatatggggctcataaata 353
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 484 tataggaggattgtttgcagggggtgttgctgctgcagctgcatatggggctcataaata 425

                                                                       
Query: 354 tggacatggatctcatcaatatggacatggatctcatcattatggacatggggcttccta 413
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 424 tggacatggatctcatcaatatggacatggatctcatcattatggacatggggcttccta 365

                                                                       
Query: 414 tggtcatggaaagtataagcatgggaaatatggcaagcatgggggatatggatatggcaa 473
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 364 tggtcatggaaagtataagcatgggaaatatggcaagcatgggggatatggatatggcaa 305

                                                
Query: 474 gtataagcgtgggaaatttggtaagtgttggaagtga 510
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 304 gtataagcgtgggaaatttggtaagtgttggaagtga 268