Miyakogusa Predicted Gene
- Lj3g3v1981230.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj3g3v1981230.1 tr|G7IYF6|G7IYF6_MEDTR Cellulose synthase
OS=Medicago truncatula GN=MTR_3g005560 PE=4 SV=1,81.9,0,FAMILY NOT
NAMED,NULL; coiled-coil,NULL; Cellulose_synt,Cellulose synthase;
seg,NULL; Nucleotide-dip,CUFF.43446.1
(2085 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC58008 weakly similar to UniRef100_A7NX35 Cluster: Chr... 4133 0.0
>gnl|LJGI|TC58008 weakly similar to UniRef100_A7NX35 Cluster: Chromosome chr5
scaffold_2, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome chr5 scaffold_2, whole genome
shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (31%)
Length = 2755
Score = 4133 bits (2085), Expect = 0.0
Identities = 2085/2085 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggccaatttcactctccacacagaaaccgttcaagcatggctccctctaagcagactc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 32 atggccaatttcactctccacacagaaaccgttcaagcatggctccctctaagcagactc 91
Query: 61 cacattcttatacactcagtgttcgtcatccttctcctctactaccgcacaacgcgtctc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 92 cacattcttatacactcagtgttcgtcatccttctcctctactaccgcacaacgcgtctc 151
Query: 121 atccacgcgccgaccgcgccgtggatcctgatgaccgttgcggaggctctcctcgccgtg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 152 atccacgcgccgaccgcgccgtggatcctgatgaccgttgcggaggctctcctcgccgtg 211
Query: 181 ctttggctcttcaaccaggccttccggtggcgaccggtgagccgctccgtgaagacagag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 212 ctttggctcttcaaccaggccttccggtggcgaccggtgagccgctccgtgaagacagag 271
Query: 241 aagctgccgcgcgacgagaatctccccgggctggacatatttgtgtgcacgattgatcct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 272 aagctgccgcgcgacgagaatctccccgggctggacatatttgtgtgcacgattgatcct 331
Query: 301 gagaaggagccaacggcaggggtgatggacacggttgtttccgccgtggcgatggattac 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 332 gagaaggagccaacggcaggggtgatggacacggttgtttccgccgtggcgatggattac 391
Query: 361 ccgccggataagctatccgtgtatctttctgatgatggtggttgcgccgtgacggagtat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 392 ccgccggataagctatccgtgtatctttctgatgatggtggttgcgccgtgacggagtat 451
Query: 421 gggattagagaggcttgtgagtttgccaaggtgtgggttcctttttgtagaaagtatggg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 452 gggattagagaggcttgtgagtttgccaaggtgtgggttcctttttgtagaaagtatggg 511
Query: 481 atcaagtcgaggtgtccaaaagttttcttctctccgatgggggaagatgaagagattcta 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 512 atcaagtcgaggtgtccaaaagttttcttctctccgatgggggaagatgaagagattcta 571
Query: 541 aggacagatgagttcagagcagagcaagagaagatcaaggcccaatacgagactatgcag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 572 aggacagatgagttcagagcagagcaagagaagatcaaggcccaatacgagactatgcag 631
Query: 601 aaaaacatcgagaaatttggttcagaccccaaaaattgtcgtattgtgactgacagaccc 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 632 aaaaacatcgagaaatttggttcagaccccaaaaattgtcgtattgtgactgacagaccc 691
Query: 661 tctaagatcgagattataaatgagcaatcagaaatcccacgtgttgtgtacgtctctcgt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 692 tctaagatcgagattataaatgagcaatcagaaatcccacgtgttgtgtacgtctctcgt 751
Query: 721 gaaagaaggccatcacttcctcacaagttcaaaggaggagctctcaacacattgctcaga 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 752 gaaagaaggccatcacttcctcacaagttcaaaggaggagctctcaacacattgctcaga 811
Query: 781 gtgtcaggtctaatcagcaatggaccttatgtgcttgcagtggattgtgatatgtattgc 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 812 gtgtcaggtctaatcagcaatggaccttatgtgcttgcagtggattgtgatatgtattgc 871
Query: 841 aatgatccatcctctgccaagcaagcaatgtgcttcttccttgatccagaaacatctaaa 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 872 aatgatccatcctctgccaagcaagcaatgtgcttcttccttgatccagaaacatctaaa 931
Query: 901 tacattgcatttgtccaattccctcaaatgtttcacaaccttagtaagaaagacatctat 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 932 tacattgcatttgtccaattccctcaaatgtttcacaaccttagtaagaaagacatctat 991
Query: 961 gataatcaatctaggactgcttttaagacaatgtggcaaggcatggatggactcagtggt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 992 gataatcaatctaggactgcttttaagacaatgtggcaaggcatggatggactcagtggt 1051
Query: 1021 ccaggtctttctggcagtggtaactacttgagtagaagtgcattgctatttggaagtcca 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1052 ccaggtctttctggcagtggtaactacttgagtagaagtgcattgctatttggaagtcca 1111
Query: 1081 aaccaaaaagatgactatctgcttgatgctcaaaactactttggcgagtctcccttgtac 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1112 aaccaaaaagatgactatctgcttgatgctcaaaactactttggcgagtctcccttgtac 1171
Query: 1141 attgaatcattgaaggccatccgtggacaacaaactaccaaaaagaatatctcaagagac 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1172 attgaatcattgaaggccatccgtggacaacaaactaccaaaaagaatatctcaagagac 1231
Query: 1201 gaaagtttactagaagctaaagtggtggcctctgcttcctacgagacaaacacagaatgg 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1232 gaaagtttactagaagctaaagtggtggcctctgcttcctacgagacaaacacagaatgg 1291
Query: 1261 ggctcagaggttggattctcatatggcatcttactggagagtactattactggttacctt 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1292 ggctcagaggttggattctcatatggcatcttactggagagtactattactggttacctt 1351
Query: 1321 ttgcactgcagaggatggaaatcagcttatctttacccaaaaacaccatgtttcttaggg 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1352 ttgcactgcagaggatggaaatcagcttatctttacccaaaaacaccatgtttcttaggg 1411
Query: 1381 tgtgcccccactgacattaaagaaggcatgcttcagttggtgaagtggttgtctgagctt 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1412 tgtgcccccactgacattaaagaaggcatgcttcagttggtgaagtggttgtctgagctt 1471
Query: 1441 tgcttgtttgctgtctctaagtacagcccttttacatatgggttttcaagattgcccatt 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1472 tgcttgtttgctgtctctaagtacagcccttttacatatgggttttcaagattgcccatt 1531
Query: 1501 atgcctaccttcacttattgtttcctggcagcttcatccctatatgctattgtcttcatc 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1532 atgcctaccttcacttattgtttcctggcagcttcatccctatatgctattgtcttcatc 1591
Query: 1561 ctttatggcattgtacctcaagtgtgcttcttgaaaggaatccctgtgtttccaaaggcc 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1592 ctttatggcattgtacctcaagtgtgcttcttgaaaggaatccctgtgtttccaaaggcc 1651
Query: 1621 acagacccttggtttgcagtgtttgcagtattgtatgtagccacccagattcaacatttg 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1652 acagacccttggtttgcagtgtttgcagtattgtatgtagccacccagattcaacatttg 1711
Query: 1681 attgaagtcctttctggcaatggctcggtctcgatgtggtgggatgaacaaagaatttgg 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1712 attgaagtcctttctggcaatggctcggtctcgatgtggtgggatgaacaaagaatttgg 1771
Query: 1741 attctgaagtcagttactagcgtatttgcaatgatagagggaatcaagaaatggttagga 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1772 attctgaagtcagttactagcgtatttgcaatgatagagggaatcaagaaatggttagga 1831
Query: 1801 ttgaacaagaaaaaattcaacctgtcaaacaaagcggttgacaaggagaaggtcaagaaa 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1832 ttgaacaagaaaaaattcaacctgtcaaacaaagcggttgacaaggagaaggtcaagaaa 1891
Query: 1861 tatgagcaaggtaggtttgatttccaaggagcagctctgtacatgtctccaatggttgtg 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1892 tatgagcaaggtaggtttgatttccaaggagcagctctgtacatgtctccaatggttgtg 1951
Query: 1921 ttgctcctagtgaacattgtttgcttctttggcggtttatggagactgtttaaggagaaa 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1952 ttgctcctagtgaacattgtttgcttctttggcggtttatggagactgtttaaggagaaa 2011
Query: 1981 gattttgcagatatgtttggtcaacttttcctactcagctatgtgatggctctcagttat 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2012 gattttgcagatatgtttggtcaacttttcctactcagctatgtgatggctctcagttat 2071
Query: 2041 cccattcttgaggggatagtaactatgaaaatgaagagtgggtag 2085
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2072 cccattcttgaggggatagtaactatgaaaatgaagagtgggtag 2116