Miyakogusa Predicted Gene
- Lj3g3v1876080.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj3g3v1876080.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1M0T4|I1M0T4_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.319 PE=4,85.03,0,WD40
repeat-like,WD40-repeat-containing domain; no description,WD40/YVTN
repeat-like-containing doma,CUFF.43266.1
(2181 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC69721 homologue to UniRef100_A4Q377 Cluster: WD40-lik... 2000 0.0
gnl|LJGI|TC65146 similar to UniRef100_A4Q377 Cluster: WD40-like;... 1633 0.0
gnl|LJGI|BW594696 homologue to UniRef100_A4Q377 Cluster: WD40-li... 759 0.0
gnl|LJGI|BP075922 72 2e-11
>gnl|LJGI|TC69721 homologue to UniRef100_A4Q377 Cluster: WD40-like; n=1; Medicago
truncatula|Rep: WD40-like - Medicago truncatula (Barrel
medic), partial (50%)
Length = 1239
Score = 2000 bits (1009), Expect = 0.0
Identities = 1022/1025 (99%), Gaps = 1/1025 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 110 ccggtccagaatttcaccgtggaccgccgcctccaccgccgcagcaacctcatccgccgc 169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 216 ccggtccagaatttcaccgtggaccgccgcctccaccgccgcagcaacctcatccgccgc 275
Query: 170 caatgatgcgtcagccatctgcatcctccacaaacctcgcaccggagtttcaccaccccg 229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276 caatgatgcgtcagccatctgcatcctccacaaacctcgcaccggagtttcaccaccccg 335
Query: 230 gtcccggtggcccccctcctccccattacgatgttcatagtgatagccatggtgcaaaaa 289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 336 gtcccggtggcccccctcctccccattacgatgttcatagtgatagccatggtgcaaaaa 395
Query: 290 ggatgagaaagcatactcaaaggaaggcagttgattatacgagcacagttgtgcgttaca 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 396 ggatgagaaagcatactcaaaggaaggcagttgattatacgagcacagttgtgcgttaca 455
Query: 350 tgcagattcgtatgtggcagcatgattcgagtgataggactgtactgcaacctacgacgg 409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 456 tgcagattcgtatgtggcagcatgattcgagtgataggactgtactgcaacctacgacgg 515
Query: 410 cagccgcaattgatatgttgccagcagcgggctatccagacaatccatccactagctttg 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 516 cagccgcaattgatatgttgccagcagcgggctatccagacaatccatccactagctttg 575
Query: 470 ctgctaaatttgttcatacatctctgaataaaaatcgatgccctattaatcgtgttcttt 529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 576 ctgctaaatttgttcatacatctctgaataaaaatcgatgccctattaatcgtgttcttt 635
Query: 530 ggactccaacaggccggcgtcttattactggctcacagactggtgaattcactctttgga 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 636 ggactccaacaggccggcgtcttattactggctcacagactggtgaattcactctttgga 695
Query: 590 atggacagtcttttaattttgaaatgatccttcaggctcatgatcaagcaatcagatcca 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 696 atggacagtcttttaattttgaaatgatccttcaggctcatgatcaagcaatcagatcca 755
Query: 650 tggtctggagtcacaatgacaactggatggtctccggtgatgatggcggtgcaataaagt 709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 756 tggtctggagtcacaatgacaactggatggtctccggtgatgatggcggtgcaataaagt 815
Query: 710 attggcagaacaacatgaataatgtcaaagctaacaaatctgctcataaagaatctgtcc 769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 816 attggcagaacaacatgaataatgtcaaagctaacaaatctgctcataaagaatctgtcc 875
Query: 770 gtgacttaagtttctgtaggacagatttgaagttctgttcgtgctctgatgataccactg 829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 876 gtgacttaagtttctgtaggacagatttgaagttctgttcgtgctctgatgataccactg 935
Query: 830 ttaaagtttgggactttgcacgctgtcaagaagagtcttcattaactggccatggttggg 889
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 936 ttaaagtttgggactttgcacgctgtcaagaggagtcttcattaactggccatggttggg 995
Query: 890 atgtgaagagtgttgactggcatccttcaaaatctctattagtatcaggtgggaaggaca 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 996 atgtgaagagtgttgactggcatccttcaaaatctctattagtatcaggtgggaaggaca 1055
Query: 950 atcttgtgaaactttgggatgccaaatcagggagggagctttgctcatttcatggccaca 1009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1056 atcttgtgaaactttgggatgccaaatcagggagggagctttgctcatttcatggccaca 1115
Query: 1010 aaaatactgtgctttgtgttaaatggaatcaaaacggcaactgggtgttaacagcttcaa 1069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1116 aaaatactgtgctttgtgttaaatggaatcaaaacggcaactgggtgttaacagcttcaa 1175
Query: 1070 aagatcaaatagtaaagctttatgacataagagcaatgaaggagcttgaatcatttcgtg 1129
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct: 1176 aagatcaaatagtaaagctttatgacataagagcaatgaa-gagcttgaatcatttcatg 1234
Query: 1130 gacac 1134
|||||
Sbjct: 1235 gacac 1239
>gnl|LJGI|TC65146 similar to UniRef100_A4Q377 Cluster: WD40-like; n=1; Medicago
truncatula|Rep: WD40-like - Medicago truncatula (Barrel
medic), partial (35%)
Length = 1153
Score = 1633 bits (824), Expect = 0.0
Identities = 824/824 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1358 ataggccgggagacactgtgcgtgatagatataacaatggcatgcaaggatatcctgagc 1417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ataggccgggagacactgtgcgtgatagatataacaatggcatgcaaggatatcctgagc 60
Query: 1418 aaaatccggttgctggtcgcatgggtggtaattttgcaatgcctgaaggcccaacaactc 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaaatccggttgctggtcgcatgggtggtaattttgcaatgcctgaaggcccaacaactc 120
Query: 1478 ctggaccatttgcccctgggttgactcgaaatgacggcaccattccaggtgttggagttg 1537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ctggaccatttgcccctgggttgactcgaaatgacggcaccattccaggtgttggagttg 180
Query: 1538 ccatgcccttatctgttccttctcttgatttttctcaaggggagcagaagcagccccatc 1597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ccatgcccttatctgttccttctcttgatttttctcaaggggagcagaagcagccccatc 240
Query: 1598 ctgcttcaatgggggctcctcctcttcccccaggtccacatccctctcttcttgcttcta 1657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ctgcttcaatgggggctcctcctcttcccccaggtccacatccctctcttcttgcttcta 300
Query: 1658 atcaacagcaaccattccaacagaatccacagcagatcccacaacatcaacaccaccagg 1717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atcaacagcaaccattccaacagaatccacagcagatcccacaacatcaacaccaccagg 360
Query: 1718 cactaccacaacagttgggtcctttgcctatgcctccaaatatgcaacagctacagcacc 1777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cactaccacaacagttgggtcctttgcctatgcctccaaatatgcaacagctacagcacc 420
Query: 1778 cttcccattctcctttgctccctcaccaacatttgccccgccctccgccccaaatgccac 1837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 cttcccattctcctttgctccctcaccaacatttgccccgccctccgccccaaatgccac 480
Query: 1838 ttggaatgccaggatcaataccaggaatttcatcagtgcctacttcacatccaatgccaa 1897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ttggaatgccaggatcaataccaggaatttcatcagtgcctacttcacatccaatgccaa 540
Query: 1898 tgccaggacctatggggatgcaacaaggtgcaatgaatcagatgggcaatccaatgccgc 1957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 tgccaggacctatggggatgcaacaaggtgcaatgaatcagatgggcaatccaatgccgc 600
Query: 1958 aaggtccttttgtgggcatgaatcaaatgcattcagggcctccaagtggagggccacctc 2017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aaggtccttttgtgggcatgaatcaaatgcattcagggcctccaagtggagggccacctc 660
Query: 2018 ttggaggtttcccaaacaacttgcctaatatgcaagggccatcaaataccaattatcctc 2077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 ttggaggtttcccaaacaacttgcctaatatgcaagggccatcaaataccaattatcctc 720
Query: 2078 aaggtgcttcctttaatagacctcaaggtggacaaatgcccatgatgcaaggctataatc 2137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 aaggtgcttcctttaatagacctcaaggtggacaaatgcccatgatgcaaggctataatc 780
Query: 2138 cttatcagtcgggaaatcaacctggtatgcctccgaacgcacaa 2181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 cttatcagtcgggaaatcaacctggtatgcctccgaacgcacaa 824
>gnl|LJGI|BW594696 homologue to UniRef100_A4Q377 Cluster: WD40-like; n=1; Medicago
truncatula|Rep: WD40-like - Medicago truncatula (Barrel
medic), partial (17%)
Length = 474
Score = 759 bits (383), Expect = 0.0
Identities = 383/383 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 259 gatgttcatagtgatagccatggtgcaaaaaggatgagaaagcatactcaaaggaaggca 318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 92 gatgttcatagtgatagccatggtgcaaaaaggatgagaaagcatactcaaaggaaggca 151
Query: 319 gttgattatacgagcacagttgtgcgttacatgcagattcgtatgtggcagcatgattcg 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 152 gttgattatacgagcacagttgtgcgttacatgcagattcgtatgtggcagcatgattcg 211
Query: 379 agtgataggactgtactgcaacctacgacggcagccgcaattgatatgttgccagcagcg 438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 212 agtgataggactgtactgcaacctacgacggcagccgcaattgatatgttgccagcagcg 271
Query: 439 ggctatccagacaatccatccactagctttgctgctaaatttgttcatacatctctgaat 498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 272 ggctatccagacaatccatccactagctttgctgctaaatttgttcatacatctctgaat 331
Query: 499 aaaaatcgatgccctattaatcgtgttctttggactccaacaggccggcgtcttattact 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 332 aaaaatcgatgccctattaatcgtgttctttggactccaacaggccggcgtcttattact 391
Query: 559 ggctcacagactggtgaattcactctttggaatggacagtcttttaattttgaaatgatc 618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 392 ggctcacagactggtgaattcactctttggaatggacagtcttttaattttgaaatgatc 451
Query: 619 cttcaggctcatgatcaagcaat 641
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 452 cttcaggctcatgatcaagcaat 474
>gnl|LJGI|BP075922
Length = 394
Score = 71.9 bits (36), Expect = 2e-11
Identities = 42/44 (95%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2079 aggtgcttcctttaatagacctcaaggtggacaaatgcccatga 2122
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 248 aggtgtttcctttaatagacctcaaggtagacaaatgcccatga 205