Miyakogusa Predicted Gene
- Lj3g3v0929270.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj3g3v0929270.1 tr|I1KTQ4|I1KTQ4_SOYBN Citrate synthase
OS=Glycine max PE=3 SV=1,92.58,0,SUBFAMILY NOT NAMED,NULL; CITRATE
SYNTHASE,Citrate synthase-like; no description,Citrate
synthase-li,CUFF.41680.1
(1419 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC57571 similar to UniRef100_Q6T8H1 Cluster: Mitochondr... 2771 0.0
gnl|LJGI|CB827045 similar to UniRef100_Q946X8 Cluster: Citrate s... 860 0.0
>gnl|LJGI|TC57571 similar to UniRef100_Q6T8H1 Cluster: Mitochondrial citrate synthase;
n=2; Citrus|Rep: Mitochondrial citrate synthase - Citrus
junos, partial (98%)
Length = 1897
Score = 2771 bits (1398), Expect = 0.0
Identities = 1412/1419 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgttcttccgaagcgtttctgcgctttcccggcttcgatctcgtgtgggtcagcaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 70 atggcgttcttccgaagcgtttctgcgctttcccggcttcgatctcgtgtgggtcagcaa 129
Query: 61 tctagtctcgccaattcagttagatggctccaaactccgagctccggtaacactgatctt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tctagtctcgccaattcagttagatggctccaaactccgagctccggtaacactgatctt 189
Query: 121 tattctgaggtgaaggaactaattcctcagtatcaggaacgtgttaagaagttgaagaaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 190 tattctgaggtgaaggaactaattcctcagtatcaggaacgtgttaagaagttgaagaaa 249
Query: 181 gatcatggaaatgttgaactgggaaaaatcactgttgatatggtacttggtggaatgaga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 250 gatcatggaaatgttgaactgggaaaaatcactgttgatatggtacttggtggaatgaga 309
Query: 241 ggaatgactgctttggtgtggcttggctcagctgttgacccagatgagggaattcggttt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 310 ggaatgactgctttggtgtggcttggctcagctgttgacccagatgagggaattcggttt 369
Query: 301 aggggcatgtcaattcctgaatgccagaaagcacttccaggtgcttttcctnnnnnnnaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 370 aggggcatgtcaattcctgaatgccagaaagcacttccaggtgcttttcctgggggggaa 429
Query: 361 cctttgcctgaagctgtactgtggcttctactcacaggaaagataccaagtaaagaacaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 430 cctttgcctgaagctgtactgtggcttctactcacaggaaagataccaagtaaagaacaa 489
Query: 421 gtggattcattagcccaagaattgcgaagccgtgcaactatcccagattatgcttataag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 490 gtggattcattagcccaagaattgcgaagccgtgcaactatcccagattatgcttataag 549
Query: 481 gcaattgatgctctgcctgtttctgctcatccaatgacacaatttacaactggtgtcatg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 550 gcaattgatgctctgcctgtttctgctcatccaatgacacaatttacaactggtgtcatg 609
Query: 541 gccctccaggtgcagagtgagtttcagaaggcatatgagggtgggatagctaagtcaagg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 610 gccctccaggtgcagagtgagtttcagaaggcatatgagggtgggatagctaagtcaagg 669
Query: 601 tattgggagccaacttatgaggatacattgaatttaattgctcgtttgcccggaattgct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 670 tattgggagccaacttatgaggatacattgaatttaattgctcgtttgcccggaattgct 729
Query: 661 gcttacatttaccgacggatatacaaggatggaaaaatcatcccattggatgatactctg 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 730 gcttacatttaccgacggatatacaaggatggaaaaatcatcccattggatgatactctg 789
Query: 721 gattatggtgcaaactatgctcacatgttaggatttgatgatccagagatgctggagttt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 790 gattatggtgcaaactatgctcacatgttaggatttgatgatccagagatgctggagttt 849
Query: 781 atgaggctgtacatttccattcatagtgatcatgaaggtggcaatgttagttctcacaca 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 850 atgaggctgtacatttccattcatagtgatcatgaaggtggcaatgttagttctcacaca 909
Query: 841 gcccacttagttgctagtccactgtcagatccttaccttgcattcgcagctgcgttgaat 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 910 gcccacttagttgctagtccactgtcagatccttaccttgcattcgcagctgcgttgaat 969
Query: 901 ggtttagctgggccactgcatggtttggccaatcaggaagttctacgatggatcagatcg 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 970 ggtttagctgggccactgcatggtttggccaatcaggaagttctacgatggatcagatcg 1029
Query: 961 ttagttaacgagtttggaactccagatataagtacagaacaattgtctgactacattcat 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1030 ttagttaacgagtttggaactccagatataagtacagaacaattgtctgactacattcat 1089
Query: 1021 aaaacattgagcagtggcaaggttgtgcctggatatggacatggggttttgcgcaatact 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1090 aaaacattgagcagtggcaaggttgtgcctggatatggacatggggttttgcgcaatact 1149
Query: 1081 gatccaagatacacatgtcagagggagttcgcactgaagcatttgcctaatgatccactt 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1150 gatccaagatacacatgtcagagggagttcgcactgaagcatttgcctaatgatccactt 1209
Query: 1141 ttccagctggtgtcaaaaataaaagaggttgtgcctcccattctaaccaagttaggcaag 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1210 ttccagctggtgtcaaaaataaaagaggttgtgcctcccattctaaccaagttaggcaag 1269
Query: 1201 gttaaaaatccatggcctaatgttgatgctcacagtggagtgctactaaactactatggt 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1270 gttaaaaatccatggcctaatgttgatgctcacagtggagtgctactaaactactatggt 1329
Query: 1261 ctaactgaggaaaactattatactgttctctttggtgtagcgaggagtattggagttggt 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1330 ctaactgaggaaaactattatactgttctctttggtgtagcgaggagtattggagttggt 1389
Query: 1321 cctcagttgatctgggaccgggctcttggaatggcacttgaaaggcccaaaagtgtcacc 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1390 cctcagttgatctgggaccgggctcttggaatggcacttgaaaggcccaaaagtgtcacc 1449
Query: 1381 ctggagaaactcgagagtttggtcggcgcatcatcctga 1419
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1450 ctggagaaactcgagagtttggtcggcgcatcatcctga 1488
>gnl|LJGI|CB827045 similar to UniRef100_Q946X8 Cluster: Citrate synthase; n=1; Prunus
persica|Rep: Citrate synthase - Prunus persica (Peach),
partial (34%)
Length = 555
Score = 860 bits (434), Expect = 0.0
Identities = 485/503 (96%), Gaps = 1/503 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgttcttccgaagcgtttctgcgctttcccggcttcgatctcgtgtgggtcagcaa 60
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||
Sbjct: 54 atggcgttcttccgatt-gtttctgcgctttcccggctgggatctcacgaccctcagcaa 112
Query: 61 tctagtctcgccaattcagttagatggctccaaactccgagctccggtaacactgatctt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 113 tctagtctcgccaattcagttagatggctccaaactccgagctccggtaacactgatctt 172
Query: 121 tattctgaggtgaaggaactaattcctcagtatcaggaacgtgttaagaagttgaagaaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 173 tattctgaggtgaaggaactaattcctcagtatcaggaacgtgttaagaagttgaagaaa 232
Query: 181 gatcatggaaatgttgaactgggaaaaatcactgttgatatggtacttggtggaatgaga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 233 gatcatggaaatgttgaactgggaaaaatcactgttgatatggtacttggtggaatgaga 292
Query: 241 ggaatgactgctttggtgtggcttggctcagctgttgacccagatgagggaattcggttt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 293 ggaatgactgctttggtgtggcttggctcagctgttgacccagatgagggaattcggttt 352
Query: 301 aggggcatgtcaattcctgaatgccagaaagcacttccaggtgcttttcctnnnnnnnaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 353 aggggcatgtcaattcctgaatgccagaaagcacttccaggtgcttttcctgggggggaa 412
Query: 361 cctttgcctgaagctgtactgtggcttctactcacaggaaagataccaagtaaagaacaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 413 cctttgcctgaagctgtactgtggcttctactcacaggaaagataccaagtaaagaacaa 472
Query: 421 gtggattcattagcccaagaattgcgaagccgtgcaactatcccagattatgcttataag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 473 gtggattcattagcccaagaattgcgaagccgtgcaactatcccagattatgcttataag 532
Query: 481 gcaattgatgctctgcctgtttc 503
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 533 gcaattgatgctctgcctgtttc 555