Miyakogusa Predicted Gene
- Lj3g3v0428820.2
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj3g3v0428820.2 Non Chatacterized Hit- tr|I1LSW3|I1LSW3_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.55833
PE,91.72,0,HOMOGENTISATE 1,2-DIOXYGENASE,NULL; HOMOGENTISATE
1,2-DIOXYGENASE,Homogentisate 1,2-dioxygenase; Hgm,CUFF.40726.2
(1305 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC62630 similar to UniRef100_A7P1V8 Cluster: Chromosome... 2587 0.0
gnl|LJGI|FS318808 similar to UniRef100_A7P1V8 Cluster: Chromosom... 1199 0.0
gnl|LJGI|BP042454 similar to UniRef100_A7P1V8 Cluster: Chromosom... 837 0.0
>gnl|LJGI|TC62630 similar to UniRef100_A7P1V8 Cluster: Chromosome chr19 scaffold_4,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr19 scaffold_4, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (92%)
Length = 2355
Score = 2587 bits (1305), Expect = 0.0
Identities = 1305/1305 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaacattccaccgccggcgacgacttcaactacctctccggcttcggcaaccacttc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 161 atggaacattccaccgccggcgacgacttcaactacctctccggcttcggcaaccacttc 220
Query: 61 tcctccgaggccctcgccggagctctcccggaggcccagaatagcccccttatctgcccc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 221 tcctccgaggccctcgccggagctctcccggaggcccagaatagcccccttatctgcccc 280
Query: 121 tatggcctctacgccgagcaaatctccggcacctcattcacttctcctcggaatctcaac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 281 tatggcctctacgccgagcaaatctccggcacctcattcacttctcctcggaatctcaac 340
Query: 181 ctcttcagttggttttatcgggtcaaaccatcggtgacccatgaaccgttcaagcctcgg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 341 ctcttcagttggttttatcgggtcaaaccatcggtgacccatgaaccgttcaagcctcgg 400
Query: 241 gttccttgtaatggaaggattttgagtgagttcaaccactccaacagttctactaaccca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 401 gttccttgtaatggaaggattttgagtgagttcaaccactccaacagttctactaaccca 460
Query: 301 acacagcttcgatggaaaccgatggattcgcctgattcacccacggatttcattgatggg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 461 acacagcttcgatggaaaccgatggattcgcctgattcacccacggatttcattgatggg 520
Query: 361 ttatctacggtttgtggttctggtagctccttcatgcgccatggatatgctattcacatg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 521 ttatctacggtttgtggttctggtagctccttcatgcgccatggatatgctattcacatg 580
Query: 421 tacactgctaacaaatcaatgaacaattgtgccttttgcaatgctgatggtgacttcttg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 581 tacactgctaacaaatcaatgaacaattgtgccttttgcaatgctgatggtgacttcttg 640
Query: 481 atagttccccagcaaggaagactcttcataactactgaatgtggaagattgaaagtttcc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 641 atagttccccagcaaggaagactcttcataactactgaatgtggaagattgaaagtttcc 700
Query: 541 ccaggtgaaattgctatgctaccccaaggttttcgttttactgtcgatctgcctgatggt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 701 ccaggtgaaattgctatgctaccccaaggttttcgttttactgtcgatctgcctgatggt 760
Query: 601 ccatcacgtggctatgttgctgaaatttttggtactcattttcaacttcctgatctggga 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 761 ccatcacgtggctatgttgctgaaatttttggtactcattttcaacttcctgatctggga 820
Query: 661 ccaataggtgctaatggtctcgctgccccaagggatttccttgttcctacagcatggttt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 821 ccaataggtgctaatggtctcgctgccccaagggatttccttgttcctacagcatggttt 880
Query: 721 gaggataaatcttatcctgggtacaccatagtacagaagtttggtggtgaactattttct 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 881 gaggataaatcttatcctgggtacaccatagtacagaagtttggtggtgaactattttct 940
Query: 781 gcagtacaagatttctctcccttcaatgttgttgcttggcgtggtaattatgttccgtat 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 941 gcagtacaagatttctctcccttcaatgttgttgcttggcgtggtaattatgttccgtat 1000
Query: 841 aagtatgatcttagcaaattctgcccttacaacacagttctctttgatcacagtgatcca 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1001 aagtatgatcttagcaaattctgcccttacaacacagttctctttgatcacagtgatcca 1060
Query: 901 tcaatcaacactgtgttgacagcaccaactgataagcctggagtggcattgcttgatttc 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1061 tcaatcaacactgtgttgacagcaccaactgataagcctggagtggcattgcttgatttc 1120
Query: 961 gtcattttcccgcccagatggctggttgctgaacacactttccggcctccatattatcac 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1121 gtcattttcccgcccagatggctggttgctgaacacactttccggcctccatattatcac 1180
Query: 1021 cgcaactgcatgagtgaatttatgggtctcatccatggtggctatgaggcgaaggttgat 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1181 cgcaactgcatgagtgaatttatgggtctcatccatggtggctatgaggcgaaggttgat 1240
Query: 1081 gggtttcttccgggcggtgcaagtcttcatagctgtatgactccccacggtcctgatacg 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1241 gggtttcttccgggcggtgcaagtcttcatagctgtatgactccccacggtcctgatacg 1300
Query: 1141 aagtcatatgaggccaccattgcgcgtgggaatgatgtaggacctaacaagatcactgac 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1301 aagtcatatgaggccaccattgcgcgtgggaatgatgtaggacctaacaagatcactgac 1360
Query: 1201 acgatggcttttatgtttgagtcgtgtttgatacctcgcattagtcgatgggctctcgaa 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1361 acgatggcttttatgtttgagtcgtgtttgatacctcgcattagtcgatgggctctcgaa 1420
Query: 1261 tcaccattcttggaccatgattattaccaatgttggattggcctg 1305
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1421 tcaccattcttggaccatgattattaccaatgttggattggcctg 1465
>gnl|LJGI|FS318808 similar to UniRef100_A7P1V8 Cluster: Chromosome chr19 scaffold_4,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr19 scaffold_4, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (44%)
Length = 722
Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0
Identities = 648/666 (97%), Gaps = 16/666 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaacattccaccgccggcgacgacttcaactacctctccggcttcggcaaccacttc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 57 atggaacattccaccgccggcgacgacttcaactacctctccggcttcggcaaccacttc 116
Query: 61 tcctccgaggccctcgccggagctctcccggaggcccagaatagcccccttatctgcccc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 117 tcctccgaggccctcgccggagctctcccggaggcccagaatagcccccttatctgcccc 176
Query: 121 tatggcctctacgccgagcaaatctccggcacctcattcacttctcctcggaatctcaac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 177 tatggcctctacgccgagcaaatctccggcacctcattcacttctcctcggaatctcaac 236
Query: 181 ctcttcagttggttttatcgggtcaaaccatcggtgacccatgaaccgttcaagcctcgg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 237 ctcttcagttggttttatcgggtcaaaccatcggtgacccatgaaccgttcaagcctcgg 296
Query: 241 gttccttgtaatggaaggattttgagtgagttcaaccactccaacagttctactaaccca 300
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 297 gttccttgtaatggaaggatttggagtgagttcaaccactccaacagttctactaaccca 356
Query: 301 acacagcttcgatggaaaccgatggattcgcctgattcacccacggatttcattgatggg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 357 acacagcttcgatggaaaccgatggattcgcctgattcacccacggatttcattgatggg 416
Query: 361 ttatctacggtttgtggttctggtagctccttcatgcgccatggatatgctattcacatg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 417 ttatctacggtttgtggttctggtagctccttcatgcgccatggatatgctattcacatg 476
Query: 421 tacactgctaacaaatcaatgaacaattgtgccttttgcaatgctgatggtgacttcttg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 477 tacactgctaacaaatcaatgaacaattgtgccttttgcaatgctgatggtgacttcttg 536
Query: 481 atagttccccagcaagga----------------agactcttcataactactgaatgtgg 524
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 537 atagttccccagcaaggaatttcatgattcttagagactcttcataactactgaatgtgg 596
Query: 525 aagattgaaagtttccccaggtgaaattgctatgctaccccaaggttttcgttttactgt 584
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 597 aagattgaaagtttccccaggtgaaattgctatgctaccccaaggttttcgttttactat 656
Query: 585 cgatctgcctgatggtccatcacgtggctatgttgctgaaatttttggtactcattttca 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 657 cgatctgcctgatggtccatcacgtggctatgttgctgaaatttttggtactcattttca 716
Query: 645 acttcc 650
||||||
Sbjct: 717 acttcc 722
>gnl|LJGI|BP042454 similar to UniRef100_A7P1V8 Cluster: Chromosome chr19 scaffold_4,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr19 scaffold_4, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (27%)
Length = 561
Score = 837 bits (422), Expect = 0.0
Identities = 422/422 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaacattccaccgccggcgacgacttcaactacctctccggcttcggcaaccacttc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 83 atggaacattccaccgccggcgacgacttcaactacctctccggcttcggcaaccacttc 142
Query: 61 tcctccgaggccctcgccggagctctcccggaggcccagaatagcccccttatctgcccc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 143 tcctccgaggccctcgccggagctctcccggaggcccagaatagcccccttatctgcccc 202
Query: 121 tatggcctctacgccgagcaaatctccggcacctcattcacttctcctcggaatctcaac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 203 tatggcctctacgccgagcaaatctccggcacctcattcacttctcctcggaatctcaac 262
Query: 181 ctcttcagttggttttatcgggtcaaaccatcggtgacccatgaaccgttcaagcctcgg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 263 ctcttcagttggttttatcgggtcaaaccatcggtgacccatgaaccgttcaagcctcgg 322
Query: 241 gttccttgtaatggaaggattttgagtgagttcaaccactccaacagttctactaaccca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323 gttccttgtaatggaaggattttgagtgagttcaaccactccaacagttctactaaccca 382
Query: 301 acacagcttcgatggaaaccgatggattcgcctgattcacccacggatttcattgatggg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 383 acacagcttcgatggaaaccgatggattcgcctgattcacccacggatttcattgatggg 442
Query: 361 ttatctacggtttgtggttctggtagctccttcatgcgccatggatatgctattcacatg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 443 ttatctacggtttgtggttctggtagctccttcatgcgccatggatatgctattcacatg 502
Query: 421 ta 422
||
Sbjct: 503 ta 504