Miyakogusa Predicted Gene

Lj3g3v0273600.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj3g3v0273600.1 Non Chatacterized Hit- tr|K3YGY0|K3YGY0_SETIT
Uncharacterized protein OS=Setaria italica
GN=Si013498,31.7,2e-18,Ankyrin repeat,Ankyrin repeat-containing
domain; ANK_REPEAT,Ankyrin repeat; ANK_REP_REGION,Ankyrin
r,CUFF.40399.1
         (1938 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC79358 similar to UniRef100_A7P764 Cluster: Chromosome...  2341   0.0  
gnl|LJGI|TC81487 weakly similar to UniRef100_A7P763 Cluster: Chr...  1669   0.0  

>gnl|LJGI|TC79358 similar to UniRef100_A7P764 Cluster: Chromosome chr9 scaffold_7,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr9 scaffold_7, whole genome shotgun sequence
            - Vitis vinifera (Grape), partial (21%)
          Length = 1272

 Score = 2341 bits (1181), Expect = 0.0
 Identities = 1196/1201 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 738  agctgtgaggtacggatgctatgatgcatttgtattcttggtgcaagtttccaatggtac 797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2    agctgtgaggtacggatgctatgatgcatttgtattcttggtgcaagtttccaatggtac 61

                                                                        
Query: 798  caatctattgcattgtcaagatatatttggcaatattgctctaccccttgcagttatagt 857
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| 
Sbjct: 62   caatctattgcattgtcaagatagatttggcaatagtgctctacaccttgcagttatagg 121

                                                                        
Query: 858  tggccgccataagatagcagagttcttgatcatcaagacaaagctagatattaatactcg 917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122  tggccgccataagatagcagagttcttgatcatcaagacaaagctagatattaatactcg 181

                                                                        
Query: 918  gaacagtgaagggatcgcagcacttgacatccttgaccaggctatggacagtgcagaaaa 977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182  gaacagtgaagggatcgcagcacttgacatccttgaccaggctatggacagtgcagaaaa 241

                                                                        
Query: 978  taggcaattacaagccacttttatccgagctggaggtaaaagaagcttcaaccaatcttc 1037
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242  taggcaattacaagccacttttatccgagctggaggtaaaagaagcttcaaccaatcttc 301

                                                                        
Query: 1038 atctttttcactggaaatagaaaagtccaattcgcattcaccagcagcgtctaggctttc 1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302  atctttttcactggaaatagaaaagtccaattcgcattcaccagcagcgtctaggctttc 361

                                                                        
Query: 1098 tttgtcaaggaggtttatggctaacgaagtggaagtgctgaatgacatggtttcttatga 1157
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 362  tttgtcaaggaggtttatggctaacgaagtggaagtgctgaatgacgtggtttcttatga 421

                                                                        
Query: 1158 ttgtacaagccctcctaaagttagcaaaagcacagaccctagatcacctcagcctcaagt 1217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422  ttgtacaagccctcctaaagttagcaaaagcacagaccctagatcacctcagcctcaagt 481

                                                                        
Query: 1218 aagtgagacattagagaatggagcctatacaccatattacttctccccaacaattttagg 1277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482  aagtgagacattagagaatggagcctatacaccatattacttctccccaacaattttagg 541

                                                                        
Query: 1278 gaaacacaagcatcacagcaaaagaaaagtggaaaatctaaatcaacattactatactca 1337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542  gaaacacaagcatcacagcaaaagaaaagtggaaaatctaaatcaacattactatactca 601

                                                                        
Query: 1338 gaggaataagtaccatcatgaaatgcacaaagaggcattactgaatgctaggaacacagt 1397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602  gaggaataagtaccatcatgaaatgcacaaagaggcattactgaatgctaggaacacagt 661

                                                                        
Query: 1398 tgtattagttgctgttttgattgcaactgtcacttttgccgccggtattagtccccctgg 1457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662  tgtattagttgctgttttgattgcaactgtcacttttgccgccggtattagtccccctgg 721

                                                                        
Query: 1458 tggtgtgtaccaagacggaccgatgaaagggaagtcaatggtgggtaaaacaacagcttt 1517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722  tggtgtgtaccaagacggaccgatgaaagggaagtcaatggtgggtaaaacaacagcttt 781

                                                                        
Query: 1518 caaggtctttgcaataagcaacaacgtagcacttttcacctctttgtctgtagttattgt 1577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782  caaggtctttgcaataagcaacaacgtagcacttttcacctctttgtctgtagttattgt 841

                                                                        
Query: 1578 tcttgttagtatcattccctttaggagaaaaccacagacaatactactaatgatggctca 1637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842  tcttgttagtatcattccctttaggagaaaaccacagacaatactactaatgatggctca 901

                                                                        
Query: 1638 caaggtcatgtgggtagctgtggcatttatggcaaccagctacgttgctgccacatgggt 1697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902  caaggtcatgtgggtagctgtggcatttatggcaaccagctacgttgctgccacatgggt 961

                                                                        
Query: 1698 gatcttgccacatagtcaagagatgcaatggctttctgttgtgctgatagcattaggtgg 1757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962  gatcttgccacatagtcaagagatgcaatggctttctgttgtgctgatagcattaggtgg 1021

                                                                        
Query: 1758 tggctctttgggaacaatattcattggtcttagtgtgatgctggttgagcactggctgag 1817
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 tggctctttgggaacaatattcattggtcttagtgtgatgctggttgagcactggctgag 1081

                                                                        
Query: 1818 gaaatccaagtggagaaagacagggaaggaaggccttgatggagatgcaaactcagaaaa 1877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 gaaatccaagtggagaaagacagggaaggaaggccttgatggagatgcaaactcagaaaa 1141

                                                                        
Query: 1878 ggaaagtaaaaattcagattttgagagctcttatttgcagggttatcattcatactgatt 1937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 ggaaagtaaaaattcagattttgagagctcttatttgcagggttatcattcatactgatt 1201

             
Query: 1938 a 1938
            |
Sbjct: 1202 a 1202


>gnl|LJGI|TC81487 weakly similar to UniRef100_A7P763 Cluster: Chromosome chr9
           scaffold_7, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
           vinifera|Rep: Chromosome chr9 scaffold_7, whole genome
           shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (21%)
          Length = 1019

 Score = 1669 bits (842), Expect = 0.0
 Identities = 863/870 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   atggatccgaagttttttgaagcaataaggaaaaatgacatatccacattttcaagctta 60
           |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 84  atggatccaaagttttttgaagcaataaggaaaaatgacataaccacattttcaagctta 143

                                                                       
Query: 61  gttaaagggaatgaagaaatacttaatcagaaaacggaagattcattcagcactccatta 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 144 gttaaagggaatgaagaaatacttaatcagaaaacggaagattcattcagcactccatta 203

                                                                       
Query: 121 caccttgcttccaagtatggttgcactgaaatggtgtctgagattctcaggttgtgccct 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 204 caccttgcttccaagtatggttgcactgaaatggtgtctgagattctcaggttgtgccct 263

                                                                       
Query: 181 gacatggtttttgctgagaataaacaactcaagactccaattcatgaggcttgccaacaa 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264 gacatggtttttgctgagaataaacaactcaagactccaattcatgaggcttgccaacaa 323

                                                                       
Query: 241 gagaatgtcaaggtcttaatgttgctgttggaggccaatccaacagctgcttgtaagctg 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 324 gagaatgtcaaggtcttaatgttgctgttggaggccaatccaacagctgcttgtaagctg 383

                                                                       
Query: 301 aactcatcttgtaaaagtgcttttttggtggcttgcagccatggtcatctagacatggtg 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 384 aactcatcttgtaaaagtgcttttttggtggcttgcagccatggtcatctagacatggtg 443

                                                                       
Query: 361 aatctcctgctgaatctatctgagatggtggggctagaagtagcaggctttgatgaaact 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 444 aatctcctgctgaatctatctgagatggtggggctagaagtagcaggctttgatgaaact 503

                                                                       
Query: 421 tgtatccatattgctatatcaagagggcccacagatgttgtgagagagttgttgaataag 480
           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 504 tgtatccatattgctatatcaagagggcacacagatgttgtgagagagttgttgaataag 563

                                                                       
Query: 481 tggccagggcttaatcaagtgattgacgacaatggaaattcactattgcatcatgcttgt 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 564 tggccagggcttaatcaagtgattgacgacaatggaaattcactattgcatcatgcttgt 623

                                                                       
Query: 541 aataaagggcacaaggagattgcatggatcctactaagacgtgatccaaatcttgcttta 600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 624 aataaagggcacaaggagattgcatggatcctactaagacgtgatccaaatcttgcttta 683

                                                                       
Query: 601 caatacaacaacaatggttacacaccactgcacctggcagtgatgaatgggaaagtctca 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 684 caatacaacaacaatggttacacaccactgcacctggcagtgatgaatgggaaagtctca 743

                                                                       
Query: 661 atccttgaggactttgtgtcaagctgtgctgcatcatttcactatctcacaagagaagaa 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 744 atccttgaggactttgtgtcaagctgtgctgcatcatttcactatctcacaagagaagaa 803

                                                                       
Query: 721 gagacaatatttcacttagctgtgaggtacggatgctatgatgcatttgtattcttggtg 780
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 804 gagacaatatttcacttagctgtgaggtacggatgctatgatgcatttgtattcttggtg 863

                                                                       
Query: 781 caagtttccaatggtaccaatctattgcattgtcaagatatatttggcaatattgctcta 840
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 864 caagtttccaatggtaccaatctattgcattgtcaagatagatttggcaatagtgctcta 923

                                         
Query: 841 ccccttgcagttatagttggccgccataag 870
           | |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 924 caccttgcagttataggtggccgccataag 953