Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v3373100.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v3373100.1 tr|Q9S7B1|Q9S7B1_LOTJA Nodule inception protein
OS=Lotus japonicus GN=nin PE=2 SV=1,100,0,CAD & PB1 domains,NULL;
SUBFAMILY NOT NAMED,NULL; FAMILY NOT NAMED,NULL; RWP-RK,Plant
regulator RWP-,NODE_39574_length_2908_cov_39.216644.path2.1
(2640 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC74887 UniRef100_Q9S7B1 Cluster: Nodule inception prot... 5109 0.0
gnl|LJGI|TC81686 UniRef100_Q7X9C0 Cluster: NIN-like protein 2; n... 76 1e-12
gnl|LJGI|TC63894 UniRef100_Q7X9C1 Cluster: NIN-like protein 1; n... 74 5e-12
>gnl|LJGI|TC74887 UniRef100_Q9S7B1 Cluster: Nodule inception protein; n=1; Lotus
japonicus|Rep: Nodule inception protein - Lotus
japonicus, complete
Length = 3000
Score = 5109 bits (2577), Expect = 0.0
Identities = 2591/2598 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 43 gattgtaattctgcctatgggagcttgtctaatttatcatcagactgtggatcagtgaca 102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 156 gattgtaattctgcctatgggagcttgtctaatttatcatcagactgtggatcagtgaca 215
Query: 103 acagcagaagcagatcatcacatcattgaggagctgttagtacaaggttgctgggtggaa 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 216 acagcagaagcagatcatcacatcattgaggagctgttagtacaaggttgctgggtggaa 275
Query: 163 gttagtggtgttggtgttagggagggtgagctccagctccaacaagacgaatcaagtttt 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276 gttagtggtgttggtgttagggagggtgagctccagctccaacaagacgaatcaagtttt 335
Query: 223 gtggtggggaagagatggtggattggaccagctgcagcagtagcaggatcatgtaattcc 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 336 gtggtggggaagagatggtggattggaccagctgcagcagtagcaggatcatgtaattcc 395
Query: 283 tctgtcaaagagagactagtgattgctgttgggtacttgaaagactacacaagaaactcc 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 396 tctgtcaaagagagactagtgattgctgttgggtacttgaaagactacacaagaaactcc 455
Query: 343 aacgtgctcattcagatatgggtgcccttacgaagaggcatccttcatgatcatgattac 402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 456 aacgtgctcattcagatatgggtgcccttacgaagaggcatccttcatgatcatgattac 515
Query: 403 cacacaaattatttactttccaataatcctcctcctcaaccagaagcagcagcagatcat 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 516 cacacaaattatttactttccaataatcctcctcctcaaccagaagcagcagcagatcat 575
Query: 463 gaatctgtttcacttggttttcccatgccagcagctcccaactcaaacttatactcaaac 522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 576 gaatctgtttcacttggttttcccatgccagcagctcccaactcaaacttatactcaaac 635
Query: 523 gtgcacgtccgnnnnnnnagaagccacgagtacccgcgcgttcaggctcagcagtatgga 582
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 636 gtgcacgtccgtttttttagaagccacgagtacccgcgcgttcaggctcagcagtatgga 695
Query: 583 tctttagcccttcctgtcttcgaaagaggcaccgggacatgccttggtgtccttgagatt 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 696 tctttagcccttcctgtcttcgaaagaggcaccgggacatgccttggtgtccttgagatt 755
Query: 643 gtaatcaccaaccaaaccaccatcaactacaatgtctccaatgctcttgatcaggctgtt 702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 756 gtaatcaccaaccaaaccaccatcaactacaatgtctccaatgctcttgatcaggctgtt 815
Query: 703 gattttagaagcagccagagcttcattccacctgccatcaaggtatatgacgagttgtac 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 816 gattttagaagcagccagagcttcattccacctgccatcaaggtatatgacgagttgtac 875
Query: 763 caagcagcagtgaatgagatcatagaggtgatgacttctgtttgcaagacacacaatttg 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 876 caagcagcagtgaatgagatcatagaggtgatgacttctgtttgcaagacacacaatttg 935
Query: 823 ccattagcactcacttgggctccttgcatccaacaaggcaagtgtggttgtggggtttca 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 936 ccattagcactcacttgggctccttgcatccaacaaggcaagtgtggttgtggggtttca 995
Query: 883 tctgagaattacatgtggtgcgtctccaccgtggattctgcgtgctttgttggggatcta 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 996 tctgagaattacatgtggtgcgtctccaccgtggattctgcgtgctttgttggggatcta 1055
Query: 943 gacatattgggattccaagaagcgtgctctgagtatcaccttttccggggacaaggaatt 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1056 gacatattgggattccaagaagcgtgctctgagtatcaccttttccggggacaaggaatt 1115
Query: 1003 gttggtacagccttcacaacatccaaaccgtgtttcgccattgacatcacagccttcagc 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1116 gttggtacagccttcacaacatccaaaccgtgtttcgccattgacatcacagccttcagc 1175
Query: 1063 aaagctgaataccctcttgctcaccatgcaaacatgttcggattgcatgcagctgtggcc 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1176 aaagctgaataccctcttgctcaccatgcaaacatgttcggattgcatgcagctgtggcc 1235
Query: 1123 attccactcaggagtgtctacaccggttcagctgctgattttgttttggagtttttcctt 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1236 attccactcaggagtgtctacaccggttcagctgctgattttgttttggagtttttcctt 1295
Query: 1183 ccaaaagattgccatgacagtgaagagcagaagcagttgctcaactcattgtccatggtg 1242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1296 ccaaaagattgccatgacagtgaagagcagaagcagttgctcaactcattgtccatggtg 1355
Query: 1243 gtacagcaagcttgccgcagcttgcatgtggtactggtggaggatgaatacaccttgccg 1302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1356 gtacagcaagcttgccgcagcttgcatgtggtactggtggaggatgaatacaccttgccg 1415
Query: 1303 atgccatcacacactagtaaagaggaattagaagaagaagagattaccattaccaataat 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1416 atgccatcacacactagtaaagaggaattagaagaagaagagattaccattaccaataat 1475
Query: 1363 catgagcagaaattatttgtgtctccctcctctcatgaatcagaatgttcaaaagaatca 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1476 catgagcagaaattatttgtgtctccctcctctcatgaatcagaatgttcaaaagaatca 1535
Query: 1423 tcatggattgcacacatgatggaggctcagcagaaggggaaaggtgtgtctgtgtctttg 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1536 tcatggattgcacacatgatggaggctcagcagaaggggaaaggtgtgtctgtgtctttg 1595
Query: 1483 gagtacttggaagaaccaaaggaggagttcaaagtaacaacaaactgggacagcagcact 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1596 gagtacttggaagaaccaaaggaggagttcaaagtaacaacaaactgggacagcagcact 1655
Query: 1543 gaccatgatcagcaggcgcaggtgttttcatcagattttgggcaaatgagttcaggattc 1602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1656 gaccatgatcagcaggcgcaggtgttttcatcagattttgggcaaatgagttcaggattc 1715
Query: 1603 aaagcaagtactgtggagggtggggatcaagagtcttcttatacctttggaagccgccgc 1662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1716 aaagcaagtactgtggagggtggggatcaagagtcttcttatacctttggaagccgccgc 1775
Query: 1663 tcgtcttctggtggaagaaagtcaggcgagaagagacgaaccaaggcagagaagactatc 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1776 tcgtcttctggtggaagaaagtcaggcgagaagagacgaaccaaggcagagaagactatc 1835
Query: 1723 agcttgcaagttctaagacagtactttgcaggaagcctaaaagatgcagcaaagagcatt 1782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1836 agcttgcaagttctaagacagtactttgcaggaagcctaaaagatgcagcaaagagcatt 1895
Query: 1783 ggtgtatgtcccacaactctgaaaaggatatgcagacagcatggcatcaccaggtggcct 1842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1896 ggtgtatgtcccacaactctgaaaaggatatgcagacagcatggcatcaccaggtggcct 1955
Query: 1843 tcaaggaaaatcaagaaggttggccattctttaaaaaagcttcagctggtgattgattca 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1956 tcaaggaaaatcaagaaggttggccattctttaaaaaagcttcagctggtgattgattca 2015
Query: 1903 gtgcagggtgctgagggtgccatacagattggctcattctatgccagttttccagagttg 1962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2016 gtgcagggtgctgagggtgccatacagattggctcattctatgccagttttccagagttg 2075
Query: 1963 agctcttcagatttctctgccagttgccgttctgattcatccaagaaaatgcataattat 2022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2076 agctcttcagatttctctgccagttgccgttctgattcatccaagaaaatgcataattat 2135
Query: 2023 cctgatcagaacaacaccttgtatggccatggagatcatggaggagttgttactagttta 2082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2136 cctgatcagaacaacaccttgtatggccatggagatcatggaggagttgttactagttta 2195
Query: 2083 aaatctccaccctctgcttgcagccaaacttttgcaggaaaccaaccatgcaccatcatc 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2196 aaatctccaccctctgcttgcagccaaacttttgcaggaaaccaaccatgcaccatcatc 2255
Query: 2143 aacaatggagatgttcttatgacagaaagtcctccagtccctgaagcattgctgagtagg 2202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2256 aacaatggagatgttcttatgacagaaagtcctccagtccctgaagcattgctgagtagg 2315
Query: 2203 agagatcactgtgaggaagcagaattattgaacaatgcatctatccaagaggatacaaag 2262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2316 agagatcactgtgaggaagcagaattattgaacaatgcatctatccaagaggatacaaag 2375
Query: 2263 cgtttcagcagacccaagagccaaaccctacctcccttgtctgacagcagtggctggaac 2322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2376 cgtttcagcagacccaagagccaaaccctacctcccttgtctgacagcagtggctggaac 2435
Query: 2323 tcactggaaacaggtgctttcagagtgaaagcaacttttgcagatgagaagatccgcttc 2382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2436 tcactggaaacaggtgctttcagagtgaaagcaacttttgcagatgagaagatccgcttc 2495
Query: 2383 agcttgcaacccatttgggggttcagtgatttgcagctagagatagcaagacggttcaat 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2496 agcttgcaacccatttgggggttcagtgatttgcagctagagatagcaagacggttcaat 2555
Query: 2443 ctaaatgatgtgaccaacatccttctcaagtatctggatgatgatggagagtgggtagtt 2502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2556 ctaaatgatgtgaccaacatccttctcaagtatctggatgatgatggagagtgggtagtt 2615
Query: 2503 ttagcatgtgatggtgatcttgaggagtgcaaagacatacacagatcatctcagagccgg 2562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2616 ttagcatgtgatggtgatcttgaggagtgcaaagacatacacagatcatctcagagccgg 2675
Query: 2563 acaattagactctccctttttcaagcttcgcctctaaatctagctaatacattccgcaat 2622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2676 acaattagactctccctttttcaagcttcgcctctaaatctagctaatacattccgcaat 2735
Query: 2623 agcagcccatcttaacat 2640
||||||||||||||||||
Sbjct: 2736 agcagcccatcttaacat 2753
>gnl|LJGI|TC81686 UniRef100_Q7X9C0 Cluster: NIN-like protein 2; n=1; Lotus
japonicus|Rep: NIN-like protein 2 - Lotus japonicus,
complete
Length = 3814
Score = 75.8 bits (38), Expect = 1e-12
Identities = 56/62 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1765 gatgcagcaaagagcattggtgtatgtcccacaactctgaaaaggatatgcagacagcat 1824
||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct: 2202 gatgctgcaaagagcattggtgtttgcccaacaactctgaagaggatatgcagacatcat 2261
Query: 1825 gg 1826
||
Sbjct: 2262 gg 2263
>gnl|LJGI|TC63894 UniRef100_Q7X9C1 Cluster: NIN-like protein 1; n=1; Lotus
japonicus|Rep: NIN-like protein 1 - Lotus japonicus,
complete
Length = 3498
Score = 73.8 bits (37), Expect = 5e-12
Identities = 94/113 (83%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1753 ggaagcctaaaagatgcagcaaagagcattggtgtatgtcccacaactctgaaaaggata 1812
||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||| ||
Sbjct: 2451 ggaagcctaaaagatgctgcaaagaatattggtgtttgtactacaactttgaaaagggta 2510
Query: 1813 tgcagacagcatggcatcaccaggtggccttcaaggaaaatcaagaaggttgg 1865
||| |||| ||||| || | | |||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct: 2511 tgccgacaacatgggataaagcgttggccttctagaaagatcaagaaggttgg 2563