Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v2843390.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v2843390.1 Non Chatacterized Hit- tr|Q602W6|Q602W6_METCA
Putative prophage MuMc02, nuclease OS=Methylococcus
ca,45.28,9e-19,seg,NULL; Staphylococcal nuclease
homologues,Staphylococcal nuclease (SNase-like);
TNASE_3,Staphyloc,NODE_34181_length_1569_cov_65.991074.path2.1
(1011 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC63501 similar to UniRef100_A1KYZ0 Cluster: Ca(2+)-dep... 2004 0.0
gnl|LJGI|AW719835 similar to UniRef100_A1KYZ0 Cluster: Ca(2+)-de... 658 0.0
>gnl|LJGI|TC63501 similar to UniRef100_A1KYZ0 Cluster: Ca(2+)-dependent DNase; n=1;
Populus tomentosa|Rep: Ca(2+)-dependent DNase - Populus
tomentosa (Chinese white poplar), complete
Length = 1448
Score = 2004 bits (1011), Expect = 0.0
Identities = 1011/1011 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgggaaacgccctcagattcctctattccaattgctgcaagcccacagcagctggtgat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 91 atgggaaacgccctcagattcctctattccaattgctgcaagcccacagcagctggtgat 150
Query: 61 tctgattcacttggaccacatggtgtttcctctgccaccgttggtgtttcagcacttgcc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 151 tctgattcacttggaccacatggtgtttcctctgccaccgttggtgtttcagcacttgcc 210
Query: 121 catgatctctttcactttgaaaacacctcccaggttcctgaaggactgagcaagcatgtt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 211 catgatctctttcactttgaaaacacctcccaggttcctgaaggactgagcaagcatgtt 270
Query: 181 aagtcttctaaaaaggctcaagctaactggtatagaaagttagtggatgcttggaaagag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 271 aagtcttctaaaaaggctcaagctaactggtatagaaagttagtggatgcttggaaagag 330
Query: 241 gcaaaaccccctcccaggacacctgaagaagcagctaggcttgttattcagacattgaaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 331 gcaaaaccccctcccaggacacctgaagaagcagctaggcttgttattcagacattgaaa 390
Query: 301 agacatcagaaagcagatgttgaggggttgttgactttctatggtcttcctctaccacac 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 391 agacatcagaaagcagatgttgaggggttgttgactttctatggtcttcctctaccacac 450
Query: 361 accctagttgaagtagttgctcaaccccctacatcgttgcctcatggagtacaatatgaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 451 accctagttgaagtagttgctcaaccccctacatcgttgcctcatggagtacaatatgaa 510
Query: 421 atgcacaccttgccggtggatgcaaaagcagtggcagatggtgatactgtaacagtttat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 511 atgcacaccttgccggtggatgcaaaagcagtggcagatggtgatactgtaacagtttat 570
Query: 481 gtcagcacagcagatcccagggaatcatcaactgtccctgccaacattcatgcggcagct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 571 gtcagcacagcagatcccagggaatcatcaactgtccctgccaacattcatgcggcagct 630
Query: 541 gtgcgtagatcagaagctcgttctcgaaggaattatgaagaagcagatgcattacacaaa 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 631 gtgcgtagatcagaagctcgttctcgaaggaattatgaagaagcagatgcattacacaaa 690
Query: 601 cagattattgatgcaggatataggatgctttcttttcaaaacgaggaagtcctagctaag 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 691 cagattattgatgcaggatataggatgctttcttttcaaaacgaggaagtcctagctaag 750
Query: 661 aagtataggattcgactaaggggaattgatgcaccagaaagtgcaatgccatatggaaag 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 751 aagtataggattcgactaaggggaattgatgcaccagaaagtgcaatgccatatggaaag 810
Query: 721 gaagctaaaatggaactgaccaaggttcttcagggtaagtctttgagggtcctaatttat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 811 gaagctaaaatggaactgaccaaggttcttcagggtaagtctttgagggtcctaatttat 870
Query: 781 ggagaagatcgctatggtcgttgtgtaggtgatatctattgtaatggcatttttgttcag 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 871 ggagaagatcgctatggtcgttgtgtaggtgatatctattgtaatggcatttttgttcag 930
Query: 841 gaattgatgcttaagaagggtttagcatggcactactcagcttatgacaaaagacccgaa 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 931 gaattgatgcttaagaagggtttagcatggcactactcagcttatgacaaaagacccgaa 990
Query: 901 ttagaaacttgggagaaagaagctagagcaaagcgagttggattatgggcttcaaaaaac 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 991 ttagaaacttgggagaaagaagctagagcaaagcgagttggattatgggcttcaaaaaac 1050
Query: 961 cctgagaaaccatgggattggagaaaggacagaagagaagctaactaagtg 1011
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1051 cctgagaaaccatgggattggagaaaggacagaagagaagctaactaagtg 1101
>gnl|LJGI|AW719835 similar to UniRef100_A1KYZ0 Cluster: Ca(2+)-dependent DNase; n=1;
Populus tomentosa|Rep: Ca(2+)-dependent DNase - Populus
tomentosa (Chinese white poplar), partial (33%)
Length = 478
Score = 658 bits (332), Expect = 0.0
Identities = 336/338 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgggaaacgccctcagattcctctattccaattgctgcaagcccacagcagctggtgat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 141 atgggaaacgccctcagattcctctattccaattgctgcaagcccacagcagctggtgat 200
Query: 61 tctgattcacttggaccacatggtgtttcctctgccaccgttggtgtttcagcacttgcc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 201 tctgattcacttggaccacatggtgtttcctctgccaccgttggtgtttcagcacttgcc 260
Query: 121 catgatctctttcactttgaaaacacctcccaggttcctgaaggactgagcaagcatgtt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 261 catgatctctttcactttgaaaacacctcccaggttcctgaaggactgagcaagcatgtt 320
Query: 181 aagtcttctaaaaaggctcaagctaactggtatagaaagttagtggatgcttggaaagag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 321 aagtcttctaaaaaggctcaagctaactggtatagaaagttagtggatgcttggaaagag 380
Query: 241 gcaaaaccccctcccaggacacctgaagaagcagctaggcttgttattcagacattgaaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 381 gcaaaaccccctcccaggacacctgaagaagcagctaggcttgntattcagacattgaaa 440
Query: 301 agacatcagaaagcagatgttgaggggttgttgacttt 338
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 441 agacatcagaaagcagatgttgaggggttgntgacttt 478