Miyakogusa Predicted Gene

Lj2g3v2509010.1
Show Alignment: 
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj2g3v2509010.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3ST41|I3ST41_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2 SV=1,99.14,0,seg,NULL;
APG5,Autophagy-related protein 5; SUBFAMILY NOT NAMED,NULL; AUTOPHAGY
PROTEIN 5,Autophagy-,CUFF.39032.1
         (1050 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC74592 similar to UniRef100_Q3MQ10 Cluster: Autophagy ...  2058   0.0  

>gnl|LJGI|TC74592 similar to UniRef100_Q3MQ10 Cluster: Autophagy protein 5; n=1;
            Glycine max|Rep: Autophagy protein 5 - Glycine max
            (Soybean), complete
          Length = 1268

 Score = 2058 bits (1038), Expect = 0.0
 Identities = 1047/1050 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgagcgaagcgcaaaagtatgtgtgggaaggagccatccctctccagattcacctccat 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 90   atgagcgaagcgcaaaagtatgtgtgggaaggagccatccctctccagattcacctccat 149

                                                                        
Query: 61   gaatctgaagtcaccactctccctcctcctccacccgctctcgtcttagcccctcggata 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 150  gaatctgaagtcaccactctccctcctcctccacccgctctcgtcttagcccctcggata 209

                                                                        
Query: 121  gggtacttgccattgttgatttctctgttgaagcctcacttcagcagtacacttccccct 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 210  gggtacttgccattgttgatttctctgttgaagcctcacttcagcagtacacttccccct 269

                                                                        
Query: 181  ggacaagacaccatttggtttgagtacaaagggcttcctctcaagtggtacataccaact 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 270  ggacaagacaccatttggtttgagtacaaagggcttcctctcaagtggtacataccaact 329

                                                                        
Query: 241  ggtgttcttttcgatcttttatgtgtggagccagaaaggccatggaatctaacagttcac 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 330  ggtgttcttttcgatcttttatgtgtggagccagaaaggccatggaatctaacagttcac 389

                                                                        
Query: 301  tttagaggatatccaagtaacttgttgcttccatgtgaaggtgaagacagtgttaagtgg 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 390  tttagaggatatccaagtaacttgttgcttccatgtgaaggtgaagacagtgttaagtgg 449

                                                                        
Query: 361  agctttattaactcactgaaagaggctgcctatgtaataaatggtaattgcaagaatgtc 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 450  agctttattaactcactgaaagaggctgcctatgtaataaatggtaattgcaagaatgtc 509

                                                                        
Query: 421  atgaacatgtctcaacctgatcaggttgagctctggggctctgttttaaatggtaacttg 480
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 510  atgaatatgtctcaacctgatcaggttgagctctggggctctgttttaaatggtaacttg 569

                                                                        
Query: 481  gaatcttatcgacgggtgtcatctaagcttaagcttggaacttttgaagataaacataca 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 570  gaatcttatcgacgggtgtcatctaagcttaagcttggaacttttgaagataaacataca 629

                                                                        
Query: 541  gaaaacatcaattcagtcttgcctaagtctgaaagtactggggatactgatgctgctgga 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 630  gaaaacatcaattcagtcttgcctaagtctgaaagtactggggatactgatgctgctgga 689

                                                                        
Query: 601  caagtgaagagtggtcggatacctgttcgtttatacgtatggactgtcaatgaggagttt 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 690  caagtgaagagtggtcggatacctgttcgtttatacgtatggactgtcaatgaggagttt 749

                                                                        
Query: 661  gatgattttgaagatgctcctcaagttgatgattgggacaaagtctcgtatatcaatcga 720
            ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 750  gatgattttgaagatgctcctcaggttgatgattgggacaaagtctcgtataccaatcga 809

                                                                        
Query: 721  cctgttgagattcacaatgaagatggtaaattctttagcttaaatgatgcggttagaaga 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 810  cctgttgagattcacaatgaagatggtaaattctttagcttaaatgatgcggttagaaga 869

                                                                        
Query: 781  ctattgcctgagttttttcagggaagttcctttgataatgaaggagacacaaacatcaac 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 870  ctattgcctgagttttttcagggaagttcctttgataatgaaggagacacaaacatcaac 929

                                                                        
Query: 841  cgaactacagaagagggagaaaattcaggtgatcccgggtcatctttcgacgcacatgag 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 930  cgaactacagaagagggagaaaattcaggtgatcccgggtcatctttcgacgcacatgag 989

                                                                        
Query: 901  attgcagaaatcaagcttgttcgcattcaagggatagaaccaattttggagatacctttt 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 990  attgcagaaatcaagcttgttcgcattcaagggatagaaccaattttggagatacctttt 1049

                                                                        
Query: 961  tcttgggtggttaacaacttaatgaaccctgagtattttcttcacatgtgtgtttgcttg 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1050 tcttgggtggttaacaacttaatgaaccctgagtattttcttcacatgtgtgtttgcttg 1109

                                          
Query: 1021 aaaatttcagaagctagtgctgtgcaatag 1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1110 aaaatttcagaagctagtgctgtgcaatag 1139