Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v2414950.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v2414950.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1MQS6|I1MQS6_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=4 SV=1,87.38,0,eEF1-gamma
domain,Translation elongation factor EF1B, gamma chain, conserved;
Glutathione S-transfer,CUFF.39041.1
(1266 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC60762 similar to UniRef100_Q8S3W1 Cluster: Elongation... 1346 0.0
gnl|LJGI|TC66422 homologue to UniRef100_A7QC85 Cluster: Chromoso... 906 0.0
>gnl|LJGI|TC60762 similar to UniRef100_Q8S3W1 Cluster: Elongation factor 1-gamma;
n=1; Glycine max|Rep: Elongation factor 1-gamma -
Glycine max (Soybean), complete
Length = 1581
Score = 1346 bits (679), Expect = 0.0
Identities = 711/723 (98%), Gaps = 9/723 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtcgctgattttgcatgcagggaaatcaaacaaaaatgcctacaaggcactcattgca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 154 atgtcgctgattttgcatgcagggaaatcaaacaaaaatgcctacaaggcactcattgca 213
Query: 61 gcagagtatgctggtgtgcaagttgagttggccccaaatttcgagatgggtgtttctaac 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 214 gcagagtatgctggtgtgcaagttgagttggccccaaatttcgagatgggtgtttctaac 273
Query: 121 aagactcccgaatttctcaaaatgaatcctattggaaaggtcccagtgttggaaacccca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 274 aagactcccgaatttctcaaaatgaatcctattggaaaggtcccagtgttggaaacccca 333
Query: 181 gatggtcctgtttttcctgtatttgagagcaatgctattgctcgttatgttgctcgatca 240
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334 gatggccctg---------tatttgagagcaatgctattgctcgttatgttgctcgatca 384
Query: 241 aaggatgacaacactttgtatgggtcttctttgattgaatatgctcaaattgaacaatgg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 385 aaggatgacaacactttgtatgggtcttctttgattgaatatgctcaaattgaacaatgg 444
Query: 301 attgattttgcatctatggaaattgatgctaatatcaccaagtggtactatccaagagct 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 445 attgattttgcatctatggaaattgatgctaatatcgccaagtggtactatccaagagct 504
Query: 361 ggatatgcaccattccttcctccagctgaggaatttgcaattacttcactgaagagagct 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 505 ggatatgcaccattccttcctccagctgaggaatttgcaattacttcactgaagagagct 564
Query: 421 ttgagtgctttgaacagccaccttgccaccaatacttatctagttgggcattctgtgacc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 565 ttgagtgctttgaacagccaccttgccaccaatacttatctagttgggcattctgtgacc 624
Query: 481 ctggctgacataatattgacatgcaatttgtatcttggttttgcctatatcctagtcaag 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 625 ctggctgacataatattgacatgcaatttgtatcttggttttgcctatatcctagtcaag 684
Query: 541 agcttcacatctgagtttcctcatgttgagagatacttttggaccttggtcaatcagcca 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 685 agcttcacatctgagtttcctcatgttgagagatacttttggaccttggtcaatcagcca 744
Query: 601 aacttccgaaagattgtaggtcaggtcaagcaggctgaagctgtaccagctgttcaatct 660
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 745 aacttccgaaagattgttggtcaggtcaagcaggctgaagctgtaccagctgttcaatct 804
Query: 661 gctaagaagccttcccagccaaaggaatctaagcccaaggcaaagagtgagcctaaggca 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 805 gctaagaagccttcccagccaaaggaatctaagcccaaggcaaagagtgagcctaaggca 864
Query: 721 gtg 723
|||
Sbjct: 865 gtg 867
Score = 940 bits (474), Expect = 0.0
Identities = 477/478 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 789 tccccttgatcttcttcctccaagtaagatggttctggatgagtggaaaaggctctactc 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 933 tccccttgatcttcttcctccaagtaagatggttctggatgagtggaaaaggctctactc 992
Query: 849 caacactaaaaccaacttccgtgaggtcgcaatcaaaggattttgggacatgtatgatcc 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 993 caacactaaaaccaacttccgtgaggtcgcaatcaaaggattttgggacatgtatgatcc 1052
Query: 909 cgagggatactctctgtggttctgtgattacaaatacaacagtgagaacactgtttcctt 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1053 cgagggatactctctgtggttctgtgattacaaatacaacagtgagaacactgtttcctt 1112
Query: 969 tgtgacattgaacaaggttggtggatttcttcagcgaatggatttggcccgcaagtatgc 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1113 tgtgacattgaacaaggttggtggatttcttcagcgaatggatttggcccgcaagtatgc 1172
Query: 1029 atttggaaagatgcttgtgattggatcagagcctccatttaaggtgaagggcttgtggct 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1173 atttggaaagatgcttgtgattggatcagagcctccatttaaggtgaagggcttgtggct 1232
Query: 1089 tttccgtggccaagaagtccctcaatttgtcattgatgagtgctatgacatggagcttta 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1233 tttccgtggccaagaagtccctcaatttgtcattgatgagtgctatgacatggagcttta 1292
Query: 1149 tgagtggacaaaggttgacatcaatgatgaagctcaaaaggagcgtgtcaatcagatgat 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1293 tgagtggacaaaggttgacatcaatgatgaagctcaaaaggagcgtgtcaatcagatgat 1352
Query: 1209 tgaagattatgaaccttttgagggcgaatctcttttggatgccaagtgcttcaagtga 1266
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1353 tgaagattatgaaccttttgagggcgagtctcttttggatgccaagtgcttcaagtga 1410
>gnl|LJGI|TC66422 homologue to UniRef100_A7QC85 Cluster: Chromosome undetermined
scaffold_77, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome undetermined scaffold_77, whole
genome shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial
(45%)
Length = 767
Score = 906 bits (457), Expect = 0.0
Identities = 460/461 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 806 ctccaagtaagatggttctggatgagtggaaaaggctctactccaacactaaaaccaact 865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ctccaagtaagatggttctggatgagtggaaaaggctctactccaacactaaaaccaact 60
Query: 866 tccgtgaggtcgcaatcaaaggattttgggacatgtatgatcccgagggatactctctgt 925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tccgtgaggtcgcaatcaaaggattttgggacatgtatgatcccgagggatactctctgt 120
Query: 926 ggttctgtgattacaaatacaacagtgagaacactgtttcctttgtgacattgaacaagg 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggttctgtgattacaaatacaacagtgagaacactgtttcctttgtgacattgaacaagg 180
Query: 986 ttggtggatttcttcagcgaatggatttggcccgcaagtatgcatttggaaagatgcttg 1045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttggtggatttcttcagcgaatggatttggcccgcaagtatgcatttggaaagatgcttg 240
Query: 1046 tgattggatcagagcctccatttaaggtgaagggcttgtggcttttccgtggccaagaag 1105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tgattggatcagagcctccatttaaggtgaagggcttgtggcttttccgtggccaagaag 300
Query: 1106 tccctcaatttgtcattgatgagtgctatgacatggagctttatgagtggacaaaggttg 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tccctcaatttgtcattgatgagtgctatgacatggagctttatgagtggacaaaggttg 360
Query: 1166 acatcaatgatgaagctcaaaaggagcgtgtcaatcagatgattgaagattatgaacctt 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 acatcaatgatgaagctcaaaaggagcgtgtcaatcagatgattgaagattatgaacctt 420
Query: 1226 ttgagggcgaatctcttttggatgccaagtgcttcaagtga 1266
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttgagggcgagtctcttttggatgccaagtgcttcaagtga 461