Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v2293750.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v2293750.1 Non Chatacterized Hit- tr|G7KFE6|G7KFE6_MEDTR
Transporter, putative OS=Medicago truncatula GN=MTR_5g,85.49,0,MATE
EFFLUX FAMILY PROTEIN,NULL; MULTIDRUG RESISTANCE PROTEIN,NULL;
seg,NULL; MatE,Multi
antimicrobi,NODE_57273_length_2145_cov_27.769697.path1.1
(1356 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC61749 similar to UniRef100_UPI000034F19D Cluster: MAT... 2666 0.0
>gnl|LJGI|TC61749 similar to UniRef100_UPI000034F19D Cluster: MATE efflux
protein-related; n=1; Arabidopsis thaliana|Rep: MATE
efflux protein-related - Arabidopsis thaliana, partial
(67%)
Length = 1962
Score = 2666 bits (1345), Expect = 0.0
Identities = 1353/1356 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgctgtctttgcctgcacttgctggacaagcaattgaccccttggcacaattgatggaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 409 atgctgtctttgcctgcacttgctggacaagcaattgaccccttggcacaattgatggaa 468
Query: 61 actgcttacattggtcggttaggtacactggagttggcttctgcgggtgtttccatcacc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 469 actgcttacattggtcggttaggtacactggagttggcttctgcgggtgtttccatcacc 528
Query: 121 atctttaacattgtttcaaagttattcaatattccccttttaagtgttgctacttctttt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 529 atctttaacattgtttcaaagttattcaatattccccttttaagtgttgctacttctttt 588
Query: 181 gttgccgaggacttagcagccaatctttctgcttcagatcatactgctttacaaaatgat 240
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 589 gttgccgagggcttagcagccaatctttctgcttcagatcatactgctttacaaaatgat 648
Query: 241 ggcaatggaaaacctctggaaagaaagcagctatcctctgtctctactgctttgctatta 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 649 ggcaatggaaaacctctggaaagaaagcagctatcctctgtctctactgctttgctatta 708
Query: 301 gcactggggcttggcatttttgagtccttagctttgtatctgggatctggaacgtttctt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 709 gcactggggcttggcatttttgagtccttagctttgtatctgggatctggaacgtttctt 768
Query: 361 catatcattggtgtatcagcagcgaatccaacacgtgttcttgctcaaaaatttctctca 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 769 catatcattggtgtatcagcagcgaatccaacacgtgttcttgctcaaaaatttctctca 828
Query: 421 ttaagagcggttggtgctcctgcagttgtgctttctttggctcttcagggcatattccgt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 829 ttaagagcggttggtgctcctgcagttgtgctttctttggctcttcagggcatattccgt 888
Query: 481 ggttttaaggatacaaaaacccctgttttatgtctaggcattggtaatctttcagctgtc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 889 ggttttaaggatacaaaaacccctgttttatgtctaggcattggtaatctttcagctgtc 948
Query: 541 tttttatttcccttacttatgtattactttcagttgggtgtaactggtgcagccatttcc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 949 tttttatttcccttacttatgtattactttcagttgggtgtaactggtgcagccatttcc 1008
Query: 601 accgttctctcccaatatattggtgccttgttgatgatctggaatctgaataatcgagct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1009 accgttctctcccaatatattggtgccttgttgatgatctggaatctgaataatcgagct 1068
Query: 661 gtgttacttcctccaaagttgggaagcctgcaatttggcagttatattaagtctggtggt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1069 gtgttacttcctccaaagttgggaagcctgcaatttggcagttatattaagtctggtggt 1128
Query: 721 tttcttcttggaagaacacttgctgttcttacaaccatgacattgggaacatcaatggct 780
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1129 tttcttnttggaagaacacttgctgttcttacaaccatgacattgggaacatcaatggct 1188
Query: 781 gctcgtcatggtccagtagctatggctgcacatcagatatgtatgcaagtctggttggca 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1189 gctcgtcatggtccagtagctatggctgcacatcagatatgtatgcaagtctggttggca 1248
Query: 841 gtttcccttcttacagatgcattggctgcatctggtcaggcccttgttgcaagttctcta 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1249 gtttcccttcttacagatgcattggctgcatctggtcaggcccttgttgcaagttctcta 1308
Query: 901 tctagacatgaatacaaagctgtgaaggaacttactaattttgtattaaagattggactg 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1309 tctagacatgaatacaaagctgtgaaggaacttactaattttgtattaaagattggactg 1368
Query: 961 ctgacaggtatctgcttgactgcaattctgggtgtatcttttggatctttagctggcgtt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1369 ctgacaggtatctgcttgactgcaattctgggtgtatcttttggatctttagctggcgtt 1428
Query: 1021 tttacccaggatcttaaagtcttgcaggttgccagaactggagtattgtttgtcagtgct 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1429 tttacccaggatcttaaagtcttgcaggttgccagaactggagtattgtttgtcagtgct 1488
Query: 1081 tctcaaccatttaatgcgctggcttatatttttgatggtctccattttggtgtttctgat 1140
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1489 tctcacccatttaatgcgctggcttatatttttgatggtctccattttggtgtttctgat 1548
Query: 1141 ttccgctatgctgctttttccatgatgtttgtgggggcagtctcctcagcatttttggta 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1549 ttccgctatgctgctttttccatgatgtttgtgggggcagtctcctcagcatttttggta 1608
Query: 1201 ttttccccttcacgttttggccttcacggtgtatggttgggcttgagtctcttcatggca 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1609 ttttccccttcacgttttggccttcacggtgtatggttgggcttgagtctcttcatggca 1668
Query: 1261 cttcgtgtggtagctggttctgttagattactatcaaagaatggcccttggtggtttctt 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1669 cttcgtgtggtagctggttctgttagattactatcaaagaatggcccttggtggtttctt 1728
Query: 1321 cacagggattatcaaattgcagagatggtttcgtaa 1356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1729 cacagggattatcaaattgcagagatggtttcgtaa 1764