Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v2124630.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v2124630.1 Non Chatacterized Hit- tr|F6HEH2|F6HEH2_VITVI
Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera
GN=,80,3e-17,seg,NULL; PDZ,PDZ domain; RUBREDOXIN_LIKE,Rubredoxin-like
domain; no description,NULL; no descriptio,CUFF.38603.1
(840 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC62637 similar to UniRef100_A9T0D3 Cluster: Predicted ... 1665 0.0
gnl|LJGI|GO025904 similar to UniRef100_A9T0D3 Cluster: Predicted... 1013 0.0
gnl|LJGI|TC75199 similar to UniRef100_A9T0D3 Cluster: Predicted ... 789 0.0
>gnl|LJGI|TC62637 similar to UniRef100_A9T0D3 Cluster: Predicted protein; n=1;
Physcomitrella patens subsp. patens|Rep: Predicted
protein - Physcomitrella patens subsp. patens, complete
Length = 1077
Score = 1665 bits (840), Expect = 0.0
Identities = 840/840 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtcaggtgtggtagcaggttcctcctcttcatgcacagccaccttcaccaccagaaga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 21 atgtcaggtgtggtagcaggttcctcctcttcatgcacagccaccttcaccaccagaaga 80
Query: 61 accattcaaaactctcacctcacaacaccttctaaaacactcactcctcctcgttgccag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 81 accattcaaaactctcacctcacaacaccttctaaaacactcactcctcctcgttgccag 140
Query: 121 aaaacatcttttcaaggtctctccattgttgaagccaagaggggtgtttcagattccttc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 141 aaaacatcttttcaaggtctctccattgttgaagccaagaggggtgtttcagattccttc 200
Query: 181 cttggtgttggtgagaattacaagaatggttcctcctcctccattgcaagaaggagactt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 201 cttggtgttggtgagaattacaagaatggttcctcctcctccattgcaagaaggagactt 260
Query: 241 gagatcactgctaaaactgctggggcttcaaagacaattgaagctgaggttgacaagcca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 261 gagatcactgctaaaactgctggggcttcaaagacaattgaagctgaggttgacaagcca 320
Query: 301 cttggcctcaccttaggccaaaagcctactggtggtgttgtcatcactgctgttgaaggt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 321 cttggcctcaccttaggccaaaagcctactggtggtgttgtcatcactgctgttgaaggt 380
Query: 361 gggggaaatgcagcaaaagcagggttaaaggcaggggaccaagtcctttatactagcagt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 381 gggggaaatgcagcaaaagcagggttaaaggcaggggaccaagtcctttatactagcagt 440
Query: 421 ttctttggggatgaattgtggcctgcggataagcttggcttcactaaaaccgcaatccaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 441 ttctttggggatgaattgtggcctgcggataagcttggcttcactaaaaccgcaatccaa 500
Query: 481 gctaagccagactctgtctactttgttgtcagcagaggagctgaggtagatgttaaaagg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 501 gctaagccagactctgtctactttgttgtcagcagaggagctgaggtagatgttaaaagg 560
Query: 541 ctcccaaagcgtcctgctccgcctcggtttggaagaaaactgactgacgctcaaaaggct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 561 ctcccaaagcgtcctgctccgcctcggtttggaagaaaactgactgacgctcaaaaggct 620
Query: 601 agagctactcacatttgccttgattgtggattcatatacaccttacagaaaccttttgag 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 621 agagctactcacatttgccttgattgtggattcatatacaccttacagaaaccttttgag 680
Query: 661 gagcagccggaatcatacatctgcccccaatgtcaagcacctaagaagaggttttctcca 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 681 gagcagccggaatcatacatctgcccccaatgtcaagcacctaagaagaggttttctcca 740
Query: 721 tatgatgtaaacactggaagagctataggagggggcttgcctcctattggagttatcatt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 741 tatgatgtaaacactggaagagctataggagggggcttgcctcctattggagttatcatt 800
Query: 781 ggacttgtggctggtcttggtgcagttggagctttgcttgtttatggtcttcagtaacaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 801 ggacttgtggctggtcttggtgcagttggagctttgcttgtttatggtcttcagtaacaa 860
>gnl|LJGI|GO025904 similar to UniRef100_A9T0D3 Cluster: Predicted protein; n=1;
Physcomitrella patens subsp. patens|Rep: Predicted
protein - Physcomitrella patens subsp. patens, partial
(81%)
Length = 580
Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0
Identities = 517/519 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 214 tcctcctccattgcaagaaggagacttgagatcactgctaaaactgctggggcttcaaag 273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 tcctcctccattgcaagaaggagacttgagatcactgctaaaactgctggggcttcaaag 121
Query: 274 acaattgaagctgaggttgacaagccacttggcctcaccttaggccaaaagcctactggt 333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 acaattgaagctgaggttgacaagccacttggcctcaccttaggccaaaagcctactggt 181
Query: 334 ggtgttgtcatcactgctgttgaaggtgggggaaatgcagcaaaagcagggttaaaggca 393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ggtgttgtcatcactgctgttgaaggtgggggaaatgcagcaaaagcagggttaaaggca 241
Query: 394 ggggaccaagtcctttatactagcagtttctttggggatgaattgtggcctgcggataag 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 ggggaccaagtcctttatactagcagtttctttggggatgaattgtggcctgcggataag 301
Query: 454 cttggcttcactaaaaccgcaatccaagctaagccagactctgtctactttgttgtcagc 513
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 cttggcttcactaaaaccgcaatccaagctaagccggactctgtctactttgttgtcagc 361
Query: 514 agaggagctgaggtagatgttaaaaggctcccaaagcgtcctgctccgcctcggtttgga 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 agaggagctgaggtagatgttaaaaggctcccaaagcgtcctgctccgcctcggtttgga 421
Query: 574 agaaaactgactgacgctcaaaaggctagagctactcacatttgccttgattgtggattc 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 422 agaaaactgactgacgctcaaaaggctagagctactcacatttgccttgattgcggattc 481
Query: 634 atatacaccttacagaaaccttttgaggagcagccggaatcatacatctgcccccaatgt 693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 atatacaccttacagaaaccttttgaggagcagccggaatcatacatctgcccccaatgt 541
Query: 694 caagcacctaagaagaggttttctccatatgatgtaaac 732
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 caagcacctaagaagaggttttctccatatgatgtaaac 580
Score = 58.0 bits (29), Expect = 9e-08
Identities = 29/29 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtcaggtgtggtagcaggttcctcctc 29
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 41 atgtcaggtgtggtagcaggttcctcctc 69
>gnl|LJGI|TC75199 similar to UniRef100_A9T0D3 Cluster: Predicted protein; n=1;
Physcomitrella patens subsp. patens|Rep: Predicted
protein - Physcomitrella patens subsp. patens, partial
(90%)
Length = 986
Score = 789 bits (398), Expect = 0.0
Identities = 398/398 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtcaggtgtggtagcaggttcctcctcttcatgcacagccaccttcaccaccagaaga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 atgtcaggtgtggtagcaggttcctcctcttcatgcacagccaccttcaccaccagaaga 189
Query: 61 accattcaaaactctcacctcacaacaccttctaaaacactcactcctcctcgttgccag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 190 accattcaaaactctcacctcacaacaccttctaaaacactcactcctcctcgttgccag 249
Query: 121 aaaacatcttttcaaggtctctccattgttgaagccaagaggggtgtttcagattccttc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 250 aaaacatcttttcaaggtctctccattgttgaagccaagaggggtgtttcagattccttc 309
Query: 181 cttggtgttggtgagaattacaagaatggttcctcctcctccattgcaagaaggagactt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 310 cttggtgttggtgagaattacaagaatggttcctcctcctccattgcaagaaggagactt 369
Query: 241 gagatcactgctaaaactgctggggcttcaaagacaattgaagctgaggttgacaagcca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 370 gagatcactgctaaaactgctggggcttcaaagacaattgaagctgaggttgacaagcca 429
Query: 301 cttggcctcaccttaggccaaaagcctactggtggtgttgtcatcactgctgttgaaggt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 430 cttggcctcaccttaggccaaaagcctactggtggtgttgtcatcactgctgttgaaggt 489
Query: 361 gggggaaatgcagcaaaagcagggttaaaggcagggga 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 490 gggggaaatgcagcaaaagcagggttaaaggcagggga 527
Score = 781 bits (394), Expect = 0.0
Identities = 394/394 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 447 ggataagcttggcttcactaaaaccgcaatccaagctaagccagactctgtctactttgt 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 525 ggataagcttggcttcactaaaaccgcaatccaagctaagccagactctgtctactttgt 584
Query: 507 tgtcagcagaggagctgaggtagatgttaaaaggctcccaaagcgtcctgctccgcctcg 566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 585 tgtcagcagaggagctgaggtagatgttaaaaggctcccaaagcgtcctgctccgcctcg 644
Query: 567 gtttggaagaaaactgactgacgctcaaaaggctagagctactcacatttgccttgattg 626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 645 gtttggaagaaaactgactgacgctcaaaaggctagagctactcacatttgccttgattg 704
Query: 627 tggattcatatacaccttacagaaaccttttgaggagcagccggaatcatacatctgccc 686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 705 tggattcatatacaccttacagaaaccttttgaggagcagccggaatcatacatctgccc 764
Query: 687 ccaatgtcaagcacctaagaagaggttttctccatatgatgtaaacactggaagagctat 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 765 ccaatgtcaagcacctaagaagaggttttctccatatgatgtaaacactggaagagctat 824
Query: 747 aggagggggcttgcctcctattggagttatcattggacttgtggctggtcttggtgcagt 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 825 aggagggggcttgcctcctattggagttatcattggacttgtggctggtcttggtgcagt 884
Query: 807 tggagctttgcttgtttatggtcttcagtaacaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 885 tggagctttgcttgtttatggtcttcagtaacaa 918