Miyakogusa Predicted Gene

Lj2g3v1560860.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj2g3v1560860.1 tr|G7K401|G7K401_MEDTR Conserved oligomeric Golgi
complex subunit OS=Medicago truncatula GN=MTR_5g02,91.22,0,seg,NULL;
COG6,Conserved oligomeric Golgi complex, subunit 6; COMPONENT OF
OLIGOMERIC GOLGI COMPLEX ,CUFF.37491.1
         (2091 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC79463 similar to UniRef100_A7PCC0 Cluster: Chromosome...  3947   0.0  
gnl|LJGI|TC72451 similar to UniRef100_A7PCC0 Cluster: Chromosome...   888   0.0  

>gnl|LJGI|TC79463 similar to UniRef100_A7PCC0 Cluster: Chromosome chr2 scaffold_11,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr2 scaffold_11, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (92%)
          Length = 2037

 Score = 3947 bits (1991), Expect = 0.0
 Identities = 1991/1991 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgggaacgacggtggcgggtttggcgccggggctatcacggaagctgaagaaggttcta 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 47   atgggaacgacggtggcgggtttggcgccggggctatcacggaagctgaagaaggttcta 106

                                                                        
Query: 61   gaatcgaggatcgatacgccggatctcttgtcatcgctcaacacgctctcttccttctac 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 107  gaatcgaggatcgatacgccggatctcttgtcatcgctcaacacgctctcttccttctac 166

                                                                        
Query: 121  gatgacaacactcctcaggcgcgccgtaacctccgatccaccatcgagaagcgcgctctc 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 167  gatgacaacactcctcaggcgcgccgtaacctccgatccaccatcgagaagcgcgctctc 226

                                                                        
Query: 181  tccatcaaccatgagttcctcgacgcttcccacgccgttcaactggcattggatagcgtg 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 227  tccatcaaccatgagttcctcgacgcttcccacgccgttcaactggcattggatagcgtg 286

                                                                        
Query: 241  gaggacgaggtcaatgcgcttgccgagtgctgcgataggatagcaaagtctttgaacagt 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 287  gaggacgaggtcaatgcgcttgccgagtgctgcgataggatagcaaagtctttgaacagt 346

                                                                        
Query: 301  tgtagtgctagcaccggtgacattatcagtaccacagaaaggctcaaacaagagcttgaa 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 347  tgtagtgctagcaccggtgacattatcagtaccacagaaaggctcaaacaagagcttgaa 406

                                                                        
Query: 361  actactacacaaagacaagagattgtggcatgtttcctgcgtgattatcagctctcccct 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 407  actactacacaaagacaagagattgtggcatgtttcctgcgtgattatcagctctcccct 466

                                                                        
Query: 421  gaagagataaacgcacttagagatgaagagctgaatgaaaactttttcaaagcattatct 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 467  gaagagataaacgcacttagagatgaagagctgaatgaaaactttttcaaagcattatct 526

                                                                        
Query: 481  catgtccaagagattcatgccaactgcaaagtgttgcttaggacacatcatcagcgtgct 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 527  catgtccaagagattcatgccaactgcaaagtgttgcttaggacacatcatcagcgtgct 586

                                                                        
Query: 541  ggtttagagttgatggatatgatggctgtgtatcaagaaggagcttatgagcgtctatgc 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 587  ggtttagagttgatggatatgatggctgtgtatcaagaaggagcttatgagcgtctatgc 646

                                                                        
Query: 601  aggtgggttcaggccgaatgtagaaggctgggtgacacggacaatccagaagttagtgag 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 647  aggtgggttcaggccgaatgtagaaggctgggtgacacggacaatccagaagttagtgag 706

                                                                        
Query: 661  cttctgaaaacagctgtacgctacctcagggaaagatctgtccttttcaagtattgtgca 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 707  cttctgaaaacagctgtacgctacctcagggaaagatctgtccttttcaagtattgtgca 766

                                                                        
Query: 721  gaagaggtagccaatatgagacacaatgcactttttagaaggtttataagtgctcttaca 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 767  gaagaggtagccaatatgagacacaatgcactttttagaaggtttataagtgctcttaca 826

                                                                        
Query: 781  cgtggaggccctggtggtttgcctcgaccaattgaagtgcatgctcatgacccattgcga 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 827  cgtggaggccctggtggtttgcctcgaccaattgaagtgcatgctcatgacccattgcga 886

                                                                        
Query: 841  tatgttggtgatatgctaggctggttgcatcaggccttggcatccgaacgtgaacttgtg 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 887  tatgttggtgatatgctaggctggttgcatcaggccttggcatccgaacgtgaacttgtg 946

                                                                        
Query: 901  cttgtattacttgatccagatgcaagtgtggacactggaccgacagcaaagcaattctcc 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 947  cttgtattacttgatccagatgcaagtgtggacactggaccgacagcaaagcaattctcc 1006

                                                                        
Query: 961  aataactatgacagtggctctgcgaagacagaatctgacttgatatttgttcttgataga 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1007 aataactatgacagtggctctgcgaagacagaatctgacttgatatttgttcttgataga 1066

                                                                        
Query: 1021 atatttgaaggagtatgtcggccatttaaattgagagttgaacaagtattgcagtctcaa 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1067 atatttgaaggagtatgtcggccatttaaattgagagttgaacaagtattgcagtctcaa 1126

                                                                        
Query: 1081 ccaagtcttatagtctcctacaaactcagtaatacacttgaattttattgctacactatg 1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1127 ccaagtcttatagtctcctacaaactcagtaatacacttgaattttattgctacactatg 1186

                                                                        
Query: 1141 tcagatttacttgggcgggaaactgcactttgtaatacactatgggcactgaaagatgct 1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1187 tcagatttacttgggcgggaaactgcactttgtaatacactatgggcactgaaagatgct 1246

                                                                        
Query: 1201 gctcagaaaacatttttcgatattttgaaaggtcgaggagaaaagcttttacgatatccc 1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1247 gctcagaaaacatttttcgatattttgaaaggtcgaggagaaaagcttttacgatatccc 1306

                                                                        
Query: 1261 ccacttgttgctgttgatctttcccctccatctgcagtgagggaaggagtatctgtactt 1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1307 ccacttgttgctgttgatctttcccctccatctgcagtgagggaaggagtatctgtactt 1366

                                                                        
Query: 1321 cttgaaataattgacaactataacagcatgatggttcctgcatctgggcaaaaacctgtt 1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1367 cttgaaataattgacaactataacagcatgatggttcctgcatctgggcaaaaacctgtt 1426

                                                                        
Query: 1381 tttgatccagttatatctgctatactggatccaataattcagatgtgtgaacgagcagca 1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1427 tttgatccagttatatctgctatactggatccaataattcagatgtgtgaacgagcagca 1486

                                                                        
Query: 1441 gaggcacacaagtcaaagggagctggccactcatcaaggaggagtagatcgagttctgac 1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1487 gaggcacacaagtcaaagggagctggccactcatcaaggaggagtagatcgagttctgac 1546

                                                                        
Query: 1501 tctggtcaactaactagatcatcagttgatgcaatcttgtcaaatagcagttctacatca 1560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1547 tctggtcaactaactagatcatcagttgatgcaatcttgtcaaatagcagttctacatca 1606

                                                                        
Query: 1561 tcctcactgactagtgagactccctcaaagatctttctcattaactgcttgtgtgctatt 1620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1607 tcctcactgactagtgagactccctcaaagatctttctcattaactgcttgtgtgctatt 1666

                                                                        
Query: 1621 caacaacctctatctggacacgaggtagctgctgagtatgtgaaaaggcttggaactatg 1680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1667 caacaacctctatctggacacgaggtagctgctgagtatgtgaaaaggcttggaactatg 1726

                                                                        
Query: 1681 atagatagccacttgcgagtccttgtggataaagaagcggatgcgatattaagaaaatgt 1740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1727 atagatagccacttgcgagtccttgtggataaagaagcggatgcgatattaagaaaatgt 1786

                                                                        
Query: 1741 aatttgtcagaaaagatgccccagttccgcaattcagtccataacaaggggggtgatgaa 1800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1787 aatttgtcagaaaagatgccccagttccgcaattcagtccataacaaggggggtgatgaa 1846

                                                                        
Query: 1801 gttagtaccccattggctgagatggaggacacaagtccatccattctttcagagtgtttg 1860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1847 gttagtaccccattggctgagatggaggacacaagtccatccattctttcagagtgtttg 1906

                                                                        
Query: 1861 aaagctctgtttggtcttattttgggaagcgaaagttccctgcctgagtttgaacagatg 1920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1907 aaagctctgtttggtcttattttgggaagcgaaagttccctgcctgagtttgaacagatg 1966

                                                                        
Query: 1921 caggttccaaggttgcgttctgaagcttctataggtgtggccaggtcgctggctgaagct 1980
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1967 caggttccaaggttgcgttctgaagcttctataggtgtggccaggtcgctggctgaagct 2026

                       
Query: 1981 tatgagcttat 1991
            |||||||||||
Sbjct: 2027 tatgagcttat 2037


>gnl|LJGI|TC72451 similar to UniRef100_A7PCC0 Cluster: Chromosome chr2 scaffold_11,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr2 scaffold_11, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (13%)
          Length = 639

 Score =  888 bits (448), Expect = 0.0
 Identities = 448/448 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1644 ggtagctgctgagtatgtgaaaaggcttggaactatgatagatagccacttgcgagtcct 1703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3    ggtagctgctgagtatgtgaaaaggcttggaactatgatagatagccacttgcgagtcct 62

                                                                        
Query: 1704 tgtggataaagaagcggatgcgatattaagaaaatgtaatttgtcagaaaagatgcccca 1763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63   tgtggataaagaagcggatgcgatattaagaaaatgtaatttgtcagaaaagatgcccca 122

                                                                        
Query: 1764 gttccgcaattcagtccataacaaggggggtgatgaagttagtaccccattggctgagat 1823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123  gttccgcaattcagtccataacaaggggggtgatgaagttagtaccccattggctgagat 182

                                                                        
Query: 1824 ggaggacacaagtccatccattctttcagagtgtttgaaagctctgtttggtcttatttt 1883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183  ggaggacacaagtccatccattctttcagagtgtttgaaagctctgtttggtcttatttt 242

                                                                        
Query: 1884 gggaagcgaaagttccctgcctgagtttgaacagatgcaggttccaaggttgcgttctga 1943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243  gggaagcgaaagttccctgcctgagtttgaacagatgcaggttccaaggttgcgttctga 302

                                                                        
Query: 1944 agcttctataggtgtggccaggtcgctggctgaagcttatgagcttatttataatgcaat 2003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303  agcttctataggtgtggccaggtcgctggctgaagcttatgagcttatttataatgcaat 362

                                                                        
Query: 2004 tatggatcccaagaatggctatccagatcccagatctttggcaaggcatcctccgaatca 2063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363  tatggatcccaagaatggctatccagatcccagatctttggcaaggcatcctccgaatca 422

                                        
Query: 2064 gataagaactatactaggaatatgagtt 2091
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423  gataagaactatactaggaatatgagtt 450