Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v1560860.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v1560860.1 tr|G7K401|G7K401_MEDTR Conserved oligomeric Golgi
complex subunit OS=Medicago truncatula GN=MTR_5g02,91.22,0,seg,NULL;
COG6,Conserved oligomeric Golgi complex, subunit 6; COMPONENT OF
OLIGOMERIC GOLGI COMPLEX ,CUFF.37491.1
(2091 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC79463 similar to UniRef100_A7PCC0 Cluster: Chromosome... 3947 0.0
gnl|LJGI|TC72451 similar to UniRef100_A7PCC0 Cluster: Chromosome... 888 0.0
>gnl|LJGI|TC79463 similar to UniRef100_A7PCC0 Cluster: Chromosome chr2 scaffold_11,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr2 scaffold_11, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (92%)
Length = 2037
Score = 3947 bits (1991), Expect = 0.0
Identities = 1991/1991 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgggaacgacggtggcgggtttggcgccggggctatcacggaagctgaagaaggttcta 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 47 atgggaacgacggtggcgggtttggcgccggggctatcacggaagctgaagaaggttcta 106
Query: 61 gaatcgaggatcgatacgccggatctcttgtcatcgctcaacacgctctcttccttctac 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 107 gaatcgaggatcgatacgccggatctcttgtcatcgctcaacacgctctcttccttctac 166
Query: 121 gatgacaacactcctcaggcgcgccgtaacctccgatccaccatcgagaagcgcgctctc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 167 gatgacaacactcctcaggcgcgccgtaacctccgatccaccatcgagaagcgcgctctc 226
Query: 181 tccatcaaccatgagttcctcgacgcttcccacgccgttcaactggcattggatagcgtg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 227 tccatcaaccatgagttcctcgacgcttcccacgccgttcaactggcattggatagcgtg 286
Query: 241 gaggacgaggtcaatgcgcttgccgagtgctgcgataggatagcaaagtctttgaacagt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 287 gaggacgaggtcaatgcgcttgccgagtgctgcgataggatagcaaagtctttgaacagt 346
Query: 301 tgtagtgctagcaccggtgacattatcagtaccacagaaaggctcaaacaagagcttgaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 347 tgtagtgctagcaccggtgacattatcagtaccacagaaaggctcaaacaagagcttgaa 406
Query: 361 actactacacaaagacaagagattgtggcatgtttcctgcgtgattatcagctctcccct 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 407 actactacacaaagacaagagattgtggcatgtttcctgcgtgattatcagctctcccct 466
Query: 421 gaagagataaacgcacttagagatgaagagctgaatgaaaactttttcaaagcattatct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 467 gaagagataaacgcacttagagatgaagagctgaatgaaaactttttcaaagcattatct 526
Query: 481 catgtccaagagattcatgccaactgcaaagtgttgcttaggacacatcatcagcgtgct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 527 catgtccaagagattcatgccaactgcaaagtgttgcttaggacacatcatcagcgtgct 586
Query: 541 ggtttagagttgatggatatgatggctgtgtatcaagaaggagcttatgagcgtctatgc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 587 ggtttagagttgatggatatgatggctgtgtatcaagaaggagcttatgagcgtctatgc 646
Query: 601 aggtgggttcaggccgaatgtagaaggctgggtgacacggacaatccagaagttagtgag 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 647 aggtgggttcaggccgaatgtagaaggctgggtgacacggacaatccagaagttagtgag 706
Query: 661 cttctgaaaacagctgtacgctacctcagggaaagatctgtccttttcaagtattgtgca 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 707 cttctgaaaacagctgtacgctacctcagggaaagatctgtccttttcaagtattgtgca 766
Query: 721 gaagaggtagccaatatgagacacaatgcactttttagaaggtttataagtgctcttaca 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 767 gaagaggtagccaatatgagacacaatgcactttttagaaggtttataagtgctcttaca 826
Query: 781 cgtggaggccctggtggtttgcctcgaccaattgaagtgcatgctcatgacccattgcga 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 827 cgtggaggccctggtggtttgcctcgaccaattgaagtgcatgctcatgacccattgcga 886
Query: 841 tatgttggtgatatgctaggctggttgcatcaggccttggcatccgaacgtgaacttgtg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 887 tatgttggtgatatgctaggctggttgcatcaggccttggcatccgaacgtgaacttgtg 946
Query: 901 cttgtattacttgatccagatgcaagtgtggacactggaccgacagcaaagcaattctcc 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 947 cttgtattacttgatccagatgcaagtgtggacactggaccgacagcaaagcaattctcc 1006
Query: 961 aataactatgacagtggctctgcgaagacagaatctgacttgatatttgttcttgataga 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1007 aataactatgacagtggctctgcgaagacagaatctgacttgatatttgttcttgataga 1066
Query: 1021 atatttgaaggagtatgtcggccatttaaattgagagttgaacaagtattgcagtctcaa 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1067 atatttgaaggagtatgtcggccatttaaattgagagttgaacaagtattgcagtctcaa 1126
Query: 1081 ccaagtcttatagtctcctacaaactcagtaatacacttgaattttattgctacactatg 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1127 ccaagtcttatagtctcctacaaactcagtaatacacttgaattttattgctacactatg 1186
Query: 1141 tcagatttacttgggcgggaaactgcactttgtaatacactatgggcactgaaagatgct 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1187 tcagatttacttgggcgggaaactgcactttgtaatacactatgggcactgaaagatgct 1246
Query: 1201 gctcagaaaacatttttcgatattttgaaaggtcgaggagaaaagcttttacgatatccc 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1247 gctcagaaaacatttttcgatattttgaaaggtcgaggagaaaagcttttacgatatccc 1306
Query: 1261 ccacttgttgctgttgatctttcccctccatctgcagtgagggaaggagtatctgtactt 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1307 ccacttgttgctgttgatctttcccctccatctgcagtgagggaaggagtatctgtactt 1366
Query: 1321 cttgaaataattgacaactataacagcatgatggttcctgcatctgggcaaaaacctgtt 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1367 cttgaaataattgacaactataacagcatgatggttcctgcatctgggcaaaaacctgtt 1426
Query: 1381 tttgatccagttatatctgctatactggatccaataattcagatgtgtgaacgagcagca 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1427 tttgatccagttatatctgctatactggatccaataattcagatgtgtgaacgagcagca 1486
Query: 1441 gaggcacacaagtcaaagggagctggccactcatcaaggaggagtagatcgagttctgac 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1487 gaggcacacaagtcaaagggagctggccactcatcaaggaggagtagatcgagttctgac 1546
Query: 1501 tctggtcaactaactagatcatcagttgatgcaatcttgtcaaatagcagttctacatca 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1547 tctggtcaactaactagatcatcagttgatgcaatcttgtcaaatagcagttctacatca 1606
Query: 1561 tcctcactgactagtgagactccctcaaagatctttctcattaactgcttgtgtgctatt 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1607 tcctcactgactagtgagactccctcaaagatctttctcattaactgcttgtgtgctatt 1666
Query: 1621 caacaacctctatctggacacgaggtagctgctgagtatgtgaaaaggcttggaactatg 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1667 caacaacctctatctggacacgaggtagctgctgagtatgtgaaaaggcttggaactatg 1726
Query: 1681 atagatagccacttgcgagtccttgtggataaagaagcggatgcgatattaagaaaatgt 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1727 atagatagccacttgcgagtccttgtggataaagaagcggatgcgatattaagaaaatgt 1786
Query: 1741 aatttgtcagaaaagatgccccagttccgcaattcagtccataacaaggggggtgatgaa 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1787 aatttgtcagaaaagatgccccagttccgcaattcagtccataacaaggggggtgatgaa 1846
Query: 1801 gttagtaccccattggctgagatggaggacacaagtccatccattctttcagagtgtttg 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1847 gttagtaccccattggctgagatggaggacacaagtccatccattctttcagagtgtttg 1906
Query: 1861 aaagctctgtttggtcttattttgggaagcgaaagttccctgcctgagtttgaacagatg 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1907 aaagctctgtttggtcttattttgggaagcgaaagttccctgcctgagtttgaacagatg 1966
Query: 1921 caggttccaaggttgcgttctgaagcttctataggtgtggccaggtcgctggctgaagct 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1967 caggttccaaggttgcgttctgaagcttctataggtgtggccaggtcgctggctgaagct 2026
Query: 1981 tatgagcttat 1991
|||||||||||
Sbjct: 2027 tatgagcttat 2037
>gnl|LJGI|TC72451 similar to UniRef100_A7PCC0 Cluster: Chromosome chr2 scaffold_11,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr2 scaffold_11, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (13%)
Length = 639
Score = 888 bits (448), Expect = 0.0
Identities = 448/448 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1644 ggtagctgctgagtatgtgaaaaggcttggaactatgatagatagccacttgcgagtcct 1703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 ggtagctgctgagtatgtgaaaaggcttggaactatgatagatagccacttgcgagtcct 62
Query: 1704 tgtggataaagaagcggatgcgatattaagaaaatgtaatttgtcagaaaagatgcccca 1763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 tgtggataaagaagcggatgcgatattaagaaaatgtaatttgtcagaaaagatgcccca 122
Query: 1764 gttccgcaattcagtccataacaaggggggtgatgaagttagtaccccattggctgagat 1823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 gttccgcaattcagtccataacaaggggggtgatgaagttagtaccccattggctgagat 182
Query: 1824 ggaggacacaagtccatccattctttcagagtgtttgaaagctctgtttggtcttatttt 1883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 ggaggacacaagtccatccattctttcagagtgtttgaaagctctgtttggtcttatttt 242
Query: 1884 gggaagcgaaagttccctgcctgagtttgaacagatgcaggttccaaggttgcgttctga 1943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 gggaagcgaaagttccctgcctgagtttgaacagatgcaggttccaaggttgcgttctga 302
Query: 1944 agcttctataggtgtggccaggtcgctggctgaagcttatgagcttatttataatgcaat 2003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 agcttctataggtgtggccaggtcgctggctgaagcttatgagcttatttataatgcaat 362
Query: 2004 tatggatcccaagaatggctatccagatcccagatctttggcaaggcatcctccgaatca 2063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 tatggatcccaagaatggctatccagatcccagatctttggcaaggcatcctccgaatca 422
Query: 2064 gataagaactatactaggaatatgagtt 2091
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 gataagaactatactaggaatatgagtt 450