Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v1549600.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v1549600.1 tr|A9XMT3|A9XMT3_LOTJA CYCLOPS OS=Lotus japonicus
PE=2 SV=1,99.61,0,seg,NULL; coiled-coil,NULL,CUFF.37396.1
(1857 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC64772 UniRef100_A9XMT3 Cluster: CYCLOPS; n=1; Lotus j... 3592 0.0
gnl|LJGI|BI418242 UniRef100_A9XMT3 Cluster: CYCLOPS; n=1; Lotus ... 315 5e-85
gnl|LJGI|BP061840 UniRef100_A9XMT3 Cluster: CYCLOPS; n=1; Lotus ... 170 2e-41
>gnl|LJGI|TC64772 UniRef100_A9XMT3 Cluster: CYCLOPS; n=1; Lotus japonicus|Rep: CYCLOPS
- Lotus japonicus, complete
Length = 2340
Score = 3592 bits (1812), Expect = 0.0
Identities = 1842/1857 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgttaatttctgtgctatttggataaaacagttcatgaactgataatagtaaagtcttc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129 atgttaatttctgtgctatttggataaaacagttcatgaactgataatagtaaagtcttc 188
Query: 61 ttttcttcnnnnnnnnatcaggaataattgctaggttgacatgattnnnnnnnttgggtt 120
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 189 ttttcttcttttttttatcaggaataattgctaggttgacatgattaaaaaaattgggtt 248
Query: 121 ttggggttgattttttagagtgatatatggttttgaagaagggtattatgatgatggatg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 ttggggttgattttttagagtgatatatggttttgaagaagggtattatgatgatggatg 308
Query: 181 acagagaatttagatgaaaattctgttctgaaacctgaaagtgctgttgagccaaacttg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309 acagagaatttagatgaaaattctgttctgaaacctgaaagtgctgttgagccaaacttg 368
Query: 241 agttgaaaacaacagcttcaattggaaatggaagggagggggttttctggtttatataga 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 369 agttgaaaacaacagcttcaattggaaatggaagggagggggttttctggtttatataga 428
Query: 301 aactcaagtgaagaattgttcctgaagacagtgatggagagccctattggtatgccagtt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429 aactcaagtgaagaattgttcctgaagacagtgatggagagccctattggtatgccagtt 488
Query: 361 ccttcaatggagatgctgggtttcaagaatgtttctcaaggctttcgcgcagatagcgag 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 ccttcaatggagatgctgggtttcaagaatgtttctcaaggctttcgcgcagatagcgag 548
Query: 421 gagcttttcaaacgctggctaacaaatggagagggatacaattcatcaagcatagggttt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549 gagcttttcaaacgctggctaacaaatggagagggatacaattcatcaagcatagggttt 608
Query: 481 agcagtcgattatcaaagaggatatccactgaactagttaatggatctaatcagctacaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609 agcagtcgattatcaaagaggatatccactgaactagttaatggatctaatcagctacaa 668
Query: 541 gttggtgtagcctcagatggaagaaacaatgacaaaccattcatacaaaataaccttttg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669 gttggtgtagcctcagatggaagaaacaatgacaaaccattcatacaaaataaccttttg 728
Query: 601 gcaaatgatgtttcaggtgatttcaattttccaatcagagatcctgttgatagagaactg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729 gcaaatgatgtttcaggtgatttcaattttccaatcagagatcctgttgatagagaactg 788
Query: 661 caacctagtaacttgtttctagccaaggcctggtttctcagtgatcaacgaatgacaaga 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789 caacctagtaacttgtttctagccaaggcctggtttctcagtgatcaacgaatgacaaga 848
Query: 721 agccggtcctctgaattgcggcggcgatattctgaaatgcaaaatggtctagccacacaa 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849 agccggtcctctgaattgcggcggcgatattctgaaatgcaaaatggtctagccacacaa 908
Query: 781 ggaatagaatccatttgcatggatcctcagcatggtgctgaggcaacaaaacaagaagtt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909 ggaatagaatccatttgcatggatcctcagcatggtgctgaggcaacaaaacaagaagtt 968
Query: 841 gcaaatttcaatggttacaattatctctctatgtgtgagcttccaagtcaaaagggttca 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969 gcaaatttcaatggttacaattatctctctatgtgtgagcttccaagtcaaaagggttca 1028
Query: 901 ttcatgtctccgtccaactcatgttcatctaacttcaacacacctcaatttggcgacatg 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 ttcatgtctccgtccaactcatgttcatctaacttcaacacacctcaatttggcgacatg 1088
Query: 961 gataaagtttcatcttgtgtaagtatgctgaaagggacattacaacgccggagactcagc 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 gataaagtttcatcttgtgtaagtatgctgaaagggacattacaacgccggagactcagc 1148
Query: 1021 agtcaacttgagaaagaagctgcagaagatgacttaaatggaattttttatcctcaagaa 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 agtcaacttgagaaagaagctgcagaagatgacttaaatggaattttttatcctcaagaa 1208
Query: 1081 cctcttttccaaactggctttgatcaaggacaagaaaactggagtaatcaaacgccagta 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1209 cctcttttccaaactggctttgatcaaggacaagaaaactggagtaatcaaacgccagta 1268
Query: 1141 aatgttcaagtagactctattggtgaagttaaggatcatggagtcctgcaaacactagaa 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1269 aatgttcaagtagactctattggtgaagttaaggatcatggagtcctgcaaacactagaa 1328
Query: 1201 ggatccacaaaccctgtcgttgatggttttgcaaatcagataaaccaaatctatgtcgga 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1329 ggatccacaaaccctgtcgttgatggttttgcaaatcagataaaccaaatctatgtcgga 1388
Query: 1261 acagcttctggagaaccttctcaaagtgaatcctctaatgctgcaccagtaatctcctct 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1389 acagcttctggagaaccttctcaaagtgaatcctctaatgctgcaccagtaatctcctct 1448
Query: 1321 ggtttagacacatgcgaaggtcccataaactcgaatcaaactctctgcgaaagctcatgg 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1449 ggtttagacacatgcgaaggtcccataaactcgaatcaaactctctgcgaaagctcatgg 1508
Query: 1381 aaacaagtaggagtgagtaaaagttcagaaaatactcaaaatagagtcaaaggtttcaga 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1509 aaacaagtaggagtgagtaaaagttcagaaaatactcaaaatagagtcaaaggtttcaga 1568
Query: 1441 gaacagatcatggataatctgaaagatgataagaagagaaaaagtctagaaagatatgga 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1569 gaacagatcatggataatctgaaagatgataagaagagaaaaagtctagaaagatatgga 1628
Query: 1501 tctataacatcagctgtttcagatgacaagggagacaccactaaaaagcgtagggtggaa 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1629 tctataacatcagctgtttcagatgacaagggagacaccactaaaaagcgtagggtggaa 1688
Query: 1561 cgctcaaggaaaatggctgaagctaaggaaagaaattcgacaccatcagttccctcagat 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1689 cgctcaaggaaaatggctgaagctaaggaaagaaattcgacaccatcagttccctcagat 1748
Query: 1621 atgcaagctgtcttgaagcggtgcgaaaaccttgagaaggaagttcgatcgctaaaactc 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1749 atgcaagctgtcttgaagcggtgcgaaaaccttgagaaggaagttcgatcgctaaaactc 1808
Query: 1681 aacttgtccttcatgaatagaaaggattctgaacaaacaaagcagatagaagaccttcag 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1809 aacttgtccttcatgaatagaaaggattctgaacaaacaaagcagatagaagaccttcag 1868
Query: 1741 aagcagaatgaagagctggcagatgaaaaagagcgcctcctcgaagagattgaaagaatt 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1869 aagcagaatgaagagctggcagatgaaaaagagcgcctcctcgaagagattgaaagaatt 1928
Query: 1801 ctatcagaaactgaaaaaatgtaatgatatgagaatcaatgttgtgctcaaacacgc 1857
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1929 ctatcagaaactgaaaaaatgtaatgatatgagaatcaatgttgtgctcaaacacgc 1985
>gnl|LJGI|BI418242 UniRef100_A9XMT3 Cluster: CYCLOPS; n=1; Lotus japonicus|Rep: CYCLOPS
- Lotus japonicus, partial (16%)
Length = 537
Score = 315 bits (159), Expect = 5e-85
Identities = 159/159 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1699 agaaaggattctgaacaaacaaagcagatagaagaccttcagaagcagaatgaagagctg 1758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 324 agaaaggattctgaacaaacaaagcagatagaagaccttcagaagcagaatgaagagctg 383
Query: 1759 gcagatgaaaaagagcgcctcctcgaagagattgaaagaattctatcagaaactgaaaaa 1818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 384 gcagatgaaaaagagcgcctcctcgaagagattgaaagaattctatcagaaactgaaaaa 443
Query: 1819 atgtaatgatatgagaatcaatgttgtgctcaaacacgc 1857
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 444 atgtaatgatatgagaatcaatgttgtgctcaaacacgc 482
Score = 256 bits (129), Expect = 4e-67
Identities = 129/129 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1572 aatggctgaagctaaggaaagaaattcgacaccatcagttccctcagatatgcaagctgt 1631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 14 aatggctgaagctaaggaaagaaattcgacaccatcagttccctcagatatgcaagctgt 73
Query: 1632 cttgaagcggtgcgaaaaccttgagaaggaagttcgatcgctaaaactcaacttgtcctt 1691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 74 cttgaagcggtgcgaaaaccttgagaaggaagttcgatcgctaaaactcaacttgtcctt 133
Query: 1692 catgaatag 1700
|||||||||
Sbjct: 134 catgaatag 142
>gnl|LJGI|BP061840 UniRef100_A9XMT3 Cluster: CYCLOPS; n=1; Lotus japonicus|Rep:
CYCLOPS - Lotus japonicus, partial (6%)
Length = 178
Score = 170 bits (86), Expect = 2e-41
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 461 attcatcaagcatagggtttagcagtcgattatcaaagaggatatccactgaactagtta 520
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 attcatcaagcatagggtttagcagtcgat-atcaaagaggatatccactgaactagtta 59
Query: 521 atggatctaatcagctacaagttggtgtagcctc 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60 atggatctaatcagctacaagttggtgtagcctc 93