Miyakogusa Predicted Gene

Lj2g3v1510840.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj2g3v1510840.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1J4N9|I1J4N9_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.7882
PE=,82.28,0,SUBFAMILY NOT NAMED,NULL; FAMILY NOT NAMED,NULL; seg,NULL;
DUF760,Protein of unknown function DUF760,CUFF.37329.1
         (1236 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC66845 similar to UniRef100_A7PC12 Cluster: Chromosome...  2395   0.0  

>gnl|LJGI|TC66845 similar to UniRef100_A7PC12 Cluster: Chromosome chr2 scaffold_11,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr2 scaffold_11, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (72%)
          Length = 1356

 Score = 2395 bits (1208), Expect = 0.0
 Identities = 1227/1236 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgctagtctcaggagcaattggtgatgtcttggtggtgcttccgccttcagcatcactc 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 111  atgctagtctcaggagcaattggtgatgtcttggtggtgcttccgccttcagcatcactc 170

                                                                        
Query: 61   cggtcaccggaattccgccatttgcatgctcctcctgttgtttctgacgccaagaatttt 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 171  cggtcaccggaattccgccatttgcatgctcctcctgttgtttctgacgccaagaatttt 230

                                                                        
Query: 121  ctctgcagtggcggattccttaaaagttatccttcatcttttaatcctaaacactacaat 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 231  ctctgcagtggcggattccttaaaagttatccttcatcttttaatcctaaacactacaat 290

                                                                        
Query: 181  gaactctacaattcccgcactagaggcttagttatgagagcatcggcagattcaagtgat 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 291  gaactctacaattcccgcactagaggcttagttatgagagcatcggcagattcaagtgat 350

                                                                        
Query: 241  aatttggtgccttctgctcctctccaatttgagtcaccagttggtcaacttttgggacaa 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 351  aatttggtgccttctgctcctctccaatttgagtcaccagttggtcaacttttgggacaa 410

                                                                        
Query: 301  attatgcaaaatcactctcatctactgtcaacagccattgatcagcaactagagaacctt 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 411  attatgcaaaatcactctcatctactgtcaacagccattgatcagcaactagagaacctt 470

                                                                        
Query: 361  cagactgccagagatgcccctaaagaagaatcttttacttcatctccggatcccctttac 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 471  cagactgccagagatgcccctaaagaagaatcttttacttcatctccggatcccctttac 530

                                                                        
Query: 421  aagaggatagctgaaattaaagagaaagaagagcggacaacattggaagagataatgtac 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 531  aagaggatagctgaaattaaagagaaagaagagcggacaacattggaagagataatgtac 590

                                                                        
Query: 481  tgctcaattgtacataaattttttgaaaacaacatttcaatgatcccaaaaatatcagca 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 591  tgctcaattgtacataaattttttgaaaacaacatttcaatgatcccaaaaatatcagca 650

                                                                        
Query: 541  gcaacagcagatcctactggtcgagtagatttatggccaaatcaagagatgaagctagaa 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 651  gcaacagcagatcctactggtcgagtagatttatggccaaatcaagagatgaagctagaa 710

                                                                        
Query: 601  gctgttcattctccagaggcatttgagatgatacagagtcacttagctctggtactagga 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 711  gctgttcattctccagaggcatttgagatgatacagagtcacttagctctggtactagga 770

                                                                        
Query: 661  gaacggggtgtgggtcctctccagacaattgttcagatcagcaaaatcaaactggggaag 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 771  gaacggggtgtgggtcctctccagacaattgttcagatcagcaaaatcaaactggggaag 830

                                                                        
Query: 721  ttgtatgcagcttcaataatgtatggatactttctgaaacgagttgatgagcggtttcaa 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 831  ttgtatgcagcttcaataatgtatggatactttctgaaacgagttgatgagcggtttcaa 890

                                                                        
Query: 781  cttgagaggtcaatgggaactcttccaaaggacttgggtnnnnnnnntttaacttatgat 840
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||
Sbjct: 891  cttgagaggtcaatgggaactcttccaaaggacttgggtaaaaaaaatttaacttatgat 950

                                                                        
Query: 841  gaaccatcgccaggaatcaagctatgggattctgattctttaatcaccatggatgcttat 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 951  gaaccatcgccaggaatcaagctatgggattctgattctttaatcaccatggatgcttat 1010

                                                                        
Query: 901  ggagaagcttctgatgaagggggttacatggatactgatgaaggcaactcactgagagct 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1011 ggagaagcttctgatgaagggggttacatggatactgatgaaggcaactcactgagagct 1070

                                                                        
Query: 961  tatgtgacacagctggacgcagaggcgcttcagagacttgctaccatacgttccaaggaa 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1071 tatgtgacacagctggacgcagaggcgcttcagagacttgctaccatacgttccaaggaa 1130

                                                                        
Query: 1021 gctatatcactgattgaaaagcaaactcaggccttgtttggaaagcctgacatccgtgtc 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1131 gctatatcactgattgaaaagcaaactcaggccttgtttggaaagcctgacatccgtgtc 1190

                                                                        
Query: 1081 tccggggatggttcaattgagacgagcaatgatgagatgctttcactcacattctcaggc 1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1191 tccggggatggttcaattgagacgagcaatgatgagatgctttcactcacattctcaggc 1250

                                                                        
Query: 1141 ttggctatgcttgttctggaggccgttgcttttggatcattcttgtgggacaaggaaaac 1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1251 ttggctatgcttgttctggaggccgttgcttttggatcattcttgtgggacaaggaaaac 1310

                                                
Query: 1201 tatgttgaatccaagtacccttttcttaataactag 1236
            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1311 tatgttgaatccaagtaccctattcttaataactag 1346