Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v1451720.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v1451720.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1K1I4|I1K1I4_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.37242
PE,73.21,0,WW_DOMAIN_2,WW/Rsp5/WWP; HELICASE_ATP_BIND_1,Helicase,
superfamily 1/2, ATP-binding domain; HELICASE,CUFF.37116.1
(2253 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC63774 similar to UniRef100_Q9SP26 Cluster: P72 DEAD b... 2198 0.0
gnl|LJGI|TC60578 similar to UniRef100_Q9SP26 Cluster: P72 DEAD b... 1140 0.0
gnl|LJGI|TC62403 similar to UniRef100_Q9SP26 Cluster: P72 DEAD b... 1072 0.0
>gnl|LJGI|TC63774 similar to UniRef100_Q9SP26 Cluster: P72 DEAD box protein; n=1; Pisum
sativum|Rep: P72 DEAD box protein - Pisum sativum (Garden
pea), partial (39%)
Length = 1473
Score = 2198 bits (1109), Expect = 0.0
Identities = 1109/1109 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1145 ttgaagtattgccaccaacagacaaacaccgtcgactggagcagattttgcggtctcagg 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttgaagtattgccaccaacagacaaacaccgtcgactggagcagattttgcggtctcagg 60
Query: 1205 atcaaggatccaagataattattttttgttctaccaagaaaatgtgtgatcaacttgctc 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 atcaaggatccaagataattattttttgttctaccaagaaaatgtgtgatcaacttgctc 120
Query: 1265 gtaatcttacgcgccagtttggagctgctgctatacacggggacaaatcccaggctgaga 1324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gtaatcttacgcgccagtttggagctgctgctatacacggggacaaatcccaggctgaga 180
Query: 1325 gggatcatgtgttgagtcagtttcgaactgggaggtctccggtgcttgtagccactgatg 1384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gggatcatgtgttgagtcagtttcgaactgggaggtctccggtgcttgtagccactgatg 240
Query: 1385 ttgcagctcgaggactagacattaaagacattagggtggttgtcaactatgactttccta 1444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttgcagctcgaggactagacattaaagacattagggtggttgtcaactatgactttccta 300
Query: 1445 ctggagtggaagattatgttcataggattggaaggactgggagggctggagccactggtt 1504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ctggagtggaagattatgttcataggattggaaggactgggagggctggagccactggtt 360
Query: 1505 tagcttacactttctttgcggagcaggatgctaaatatgcttcagatttgatcaaagtct 1564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tagcttacactttctttgcggagcaggatgctaaatatgcttcagatttgatcaaagtct 420
Query: 1565 tggaaggtgcaaaccagcgtgtcccgtcagaacttcgtgatatgtcaacacggggtggtg 1624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tggaaggtgcaaaccagcgtgtcccgtcagaacttcgtgatatgtcaacacggggtggtg 480
Query: 1625 ggatgaacagatccagacgctggggttcaggtggacggggtgactctggatatggcgcaa 1684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ggatgaacagatccagacgctggggttcaggtggacggggtgactctggatatggcgcaa 540
Query: 1685 ggaatgactctggatatggtggaagaggtagtgattctggatatggtggaagaggtgggt 1744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 ggaatgactctggatatggtggaagaggtagtgattctggatatggtggaagaggtgggt 600
Query: 1745 ttgggactgctgcttctggcaggggtggaggccgtggatttgacaatgattcacaaagga 1804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ttgggactgctgcttctggcaggggtggaggccgtggatttgacaatgattcacaaagga 660
Query: 1805 atgatcgtggtcgaagtcctgagaggggtggttctagctggagtgatcgcttcaaaagtg 1864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 atgatcgtggtcgaagtcctgagaggggtggttctagctggagtgatcgcttcaaaagtg 720
Query: 1865 gtgaccgcgatcgtagtcgtagtcctgacagggctgcaccatctcaaaatactcaattca 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gtgaccgcgatcgtagtcgtagtcctgacagggctgcaccatctcaaaatactcaattca 780
Query: 1925 gctttcaccaagcaatgatggaacgacgtggaggggatagtgatcgtagtaagagcctta 1984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 gctttcaccaagcaatgatggaacgacgtggaggggatagtgatcgtagtaagagcctta 840
Query: 1985 accgtgaccgtagtcgcagtcctggtcctcataaacaggagagggccccagcagttcgtg 2044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 accgtgaccgtagtcgcagtcctggtcctcataaacaggagagggccccagcagttcgtg 900
Query: 2045 aaggttacagttttcatggatcaatgatgggacaagggcagcgtgatgacagtcgtaaat 2104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 aaggttacagttttcatggatcaatgatgggacaagggcagcgtgatgacagtcgtaaat 960
Query: 2105 ctgcacgtagtcctcaccgaagttcaccatcctcccctggtggtggtaggtctaacaata 2164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 ctgcacgtagtcctcaccgaagttcaccatcctcccctggtggtggtaggtctaacaata 1020
Query: 2165 accctcagaaagggtggggaggatctcatccttcttacaatggagaagtggaggaaggga 2224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 accctcagaaagggtggggaggatctcatccttcttacaatggagaagtggaggaaggga 1080
Query: 2225 tgattcctgaagaaggaatgatatgttaa 2253
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 tgattcctgaagaaggaatgatatgttaa 1109
>gnl|LJGI|TC60578 similar to UniRef100_Q9SP26 Cluster: P72 DEAD box protein; n=1;
Pisum sativum|Rep: P72 DEAD box protein - Pisum sativum
(Garden pea), partial (24%)
Length = 751
Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0
Identities = 582/583 (99%), Gaps = 1/583 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggccgccacagctactgccacagtgggtccgcgatatgcaccacccgacccgactcta 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 169 atggccgccacagctactgccacagtgggtccgcgatatgcaccacccgacccgactcta 228
Query: 61 cctaaaccatggaggggtcttgtggatggcaagactgggtatctttacttttggaaccct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 229 cctaaaccatggaggggtcttgtggatggcaagactgggtatctttacttttggaaccct 288
Query: 121 gagactaatgttacccagtatgagaggcctacaagctccgctgccccgccaaagtcttcg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 289 gagactaatgttacccagtatgagaggcctacaagctccgctgccccgccaaagtcttcg 348
Query: 181 gtgcccagttcttctgtccaggttcaacaatcatctcagcgtgctcgcagtccggatttg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 349 gtgcccagttcttctgtccaggttcaacaatcatctcagcgtgctcgcagtccggatttg 408
Query: 241 aaggacaggtatgatagaaatggaggtggtgggtcaaatgacagtggatcacggaaccat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 409 aaggacaggtatgatagaaatggaggtggtgggtcaaatgacagtggatcacggaaccat 468
Query: 301 cagagttccaaagagggaagttttagttctcatccaaatggaacacatgctactggaaat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 469 cagagttccaaagagggaagttttagttctcatccaaatggaacacatgctactggaaat 528
Query: 361 gttagttctgtcaaagatcaaggggcatcagatgctggagctggactaagcccagagtct 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 529 gttagttctgtcaaagatcaaggggcatcagatgctggagctggactaagcccagagtct 588
Query: 421 tatcggcgtcggcatgaaataactgtttctggagataatgtgccgccaccttttacatca 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 589 tatcggcgtcggcatgaaataactgtttctggagataatgtgccgccaccttttacatca 648
Query: 481 tttgggtccactggcttaccaccggaaattcttaaagaggtac-aaaatgctgggttctc 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 649 tttgggtccactggcttaccaccggaaattcttaaagaggtacaaaaatgctgggttctc 708
Query: 540 agcccctactccaattcaggctcagtcatggcccattgctctt 582
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 709 agcccctactccaattcaggctcagtcatggcccattgctctt 751
>gnl|LJGI|TC62403 similar to UniRef100_Q9SP26 Cluster: P72 DEAD box protein; n=1;
Pisum sativum|Rep: P72 DEAD box protein - Pisum sativum
(Garden pea), partial (22%)
Length = 741
Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0
Identities = 541/541 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggccgccacagctactgccacagtgggtccgcgatatgcaccacccgacccgactcta 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 201 atggccgccacagctactgccacagtgggtccgcgatatgcaccacccgacccgactcta 260
Query: 61 cctaaaccatggaggggtcttgtggatggcaagactgggtatctttacttttggaaccct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 261 cctaaaccatggaggggtcttgtggatggcaagactgggtatctttacttttggaaccct 320
Query: 121 gagactaatgttacccagtatgagaggcctacaagctccgctgccccgccaaagtcttcg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 321 gagactaatgttacccagtatgagaggcctacaagctccgctgccccgccaaagtcttcg 380
Query: 181 gtgcccagttcttctgtccaggttcaacaatcatctcagcgtgctcgcagtccggatttg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 381 gtgcccagttcttctgtccaggttcaacaatcatctcagcgtgctcgcagtccggatttg 440
Query: 241 aaggacaggtatgatagaaatggaggtggtgggtcaaatgacagtggatcacggaaccat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 441 aaggacaggtatgatagaaatggaggtggtgggtcaaatgacagtggatcacggaaccat 500
Query: 301 cagagttccaaagagggaagttttagttctcatccaaatggaacacatgctactggaaat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 501 cagagttccaaagagggaagttttagttctcatccaaatggaacacatgctactggaaat 560
Query: 361 gttagttctgtcaaagatcaaggggcatcagatgctggagctggactaagcccagagtct 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 561 gttagttctgtcaaagatcaaggggcatcagatgctggagctggactaagcccagagtct 620
Query: 421 tatcggcgtcggcatgaaataactgtttctggagataatgtgccgccaccttttacatca 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 621 tatcggcgtcggcatgaaataactgtttctggagataatgtgccgccaccttttacatca 680
Query: 481 tttgggtccactggcttaccaccggaaattcttaaagaggtacaaaatgctgggttctca 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 681 tttgggtccactggcttaccaccggaaattcttaaagaggtacaaaatgctgggttctca 740
Query: 541 g 541
|
Sbjct: 741 g 741