Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v1227800.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v1227800.1 Non Chatacterized Hit- tr|A5AXI3|A5AXI3_VITVI
Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera
GN=,30.43,0.0000001,seg,NULL,CUFF.36526.1
(922 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC72977 similar to UniRef100_A7P6K7 Cluster: Chromosome... 1386 0.0
gnl|LJGI|TC59524 1080 0.0
gnl|LJGI|FS353401 weakly similar to UniRef100_Q5BI51 Cluster: LP... 260 1e-68
>gnl|LJGI|TC72977 similar to UniRef100_A7P6K7 Cluster: Chromosome chr9 scaffold_7,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr9 scaffold_7, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (13%)
Length = 928
Score = 1386 bits (699), Expect = 0.0
Identities = 763/789 (96%), Gaps = 23/789 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 155 agatcatgagagaagaaaggcatggacacagagccagaatcagcttagatatgccaatga 214
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 agatcatgagagag--aaggcatggacacagagccagaatcagcttagatatgccaatga 60
Query: 215 gaagcttgcttcctcagcaatttcatggcatggagaagcagatgaaggagaagaaacaca 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gaagcttgcttcctcagcaatttcatggcatggagaagcagatgaaggagaagaaacaca 120
Query: 275 agcagcctagctccccaggtggtaggcttgcaagcttcttgaattctctcttcaaccaat 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agcagcctagctccccaggtggtaggcttgcaagcttcttgaattctctcttcaaccaat 180
Query: 335 cagcatctaagaagaagaaatcaaagtccagctcacagtccatgaaggatgaagatgaga 394
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 cagcatctaagaagaagaagtcaaagtccagctcacagtccatgaaggatgaagatgaga 240
Query: 395 gccctggtggaaggagaaggagaaggagcagcattagccatttcagaagctcna------ 448
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 241 gccctggtggaaggagaaggagaaggagcagcattagccatttcagaagctccagcactg 300
Query: 449 ---------------cactctcttctttaagctcaggattcagaactcctccttatgtac 493
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cagattcaaagtctacactctcttctttaagctcaggattcagaactcctccttatgtac 360
Query: 494 tacaaactccaacaaagagctgcaaggaattcagaacctcctcagaccacaagcatacag 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tacaaactccaacaaagagctgcaaggaattcagaacctcctcagaccacaagcatacag 420
Query: 554 ttcccttgccaacaaagttgaatggacatgcaaaacaaaacactttgcaaaatgagttga 613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttcccttgccaacaaagttgaatggacatgcaaaacaaaacactttgcaaaatgagttga 480
Query: 614 agaaagactcaacttttctggatgataagtataaacatagcaataatgggttatcagaga 673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 agaaagactcaacttttctggatgataagtataaacatagcaataatgggttatcagaga 540
Query: 674 aacaaaagaactgggggaatgagttgcttgagaaagataggacatggctggagaaatact 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aacaaaagaactgggggaatgagttgcttgagaaagataggacatggctggagaaatact 600
Query: 734 cattagaggagaaggatatcagaaaattcaatgaggttgatgatggtgcagagagtgatt 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 cattagaggagaaggatatcagaaaattcaatgaggttgatgatggtgcagagagtgatt 660
Query: 794 caagctctgatctgtttgaattgcaaaactatgacttgggttactgctcaagtggtctac 853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 caagctctgatctgtttgaattgcaaaactatgacttgggttactgctcaagtggtctac 720
Query: 854 ctgtctatgaaactaccaatatggataacatcaagagaggagcaccaatttccagtggtc 913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 ctgtctatgaaactaccaatatggataacatcaagagaggagcaccaatttccagtggtc 780
Query: 914 ttctgtgat 922
|||||||||
Sbjct: 781 ttctgtgat 789
>gnl|LJGI|TC59524
Length = 1007
Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0
Identities = 594/616 (96%), Gaps = 21/616 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtccataacagggctaatagacccagaaatgaatcacaagaagtccttccacctcagg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 atgtccataacagggctaatagacccagaaatgaatcacaagaagtccttccacctcagg 182
Query: 61 aatgattctggtgagcttgatgtgtttgaagctgcaagatacttctcaggatacaatgaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 aatgattctggtgagcttgatgtgtttgaagctgcaagatacttctcaggatacaatgaa 242
Query: 121 gttgttggctacactggctctactcttgcccagaagatcatgagagaagaaaggcatgga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 gttgttggctacactggctctactcttgcccagaagatcatgagagaagaaaggcatgga 302
Query: 181 cacagagccagaatcagcttagatatgccaatgagaagcttgcttcctcagcaatttcat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 cacagagccagaatcagcttagatatgccaatgagaagcttgcttcctcagcaatttcat 362
Query: 241 ggcatggagaagcagatgaaggagaagaaacacaagcagcctagctccccaggtggtagg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 ggcatggagaagcagatgaaggagaagaaacacaagcagcctagctccccaggtggtagg 422
Query: 301 cttgcaagcttcttgaattctctcttcaaccaatcagcatctaagaagaagaaatcaaag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 cttgcaagcttcttgaattctctcttcaaccaatcagcatctaagaagaagaaatcaaag 482
Query: 361 tccagctcacagtccatgaaggatgaagatgagagccctggtggaaggagaaggagaagg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 483 tccagctcacagtccatgaaggatgaagatgagagccctggtggaaggagaaggagaagg 542
Query: 421 agcagcattagccatttcagaagc---------------------tcnacactctcttct 459
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct: 543 agcagcattagccatttcagaagctccagcactgcagattcaaagtctacactctcttct 602
Query: 460 ttaagctcaggattcagaactcctccttatgtactacaaactccaacaaagagctgcaag 519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 603 ttaagctcaggattcagaactcctccttatgtactacaaactccaacaaagagctgcaag 662
Query: 520 gaattcagaacctcctcagaccacaagcatacagttcccttgccaacaaagttgaatgga 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 663 gaattcagaacctcctcagaccacaagcatacagttcccttgccaacaaagttgaatgga 722
Query: 580 catgcaaaacaaaaca 595
||||||||||||||||
Sbjct: 723 catgcaaaacaaaaca 738
Score = 361 bits (182), Expect = 5e-99
Identities = 188/190 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 733 tcattagaggagaaggatatcagaaaattcaatgaggttgatgatggtgcagagagtgat 792
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 739 tcattagaggagaaggatatcagaaaattcaacgaggttgatgatggtgcagaaagtgat 798
Query: 793 tcaagctctgatctgtttgaattgcaaaactatgacttgggttactgctcaagtggtcta 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 799 tcaagctctgatctgtttgaattgcaaaactatgacttgggttactgctcaagtggtcta 858
Query: 853 cctgtctatgaaactaccaatatggataacatcaagagaggagcaccaatttccagtggt 912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 859 cctgtctatgaaactaccaatatggataacatcaagagaggagcaccaatttccagtggt 918
Query: 913 cttctgtgat 922
||||||||||
Sbjct: 919 cttctgtgat 928
>gnl|LJGI|FS353401 weakly similar to UniRef100_Q5BI51 Cluster: LP02810p; n=1;
Drosophila melanogaster|Rep: LP02810p - Drosophila
melanogaster (Fruit fly), partial (6%)
Length = 684
Score = 260 bits (131), Expect = 1e-68
Identities = 131/131 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtccataacagggctaatagacccagaaatgaatcacaagaagtccttccacctcagg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 554 atgtccataacagggctaatagacccagaaatgaatcacaagaagtccttccacctcagg 613
Query: 61 aatgattctggtgagcttgatgtgtttgaagctgcaagatacttctcaggatacaatgaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 614 aatgattctggtgagcttgatgtgtttgaagctgcaagatacttctcaggatacaatgaa 673
Query: 121 gttgttggcta 131
|||||||||||
Sbjct: 674 gttgttggcta 684