Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v1069050.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v1069050.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1JDI6|I1JDI6_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.8095
PE=,78.04,0,RNA-binding domain, RBD,NULL; seg,NULL; RNA-DEPENDENT RNA
POLYMERASE,RNA-dependent RNA polymerase, e,CUFF.36192.1
(3300 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC70825 weakly similar to UniRef100_A7P3W3 Cluster: Chr... 1758 0.0
gnl|LJGI|TC78540 similar to UniRef100_A7P3W5 Cluster: Chromosome... 1164 0.0
gnl|LJGI|TC61133 similar to UniRef100_Q75ZN6 Cluster: RNA-direct... 1066 0.0
gnl|LJGI|BP066387 similar to UniRef100_Q6TAV8 Cluster: ORF1; n=3... 147 5e-34
>gnl|LJGI|TC70825 weakly similar to UniRef100_A7P3W3 Cluster: Chromosome chr1
scaffold_5, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome chr1 scaffold_5, whole genome
shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (12%)
Length = 981
Score = 1758 bits (887), Expect = 0.0
Identities = 893/895 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcgtaaaacaatcgagttgtatggtttcccttgtcatgtaactgtgtctagtgtaagg 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 87 atgcgtaaaacaatcgagttgtatggtttcccttgtcatgtaactgtgtcaagtgtaagg 146
Query: 61 acatttgtagagaattatactggtaaaagcactgtgtatgctattaaggtaagacatgga 120
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 147 acatttgtagagaattatactggtaaaggcactgtgtatgctattaaggtaagacatgga 206
Query: 121 aaagggcgtgttccaagagcatttgctattattcaattcacctctgtggagtcttctgca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 207 aaagggcgtgttccaagagcatttgctattattcaattcacctctgtggagtcttctgca 266
Query: 181 gacatgatgtccagagctaacagtttatggtatgggaactcctatctaaaagttcgcgaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 267 gacatgatgtccagagctaacagtttatggtatgggaactcctatctaaaagttcgcgaa 326
Query: 241 atggaaagagatattgtgccaaagccaagaacctttttgcatagtttgaataatgtgaaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327 atggaaagagatattgtgccaaagccaagaacctttttgcatagtttgaataatgtgaaa 386
Query: 301 ctgtcttttggctgtcaaatatcaaaaggaagattctcagctttatggaatacagtgaat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 387 ctgtcttttggctgtcaaatatcaaaaggaagattctcagctttatggaatacagtgaat 446
Query: 361 gttgaggtaaattttgggtctggaatgagaaagtggcatttcattctgtccgataacaat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 447 gttgaggtaaattttgggtctggaatgagaaagtggcatttcattctgtccgataacaat 506
Query: 421 gtcagatacaaacttgagctttcatatgaaaacatttggaagttagagctgcatcaacca 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 507 gtcagatacaaacttgagctttcatatgaaaacatttggaagttagagctgcatcaacca 566
Query: 481 cggggtggaattgcaaagcatctcctgattcagttacttggcgctcctcggatttacaag 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 567 cggggtggaattgcaaagcatctcctgattcagttacttggcgctcctcggatttacaag 626
Query: 541 cttaacaatcctacttcaggaaatgtatatgaagatccttcaatgaactattgcatggat 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 627 cttaacaatcctacttcaggaaatgtatatgaagatccttcaatgaactattgcatggat 686
Query: 601 acccctgatgagcaatggatcagagcagttgattttactcctttcagtcgtatcgggcag 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 687 acccctgatgagcaatggatcagagcagttgattttactcctttcagtcgtatcgggcag 746
Query: 661 tcttctgctttgtgtctggagcttcctgatggccaatgtgttccaaatttcagggaaaac 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 747 tcttctgctttgtgtctggagcttcctgatggccaatgtgttccaaatttcagggaaaac 806
Query: 721 tttgcttattatgaagaaagtgcgaggcgatgcactgtagagacaggacttcctttttct 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 807 tttgcttattatgaagaaagtgcgaggcgatgcactgtagagacaggacttcctttttct 866
Query: 781 ctcaatcttaggcttgtccccattgttgctcctcctcaaggcattgaaataccatatgat 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 867 ctcaatcttaggcttgtccccattgttgctcctcctcaaggcattgaaataccatatgat 926
Query: 841 atcttgtttaaagttaattcattggttcaacatgggtgtcttgcaggtccttcac 895
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 927 atcttgtttaaagttaattcattggttcaacatgggtgtcttgcaggtccttcac 981
>gnl|LJGI|TC78540 similar to UniRef100_A7P3W5 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_5,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr1 scaffold_5, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (16%)
Length = 602
Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0
Identities = 593/595 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1993 attctgaaggagatgctcatttgtggctacaagcctaatgttgaaccatttctctcaatg 2052
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8 attctgaaggagatgctcgtttgtggctacaagcctaatgttgaaccatttctctcaatg 67
Query: 2053 atgatgcagacatttagggcatcaaaactgctggaattgcgaacaaaaactaggatcttt 2112
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 68 atgatgcagacatttagggcatcaaaactgctggaattgcgaacaagaactaggatcttt 127
Query: 2113 attccaagtggaagagcaatgatgggatgtctagatgaaactggaacccttgaatatggt 2172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 128 attccaagtggaagagcaatgatgggatgtctagatgaaactggaacccttgaatatggt 187
Query: 2173 caagtgtttgttcaattttccaacaataggctcgggaatcagagtctttatgttattacg 2232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 188 caagtgtttgttcaattttccaacaataggctcgggaatcagagtctttatgttattacg 247
Query: 2233 ggtaaggtagtagtagcgaaaaacccctgcttgcacccgggtgatgtgcgtgttttgaag 2292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 248 ggtaaggtagtagtagcgaaaaacccctgcttgcacccgggtgatgtgcgtgttttgaag 307
Query: 2293 gctatgaatgtgccagctttgcaccacatggtagattgtgttgttttccctaaaaaagga 2352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 308 gctatgaatgtgccagctttgcaccacatggtagattgtgttgttttccctaaaaaagga 367
Query: 2353 agcagacctcatccaaatgaatgttcaggaagtgatttggatggagacatctacttcgtt 2412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 368 agcagacctcatccaaatgaatgttcaggaagtgatttggatggagacatctacttcgtt 427
Query: 2413 tgttgggactctgatttaattccaagtaggacagaacaaccaatggactatactgctgcc 2472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 428 tgttgggactctgatttaattccaagtaggacagaacaaccaatggactatactgctgcc 487
Query: 2473 ccaaatatggaattggatcatgatgtaatgattgaggaggttgaggagtattttacaaat 2532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 488 ccaaatatggaattggatcatgatgtaatgattgaggaggttgaggagtattttacaaat 547
Query: 2533 tacatagtcaatgactgtctggggataattgccaatgcacacactgtctttgcag 2587
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 548 tacatagtcaatgactgtctggggataattgccaatgcacacactgtctttgcag 602
>gnl|LJGI|TC61133 similar to UniRef100_Q75ZN6 Cluster: RNA-directed RNA Polymerase;
n=1; Vigna unguiculata|Rep: RNA-directed RNA Polymerase -
Vigna unguiculata (Cowpea), partial (61%)
Length = 878
Score = 1066 bits (538), Expect = 0.0
Identities = 538/538 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2763 cgtaataggaaagctttttagggaagtgcaagggatttcatcaagtgctggctctattac 2822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 cgtaataggaaagctttttagggaagtgcaagggatttcatcaagtgctggctctattac 60
Query: 2823 atccttcactaaggaagtggctataaagtcatttgaccccgacatggaagtcgatggctt 2882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 atccttcactaaggaagtggctataaagtcatttgaccccgacatggaagtcgatggctt 120
Query: 2883 catggactatgttgatgatgcttactatcacaaggggaattatgactataggttgggaaa 2942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 catggactatgttgatgatgcttactatcacaaggggaattatgactataggttgggaaa 180
Query: 2943 tctgatggactactatgggatcaaaactgaagctgaaatcctcagtgggaatatcatgaa 3002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tctgatggactactatgggatcaaaactgaagctgaaatcctcagtgggaatatcatgaa 240
Query: 3003 aatgtcaaagtcattcactaaaagacgggatgcggaagcaattactatggctgtaaggtc 3062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aatgtcaaagtcattcactaaaagacgggatgcggaagcaattactatggctgtaaggtc 300
Query: 3063 ccttaggaaagaggcgcgcacctggttcaatgatagcagtggtggtggtggtgatgatgc 3122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ccttaggaaagaggcgcgcacctggttcaatgatagcagtggtggtggtggtgatgatgc 360
Query: 3123 gtacgcaaaagcttcggcttggtattatgttacttaccatcacagttactggggttgcta 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtacgcaaaagcttcggcttggtattatgttacttaccatcacagttactggggttgcta 420
Query: 3183 cgatgaaggtatgaatagggaccattatctaagcttcccatggtgtgtgtactctctcct 3242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 cgatgaaggtatgaatagggaccattatctaagcttcccatggtgtgtgtactctctcct 480
Query: 3243 tgtccaaatcaagaaggagaagatagcctggaacagaagaaatgctgaccaatccttg 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tgtccaaatcaagaaggagaagatagcctggaacagaagaaatgctgaccaatccttg 538
>gnl|LJGI|BP066387 similar to UniRef100_Q6TAV8 Cluster: ORF1; n=3; Porcine enteric
sapovirus|Rep: ORF1 - Porcine enteric sapovirus, partial
(0%)
Length = 423
Score = 147 bits (74), Expect = 5e-34
Identities = 102/106 (96%), Gaps = 4/106 (3%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3143 ggtattatgttacttaccatcacagttactggggttgctacgatgaag-gtatgaata-g 3200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct: 423 ggtattatgttacttaccatcacagttactggggttgctacgatgaagngtatgaatagg 364
Query: 3201 ggaccattatctaagct-tccca-tggtgtgtgtactctctccttg 3244
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 ggaccattatctaagctgtcccattggtgtgtgtactctctccttg 318