Miyakogusa Predicted Gene

Lj2g3v1022220.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj2g3v1022220.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1N5Z2|I1N5Z2_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.39886 PE,84.3,0,MFS
general substrate transporter,Major facilitator superfamily domain,
general substrate transporte,CUFF.35962.1
         (1620 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC57849 similar to UniRef100_A4Q3S0 Cluster: TGF-beta r...  2993   0.0  

>gnl|LJGI|TC57849 similar to UniRef100_A4Q3S0 Cluster: TGF-beta receptor, type I/II
            extracellular region; n=1; Medicago truncatula|Rep:
            TGF-beta receptor, type I/II extracellular region -
            Medicago truncatula (Barrel medic), partial (93%)
          Length = 1848

 Score = 2993 bits (1510), Expect = 0.0
 Identities = 1540/1551 (99%), Gaps = 1/1551 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 60   agccattgcaggtatagaaaggtttgcattcaaaggggtggcatccaatttggtgactta 119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295  agccattgcaggtatagaaaggtttgcattcaaaggggtggcatccaatttggtgactta 354

                                                                        
Query: 120  cttaactgatgttgtgggcttaagcaattcctctgcagcaaagatggttaatagttgggt 179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355  cttaactgatgttgtgggcttaagcaattcctctgcagcaaagatggttaatagttgggt 414

                                                                        
Query: 180  agggttcacctcaataatgccattgctagtggcacccattgcagatgcctattggcacca 239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415  agggttcacctcaataatgccattgctagtggcacccattgcagatgcctattggcacca 474

                                                                        
Query: 240  atattccaccataatgacctcatctttcctctatgtaatgggactttcggcattgacagc 299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475  atattccaccataatgacctcatctttcctctatgtaatgggactttcggcattgacagc 534

                                                                        
Query: 300  aacagcactggcaaggtcatggcctcatagaaacagaacaatgtcttcttcctttctttc 359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535  aacagcactggcaaggtcatggcctcatagaaacagaacaatgtcttcttcctttctttc 594

                                                                        
Query: 360  tttgtctctctatttagtttcattaggccaaggtggatacaacccatctctgcaagcctt 419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595  tttgtctctctatttagtttcattaggccaaggtggatacaacccatctctgcaagcctt 654

                                                                        
Query: 420  tggagcagatcaactcggtgacgaggaagaattgcctagtaacaaaaatgataaaagttc 479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 655  tggagcagatcaactcggtgacgaggaagaattgcctagtaacaaaaatgataaaagttc 714

                                                                        
Query: 480  caacaagaaaactctattcttccaatggtggtattttggagtttgcagtggaagcctaat 539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 715  caacaagaaaactctattcttccaatggtggtattttggagtttgcagtggaagcctaat 774

                                                                        
Query: 540  gggtgttacagtcatgtcctacatccaagacacttttggctgggttttaggttttgccat 599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 775  gggtgttacagtcatgtcctacatccaagacacttttggctgggttttaggttttgccat 834

                                                                        
Query: 600  ccctgcaatttcaatggttatttctattttcatcttcacctgtggaagccctatatattt 659
            |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 835  cccc-caatttcaatggttatttctattttcatcttcacctgtggaagccctatatattt 893

                                                                        
Query: 660  atataaagaacatgaagatgacattcaagnnnnnnngcctttcatgaacatgtttcatgc 719
            |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 894  atataaagaacatgaagatgacattcaagaaaaaaagcctttcatgaacatgtttcatgc 953

                                                                        
Query: 720  tataaaagcatctgccttgaagtgcttccattgtgaaatcacccttccaaatgacaagtc 779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 954  tataaaagcatctgccttgaagtgcttccattgtgaaatcacccttccaaatgacaagtc 1013

                                                                        
Query: 780  cgaaaccgtggagttggagcttcaagagagacccctttgtcaagaaagtcttaaggattt 839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1014 cgaaaccgtggagttggagcttcaagagagacccctttgtcaagaaagtcttaaggattt 1073

                                                                        
Query: 840  gaataagaattctaaaacttgcatgcatctggtggaacaagccaaggttatggtgaggct 899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1074 gaataagaattctaaaacttgcatgcatctggtggaacaagccaaggttatggtgaggct 1133

                                                                        
Query: 900  tttgcccatatggacaatgcttctcatgtttgcagtgattttccagcaaccagccacatt 959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1134 tttgcccatatggacaatgcttctcatgtttgcagtgattttccagcaaccagccacatt 1193

                                                                        
Query: 960  tttcacaaaacaaggcatgactatgaaaaggaacattggtgatttcaagattccaccagc 1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1194 tttcacaaaacaaggcatgactatgaaaaggaacattggtgatttcaagattccaccagc 1253

                                                                        
Query: 1020 cacgctccaaagtgcaataacaatgtccataatacttttgatgccattatatgacagaat 1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1254 cacgctccaaagtgcaataacaatgtccataatacttttgatgccattatatgacagaat 1313

                                                                        
Query: 1080 ttttataccaattgctcagatgattactcgtcaggacaaaggtataagcgtaatgcaaag 1139
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1314 ttttatgccaattgctcagatgattactcgtcaggacaaaggtataagcgtaatgcaaag 1373

                                                                        
Query: 1140 gatgggaattggaatggttctctcaattatagccatggttattgcagctctagttgaaat 1199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1374 gatgggaattggaatggttctctcaattatagccatggttattgcagctctagttgaaat 1433

                                                                        
Query: 1200 gagaaggcttgatattggtagggaaatgagaattgcaggattacaatcagagacagtgcc 1259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1434 gagaaggcttgatattggtagggaaatgagaattgcaggattacaatcagagacagtgcc 1493

                                                                        
Query: 1260 tctaagcattttctggttgctgccacagtacattcttcttggcatttcagatatcttcac 1319
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1494 tctaagcattttctggttgctgccacagtacattcttcttggcatttcagatatctccac 1553

                                                                        
Query: 1320 agttgttggcatgcaggagttcttttatggtgaagttccaaagacaatgagaacaatggg 1379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1554 agttgttggcatgcaggagttcttttatggtgaagttccaaagacaatgagaacaatggg 1613

                                                                        
Query: 1380 aattgccttgtacactagtgtttttggggttggaagctttgtgagtgcactattgattac 1439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1614 aattgccttgtacactagtgtttttggggttggaagctttgtgagtgcactattgattac 1673

                                                                        
Query: 1440 actagttgaggtgtacacaagttcaaaaggggtaccaagttggttctctgatgatatggt 1499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1674 actagttgaggtgtacacaagttcaaaaggggtaccaagttggttctctgatgatatggt 1733

                                                                        
Query: 1500 tgaagcacgcttggacaattactattggcttttggcctggtttagtggagggagcttggt 1559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1734 tgaagcacgcttggacaattactattggcttttggcctggtttagtggagggagcttggt 1793

                                                               
Query: 1560 attgtatgtgctgttgtgtaaattttaccgctataggagtgattcagatag 1610
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1794 attgtatgtgctgttgtgtaaattttaccgctataggagtgattcagatag 1844