Miyakogusa Predicted Gene

Lj2g3v0690350.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj2g3v0690350.1 Non Chatacterized Hit- tr|H0XL55|H0XL55_OTOGA
Uncharacterized protein OS=Otolemur garnettii PE=4
SV=,25.84,1e-18,AMINO ACID TRANSPORTER,NULL; Peroxin-3,Peroxin-3;
seg,NULL; coiled-coil,NULL,CUFF.35208.1
         (1113 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC78846 similar to UniRef100_A7PH34 Cluster: Chromosome...  2157   0.0  

>gnl|LJGI|TC78846 similar to UniRef100_A7PH34 Cluster: Chromosome chr17 scaffold_16,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr17 scaffold_16, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (84%)
          Length = 1676

 Score = 2157 bits (1088), Expect = 0.0
 Identities = 1105/1113 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgctttctgtcagggatttttggaggcgccataggaggaagctttatcttacagctggt 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 250  atgctttctgtcagggatttttggaggcgccataggaggaagctttatcttacagctggt 309

                                                                        
Query: 61   gtttttggtggtggctattttttgtataagctttatgatactcacaggcaaaggctccat 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 310  gtttttggtggtggctattttttgtataagctttatgatactcacaggcaaaggctccat 369

                                                                        
Query: 121  gcacttgagagggaactccaacttcagagggaaagtgaggagcttatcaaggctcagata 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 370  gcacttgagagggaactccaacttcagagggaaagtgaggagcttatcaaggctcagata 429

                                                                        
Query: 181  caagctcactttgagaatattcagagaatttctgataccattacattgcctcatgctatg 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 430  caagctcactttgagaatattcagagaatttctgataccattacattgcctcatgctatg 489

                                                                        
Query: 241  cacaacttgagttgccggatagcacaagagttggatctttctcaccttctcgagaggcta 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 490  cacaacttgagttgccggatagcacaagagttggatctttctcaccttctcgagaggcta 549

                                                                        
Query: 301  atacaaggaaagggtcagccaaccaccttaacacaatcagagaaactagatttatgggga 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 550  atacaaggaaagggtcagccaaccaccttaacacaatcagagaaactagatttatgggga 609

                                                                        
Query: 361  aaactcaaaattttaagttttacacgaatggcattgtcaatatgggcaacaatactgctt 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 610  aaactcaaaattttaagttttacacgaatggcattgtcaatatgggcaacaatactgctt 669

                                                                        
Query: 421  agcttatatacaaaagttcaagtcaatatactaggaaggcatctatacattgatactgca 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 670  agcttatatacaaaagttcaagtcaatatactaggaaggcatctatacattgatactgca 729

                                                                        
Query: 481  cggaaccttggaatatctaattcaatggaaagcggagatgtggttgatagggaggaccag 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 730  cggaaccttggaatatctaattcaatggaaagcggagatgtggttgatagggaggaccag 789

                                                                        
Query: 541  cagaaatttctaggaactgctgattttctctctcaacatggtatgcctgccttgatttct 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 790  cagaaatttctaggaactgctgattttctctctcaacatggtatgcctgccttgatttct 849

                                                                        
Query: 601  gacatggaggcagcaacgaaagaagttatcaaaggaaagcaattgagcagtttattcaac 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 850  gacatggaggcagcaacgaaagaagttatcaaaggaaagcaattgagcagtttattcaac 909

                                                                        
Query: 661  aacacaacacttcatgaaactatcatgcagattctcgacaccttcatgagtatggggagt 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 910  aacacaacacttcatgaaactatcatgcagattctcgacaccttcatgagtatggggagt 969

                                                                        
Query: 721  ccacattcctggataaagtatatgatgcctgaggatgttagatcacactctattaccgct 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 970  ccacattcctggataaagtatatgatgcctgaggatgttagatcacactctattaccgct 1029

                                                                        
Query: 781  ggcaatgatgaaacagttccatatgatgtgactgaatttgaacaacttatggtggaagtg 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1030 ggcaatgatgaaacagttccatatgatgtgactgaatttgaacaacttatggtggaagtg 1089

                                                                        
Query: 841  cgtgcagtattgtcaagcgctgaatttgggagcattgtagagatagctctgaaagttgtg 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1090 cgtgcagtattgtcaagcgctgaatttgggagcattgtagagatagctctgaaagttgtg 1149

                                                                        
Query: 901  gtggataaactggtggagctcatgggggctaaatttggagggaatttaaccacaggcttg 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1150 gtggataaactggtggagctcatgggggctaaatttggagggaatttaaccacaggcttg 1209

                                                                        
Query: 961  ccgctggccagagtattgcctcaagttgcacagatgtgtcctttcctccttgaagaaccc 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1210 ccgctggccagagtattgcctcaagttgcacagatgtgtcctttcctccttgaagaaccc 1269

                                                                        
Query: 1021 agcaagaatcagttcatccaagttattaaaaatatgcaagaggttgaacnnnnnnncact 1080
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||
Sbjct: 1270 agcaagaatcagttcatccaagttattaaaaatatgcaagaggttgaactttttttcact 1329

                                             
Query: 1081 ctcctctatgcaaacatgccaagtgcatagtga 1113
            ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1330 ctcctatatgcaaacatgccaagtgcatagtga 1362