Miyakogusa Predicted Gene
- Lj2g3v0658080.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj2g3v0658080.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1KJ84|I1KJ84_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.2418
PE=,91.88,0,DHO_dh,Dihydroorotate dehydrogenase, class 1/ 2; no
description,Aldolase-type TIM barrel; FMN-linked,CUFF.35158.1
(1185 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC57617 homologue to UniRef100_A7PHC0 Cluster: Chromoso... 2341 0.0
gnl|LJGI|BW627062 homologue to UniRef100_A7PHC0 Cluster: Chromos... 579 e-164
>gnl|LJGI|TC57617 homologue to UniRef100_A7PHC0 Cluster: Chromosome chr17 scaffold_16,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr17 scaffold_16, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (93%)
Length = 1585
Score = 2341 bits (1181), Expect = 0.0
Identities = 1184/1185 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcatctctaagcatgacccaggtcagaacaggaaaatctgcatctgggttttccttg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 atggcatctctaagcatgacccaggtcagaacaggaaaatctgcatctgggttttccttg 192
Query: 61 aattgccctgggaaggttcaggctcgtcccagcagagttggtttcagggtttttgcttca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193 aattgccctgggaaggttcaggctcgtcccagcagagttggtttcagggtttttgcttca 252
Query: 121 gaggctcaggttcctgagcctgatctcagtgttactgtaaatgggttgcatatgccaaac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 253 gaggctcaggttcctgagcctgatctcagtgttactgtaaatgggttgcatatgccaaac 312
Query: 181 ccttttgttattgggtcaggtccacctggaacaaattatactgtcatgaagagagccttt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 313 ccttttgttattgggtcaggtccacctggaacaaattatactgtcatgaagagagccttt 372
Query: 241 gatgaagggtggggtgctgtgattgctaaaactgtgtcacttgatgcagcaaaagttata 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373 gatgaagggtggggtgctgtgattgctaaaactgtgtcacttgatgcagcaaaagttata 432
Query: 301 aatgtaactcctcggtatgcccgactacgggccggtgcaaatggctctgcaaaaggagaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 433 aatgtaactcctcggtatgcccgactacgggccggtgcaaatggctctgcaaaaggagaa 492
Query: 361 attattgggtgggagaacatagaacttatcagtgatcgaccacttgaaaccatgttgaaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 493 attattgggtgggagaacatagaacttatcagtgatcgaccacttgaaaccatgttgaaa 552
Query: 421 gaatttaagcaattaaaagaagaatacccagacagaattctcattgcttcaatcatggag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 553 gaatttaagcaattaaaagaagaatacccagacagaattctcattgcttcaatcatggag 612
Query: 481 gagtacaataaggctgcttgggaggagcttatcgacagagttgagcaaactggaattgac 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 613 gagtacaataaggctgcttgggaggagcttatcgacagagttgagcaaactggaattgac 672
Query: 541 gcgatcgagataaatttctcctgtcctcatggcatgccagaacgcaaaatgggtgctgct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 673 gcgatcgagataaatttctcctgtcctcatggcatgccagaacgcaaaatgggtgctgct 732
Query: 601 gttgggcaagattgtgctcttttggaagaggtttgtcgatggataaatgcaaaagctaca 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 733 gttgggcaagattgtgctcttttggaagaggtttgtcgatggataaatgcaaaagctaca 792
Query: 661 gttcctgtttgggctaagatgactcccaacataactgatatttcagagccagcaagggtt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 793 gttcctgtttgggctaagatgactcccaacataactgatatttcagagccagcaagggtt 852
Query: 721 gctctaagttcagggtgtgagggagtagctgctataaatacgatcatgagcgtcatggga 780
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 853 gctctaagttcagggtgttagggagtagctgctataaatacgatcatgagcgtcatggga 912
Query: 781 atcaatctcaatacattgcgccctgaaccttgtgttgagggatactcaactcccggtggt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 913 atcaatctcaatacattgcgccctgaaccttgtgttgagggatactcaactcccggtggt 972
Query: 841 tattctgcaaaggcggtccaccccatagctctcgcgaaggtgatgagtatagcgaaaatg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 973 tattctgcaaaggcggtccaccccatagctctcgcgaaggtgatgagtatagcgaaaatg 1032
Query: 901 atgaagtctgagtttgacagtgaggactattcactttcggccattggtggtgttgagaca 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1033 atgaagtctgagtttgacagtgaggactattcactttcggccattggtggtgttgagaca 1092
Query: 961 ggtggtgatgctgctgagtttattcttcttggggcaaatactgttcaggtttgcactgga 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1093 ggtggtgatgctgctgagtttattcttcttggggcaaatactgttcaggtttgcactgga 1152
Query: 1021 gttatgatgcatggctatggtcttgtgaagaagctgtgtgtagagcttcaagacttcatg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1153 gttatgatgcatggctatggtcttgtgaagaagctgtgtgtagagcttcaagacttcatg 1212
Query: 1081 aaaaagcacaatttcacatcaatagaagatttccgagggacctctcttcagtattttaca 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1213 aaaaagcacaatttcacatcaatagaagatttccgagggacctctcttcagtattttaca 1272
Query: 1141 actcacactgacttggtgcaaaggcagcaagaggcaattaggcag 1185
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1273 actcacactgacttggtgcaaaggcagcaagaggcaattaggcag 1317
>gnl|LJGI|BW627062 homologue to UniRef100_A7PHC0 Cluster: Chromosome chr17
scaffold_16, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome chr17 scaffold_16, whole genome
shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (17%)
Length = 472
Score = 579 bits (292), Expect = e-164
Identities = 292/292 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcatctctaagcatgacccaggtcagaacaggaaaatctgcatctgggttttccttg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atggcatctctaagcatgacccaggtcagaacaggaaaatctgcatctgggttttccttg 240
Query: 61 aattgccctgggaaggttcaggctcgtcccagcagagttggtttcagggtttttgcttca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aattgccctgggaaggttcaggctcgtcccagcagagttggtttcagggtttttgcttca 300
Query: 121 gaggctcaggttcctgagcctgatctcagtgttactgtaaatgggttgcatatgccaaac 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gaggctcaggttcctgagcctgatctcagtgttactgtaaatgggttgcatatgccaaac 360
Query: 181 ccttttgttattgggtcaggtccacctggaacaaattatactgtcatgaagagagccttt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ccttttgttattgggtcaggtccacctggaacaaattatactgtcatgaagagagccttt 420
Query: 241 gatgaagggtggggtgctgtgattgctaaaactgtgtcacttgatgcagcaa 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gatgaagggtggggtgctgtgattgctaaaactgtgtcacttgatgcagcaa 472