Miyakogusa Predicted Gene

Lj2g3v0621350.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj2g3v0621350.1 tr|D7KD08|D7KD08_ARALL Predicted protein
OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata GN=ARALYDRAFT_681800
PE,32.6,0.0000000000002,seg,NULL; coiled-coil,NULL;
KIP1,KIP1-like,CUFF.34867.1
         (1125 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC68503                                                     1909   0.0  
gnl|LJGI|FS330820                                                    1124   0.0  
gnl|LJGI|TC69729                                                      519   e-146

>gnl|LJGI|TC68503 
          Length = 1366

 Score = 1909 bits (963), Expect = 0.0
 Identities = 972/975 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 151  gacctggaagagaggatgaaaatgttggcaatgaacacaatggaagatgaagagatgggt 210
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 43   gacctggaagagaggatgaacatgttggcaatgaacacaatggaagatgaagagatgggt 102

                                                                        
Query: 211  gatacttttgcagaaagagcagaaacttactaccaaaagcgaccacagcttctgtcactt 270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 103  gatacttttgcagaaagagcagaaacttactaccaaaagcgaccacagcttctgtcactt 162

                                                                        
Query: 271  ctgcaggacctgtacaatggctatattactttgtctgatagatacatacaaacattggcc 330
            |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 163  ctgcaggacctgtacaatggctatatcactttgtctgatagatacatacaaacattggcc 222

                                                                        
Query: 331  aaacacaagcatttcaggcatagcagacactcttctcaagttgaggggggcttctctgac 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 223  aaacacaagcatttcaggcatagcagacactcttctcaagttgaggggggcttctctgac 282

                                                                        
Query: 391  caagaagaagttagtggtgtgagccaggttgattcagatattgagagctcaatctcttat 450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 283  caagaagaagttagtggtgtgagccaggttgattcagatattgagagctcaatctcttat 342

                                                                        
Query: 451  cagcaaatgcctgtgatgattctccctgggagctctatgcttgatgttgatgcttttgtt 510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 343  cagcaaatgcctgtgatgattctccctgggagctctatgcttgatgttgatgcttttgtt 402

                                                                        
Query: 511  gctgagcttgtgattaagaatgtggagcatgatatcttgatgcatgaggtcagtgtgatg 570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 403  gctgagcttgtgattaagaatgtggagcatgatatcttgatgcatgaggtcagtgtgatg 462

                                                                        
Query: 571  gagaggaagtactgtgagtcatcaaggaagaatgagctgcagaagagcttgcttgaggtg 630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 463  gagaggaagtactgtgagtcatcaaggaagaatgagctgcagaagagcttgcttgaggtg 522

                                                                        
Query: 631  ttggagtccgagagggttgttcttcttaatgagaatgctggattgagctacagggtcaac 690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 523  ttggagtccgagagggttgttcttcttaatgagaatgctggattgagctacagggtcaac 582

                                                                        
Query: 691  actctggtggaagagaacaaggatctggcatcagagtcggtgtttattaagaggaaggcc 750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 583  actctggtggaagagaacaaggatctggcatcagagtcggtgtttattaagaggaaggcc 642

                                                                        
Query: 751  ggggagctggcaaagtgtgtgctgaagatgagggaggatcacagggtgtacttgctccac 810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 643  ggggagctggcaaagtgtgtgctgaagatgagggaggatcacagggtgtacttgctccac 702

                                                                        
Query: 811  aagaagattgaggatcttcaagcacagatacatgggttggagaagaggaacaaggagtac 870
            |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 703  aagaggattgaggatcttcaagcacagatacatgggttggagaagaggaacaaggagtac 762

                                                                        
Query: 871  tatgagaagcttctgagaagagatgatgacagctgcagcatgggaagcagcagcaagggg 930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 763  tatgagaagcttctgagaagagatgatgacagctgcagcatgggaagcagcagcaagggg 822

                                                                        
Query: 931  aagaacaacaacgaagggatcgcgttggaggttcgtgttcagctcaataagcttcgaagg 990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 823  aagaacaacaacgaagggatcgcgttggaggttcgtgttcagctcaataagcttcgaagg 882

                                                                        
Query: 991  ttcaagtggaaagatggcaatggtagcggcactcctgggaagaaatttgagggagtgaag 1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 883  ttcaagtggaaagatggcaatggtagcggcactcctgggaagaaatttgagggagtgaag 942

                                                                        
Query: 1051 aaaggcccaagtttgtggaagaagctgaagaacatggacttgttattgtgtgggacaaat 1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 943  aaaggcccaagtttgtggaagaagctgaagaacatggacttgttattgtgtgggacaaat 1002

                           
Query: 1111 cccacttgtgcttga 1125
            |||||||||||||||
Sbjct: 1003 cccacttgtgcttga 1017


>gnl|LJGI|FS330820 
          Length = 730

 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0
 Identities = 570/571 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   atggagagggaccctaacactgtagtcatgggcaaggagaaaaagatttcaaattcccca 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 160 atggagagggaccctaacactgtagtcatgggcaaggagaaaaagatttcaaattcccca 219

                                                                       
Query: 61  ttgctttcttcctccacaaaagggccaagggacaagagcatcatcaccaacaacaacatc 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 220 ttgctttcttcctccacaaaagggccaagggacaagagcatcatcaccaacaacaacatc 279

                                                                       
Query: 121 atgccctcttggctagtcaccagcatttctgacctggaagagaggatgaaaatgttggca 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280 atgccctcttggctagtcaccagcatttctgacctggaagagaggatgaaaatgttggca 339

                                                                       
Query: 181 atgaacacaatggaagatgaagagatgggtgatacttttgcagaaagagcagaaacttac 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 340 atgaacacaatggaagatgaagagatgggtgatacttttgcagaaagagcagaaacttac 399

                                                                       
Query: 241 taccaaaagcgaccacagcttctgtcacttctgcaggacctgtacaatggctatattact 300
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 400 taccaaaagcgaccacagcttctgtcacttctgcaggacctgtacaatggctatatcact 459

                                                                       
Query: 301 ttgtctgatagatacatacaaacattggccaaacacaagcatttcaggcatagcagacac 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 460 ttgtctgatagatacatacaaacattggccaaacacaagcatttcaggcatagcagacac 519

                                                                       
Query: 361 tcttctcaagttgaggggggcttctctgaccaagaagaagttagtggtgtgagccaggtt 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 520 tcttctcaagttgaggggggcttctctgaccaagaagaagttagtggtgtgagccaggtt 579

                                                                       
Query: 421 gattcagatattgagagctcaatctcttatcagcaaatgcctgtgatgattctccctggg 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 580 gattcagatattgagagctcaatctcttatcagcaaatgcctgtgatgattctccctggg 639

                                                                       
Query: 481 agctctatgcttgatgttgatgcttttgttgctgagcttgtgattaagaatgtggagcat 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 640 agctctatgcttgatgttgatgcttttgttgctgagcttgtgattaagaatgtggagcat 699

                                          
Query: 541 gatatcttgatgcatgaggtcagtgtgatgg 571
           |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 700 gatatcttgatgcatgaggtcagtgtgatgg 730


>gnl|LJGI|TC69729 
          Length = 772

 Score =  519 bits (262), Expect = e-146
 Identities = 262/262 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 864  ggagtactatgagaagcttctgagaagagatgatgacagctgcagcatgggaagcagcag 923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54   ggagtactatgagaagcttctgagaagagatgatgacagctgcagcatgggaagcagcag 113

                                                                        
Query: 924  caaggggaagaacaacaacgaagggatcgcgttggaggttcgtgttcagctcaataagct 983
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 114  caaggggaagaacaacaacgaagggatcgcgttggaggttcgtgttcagctcaataagct 173

                                                                        
Query: 984  tcgaaggttcaagtggaaagatggcaatggtagcggcactcctgggaagaaatttgaggg 1043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 174  tcgaaggttcaagtggaaagatggcaatggtagcggcactcctgggaagaaatttgaggg 233

                                                                        
Query: 1044 agtgaagaaaggcccaagtttgtggaagaagctgaagaacatggacttgttattgtgtgg 1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 234  agtgaagaaaggcccaagtttgtggaagaagctgaagaacatggacttgttattgtgtgg 293

                                  
Query: 1104 gacaaatcccacttgtgcttga 1125
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 294  gacaaatcccacttgtgcttga 315