Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v4763860.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v4763860.1 tr|G7I359|G7I359_MEDTR Calcium homeostasis
endoplasmic reticulum protein OS=Medicago truncatula
GN=M,81.05,0,Suppressor-of-White-APricot splicing regulat,SWAP/Surp;
no description,RNA polymerase II, large subu,CUFF.33187.1
(2073 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC58658 similar to UniRef100_A7Q6W4 Cluster: Chromosome... 2698 0.0
gnl|LJGI|TC61999 similar to UniRef100_Q3LHL4 Cluster: Pre-mRNA s... 991 0.0
>gnl|LJGI|TC58658 similar to UniRef100_A7Q6W4 Cluster: Chromosome chr12 scaffold_57,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr12 scaffold_57, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (50%)
Length = 1699
Score = 2698 bits (1361), Expect = 0.0
Identities = 1374/1377 (99%), Gaps = 1/1377 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 698 atgatcagcaccaccaccatcagcatcctcagtcattcgggcttcatggtcgaccagagt 757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 atgatcagcaccaccaccatcagcatcctcagtcattcgggcttcatggtcgaccagagt 61
Query: 758 atgaccagtcatccaagtcttttaaagggctctctgggccacttccttctgatgtggcaa 817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 atgaccagtcatccaagtcttttaaagggctctctgggccacttccttctgatgtggcaa 121
Query: 818 tggagctcagcaatgttcttggcaatctcactggtacaaaagaatccatcaaaagtgcca 877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 tggagctcagcaatgttcttggcaatctcactggtacaaaagaatccatcaaaagtgcca 181
Query: 878 agctttggttcatgcagagatctccatttgcaccagctcttgcagaggctcttcgagaga 937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 agctttggttcatgcagagatctccatttgcaccagctcttgcagaggctcttcgagaga 241
Query: 938 gggtctttgcattggatgacgttgagaggcagttacatataatataccttgctaatgaca 997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 gggtctttgcattggatgacgttgagaggcagttacatataatataccttgctaatgaca 301
Query: 998 ttctttttgacagcttaaatcggagggcaagcactcatgatcttgacaatgaggctcttg 1057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ttctttttgacagcttaaatcggagggcaagcactcatgatcttgacaatgaggctcttg 361
Query: 1058 catttaaacctgttttaggctccatgcttgcaagaatttatcataatccacaaagcaatg 1117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 catttaaacctgttttaggctccatgcttgcaagaatttatcataatccacaaagcaatg 421
Query: 1118 aggaatataggaaaagattgcagcagatggtggagttctggtcttctaaagaggtatatg 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 aggaatataggaaaagattgcagcagatggtggagttctggtcttctaaagaggtatatg 481
Query: 1178 agcaagagactatatccttaatgaagggtgagatgattggtgggccacaatcaacttttc 1237
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 482 agcaagagactatatccttaatgaagggtgagatgattggtgggccgcaatcaacttttc 541
Query: 1238 ctggggcatccaaggatttatcctctgcttcagcagattcaagtgcaggattgctgcaga 1297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 ctggggcatccaaggatttatcctctgcttcagcagattcaagtgcaggattgctgcaga 601
Query: 1298 ctcctaaccatattggccaacagtggctagctgatagagggg-gcgctggtttaagtgtc 1356
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 602 ctcctaaccatattggccaacagtggctagctgatagaggggggcgctggtttaagtgtc 661
Query: 1357 ttagatcaagatcgtcctgataaacatgcaattttagggcagtctatgccagcatctctg 1416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 ttagatcaagatcgtcctgataaacatgcaattttagggcagtctatgccagcatctctg 721
Query: 1417 gctgctcagcaatttcatctaaattctgctcctcctagtgcctttccagggtccatggcg 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 gctgctcagcaatttcatctaaattctgctcctcctagtgcctttccagggtccatggcg 781
Query: 1477 ataccatctactgctcaaccaactaatcaaccacctggtgcacatttattgccccctcca 1536
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 ataccatctactactcaaccaactaatcaaccacctggtgcacatttattgccccctcca 841
Query: 1537 tcgtccaataccagcgaacagttgcctccatacccattgttcccacctggcctcattcct 1596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 tcgtccaataccagcgaacagttgcctccatacccattgttcccacctggcctcattcct 901
Query: 1597 ggaatggttagaaagatgcaaattggtagtggggtcccatattctcctttgagccctttg 1656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 ggaatggttagaaagatgcaaattggtagtggggtcccatattctcctttgagccctttg 961
Query: 1657 gatatcccaactatgataccaccatcaacgataccgccgtcagatattcttcaaagagtg 1716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 gatatcccaactatgataccaccatcaacgataccgccgtcagatattcttcaaagagtg 1021
Query: 1717 tcgaaattttttaaagaaattggagaggtaaatccttctgagggccctatgaattctgat 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 tcgaaattttttaaagaaattggagaggtaaatccttctgagggccctatgaattctgat 1081
Query: 1777 tcaagagatgaggatgatgaatatgatagagaatatgagagggagactccagcaagaaag 1836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 tcaagagatgaggatgatgaatatgatagagaatatgagagggagactccagcaagaaag 1141
Query: 1837 ggaggtgcttgcattcctccacccgcaaacttgcaggttgatccagagacagggacctat 1896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 ggaggtgcttgcattcctccacccgcaaacttgcaggttgatccagagacagggacctat 1201
Query: 1897 gcggatgggagtgtagatcgtaagccagggtcaagtggctcgggaaggttggggcttggt 1956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1202 gcggatgggagtgtagatcgtaagccagggtcaagtggctcgggaaggttggggcttggt 1261
Query: 1957 gccacagcaaatcccaatgaggtgagtcagtatgatgatgtatatacatcttacaggaag 2016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1262 gccacagcaaatcccaatgaggtgagtcagtatgatgatgtatatacatcttacaggaag 1321
Query: 2017 cagaggagcacaaattaccattcatcaatgagtgctagagcgatcacgagatgaaag 2073
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1322 cagaggagcacaaattaccattcatcaatgagtgctagagcgatcacgagatgaaag 1378
>gnl|LJGI|TC61999 similar to UniRef100_Q3LHL4 Cluster: Pre-mRNA splicing factor; n=1;
Solanum tuberosum|Rep: Pre-mRNA splicing factor -
Solanum tuberosum (Potato), partial (14%)
Length = 751
Score = 991 bits (500), Expect = 0.0
Identities = 513/516 (99%), Gaps = 1/516 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaacgacctggccatgattttgcagctgcatctgctatggcatatgctcagcagcag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 236 atggaacgacctggccatgattttgcagctgcatctgctatggcatatgctcagcagcag 295
Query: 61 cgaccgccggccgcgaatatgcaacagcagcagcagtttggatttcatccccagcatcag 120
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 296 cgaccaccggccgcgaatatgcaacagcagcagcagtttggatttcatccccagcatcag 355
Query: 121 cagtttccttcatcaatccatggtcctccttttatgcccccaggtcccccctccatgcaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 356 cagtttccttcatcaatccatggtcctccttttatgcccccaggtcccccctccatgcaa 415
Query: 181 cagttcccttaccatcccgccctacagcaacagcagcagcagcttcagcagttacatcct 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 416 cagttcccttaccatcccgccctacagcaacagcagcagcagcttcagcagttacatcct 475
Query: 241 catgcccctctgccaccccctcatcttcttcagcaccaagcaccgcctgcattcccctcg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 476 catgcccctctgccaccccctcatcttcttcagcaccaagcaccgcctgcattcccctcg 535
Query: 301 cattatcctcgtcctcttgtttcatcgccttttttcgattctgctccacccccggctccc 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 536 cattatcctcgtcctcttgtttcatcgccttttttcgattctgctccacccccggctcac 595
Query: 361 ccgccttctgaccccgagctccacaagcggattgacaaacttgttgagtatgctgtgaaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 596 ccgccttctgaccccgagctccacaagcggattgacaaacttgttgagtatgctgtgaaa 655
Query: 421 aatggccctgagtttgaag-ccatgatatgtgaaaagcaacgagataatccggcctatgg 479
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 656 aatggccctgagtttgaagcccatgatatgtgaaaagcaacgagataatccggcctatgg 715
Query: 480 tttcctctttggtgaggaaggccatggttactaccg 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 716 tttcctctttggtgaggaaggccatggttactaccg 751