Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v4579300.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v4579300.1 gi|558544|emb|Z36750.1|.path1.1
(1650 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC57140 UniRef100_Q40221 Cluster: Protein containing C-... 3255 0.0
gnl|LJGI|FS341285 UniRef100_Q40221 Cluster: Protein containing C... 1043 0.0
gnl|LJGI|BW621301 UniRef100_Q40221 Cluster: Protein containing C... 494 e-138
>gnl|LJGI|TC57140 UniRef100_Q40221 Cluster: Protein containing C-terminal RING-finger;
n=1; Lotus japonicus|Rep: Protein containing C-terminal
RING-finger - Lotus japonicus, complete
Length = 2092
Score = 3255 bits (1642), Expect = 0.0
Identities = 1648/1650 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggggcatagacatttgtataacacaaccccattgtttgagggtgagcctgaccagaat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 atggggcatagacatttgtataacacaaccccattgtttgagggtgagcctgaccagaat 358
Query: 61 tggaatcatatgcatactgatcaacattatgtgaaccttggtaggactagcactgcagag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359 tggaatcatatgcatactgatcaacattatgtgaaccttggtaggactagcactgcagag 418
Query: 121 aatggttcctatttttatcctgtggaaaatgtgtccatagatagcacttctttcccctct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 419 aatggttcctatttttatcctgtggaaaatgtgtccatagatagcacttctttcccctct 478
Query: 181 cattggaaccctgcaacaaggtcaaatggatatgcatcttcaagtctcaacattgaagta 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 479 cattggaaccctgcaacaaggtcaaatggatatgcatcttcaagtctcaacattgaagta 538
Query: 241 cctcctcatcaatcagatacatcaggcgcttcaaatgatcattttatacattcgtctagt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 539 cctcctcatcaatcagatacatcaggcgcttcaaatgatcattttatacattcgtctagt 598
Query: 301 gctggagctttctttgcagtatctaataattgtgtgcctcagccgcctgcggccaattat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599 gctggagctttctttgcagtatctaataattgtgtgcctcagccgcctgcggccaattat 658
Query: 361 gacagaccaccatttcaggttgatggtggttttattgatcttacgatgggaagtggacga 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659 gacagaccaccatttcaggttgatggtggttttattgatcttacgatgggaagtggacga 718
Query: 421 gggcctcacaagcgaaagagccctggaattccatcagtctatgagagaggcggttcaagc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 719 gggcctcacaagcgaaagagccctggaattccatcagtctatgagagaggcggttcaagc 778
Query: 481 agatatttcaatgctgggagttcaactgatgttcctatatcttcagaatcgcggcccgag 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779 agatatttcaatgctgggagttcaactgatgttcctatatcttcagaatcgcggcccgag 838
Query: 541 aagccaaatatagattctcaatatatgccctgggatcatgttcctatgacatccacagtc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839 aagccaaatatagattctcaatatatgccctgggatcatgttcctatgacatccacagtc 898
Query: 601 agaggtgcaggccactcaataaagggtgagagttctttgaggaatgtgaggagccgttct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 899 agaggtgcaggccactcaataaagggtgagagttctttgaggaatgtgaggagccgttct 958
Query: 661 gcacttgatttggaatccaacctttctaggacccatttaccaagtaatcattcgcacaac 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 gcacttgatttggaatccaacctttctaggacccatttaccaagtaatcattcgcacaac 1018
Query: 721 tcctactctactatcccaccagttgaccattctagcatgatggatctttcaggtcagatt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 tcctactctactatcccaccagttgaccattctagcatgatggatctttcaggtcagatt 1078
Query: 781 tctacctctttgacaggggattggagccaaatgaacatatctcctgctaatggaagggtg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1079 tctacctctttgacaggggattggagccaaatgaacatatctcctgctaatggaagggtg 1138
Query: 841 ttattaccagatgccggtgcttatggtcttgagtcaagtcacttccttgctggaagtggt 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1139 ttattaccagatgccggtgcttatggtcttgagtcaagtcacttccttgctggaagtggt 1198
Query: 901 gctactgctagtaatgcttctgttgatgttgggagcttccatcatgaatttggtacaagc 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1199 gctactgctagtaatgcttctgttgatgttgggagcttccatcatgaatttggtacaagc 1258
Query: 961 agaaatcctactggtcctcaaagttttcataatctgactcagactgctaggggaatccga 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1259 agaaatcctactggtcctcaaagttttcataatctgactcagactgctaggggaatccga 1318
Query: 1021 agtaactattctcagagatcagccccaacttttagggcttcttcaagcacgcacttggga 1080
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1319 agtaactattctcagagatcagcccctacttttagggcttcttcaagcacgcacttggga 1378
Query: 1081 catgtgacaccattggatgatggattgcccatggtagctgaaagttactcttctagacat 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1379 catgtgacaccattggatgatggattgcccatggtagctgaaagttactcttctagacat 1438
Query: 1141 caaaggccattatccagcattggatggcggaacagtgatcgaaatgggagggcaagaatt 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1439 caaaggccattatccagcattggatggcggaacagtgatcgaaatgggagggcaagaatt 1498
Query: 1201 tctagtgaaagatatcgatcattggctaatgaggccggtctccatggtcgaatttcccct 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1499 tctagtgaaagatatcgatcattggctaatgaggccggtctccatggtcgaatttcccct 1558
Query: 1261 gagggtttcatgattgtcgatcgcgcatcaatgtatggttcaaggaatatgcttgaccag 1320
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1559 gaggttttcatgattgtcgatcgcgcatcaatgtatggttcaaggaatatgcttgaccag 1618
Query: 1321 cacagagacatgaggatggacatagataacatgagctatgaggaactacttgcacttggt 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1619 cacagagacatgaggatggacatagataacatgagctatgaggaactacttgcacttggt 1678
Query: 1381 gagaggattggccatgttaacacgggattatccgaggattcgttttcccagtgtatgaca 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1679 gagaggattggccatgttaacacgggattatccgaggattcgttttcccagtgtatgaca 1738
Query: 1441 gaaacaatatattgttcatctgagcaaggtcaagacgaaggaagctgtgtaatctgtctg 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1739 gaaacaatatattgttcatctgagcaaggtcaagacgaaggaagctgtgtaatctgtctg 1798
Query: 1501 gaagaatacaagaacatggacgatgttgggacacttaaaacttgtggacatgattaccat 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1799 gaagaatacaagaacatggacgatgttgggacacttaaaacttgtggacatgattaccat 1858
Query: 1561 gtgaactgcattaagaagtggttatctatgaagaaactatgtcctatctgcaaagcttct 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1859 gtgaactgcattaagaagtggttatctatgaagaaactatgtcctatctgcaaagcttct 1918
Query: 1621 gttatgcccgaggataagatgaacaaataa 1650
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1919 gttatgcccgaggataagatgaacaaataa 1948
>gnl|LJGI|FS341285 UniRef100_Q40221 Cluster: Protein containing C-terminal
RING-finger; n=1; Lotus japonicus|Rep: Protein
containing C-terminal RING-finger - Lotus japonicus,
partial (32%)
Length = 783
Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0
Identities = 526/526 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggggcatagacatttgtataacacaaccccattgtttgagggtgagcctgaccagaat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 258 atggggcatagacatttgtataacacaaccccattgtttgagggtgagcctgaccagaat 317
Query: 61 tggaatcatatgcatactgatcaacattatgtgaaccttggtaggactagcactgcagag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 318 tggaatcatatgcatactgatcaacattatgtgaaccttggtaggactagcactgcagag 377
Query: 121 aatggttcctatttttatcctgtggaaaatgtgtccatagatagcacttctttcccctct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 378 aatggttcctatttttatcctgtggaaaatgtgtccatagatagcacttctttcccctct 437
Query: 181 cattggaaccctgcaacaaggtcaaatggatatgcatcttcaagtctcaacattgaagta 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 438 cattggaaccctgcaacaaggtcaaatggatatgcatcttcaagtctcaacattgaagta 497
Query: 241 cctcctcatcaatcagatacatcaggcgcttcaaatgatcattttatacattcgtctagt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 498 cctcctcatcaatcagatacatcaggcgcttcaaatgatcattttatacattcgtctagt 557
Query: 301 gctggagctttctttgcagtatctaataattgtgtgcctcagccgcctgcggccaattat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 558 gctggagctttctttgcagtatctaataattgtgtgcctcagccgcctgcggccaattat 617
Query: 361 gacagaccaccatttcaggttgatggtggttttattgatcttacgatgggaagtggacga 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 618 gacagaccaccatttcaggttgatggtggttttattgatcttacgatgggaagtggacga 677
Query: 421 gggcctcacaagcgaaagagccctggaattccatcagtctatgagagaggcggttcaagc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 678 gggcctcacaagcgaaagagccctggaattccatcagtctatgagagaggcggttcaagc 737
Query: 481 agatatttcaatgctgggagttcaactgatgttcctatatcttcag 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 agatatttcaatgctgggagttcaactgatgttcctatatcttcag 783
>gnl|LJGI|BW621301 UniRef100_Q40221 Cluster: Protein containing C-terminal
RING-finger; n=1; Lotus japonicus|Rep: Protein
containing C-terminal RING-finger - Lotus japonicus,
partial (15%)
Length = 508
Score = 494 bits (249), Expect = e-138
Identities = 249/249 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggggcatagacatttgtataacacaaccccattgtttgagggtgagcctgaccagaat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 atggggcatagacatttgtataacacaaccccattgtttgagggtgagcctgaccagaat 319
Query: 61 tggaatcatatgcatactgatcaacattatgtgaaccttggtaggactagcactgcagag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 320 tggaatcatatgcatactgatcaacattatgtgaaccttggtaggactagcactgcagag 379
Query: 121 aatggttcctatttttatcctgtggaaaatgtgtccatagatagcacttctttcccctct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 aatggttcctatttttatcctgtggaaaatgtgtccatagatagcacttctttcccctct 439
Query: 181 cattggaaccctgcaacaaggtcaaatggatatgcatcttcaagtctcaacattgaagta 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 440 cattggaaccctgcaacaaggtcaaatggatatgcatcttcaagtctcaacattgaagta 499
Query: 241 cctcctcat 249
|||||||||
Sbjct: 500 cctcctcat 508