Miyakogusa Predicted Gene

Lj1g3v4251220.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj1g3v4251220.1 tr|O65808|O65808_SOYBN Magnesium chelatase
subunit OS=Glycine max GN=chlH PE=2
SV=1,94.38,0,CobN-Mg_chel,CobN/magnesium chelatase; DUF3479,Magnesium
chelatase, subunit H, N-terminal; BchH: mag,CUFF.32611.1
         (3630 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC76066 homologue to UniRef100_O65808 Cluster: Magnesiu...  2807   0.0  
gnl|LJGI|TC75383 homologue to UniRef100_O65808 Cluster: Magnesiu...  1532   0.0  
gnl|LJGI|TC81969 homologue to UniRef100_A7PWG0 Cluster: Chromoso...   626   e-178
gnl|LJGI|AV778756 weakly similar to UniRef100_Q07893 Cluster: Pr...   113   8e-24

>gnl|LJGI|TC76066 homologue to UniRef100_O65808 Cluster: Magnesium chelatase subunit;
            n=1; Glycine max|Rep: Magnesium chelatase subunit -
            Glycine max (Soybean), partial (34%)
          Length = 1710

 Score = 2807 bits (1416), Expect = 0.0
 Identities = 1416/1416 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 2215 ggatttggcataaatgagccatggattcagtacttgtcaaacaccaaattttaccgagct 2274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    ggatttggcataaatgagccatggattcagtacttgtcaaacaccaaattttaccgagct 60

                                                                        
Query: 2275 gacagggaaaaacttagaacaatgtttgagttcttgggagagtgtttgatgctggttgtg 2334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   gacagggaaaaacttagaacaatgtttgagttcttgggagagtgtttgatgctggttgtg 120

                                                                        
Query: 2335 gctgataatgaattgggaagtttaaaacaagccttggagggtaactttgtggagccaggg 2394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  gctgataatgaattgggaagtttaaaacaagccttggagggtaactttgtggagccaggg 180

                                                                        
Query: 2395 cctggtggtgaccctattagaaatcctaaagttttgccaacaggaaagaatattcatgcc 2454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  cctggtggtgaccctattagaaatcctaaagttttgccaacaggaaagaatattcatgcc 240

                                                                        
Query: 2455 ctggacccacaatctattcctactactgcagcattgcagagtgccaaagtagtggtagat 2514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  ctggacccacaatctattcctactactgcagcattgcagagtgccaaagtagtggtagat 300

                                                                        
Query: 2515 aggttggttgagaggcagaaagctgataatgggggaaaatatcccgagacagttgcactt 2574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  aggttggttgagaggcagaaagctgataatgggggaaaatatcccgagacagttgcactt 360

                                                                        
Query: 2575 gtattgtggggaacagataatattaaaacatatggtgaatccctggctcaggtcttgtgg 2634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gtattgtggggaacagataatattaaaacatatggtgaatccctggctcaggtcttgtgg 420

                                                                        
Query: 2635 atgataggtgtgaaaccagtggctgatacctttggtagggtaaaccgtgttgaacctgta 2694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  atgataggtgtgaaaccagtggctgatacctttggtagggtaaaccgtgttgaacctgta 480

                                                                        
Query: 2695 agccttgaagagcttggaaggcctaggattgatgttgttgttaattgctcaggagtgttc 2754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  agccttgaagagcttggaaggcctaggattgatgttgttgttaattgctcaggagtgttc 540

                                                                        
Query: 2755 agagaccttttcatcaatcagatgaatcttctggatagagcagtgaagatggttgctgaa 2814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  agagaccttttcatcaatcagatgaatcttctggatagagcagtgaagatggttgctgaa 600

                                                                        
Query: 2815 ttagatgagccactagagcaaaactatgtaagaaagcatgcattggaacaagctgaagcc 2874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  ttagatgagccactagagcaaaactatgtaagaaagcatgcattggaacaagctgaagcc 660

                                                                        
Query: 2875 cttggaattgaagttcgagaagcggcaacaaggatcttctccaatgcctctggatcctac 2934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  cttggaattgaagttcgagaagcggcaacaaggatcttctccaatgcctctggatcctac 720

                                                                        
Query: 2935 tcctctaacataaacctggctgtggagaattcctcatggaatgatgagaagcagctccag 2994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  tcctctaacataaacctggctgtggagaattcctcatggaatgatgagaagcagctccag 780

                                                                        
Query: 2995 gacatgtatctcagcagaaagtcttttgcttttgattgtgatgctcccggcgcaggcatg 3054
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781  gacatgtatctcagcagaaagtcttttgcttttgattgtgatgctcccggcgcaggcatg 840

                                                                        
Query: 3055 gccgaaaaaaggaaagtatttgagatggctctgagcacagcagaggcaacattccaaaac 3114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  gccgaaaaaaggaaagtatttgagatggctctgagcacagcagaggcaacattccaaaac 900

                                                                        
Query: 3115 cttgactcgtcagaaatctccctcactgatgtcagtcattactttgattcagacccaacc 3174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  cttgactcgtcagaaatctccctcactgatgtcagtcattactttgattcagacccaacc 960

                                                                        
Query: 3175 aatcttgttcaaaatctaaggaaagatgggaagaagcctagtgcatacattgctgacaca 3234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  aatcttgttcaaaatctaaggaaagatgggaagaagcctagtgcatacattgctgacaca 1020

                                                                        
Query: 3235 accacagccaatgcccaggtacgtactcttgctgagacagttagacttgatgcaagaacc 3294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 accacagccaatgcccaggtacgtactcttgctgagacagttagacttgatgcaagaacc 1080

                                                                        
Query: 3295 aagctgttgaacccaaagtggtatgaaggcatgttgtcaagtggatatgagggtgttcgt 3354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 aagctgttgaacccaaagtggtatgaaggcatgttgtcaagtggatatgagggtgttcgt 1140

                                                                        
Query: 3355 gagattgagaagagactgacaaatacagtagggtggagtgcaacttcaggccaggttgac 3414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 gagattgagaagagactgacaaatacagtagggtggagtgcaacttcaggccaggttgac 1200

                                                                        
Query: 3415 aactgggtgtatgaagaagccaacacaactttcattgaagatgagcaaatgctgaacaag 3474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 aactgggtgtatgaagaagccaacacaactttcattgaagatgagcaaatgctgaacaag 1260

                                                                        
Query: 3475 ctcatgaacactaatcctaactcatttaggaagctggtgcagacattcttggaagccaat 3534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 ctcatgaacactaatcctaactcatttaggaagctggtgcagacattcttggaagccaat 1320

                                                                        
Query: 3535 gggcgcggttactgggaaacctctaaacagaatattgagaggctcaagcagttgtactca 3594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 gggcgcggttactgggaaacctctaaacagaatattgagaggctcaagcagttgtactca 1380

                                                
Query: 3595 gaagtggaagacaaaattgaaggcattgatcgttga 3630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 gaagtggaagacaaaattgaaggcattgatcgttga 1416


>gnl|LJGI|TC75383 homologue to UniRef100_O65808 Cluster: Magnesium chelatase subunit;
            n=1; Glycine max|Rep: Magnesium chelatase subunit -
            Glycine max (Soybean), partial (18%)
          Length = 802

 Score = 1532 bits (773), Expect = 0.0
 Identities = 790/793 (99%), Gaps = 2/793 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 384  gaaggagtatttgaattggtatggaactagaagggatgctaatgagaagctgaagagtcc 443
            |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12   gaaggagtatttgaatgggtatgga-ctagaagggatgctaatgagaagctgaagagtcc 70

                                                                        
Query: 444  agatgctcctgtgattggtttgattcttcagaggagtcatattgtgactggtgatgatgg 503
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 71   agatgctcctgtgattggtttgattcttcagaggagtcatat-gtgactggtgatgatgg 129

                                                                        
Query: 504  acactatgtggctgtgatcatggaactggaggctagaggggctaaggttgttccactttt 563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130  acactatgtggctgtgatcatggaactggaggctagaggggctaaggttgttccactttt 189

                                                                        
Query: 564  tgctggtggccttgacttctcagggcctgtggagaagtttctgattgatcctatcacgaa 623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 190  tgctggtggccttgacttctcagggcctgtggagaagtttctgattgatcctatcacgaa 249

                                                                        
Query: 624  gaaaccgtttgtgaattcagtggtgtcccttactgggtttgctcttgttggaggccctgc 683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 250  gaaaccgtttgtgaattcagtggtgtcccttactgggtttgctcttgttggaggccctgc 309

                                                                        
Query: 684  aaggcaggaccatccgagggcgattgaggctttgatgaagcttgatgttccttacattgt 743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 310  aaggcaggaccatccgagggcgattgaggctttgatgaagcttgatgttccttacattgt 369

                                                                        
Query: 744  tgctgtgccactggtatttcagacaactgaggaatggctcaacagtactcttggtctgca 803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 370  tgctgtgccactggtatttcagacaactgaggaatggctcaacagtactcttggtctgca 429

                                                                        
Query: 804  tccaattcaggttgctctccaagttgctctgccggagctagatggaggcatggagccaat 863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 430  tccaattcaggttgctctccaagttgctctgccggagctagatggaggcatggagccaat 489

                                                                        
Query: 864  tgttttcgccggtcgggatcccaaaacaggaaaatctcatgctcttcataagagagtgga 923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 490  tgttttcgccggtcgggatcccaaaacaggaaaatctcatgctcttcataagagagtgga 549

                                                                        
Query: 924  acagctctgcatcagggcaatcagatgggctgaattgaaaagaaaatcaaaggcagagaa 983
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 550  acagctctgcatcagggcaatcagatgggctgaattgaaaagaaaatcaaaggcagagaa 609

                                                                        
Query: 984  gaaacttgcaatcactgtcttcagtttccctccagacaaaggaaatgttggaactgctgc 1043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 610  gaaacttgcaatcactgtcttcagtttccctccagacaaaggaaatgttggaactgctgc 669

                                                                        
Query: 1044 ctacctcaatgtcttctcctccatatactcagttctgacagacctgaaaagagatggtta 1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 670  ctacctcaatgtcttctcctccatatactcagttctgacagacctgaaaagagatggtta 729

                                                                        
Query: 1104 caacgttgatggccttccagagagttcagaagctttgattgaagaagtgatacatgacaa 1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 730  caacgttgatggccttccagagagttcagaagctttgattgaagaagtgatacatgacaa 789

                         
Query: 1164 agaagctcaattc 1176
            |||||||||||||
Sbjct: 790  agaagctcaattc 802


>gnl|LJGI|TC81969 homologue to UniRef100_A7PWG0 Cluster: Chromosome chr8 scaffold_34,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr8 scaffold_34, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (7%)
          Length = 316

 Score =  626 bits (316), Expect = e-178
 Identities = 316/316 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1693 cttaagcagttgagtgagctcatctcctcataccagtctctcaaagataccggtcgtggg 1752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    cttaagcagttgagtgagctcatctcctcataccagtctctcaaagataccggtcgtggg 60

                                                                        
Query: 1753 ccacaaattgtgagttcaattatcagcactgcaaaacaatgtaatcttgacaaggatgtg 1812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   ccacaaattgtgagttcaattatcagcactgcaaaacaatgtaatcttgacaaggatgtg 120

                                                                        
Query: 1813 gcactacctgatgagggtgaggagcttccggctaaagagcgcgacaatgtggttggtaag 1872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  gcactacctgatgagggtgaggagcttccggctaaagagcgcgacaatgtggttggtaag 180

                                                                        
Query: 1873 gtgtattccaagatcatggagatcgagtctcgcttgttgccttgcggccttcatgtcatt 1932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  gtgtattccaagatcatggagatcgagtctcgcttgttgccttgcggccttcatgtcatt 240

                                                                        
Query: 1933 ggtgaacctccctcagccttggaagcagttgcaacactggtgaacattgctgcacttgat 1992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  ggtgaacctccctcagccttggaagcagttgcaacactggtgaacattgctgcacttgat 300

                            
Query: 1993 cgtccggaacaaaata 2008
            ||||||||||||||||
Sbjct: 301  cgtccggaacaaaata 316


>gnl|LJGI|AV778756 weakly similar to UniRef100_Q07893 Cluster: Protoporphyrin IX:Mg
            Chelatase; n=1; Antirrhinum majus|Rep: Protoporphyrin
            IX:Mg Chelatase - Antirrhinum majus (Garden snapdragon),
            partial (3%)
          Length = 513

 Score =  113 bits (57), Expect = 8e-24
 Identities = 117/137 (85%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                        
Query: 3361 gagaagagactgacaaatacagtagggtggagtgcaacttcaggccaggttgacaactgg 3420
            |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||
Sbjct: 513  gagaagagactgaccaatcccgtagggtggggtgccacttcaggcccggttgaccactgg 454

                                                                        
Query: 3421 gtgtatgaagaagccaacacaactttcattgaagatgagcaaatgctgaacaagctcatg 3480
            ||||||| ||||||| || | || ||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||
Sbjct: 453  gtgtatgtagaagcccaccccaccttccttgaagatgagccaatgctggaccagctcctg 394

                             
Query: 3481 aacactaatcctaactc 3497
             || |||||||| ||||
Sbjct: 393  gaccctaatccttactc 377